# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh24556.fasta.huge -Q ../query/KIAA1948.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1948, 487 aa vs ./tmplib.25089 library 1987018 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.8786+/-0.00538; mu= 18.7935+/- 0.367 mean_var=137.6098+/-37.076, 0's: 0 Z-trim: 77 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.109333 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 2386 388.4 6.5e-109 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 2331 379.7 2.7e-106 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 1618 267.6 2.3e-72 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 1583 262.0 1e-70 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 1579 261.5 1.7e-70 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 1566 259.5 7e-70 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 1543 255.3 6.6e-69 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 1534 254.1 2e-68 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 1524 252.5 5.7e-68 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 1520 252.1 1e-67 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 1519 252.1 1.2e-67 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 1481 245.7 6.4e-66 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 1476 244.8 1.1e-65 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 1470 244.0 2.1e-65 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 1470 244.1 2.3e-65 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 1455 241.8 1.2e-64 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 1448 240.6 2.5e-64 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 1446 240.2 2.9e-64 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 1440 239.2 5.5e-64 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 1425 237.2 3.5e-63 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 1409 234.3 1.7e-62 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 1403 233.3 3e-62 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 1387 230.7 1.7e-61 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 1355 225.8 6e-60 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 1314 219.4 5.5e-58 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 1307 218.5 1.3e-57 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 1236 207.0 2.7e-54 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 1237 207.5 2.8e-54 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 1209 202.6 4.7e-53 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 1202 201.7 1.1e-52 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 1172 196.8 2.7e-51 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 1137 191.6 1.5e-49 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 1066 180.3 3.3e-46 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 968 165.1 1.7e-41 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 921 157.7 3e-39 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 828 142.5 5.9e-35 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 738 128.2 1e-30 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 731 127.5 2.8e-30 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 654 114.7 9e-27 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 638 112.8 6.9e-26 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 631 111.6 1.5e-25 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 557 99.8 4.4e-22 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 558 100.7 5.7e-22 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 541 98.1 3.8e-21 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 538 97.1 4e-21 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 534 97.2 9.2e-21 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 489 89.5 9.1e-19 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 446 82.9 1.1e-16 KIAA0287 ( 1523 res) fg06332 (1523) 417 78.7 3.2e-15 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 406 76.2 7.3e-15 >>KIAA0961 ( 530 res) hj05830 (530 aa) initn: 2358 init1: 2358 opt: 2386 Z-score: 2047.2 bits: 388.4 E(): 6.5e-109 Smith-Waterman score: 2511; 76.754% identity (88.377% similar) in 456 aa overlap (31-485:89-529) 10 20 30 40 50 60 KIAA19 GLLLLSFISTLEMLLLLVKENSMCLLSCFILDLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKIME ::::..:.:::: .::::.::::::.:: KIAA09 CSISKPDVITLLEQGKEPWMVVRDEKRRWTLDLESRYDTKKLFQGKDIYEMNLSQWKVME 60 70 80 90 100 110 70 80 90 100 110 KIAA19 