# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fk06944.fasta.nr -Q ../query/KIAA1969.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1969, 595 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7798209 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5809+/-0.00019; mu= 12.6733+/- 0.011 mean_var=72.8264+/-14.141, 0's: 38 Z-trim: 238 B-trim: 889 in 1/66 Lambda= 0.150290 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|30173456|sp|Q8TF32.2|ZN431_HUMAN RecName: Full= ( 576) 4058 890.0 0 gi|26251755|gb|AAH40506.1| Zinc finger protein 431 ( 576) 4048 887.9 0 gi|114676344|ref|XP_001145538.1| PREDICTED: zinc f ( 559) 3786 831.0 0 gi|119605292|gb|EAW84886.1| zinc finger protein 71 ( 712) 3323 730.8 3.5e-208 gi|21740125|emb|CAD39077.1| hypothetical protein [ ( 644) 3311 728.1 2e-207 gi|34193526|gb|AAH50468.2| ZNF714 protein [Homo sa ( 661) 3311 728.1 2e-207 gi|119605291|gb|EAW84885.1| zinc finger protein 71 ( 713) 3311 728.2 2.1e-207 gi|84627547|gb|AAI11777.1| Zinc finger protein 430 ( 569) 3177 699.0 1e-198 gi|119605290|gb|EAW84884.1| zinc finger protein 43 ( 570) 3165 696.4 6.1e-198 gi|34925658|sp|Q9H8G1.2|ZN430_HUMAN RecName: Full= ( 570) 3164 696.2 7.1e-198 gi|158254382|dbj|BAF83164.1| unnamed protein produ ( 570) 3156 694.4 2.4e-197 gi|114676319|ref|XP_001144468.1| PREDICTED: zinc f ( 569) 3142 691.4 1.9e-196 gi|144953913|ref|NP_872321.2| zinc finger protein ( 555) 3032 667.5 2.9e-189 gi|74760994|sp|Q96N38.1|ZN714_HUMAN RecName: Full= ( 555) 3029 666.9 4.5e-189 gi|114676373|ref|XP_512544.2| PREDICTED: zinc fing ( 541) 2892 637.2 3.9e-180 gi|194018565|ref|NP_775802.2| zinc finger protein ( 542) 2880 634.6 2.4e-179 gi|55976738|sp|Q8IYN0.1|ZN100_HUMAN RecName: Full= ( 542) 2874 633.3 5.8e-179 gi|114676410|ref|XP_512552.2| PREDICTED: zinc fing ( 625) 2818 621.2 2.9e-175 gi|85681871|sp|Q03936.2|ZNF92_HUMAN RecName: Full= ( 586) 2795 616.2 8.8e-174 gi|119572686|gb|EAW52301.1| zinc finger protein 92 ( 607) 2795 616.2 9e-174 gi|194373791|dbj|BAG62802.1| unnamed protein produ ( 619) 2791 615.3 1.7e-173 gi|119605341|gb|EAW84935.1| hCG36740, isoform CRA_ ( 619) 2791 615.3 1.7e-173 gi|109066422|ref|XP_001097169.1| PREDICTED: simila ( 586) 2784 613.8 4.6e-173 gi|109124127|ref|XP_001084590.1| PREDICTED: zinc f ( 582) 2783 613.6 5.3e-173 gi|215274175|sp|Q03923.3|ZNF85_HUMAN RecName: Full ( 595) 2779 612.7 9.9e-173 gi|119605342|gb|EAW84936.1| hCG36740, isoform CRA_ ( 613) 2775 611.9 1.8e-172 gi|119605293|gb|EAW84887.1| zinc finger protein 71 ( 519) 2772 611.1 2.6e-172 gi|1017722|gb|AAA79179.1| repressor transcriptiona ( 595) 2771 611.0 3.3e-172 gi|109124104|ref|XP_001082498.1| PREDICTED: simila ( 566) 2759 608.4 1.9e-171 gi|148806912|ref|NP_001092096.1| zinc finger prote ( 572) 2758 608.2 2.3e-171 gi|114676358|ref|XP_512547.2| PREDICTED: zinc fing (1186) 2757 608.3 4.3e-171 gi|21752592|dbj|BAC04216.1| unnamed protein produc ( 540) 2752 606.8 5.3e-171 gi|85681863|sp|P17019.2|ZN708_HUMAN RecName: Full= ( 563) 2751 606.6 6.4e-171 gi|114676394|ref|XP_001147366.1| PREDICTED: hypoth ( 540) 2747 605.7 1.1e-170 gi|119605298|gb|EAW84892.1| zinc finger protein 70 ( 648) 2747 605.8 1.3e-170 gi|116642871|ref|NP_067092.2| zinc finger protein ( 563) 2740 604.2 3.3e-170 gi|71051536|gb|AAH31248.1| ZNF100 protein [Homo sa ( 596) 2735 603.2 7.4e-170 gi|212288104|sp|A6NK21.3|YI017_HUMAN RecName: Full ( 547) 2710 597.7 3e-168 gi|215274193|sp|O75437.3|ZN254_HUMAN RecName: Full ( 659) 2710 597.8 3.4e-168 gi|71051560|gb|AAH43147.2| Zinc finger protein 254 ( 659) 2708 597.4 4.6e-168 gi|218511972|sp|Q86V71.2|ZN429_HUMAN RecName: Full ( 674) 2702 596.1 1.1e-167 gi|114676346|ref|XP_524178.2| PREDICTED: hypotheti ( 563) 2700 595.6 1.4e-167 gi|158256008|dbj|BAF83975.1| unnamed protein produ ( 650) 2699 595.4 1.7e-167 gi|51476198|emb|CAH18089.1| hypothetical protein [ ( 540) 2697 594.9 2.1e-167 gi|114679826|ref|XP_001149923.1| PREDICTED: zinc f ( 659) 2690 593.5 6.8e-167 gi|114676383|ref|XP_001147215.1| PREDICTED: zinc f ( 704) 2689 593.3 8.3e-167 gi|190485783|sp|O75373.2|ZN737_HUMAN RecName: Full ( 536) 2684 592.1 1.5e-166 gi|190463823|sp|A6NNF4.3|YS047_HUMAN RecName: Full ( 738) 2685 592.4 1.6e-166 gi|109124102|ref|XP_001082377.1| PREDICTED: zinc f ( 674) 2681 591.5 2.7e-166 gi|110349778|ref|NP_066971.2| zinc finger protein ( 569) 2666 588.2 2.3e-165 >>gi|30173456|sp|Q8TF32.2|ZN431_HUMAN RecName: Full=Zinc (576 aa) initn: 4058 init1: 4058 opt: 4058 Z-score: 4756.2 bits: 890.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 4058; 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