# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ph00746.fasta.huge -Q ../query/KIAA1964.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1964, 757 aa vs ./tmplib.25089 library 1986748 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1192+/-0.00644; mu= 4.8961+/- 0.437 mean_var=167.5245+/-39.735, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.099091 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1092 ( 1154 res) hk04417 (1154) 1507 228.1 3.8e-60 KIAA0450 ( 1182 res) hj05822 (1182) 1080 167.1 9.1e-42 KIAA1069 ( 787 res) hj05486 ( 787) 761 121.3 3.7e-28 KIAA1516 ( 2304 res) fh10631s2 (2304) 595 98.0 1.1e-20 KIAA0581 ( 1218 res) pf10976 (1218) 505 84.9 5.2e-17 >>KIAA1092 ( 1154 res) hk04417 (1154 aa) initn: 1323 init1: 593 opt: 1507 Z-score: 1171.8 bits: 228.1 E(): 3.8e-60 Smith-Waterman score: 1622; 37.154% identity (66.930% similar) in 759 aa overlap (20-754:158-907) 10 20 30 40 KIAA19 PSPPTPSDGGTKRPGLRALKKMGLTEDEDVRAMLRGSRLRKIRSRTWHK ::.. . : . .:..::.:.:.:: . KIAA10 LPRRSSIIKDGTKQKRERKKTVSFSSMPTEKKISSASDC-INSMVEGSELKKVRSNSRIY 130 140 150 160 170 180 50 60 70 80 90 100 KIAA19 ERLYRLQEDGLSV-WFQRRIPRAPSQHIFFVQHIEAVREGHQSEGLRRFGGAFAPAR-C- .: . :. : :. : . . . . .. :. :: :.... .: : . .. : KIAA10 HRYFLLDADMQSLRWEPSK--KDSEKAKIDIKSIKEVRTGKNTDIFRSNGISDQISEDCA 190 200 210 220 230 240 110 120 130 140 150 160 KIAA19 LTIAFKGRRKNLDLAAPTAEEAQRWVRGLTKL----RARLDAM--SQRERLDHWIHSYLH ... . ..:::.: .:. :. :: :: : . :: . :: . :. ... KIAA10 FSVIYGENYESLDLVANSADVANIWVTGLRYLISYGKHTLDMLESSQDNMRTSWVSQMFS 250 260 270 280 290 300 170 180 190 200 210 KIAA19 RADSNQDSKMSFKEIKSLLRMVNVDMNDMYAYLLFKECDHSNNDRLEGAEI--EEFLR-- . : .. ..... . . .: .: .. : ::: :...:. :.:. :::.. KIAA10 EIDVDNLGHITLCNAVQCIRNLNPGLKTSKIELKFKEL-HKSKDK-AGTEVTKEEFIEVF 310 320 330 340 350 360 220 230 240 250 260 270 KIAA19 -RLLKRPELEEIFHQYSGEDRVLSAPELLEFLE-DQGEEGATLARAQQLIQTYELNETAK .: :::. .. :.:.. . :.. .:. ::: .:: . . ..:. :: .. .. KIAA10 HELCTRPEIYFLLVQFSSNKEFLDTKDLMMFLEAEQGVAHINEEISLEIIHKYEPSKEGQ 370 380 390 400 410 420 280 290 300 310 320 330 KIAA19 QHELMTLDGFMMYLLSPEGAALDNTHTCVFQDMNQPLAHYFISSSHNTYLTDSQIGGPSS .. ...::: ::.::. .: : : :::.:::.::::.::::::: ..:. :::. KIAA10 EKGWLSIDGFTNYLMSPDCYIFDPEHKKVCQDMKQPLSHYFINSSHNTYLIEDQFRGPSD 430 440 450 460 470 480 340 350 360 370 380 390 KIAA19 TEAYVRAFAQGCRCVELDCWEGPGGEPVIYHGHTLTSKILFRDVVQAVRDHAFTLSPYPV .:.::. .::: :::: :.:: .::::: :::.::.:.::.:.. . .:: : ::. KIAA10 