RIENHGLKGLILKNDWESTGKIEGQERPQEGYFSSV-KMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLH ::.. :: : :: :.: : .: : :::. .:.: ::. .:. : KIAA09 RIKSCGL---------------EEQESPHEVCFRQVTKTTSEKMPTYRKLTSLPLYQKSH 120 130 140 150 160 120 130 140 150 160 170 KIAA19 FVDKPYECKECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEK .::::: :::::::::::::::.::::::::::::::: :::: :::.::::.:...: KIAA09 NREKPYECGECGKAFRVRQQLTFHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQCAHLSRHQRIHTSDK 170 180 190 200 210 220 180 190 200 210 220 230 KIAA19 LYECKECGEAFICGADLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVC :::::.::. : ::.::::::..::::::::::::::::::::::.:::::::::::: : KIAA09 LYECKKCGKIFTCGSDLRVHQRIHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTGEKPYEC 230 240 250 260 270 280 240 250 260 270 280 290 KIAA19 KECGKAFRQYAHLTRHQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECG :::::::::::::::::.:: :.. :::::::.::::..:::.::::::::::::::::: KIAA09 KECGKAFRQYAHLTRHQRLNIAEKCYECKECGQAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYECKECG 290 300 310 320 330 340 300 310 320 330 340 350 KIAA19 KAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFS ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: ::.:::::::::::::: : : KIAA09 KAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYDCKECGKTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECQKFFR 350 360 370 380 390 400 360 370 380 390 400 410 KIAA19 RYSQLISHQSIHIGVKPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQK :::.:::::.:::: :::.::::::::::.::::::::::.::::.::::: :.::: .. 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KIAA16 CGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKL 320 330 340 350 360 370 190 200 210 220 230 240 KIAA19 FICGADLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQY : .. : : ..: :::::.:.:::::: ::..:..:: :::::::: :.::::.:: KIAA16 FTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYN 380 390 400 410 420 430 250 260 270 280 290 300 KIAA19 AHLTRHQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLT ..: ::........ :.:.:::::: :.: .:. .::: ::..:.::.:.: .::. KIAA16 SYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLA 440 450 460 470 480 490 310 320 330 340 350 360 KIAA19 LHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQS :.:::::::::.:.::::.:: : :. ::.:::::.: :: :.:.. :.: ::.. KIAA16 NHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRG 500 510 520 530 540 550 370 380 390 400 410 420 KIAA19 IHIGVKPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTG :: : ::: :.::::.: :::..: .: :::::::..::.:: :..::.::.:::: KIAA16 IHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTG 560 570 580 590 600 610 430 440 450 460 470 480 KIAA19 EKPFECKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI :::..:.:: :.:: :: : : :::.:::::.:.:: ::: .::.:: : :: KIAA16 EKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPY 620 630 640 650 660 670 KIAA16 KCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNE 680 690 700 710 720 730 >>KIAA1349 ( 752 res) fj00940 (752 aa) initn: 3092 init1: 1577 opt: 1583 Z-score: 1361.5 bits: 262.0 E(): 1e-70 Smith-Waterman score: 1588; 55.937% identity (78.628% similar) in 379 aa overlap (105-483:367-745) 80 90 100 110 120 130 KIAA19 DWESTGKIEGQERPQEGYFSSVKMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAF .:.. .:. : : : .:::::.:::::: KIAA13 GKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYECNECGKAF 340 350 360 370 380 390 140 150 160 170 180 190 KIAA19 RVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGA ..: :.:::::::::.:.::: :: . . :: :.:.:.::: :.: :::.::. .. KIAA13 NRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECGKAFMRSS 400 410 420 430 440 450 200 210 220 230 240 250 KIAA19 DLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTR .: .::..: :::: :.:::..::....::.::::::::::: : .: .:: ....: . KIAA13 SLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFTKMVNLKE 460 470 480 490 500 510 260 270 280 290 300 310 KIAA19 HQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRI :::.... . :.: .:::.: : : ::.. :::::::.:.:: ::: .:::.::: KIAA13 HQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQLTVHQRR 520 530 540 550 560 570 320 330 340 350 360 370 KIAA19 HTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGV :::::::.:.::::.:. . . :.: ::::::..:..: ::::.. .. ::.:: : KIAA13 HTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEHQKIHSGE 580 590 600 610 620 630 380 390 400 410 420 430 KIAA19 KPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFE ::: : :::::: : :: : : ::::: ::::::. ..::::: :::::.:.. KIAA13 KPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIHTGERPYK 640 650 660 670 680 690 440 450 460 470 480 KIAA19 CKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI :.:: :::: ::.. :::.:.:::::.:.:: ::::. : :: : .:: KIAA13 CEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRETQLI 700 710 720 730 740 750 >>KIAA0065 ( 848 res) ha00946 (848 aa) initn: 5930 init1: 1567 opt: 1579 Z-score: 1357.7 bits: 261.5 E(): 1.7e-70 Smith-Waterman score: 1579; 56.201% identity (76.253% similar) in 379 aa overlap (105-483:374-752) 80 90 100 110 120 130 KIAA19 DWESTGKIEGQERPQEGYFSSVKMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAF .. ... .: :::.: .::..:.:: ::: KIAA00 GNNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAF 350 360 370 380 390 400 140 150 160 170 180 190 KIAA19 RVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGA ...:: :.: ::::::.::.::: :: . . :: ::: :.::: :.:. ::..: . KIAA00 WDKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKS 410 420 430 440 450 460 200 210 220 230 240 250 KIAA19 DLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTR :: ::. : : ::::: ::::.::: ..: .::: ::::::. : ::::.: . ..::. KIAA00 DLTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQ 470 480 490 500 510 520 260 270 280 290 300 310 KIAA19 HQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRI ::... .:. :::. :::.: : : :. .::: ::::: ::::.: ....::.::: KIAA00 HQRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRT 530 540 550 560 570 580 320 330 340 350 360 370 KIAA19 HTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGV :::.::. : :::: ::. : :.: :::::::::.:: : : : : .:. : : KIAA00 HTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGE 590 600 610 620 630 640 380 390 400 410 420 430 KIAA19 KPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFE :::.:.:::::: ::::::: ::::::::::.:::::: .. : .:: :: :::.. KIAA00 KPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYK 650 660 670 680 690 700 440 450 460 470 480 KIAA19 CKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI :.:: :.: ..:.:: : : :.:::::::.:: : ::..: :: : . : KIAA00 CNECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNEC 710 720 730 740 750 760 KIAA00 GKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQ 770 780 790 800 810 820 >>KIAA1431 ( 891 res) fj00022 (891 aa) initn: 1458 init1: 1458 opt: 1566 Z-score: 1346.5 bits: 259.5 E(): 7e-70 Smith-Waterman score: 1601; 50.559% identity (73.154% similar) in 447 aa overlap (40-483:389-830) 10 20 30 40 50 60 KIAA19 TLEMLLLLVKENSMCLLSCFILDLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKIMERIENHGLKG : :: : . . ..:. .. :.. . KIAA14 RENWDSDYVFGRKLAVGQETQFRQEPITHNKTLSKERERTYNKSGRWSYLDDSEEKVHNR 360 370 380 390 400 410 70 80 90 100 110 120 KIAA19 LILKNDWESTGKIEGQERPQEGYFSSVKMP--SEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYEC .:: .:. :. : : ... :. .: ... . .:.: :::.: .:::.: KIAA14 DSIKNFQKSSVVIK-----QTGIYAGKKLFKCNECKKTFTQSSSLTVHQRIHTGEKPYKC 420 430 440 450 460 470 130 140 150 160 170 180 KIAA19 KECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRL-HSGEKLYECKEC .:::::: .... :.: :::.::::: ::: :: :.. : :: : :.::: ..: .: KIAA14 NECGKAFSDGSSFARHQRCHTGKKPYECIECGKAFIQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCIDC 480 490 500 510 520 530 190 200 210 220 230 240 KIAA19 GEAFICGADLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAF :.:: : :...: :::::.: : :.:: ..::.::::::::::: : : ::: KIAA14 GKAFSDHIGLNQHRRIHTGEKPYKCDVCHKSFRYGSSLTVHQRIHTGEKPYECDVCRKAF 540 550 560 570 580 590 250 260 270 280 290 300 KIAA19 RQYAHLTRHQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQ ..: ::.::...:... ..:::::::: . : : ..::::::.:: ::::.: . . KIAA14 SHHASLTQHQRVHSGEKPFKCKECGKAFRQNIHLASHLRIHTGEKPFECAECGKSFSISS 600 610 620 630 640 650 310 320 330 340 350 360 KIAA19 QLTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLIS ::. :::::::::::::: :.:.:.. :: :.. :::::::::::: ::::. ..::. KIAA14 QLATHQRIHTGEKPYECKVCSKAFTQKAHLAQHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQ 660 670 680 690 700 710 370 380 390 400 410 420 KIAA19 HQSIHIGVKPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSI :: .: : ::: : :::::: :. :::: .: :..::.: ::::::. ...: :. KIAA14 HQRVHTGEKPYKCMECGKAFGDNSSCTQHQRLHTGQRPYECIECGKAFKTKSSLICHRRS 720 730 740 750 760 770 430 440 450 460 470 480 KIAA19 HTGEKPFECKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVK ::::::.::. : ::: .:: : :::::.::::::::.:.: : .::..: ..: KIAA14 HTGEKPYECSVCGKAFSHRQSLSVHQRIHSGKKPYECKECRKTFIQIGHLNQHKRVHTGE 780 790 800 810 820 830 KIAA19 I KIAA14 RSYNYKKSRKVFRQTAHLAHHQRIHTGESSTCPSLPSTSNPVDLFPKFLWNPSSLPSP 840 850 860 870 880 890 >>KIAA1827 ( 469 res) fk01409 (469 aa) initn: 4386 init1: 1535 opt: 1543 Z-score: 1329.0 bits: 255.3 E(): 6.6e-69 Smith-Waterman score: 1543; 54.881% identity (76.253% similar) in 379 aa overlap (106-484:91-469) 80 90 100 110 120 130 KIAA19 WESTGKIEGQERPQEGYFSSVKMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAFR ... .... :::.: .:::.:.:: :.:: KIAA18 KVFSCSSKLVIHRRMHTGEKPYKCHECGKLFSSNSNLSQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFR 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 KIAA19 VRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGAD ..:. :.:::::::::.:.:: .: : :::.:::..:.::: : :..::..: . KIAA18 SSSKLAQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFNQIAHLVRHQKIHTGEKPYSCNKCGKVFSRHSY 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 KIAA19 LRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTRH : :: .: :::::.:.:::::: ::..: :: ::::.::: :::: :.: . :: : KIAA18 LAEHQTVHTGEKPYKCEECGKAFSVRSSLITHQLIHTGRKPYKCKECDKVFGRKCFLTSH 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 KIAA19 QKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRIH :.... .: : :..::: : : : :.: :: ::::.:..:: ::: ..:: : :: KIAA18 QRIHTRERPYGCSQCGKIFSQKSDLIRHRKTHTDEKPYKCNKCGTAFREFSDLTAHFLIH 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 KIAA19 TGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGVK .::::::::::::.: : :::::::::::.:..: :.::: :.:. ::.:: : : KIAA18 SGEKPYECKECGKVFRYKSSLTSHHRIHTGEKPYKCNRCGKVFSRSSNLVCHQKIHTGEK 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 KIAA19 PYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFEC :: :..:::.: : ::.:: :: ::.::.:..:::::: . :: : .::: .: :: KIAA18 PYKCNQCGKVFNQASYLTRHQIIHTGERPYRCSKCGKAFRGCSGLTAHLAIHTEKKSHEC 370 380 390 400 410 420 440 450 460 470 480 KIAA19 KECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI ::: : : .::: .: ::: :::::.: :.:.: ..: :..: ..:. KIAA18 KECGKIFTQKSSLTNHHRIHIGEKPYKCTLCSKVFSHNSDLAQHQRVHS 430 440 450 460 >>KIAA1947 ( 608 res) fh23660 (608 aa) initn: 5864 init1: 1524 opt: 1534 Z-score: 1320.5 bits: 254.1 E(): 2e-68 Smith-Waterman score: 1534; 49.161% identity (71.223% similar) in 417 aa overlap (67-483:108-522) 40 50 60 70 80 90 KIAA19 YETKKLSLENDIYEINLSQWKIMERIENHGLKGLILKNDWESTGKIEGQERPQEGYFSSV :. :.. :. .: : : : . KIAA19 RPSFVNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTHGVEAFQSGQNNYS 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 KIAA19 KMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECK : .:. .. ::..: ..::::.:::: :: ..: :.: ::::.::.:. KIAA19 CTQCGKDFCHQH--TLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCS 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 KIAA19 ECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGADLRVHQKMHIGEKPYECKECGK ::: :: ....::..:.::. :::.:::.::. . : ::..: .:: :.:::: KIAA19 ECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGK 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 KIAA19 AFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTRHQKLNSADRLYECKECGKAFLC :: ....:. ::.:::::.:: :.:::: : . : ::::.....: . : :::: :. KIAA19 AFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMD 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 KIAA19 GSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGYHL . : .:...:::::::::.:::: :: :. : ::..:::::::::.:::: : : KIAA19 SCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTL 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 KIAA19 ILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGVKPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQ :.:.:.:::::::::..: : : : :: .: : .::.:.:::: : : .:: KIAA19 IIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQ 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 KIAA19 SIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFECKECRKAFRLNSSLIQHLRIHS .: ::.:..:. :::.:: :. : :: :::::.:.::.:: : :: ::. :.: : : KIAA19 RVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHF 440 450 460 470 480 490 460 470 480 KIAA19 GEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI ::. .:: :: ..: :.::: .: :.: KIAA19 GERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKP 500 510 520 530 540 550 >>KIAA1473 ( 574 res) fj03262 (574 aa) initn: 1506 init1: 1506 opt: 1524 Z-score: 1312.1 bits: 252.5 E(): 