# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh24556.fasta.nr -Q ../query/KIAA1948.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1948, 487 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7799738 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7532+/-0.000188; mu= 10.6176+/- 0.011 mean_var=75.1466+/-14.529, 0's: 34 Z-trim: 237 B-trim: 344 in 1/65 Lambda= 0.147952 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|74762511|sp|Q8N141.1|ZFP82_HUMAN RecName: Full= ( 532) 3246 703.0 4.7e-200 gi|22760718|dbj|BAC11308.1| unnamed protein produc ( 532) 3232 700.0 3.7e-199 gi|109124516|ref|XP_001112876.1| PREDICTED: simila ( 574) 3207 694.7 1.6e-197 gi|194215358|ref|XP_001494637.2| PREDICTED: simila (1539) 3041 659.7 1.5e-186 gi|194675164|ref|XP_001788291.1| PREDICTED: simila ( 548) 2990 648.4 1.3e-183 gi|81911355|sp|Q6P9Y7.1|ZFP82_MOUSE RecName: Full= ( 530) 2854 619.4 7.2e-175 gi|73947801|ref|XP_867605.1| PREDICTED: similar to ( 745) 2853 619.3 1.1e-174 gi|148692099|gb|EDL24046.1| zinc finger protein 82 (1357) 2850 618.9 2.5e-174 gi|149056371|gb|EDM07802.1| rCG54648 [Rattus norve ( 987) 2787 605.3 2.3e-170 gi|73947799|ref|XP_867596.1| PREDICTED: similar to (1751) 2712 589.6 2.2e-165 gi|73947797|ref|XP_867586.1| PREDICTED: similar to ( 939) 2546 553.9 6.7e-155 gi|154425583|gb|AAI51290.1| LOC100124429 protein [ ( 534) 2524 548.9 1.2e-153 gi|194215367|ref|XP_001493771.2| PREDICTED: simila ( 592) 2522 548.5 1.7e-153 gi|6686181|sp|Q9Y2G7.1|ZFP30_HUMAN RecName: Full=Z ( 519) 2386 519.5 8.4e-145 gi|75073966|sp|Q9BE27.1|ZFP30_MACFA RecName: Full= ( 519) 2384 519.0 1.1e-144 gi|148692112|gb|EDL24059.1| zinc finger protein 30 ( 486) 2381 518.4 1.7e-144 gi|148692113|gb|EDL24060.1| zinc finger protein 30 ( 548) 2381 518.4 1.8e-144 gi|114676933|ref|XP_001165552.1| PREDICTED: zinc f ( 518) 2380 518.2 2e-144 gi|114676931|ref|XP_001165619.1| PREDICTED: zinc f ( 519) 2380 518.2 2e-144 gi|66773972|sp|Q60585.2|ZFP30_MOUSE RecName: Full= ( 533) 2375 517.1 4.3e-144 gi|456269|emb|CAA82913.1| zinc finger protein 30 [ ( 548) 2375 517.1 4.4e-144 gi|149056388|gb|EDM07819.1| rCG54037 [Rattus norve ( 548) 2343 510.3 5e-142 gi|158259667|dbj|BAF85792.1| unnamed protein produ ( 533) 2331 507.7 2.9e-141 gi|20140808|sp|Q9HCL3.2|ZFP14_HUMAN RecName: Full= ( 533) 2331 507.7 2.9e-141 gi|114677086|ref|XP_512623.2| PREDICTED: zinc fing ( 660) 2331 507.8 3.4e-141 gi|194675168|ref|XP_001790692.1| PREDICTED: simila ( 621) 2325 506.5 7.9e-141 gi|73947805|ref|XP_867624.1| PREDICTED: similar to (1980) 2329 507.9 9.9e-141 gi|73947807|ref|XP_541674.2| PREDICTED: similar to (2872) 2329 508.0 1.3e-140 gi|73947795|ref|XP_853558.1| PREDICTED: similar to (1186) 2312 504.0 8.5e-140 gi|85681855|sp|P10755.2|ZFP14_MOUSE RecName: Full= ( 501) 2182 475.9 1e-131 gi|118764097|gb|AAI28773.1| LOC499124 protein [Rat ( 501) 2105 459.5 9.3e-127 gi|26337507|dbj|BAC32439.1| unnamed protein produc ( 457) 1947 425.7 1.2e-116 gi|149722053|ref|XP_001494018.1| PREDICTED: zinc f ( 688) 1930 422.2 2e-115 gi|109124478|ref|XP_001104516.1| PREDICTED: simila (1233) 1926 421.6 5.6e-115 gi|71153480|sp|Q8TAQ5.1|ZN420_HUMAN RecName: Full= ( 688) 1923 420.8 5.7e-115 gi|205831220|sp|A2VDQ7.1|ZN420_BOVIN RecName: Full ( 687) 1900 415.8 1.7e-113 gi|189442386|gb|AAI67809.1| Zinc finger protein 28 ( 679) 1894 414.6 4.2e-113 gi|119577637|gb|EAW57233.1| hCG39352 [Homo sapiens ( 655) 1888 413.3 9.8e-113 gi|209572708|sp|Q8N7M2.3|ZN283_HUMAN RecName: Full ( 679) 1888 413.3 1e-112 gi|114677624|ref|XP_524292.2| PREDICTED: hypotheti ( 651) 1880 411.6 3.2e-112 gi|194378412|dbj|BAG57956.1| unnamed protein produ ( 677) 1879 411.4 3.8e-112 gi|73948218|ref|XP_855213.1| PREDICTED: similar to ( 650) 1852 405.6 2e-110 gi|76634597|ref|XP_596152.2| PREDICTED: similar to ( 612) 1833 401.5 3.2e-109 gi|38258828|sp|Q95K52.1|ZN283_MACFA RecName: Full= ( 654) 1819 398.5 2.7e-108 gi|109125046|ref|XP_001107639.1| PREDICTED: zinc f ( 611) 1810 396.6 9.6e-108 gi|62901485|sp|Q6JLC9.1|ZN331_CANFA RecName: Full= ( 490) 1803 395.0 2.3e-107 gi|126324551|ref|XP_001367025.1| PREDICTED: simila ( 849) 1797 393.9 8.3e-107 gi|16552245|dbj|BAB71272.1| unnamed protein produc ( 536) 1790 392.3 1.7e-106 gi|114676858|ref|XP_512615.2| PREDICTED: zinc fing (1120) 1791 392.8 2.5e-106 gi|114676856|ref|XP_001163591.1| PREDICTED: zinc f (1238) 1791 392.8 2.6e-106 >>gi|74762511|sp|Q8N141.1|ZFP82_HUMAN RecName: Full=Zinc (532 aa) initn: 3246 init1: 3246 opt: 3246 Z-score: 3747.8 bits: 703.0 E(): 4.7e-200 Smith-Waterman score: 3246; 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