ITGYIRALKMGCRSVELDVWDGPDNEPVIYTGHTMTSQIVFRSVIDIINKYAFFASEYPL 490 500 510 520 530 540 400 410 420 430 440 450 KIAA19 ILSLENHCGLEQQAAMARHLCTILGDMLVTQALDSPNPEE--LPSPEQLKGRVLVKGKKL :: :::::...:: .:..:. .::: : : ::: :: ::::. :::..:.:.::: KIAA10 ILCLENHCSIKQQKVMVQHMKKLLGDKLYTT---SPNVEESYLPSPDVLKGKILIKAKKL 550 560 570 580 590 460 470 480 490 500 510 KIAA19 PAARSE-DGRALSDREEEEEDDEEEEEEVEAAAQRRLAK-QISPELSALAVYCHATRLRT . : .: . .. : : ... .:..: . . . :. ::: :. :...... KIAA10 SSNCSGVEGDVTDEDEGAEMSQRMGKENMEQPNNVPVKRFQLCKELSELVSICKSVQFKE 600 610 620 630 640 650 520 530 540 550 560 570 KIAA19 LHPAPNAPQPCQVSSLSERKAKKLIREAGNSFVRHNARQLTRVYPLGLRMNSANYSPQEM .. . .. . .: :..: :.: : ..:: .: : :.::.: .:..:.:..::.. KIAA10 FQVSFQVQKYWEVCSFNEVLASKYANENPGDFVNYNKRFLARVFPSPMRIDSSNMNPQDF 660 670 680 690 700 710 580 590 600 610 620 KIAA19 WNSGCQLVALNFQTPGYEMDLNAGRFLVNGQCGYVLKPACLRQPDSTFDPE----YPGPP :. :::.::.:::::: :::: : : ::.:::::.:: .:. : :. . :: KIAA10 WKCGCQIVAMNFQTPGLMMDLNIGWFRQNGNCGYVLRPAIMREEVSFFSANTKDSVPGVS 720 730 740 750 760 770 630 640 650 660 670 680 KIAA19 RTTLSIQVLTAQQLPKLNAEKPHS-IVDPLVRIEIHGVPADCARQETDYVLNNGFNPRWG : :.....:..:: .. .. .::: : .::::.:::::.:.: : .:: : . KIAA10 PQLLHIKIISGQNFPKPKGSGAKGDVVDPYVYVEIHGIPADCAEQRTKTVHQNGDAPIFD 780 790 800 810 820 830 690 700 710 720 730 740 KIAA19 QTLQFQLRAPELALVRFVVEDYDATSPNDFVGQFTLPLSSLKQGYRHIHLLSKDGASLSP ....::. ::::.::::: : : . ..:.::.:.:. :. ::::. : : : :. KIAA10 ESFEFQINLPELAMVRFVVLDDDYIG-DEFIGQYTIPFECLQTGYRHVPLQSLTGEVLAH 840 850 860 870 880 890 750 KIAA19 ATLFIQIRIQRS :.::... : KIAA10 ASLFVHVAITNRRGGGKPHKRGLSVRKGKKSREYASLRTLWIKTVDEVFKNAQPPIRDAT 900 910 920 930 940 950 >>KIAA0450 ( 1182 res) hj05822 (1182 aa) initn: 1455 init1: 710 opt: 1080 Z-score: 841.7 bits: 167.1 E(): 9.1e-42 Smith-Waterman score: 1601; 35.649% identity (60.706% similar) in 878 aa overlap (3-754:51-907) 10 20 30 KIAA19 PSPPTPSDGGTKRPGLRALKKMGLTEDEDVR- ::. . : :: ::..:. : KIAA04 CPCSGWGSGDAGGQHRARCPSGRAGNWDWHPPAMEEPGP--PG-------GLSQDQVERC 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 KIAA19 --AMLRGSRLRKIRSRTWHKERLYRLQEDGLSV-WFQRRIPRAPSQHIFFVQHIEAVREG :: .: .. :.:. . :.: :.: . : : : . . .. :. : :: KIAA04 MGAMQEGMQMVKLRGGSKGLVRFYYLDEHRSCIRW---RPSRKNEKAKISIDSIQEVSEG 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 KIAA19 HQSEGLRRF-GGAFAPARCLTIAFKGRRKNLDLAAPTAEEAQRWVRGLTKLRARL---DA .::: ..:. :.: : :..: ..:..:::.. ..: :. :: :: : : . :. KIAA04 