5.7e-68 Smith-Waterman score: 1524; 49.203% identity (74.032% similar) in 439 aa overlap (52-483:104-542) 30 40 50 60 70 80 KIAA19 SMCLLSCFILDLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKIMERIENHGLKGLILKNDWESTGK : : :..: .. : ..: :.. .: . KIAA14 WNVKRHEMVAEPPVVCSYFARDLWPKQGKKNYFQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDE 80 90 100 110 120 130 90 100 110 120 130 KIAA19 IEGQERPQEGYFSSVKMPSEK-------VSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAF . ... .: . . ..: :. ..: .. . : : : ..:::: :.: KIAA14 CKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQCDKYVKVFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSF 140 150 160 170 180 190 140 150 160 170 180 190 KIAA19 RVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGA . ..:. :.:::.:::::.::::: :. .:..:. :.:.:.:.: :.:.:::.:: . KIAA14 CMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNETSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLS 200 210 220 230 240 250 200 210 220 230 240 250 KIAA19 DLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTR : .:. .: :.:::.:.:::::: ..:: :.::::::::: :.:::.:: : . :: KIAA14 HLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTA 260 270 280 290 300 310 260 270 280 290 300 310 KIAA19 HQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRI :. ...... :.:.:::::: .: : .:. .::::: :.:.:::::: ..:: :.:: KIAA14 HKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRI 320 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 370 KIAA19 HTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGV :.:::::.:.::::.:... : :.:::.::: :.:. : :::::.:.: .:. :: : KIAA14 HSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGE 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 430 KIAA19 KPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFE ::: :.:::::: : :::: :. :: :::::::.:::::: . :. :. :::::::.. KIAA14 KPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYK 440 450 460 470 480 490 440 450 460 470 480 KIAA19 CKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI .:: ::: .: : : ::.:::::.:.:: ::: . : :..: :: KIAA14 YEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESC 500 510 520 530 540 550 KIAA14 NNACDNIAKISKYKRNCAGEK 560 570 >>KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 (766 aa) initn: 4304 init1: 1520 opt: 1520 Z-score: 1307.8 bits: 252.1 E(): 1e-67 Smith-Waterman score: 1520; 52.770% identity (78.364% similar) in 379 aa overlap (105-483:298-676) 80 90 100 110 120 130 KIAA19 DWESTGKIEGQERPQEGYFSSVKMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAF .... .:.: :.::: .:::.:.:: ::: KIAA20 GKLFNQKRNLACHRRCHTGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAF 270 280 290 300 310 320 140 150 160 170 180 190 KIAA19 RVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGA . .. : :. ::: ::::.:.::: .::: . ::::.:::.::: :.:.:::..: . KIAA20 HFKSILERHRIIHTEEKPYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKS 330 340 350 360 370 380 200 210 220 230 240 250 KIAA19 DLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTR .: :...: :::::.:.::::.: ...:: :.:.::::::: :.:: ::. ... KIAA20 SLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAYSFRSNFEI 390 400 410 420 430 440 260 270 280 290 300 310 KIAA19 HQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRI :.:... : :.:.::::.: :.: :.. ::::.::.:.:: :::: ...: :.:: KIAA20 HRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECDKAFRFKSNLERHRRI 450 460 470 480 490 500 320 330 340 350 360 370 KIAA19 HTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGV :::::::.:.:::::::: .: :::.::::: :.:.:: :.:: :.: :. .: : KIAA20 HTGEKPYKCNECGKTFSRKSYLTCHHRLHTGEKAYKCNECSKTFSWKSSLTCHRRLHSGE 510 520 530 540 550 560 380 390 400 410 420 430 KIAA19 KPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFE ::: ::::::.: : .:. .: ::.::::.. ::. ....: .::.::: ..:.. KIAA20 KPYKCKECGKTFNQQLTLKRHRRLHSGENPYKCEDSDKAYSFKSNLEIHQKIHTEQNPYK 570 580 590 600 610 620 440 450 460 470 480 KIAA19 CKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI :.:: :.: .::: : :.:.:::::.:.:: :::: .:.: : .:: KIAA20 CNECGKTFSRTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFRVKSNLEGHRRIHTGEKPYKCNEC 630 640 650 660 670 680 KIAA20 GKTFSRKSYFVCHHRLHTGEKPYKCNECGKNFSQKSSLICHHRLHTGEKPYKCNECGKTF 690 700 710 720 730 740 487 residues in 1 query sequences 1987018 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:23:11 2008 done: Thu Dec 18 15:23:12 2008 Total Scan time: 0.440 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]