RQSEVFQRYPDGSFDPNCCFSIYHGSHRESLDLVSTSSEVARTWVTGLRYLMAGISDEDS 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 KIAA19 MSQRERL-DHWIHSYLHRADSNQDSKMSFKEIKSLLRMVNVDMNDMYAYLLFKECDHSNN ...:.: :.:... . .::.: :...:. :. .::. .::.. . . .:.: : ... KIAA04 LARRQRTRDQWLKQTFDEADKNGDGSLSIGEVLQLLHKLNVNLPRQRVKQMFREADTDDH 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 KIAA19 DRLEG-AEIEEFLRRLLKRPELEEIFHQYSGEDRVLSAPELLEFLE-DQGEEGATLARAQ . : :. : . . : .: .. ::.. :.: : .::. .: :.:: : KIAA04 QGTLGFEEFCAFYKMMSTRRDLYLLMLTYSNHKDHLDAASLQRFLQVEQKMAGVTLESCQ 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 KIAA19 QLIQTYELNETAKQHELMTLDGFMMYLLSPEGAALDNTHTCVFQDMNQPLAHYFISSSHN ..:. .: :.. :. .::: : :: : .. : : :::.:::.::::.:::: KIAA04 DIIEQFEPCPENKSKGLLGIDGFTNYTRSPAGDIFNPEHHHVHQDMTQPLSHYFITSSHN 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 KIAA19 TYLTDSQIGGPSSTEAYVRAFAQGCRCVELDCWEGPGGEPVIYHGHTLTSKILFRDVVQA :::. .:. . : .. :. .. ::::::.:::.:: :::...::.::::::::.::... KIAA04 TYLVGDQLMSQSRVDMYAWVLQAGCRCVEVDCWDGPDGEPIVHHGYTLTSKILFKDVIET 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 KIAA19 VRDHAFTLSPYPVILSLENHCGLEQQAAMARHLCTILGDMLVTQALDSPNPEELPSPEQL . .:: . ::::::.::::.. :: ::..: :::: : ....: . ::::..: KIAA04 INKYAFIKNEYPVILSIENHCSVIQQKKMAQYLTDILGDKLDLSSVSSEDATTLPSPQML 430 440 450 460 470 480 450 460 470 KIAA19 KGRVLVKGKKLPAARSEDGRA--LSDREEEEE-DDE------------------------ ::..::::::::: :::.. .::.. .: ::. KIAA04 KGKILVKGKKLPANISEDAEEGEVSDEDSADEIDDDCKLLNGDASTNRKRVENTAKRKLD 490 500 510 520 530 540 480 KIAA19 --------------------------------EEEEEVE----AAAQRR----------- . ::.:: :.:.:: KIAA04 SLIKESKIRDCEDPNNFSVSTLSPSGKLGRKSKAEEDVESGEDAGASRRNGRLVVGSFSR 550 560 570 580 590 600 490 500 510 KIAA19 -------LAK----------QISP--------------ELS-ALAVYCHATRLRTLHPAP : : : :: .:: ::. . :. . : KIAA04 RKKKGSKLKKAASVEEGDEGQDSPGGQSRGATRQKKTMKLSRALSDLVKYTKSVATHDIE 610 620 630 640 650 660 520 530 540 550 560 570 KIAA19 -NAPQPCQVSSLSERKAKKLIREAGNSFVRHNARQLTRVYPLGLRMNSANYSPQEMWNSG .: . ::::.:: ::...... ...: : .::.:.:: . :..:.::.:: .::.: KIAA04 MEAASSWQVSSFSETKAHQILQQKPAQYLRFNQQQLSRIYPSSYRVDSSNYNPQPFWNAG 670 680 690 700 710 720 580 590 600 610 620 630 KIAA19 CQLVALNFQTPGYEMDLNAGRFLVNGQCGYVLKPACLRQ----PDSTFDPEYPGPPRTTL ::.::::.:. : ..:: ..: .:: :::::::.:. : :.: :: :: . : KIAA04 CQMVALNYQSEGRMLQLNRAKFSANGGCGYVLKPGCMCQGVFNPNSE-DP-LPGQLKKQL 730 740 750 760 770 780 640 650 660 670 680 KIAA19 SIQVLTAQQLPK----LNAEKPHSIVDPLVRIEIHGVPADCARQETDYVLNNGFNPRWGQ ......::::: . ... . :.::.:..:: :.:.::.:..: : .::::: : . KIAA04 VLRIISGQQLPKPRDSMLGDRGE-IIDPFVEVEIIGLPVDCSREQTRVVDDNGFNPTWEE 790 800 810 820 830 840 690 700 710 720 730 740 KIAA19 TLQFQLRAPELALVRFVVEDYDATSPNDFVGQFTLPLSSLKQGYRHIHLLSKDGASLSPA :: :... ::.:::::.: :.: . ::.:: :: .::. ::::..: .: . : KIAA04 TLVFMVHMPEIALVRFLVWDHDPIG-RDFIGQRTLAFSSMMPGYRHVYL---EG--MEEA 850 860 870 880 890 750 KIAA19 TLFIQIRIQRS ..:... . KIAA04 SIFVHVAVSDISGKVKQALGLKGLFLRGPKPGSLDSHAAGRPPARPSVSQRILRRTASAP 900 910 920 930 940 950 >>KIAA1069 ( 787 res) hj05486 (787 aa) initn: 1424 init1: 703 opt: 761 Z-score: 597.5 bits: 121.3 E(): 3.7e-28 Smith-Waterman score: 1229; 34.977% identity (61.787% similar) in 649 aa overlap (223-754:1-640) 200 210 220 230 240 250 KIAA19 LLFKECDHSNNDRLEGAEIEEFLRRLLKRPELEEIFHQYSGEDRVLSAPELLEFLE-DQG .: .. .:: . :.. :: .::. .: KIAA10 DLYLLLLSYSDKKDHLTVEELAQFLKVEQK 10 20 30 260 270 280 290 300 310 KIAA19 EEGATLARAQQLIQTYELNETAKQHELMTLDGFMMYLLSPEGAALDNTHTCVFQDMNQPL ...: ..:. .:..: : .... ..:: .. :: .. : :.:::.::: KIAA10 MNNVTTDYCLDIIKKFEVSEENKVKNVLGIEGFTNFMRSPACDIFNPLHHEVYQDMDQPL 40 50 60 70 80 90 320 330 340 350 360 370 KIAA19 AHYFISSSHNTYLTDSQIGGPSSTEAYVRAFAQGCRCVELDCWEGPGGEPVIYHGHTLTS .:.:.:::::::: .:. . :... :.:.. .::::::.:::.:: ::::..::.:::: KIAA10 CNYYIASSHNTYLTGDQLLSQSKVDMYARVLQEGCRCVEVDCWDGPDGEPVVHHGYTLTS 100 110 120 130 140 150 380 390 400 410 420 430 KIAA19 KILFRDVVQAVRDHAFTLSPYPVILSLENHCGLEQQAAMARHLCTILGDMLVTQALDSPN ::::::::... :::. . .:::::.::::...:: .:..: :.:: : ...:. . KIAA10 KILFRDVVETINKHAFVKNEFPVILSIENHCSIQQQRKIAQYLKGIFGDKLDLSSVDTGE 160 170 180 190 200 210 440 450 460 470 KIAA19 PEELPSPEQLKGRVLVKGKKLPAARSEDGRA--LSDREEEEEDDEE-----------EEE ..::::..:::..:::::::: ..:.. .::.. .: ..: :. KIAA10 CKQLPSPQSLKGKILVKGKKLPYHLGDDAEEGEVSDEDSADEIEDECKFKLHYSNGTTEH 220 230 240 250 260 270 480 490 500 KIAA19 EVEAAAQRRLAK-----QI----------------------------SPELSALAVYCHA .::. ...: . :: ::... . :. KIAA10 QVESFIRKKLESLLKESQIRDKEDPDSFTVRALLKATHEGLNAHLKQSPDVKESGKKSHG 280 290 300 310 320 330 510 520 KIAA19 -------------TRLRTLHPAPNAPQPCQVS---------------------------- :. :. . . . : : KIAA10 RSLMTNFGKHKKTTKSRSKSYSTDDEEDTQQSTGKEGGQLYRLGRRRKTMKLCRELSDLV 340 350 360 370 380 390 530 540 550 560 KIAA19 ---------------------SLSERKAKKLIREAGNSFVRHNARQLTRVYPLGLRMNSA :.:: .:...... ...:. .: .::::.:: . :..:. KIAA10 VYTNSVAAQDIVDDGTTGNVLSFSETRAHQVVQQKSEQFMIYNQKQLTRIYPSAYRIDSS 400 410 420 430 440 450 570 580 590 600 610 620 KIAA19 NYSPQEMWNSGCQLVALNFQTPGYEMDLNAGRFLVNGQCGYVLKPACLRQPDSTFDP--- :..: .::.::::::::.:. : :.:: ..: .::.::::::: . . .::.: KIAA10 NFNPLPYWNAGCQLVALNYQSEGRMMQLNRAKFKANGNCGYVLKPQQMCK--GTFNPFSG 460 470 480 490 500 630 640 650 660 670 KIAA19 -EYPGPPRTTLSIQVLTAQQLPK----LNAEKPHSIVDPLVRIEIHGVPADCARQETDYV :. :. : ..:...::::: . ... . :.::.:..:: :.:.:: ...: : KIAA10 DPLPANPKKQLILKVISGQQLPKPPDSMFGDRGE-IIDPFVEVEIIGLPVDCCKDQTRVV 510 520 530 540 550 560 680 690 700 710 720 730 KIAA19 LNNGFNPRWGQTLQFQLRAPELALVRFVVEDYDATSPNDFVGQFTLPLSSLKQGYRHIHL .::::: : .:: : .. ::.:::::.: :.: . ::::: :. .::: ::::..: KIAA10 DDNGFNPVWEETLTFTVHMPEIALVRFLVWDHDPIG-RDFVGQRTVTFSSLVPGYRHVYL 570 580 590 600 610 620 740 750 KIAA19 LSKDGASLSPATLFIQIRIQRS .: :. :..:..: : KIAA10 ---EG--LTEASIFVHITINEIYGKWSPLILNPSYTILHFLGATKNRQLQGLKGLFNKNP 630 640 650 660 670 680 >>KIAA1516 ( 2304 res) fh10631s2 (2304 aa) initn: 1042 init1: 462 opt: 595 Z-score: 463.3 bits: 98.0 E(): 1.1e-20 Smith-Waterman score: 877; 30.468% identity (54.148% similar) in 663 aa overlap (242-753:1330-1988) 220 230 240 250 260 270 KIAA19 EEFLRRLLKRPELEEIFHQYSGEDRVLSAPELLEFLED-QGEEGATLARAQQLIQTYELN .: .:: . :::. : . ..:: .: . KIAA15 ISDAIAAASIVTNGTGIESTSLGIFGVGILQLNDFLVNCQGEH-CTYDEILSIIQKFEPS 1300 1310 1320 1330 1340 1350 280 290 300 310 320 KIAA19 ETAKQHELMTLDGFMMYLLSPEGAALDNTHTCV-FQDMNQPLAHYFISSSHNTYLTDSQI . .. ::...:: .:.. :. : : .. ..... ::..:.: :::::::: :. KIAA15 ISMCHQGLMSFEGFARFLMDKENFASKNDESQENIKELQLPLSYYYIESSHNTYLTGHQL 1360 1370 1380 1390 1400 1410 330 340 350 360 370 380 KIAA19 GGPSSTEAYVRAFAQGCRCVELDCWEGPGGEPVIYHGHTLTSKILFRDVVQAVRDHAFTL : ::.: : ... :::: ::::::.: : :.::::::::.:: :..::.:. :: KIAA15 KGESSVELYSQVLLQGCRSVELDCWDGDDGMPIIYHGHTLTTKIPFKEVVEAIDRSAFIN 1420 1430 1440 1450 1460 1470 390 400 410 420 430 440 KIAA19 SPYPVILSLENHCGLEQQAAMARHLCTILGDMLVTQAL---DSPNPEELPSPEQLKGRVL : :.:.:.::::.: :: ::. . :..:. :::. : : . ::::.::. .:: KIAA15 SDLPIIISIENHCSLPQQRKMAEIFKTVFGEKLVTKFLFETDFSDDPMLPSPDQLRKKVL 1480 1490 1500 1510 1520 1530 450 460 470 KIAA19 VKGKKLPAARSE-------------------DG-----RALSDREEEEEDDE-------- .:.::: : .. .: : ...:::.:.:: KIAA15 LKNKKLKAHQTPVDILKQKAHQLASMQVQAYNGGNANPRPANNEEEEDEEDEYDYDYESL 1540 1550 1560 1570 1580 1590 480 KIAA19 ---------------------EEEEEVEAAAQR--------------------------R : .::. .. . 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