# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh23660.fasta.huge -Q ../query/KIAA1947.ptfa ./tmplib.25089 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1947, 608 aa
 vs ./tmplib.25089 library

1986897 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3825+/-0.00564; mu= 16.6869+/- 0.384
 mean_var=151.1812+/-39.738, 0's: 0 Z-trim: 77  B-trim: 15 in 1/39
 Lambda= 0.104310

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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KIAA1956  ( 680 res)   fk08713                     ( 680) 2010 315.2 1.1e-86
KIAA1349  ( 752 res)   fj00940                     ( 752) 1980 310.7 2.7e-85
KIAA0065  ( 848 res)   ha00946                     ( 848) 1932 303.6 4.3e-83
KIAA2033  ( 766 res)   ej00602s1                   ( 766) 1898 298.4 1.4e-81
KIAA1396  ( 551 res)   hj08221                     ( 551) 1878 295.1 9.8e-81
KIAA1982  ( 599 res)   fk06527(revised)            ( 599) 1868 293.7 2.9e-80
KIAA0798  ( 682 res)   hk06584                     ( 682) 1843 290.0 4.2e-79
KIAA1827  ( 469 res)   fk01409                     ( 469) 1812 285.1 8.9e-78
KIAA1852  ( 948 res)   fj01514                     ( 948) 1716 271.2 2.7e-73
KIAA1508  ( 573 res)   hk06576                     ( 573) 1691 267.0   3e-72
KIAA0326  ( 927 res)   hg00579                     ( 927) 1674 264.8 2.2e-71
KIAA1871  ( 821 res)   hj05256s1                   ( 821) 1671 264.3 2.8e-71
KIAA0628  ( 540 res)   hh01433                     ( 540) 1651 261.0 1.9e-70
KIAA0412  ( 720 res)   hg03242                     ( 720) 1626 257.4 2.9e-69
KIAA1431  ( 891 res)   fj00022                     ( 891) 1603 254.1 3.5e-68
KIAA1473  ( 574 res)   fj03262                     ( 574) 1560 247.3 2.5e-66
KIAA1829  ( 557 res)   hj00069                     ( 557) 1558 247.0 3.1e-66
KIAA1559  ( 544 res)   fh19195                     ( 544) 1550 245.8   7e-66
KIAA1710  ( 515 res)   fj18457                     ( 515) 1545 245.0 1.2e-65
KIAA0961  ( 530 res)   hj05830                     ( 530) 1544 244.8 1.3e-65
KIAA2007  ( 580 res)   fj01689                     ( 580) 1543 244.8 1.5e-65
KIAA1948  ( 487 res)   fh24556                     ( 487) 1534 243.3 3.6e-65
KIAA1969  ( 595 res)   fk06944                     ( 595) 1488 236.5 4.7e-63
KIAA2003  ( 460 res)   ah02593                     ( 460) 1473 234.0   2e-62
KIAA1588  ( 613 res)   fj08823                     ( 613) 1454 231.4 1.7e-61
KIAA1962  ( 746 res)   hm00158                     ( 746) 1405 224.2   3e-59
KIAA1615  ( 484 res)   fj13419                     ( 484) 1347 215.1   1e-56
KIAA0426  ( 613 res)   hh01274                     ( 613) 1347 215.3 1.2e-56
KIAA1874  ( 579 res)   hk07257s1                   ( 579) 1338 213.9 2.9e-56
KIAA1198  ( 553 res)   fg01911                     ( 553) 1333 213.1 4.8e-56
KIAA0972  ( 702 res)   hj06859                     ( 702) 1280 205.3 1.3e-53
KIAA1806  ( 481 res)   fk00438                     ( 481) 1226 196.9 3.2e-51
KIAA1141  ( 914 res)   hk01833                     ( 914) 1093 177.4 4.5e-45
KIAA1015  ( 841 res)   hk03609(revised)            ( 841) 1041 169.5 9.8e-43
KIAA1954  ( 468 res)   fk02322                     ( 468)  877 144.4   2e-35
KIAA1388  ( 599 res)   fj06552                     ( 599)  829 137.3 3.4e-33
KIAA0441  ( 702 res)   hh00601s1                   ( 702)  780 130.1   6e-31
KIAA1339  ( 409 res)   fj00071                     ( 409)  747 124.7 1.5e-29
KIAA1979  ( 309 res)   fj09511                     ( 309)  673 113.3 2.9e-26
KIAA1285  ( 785 res)   hh11563(revised)            ( 785)  665 112.9   1e-25
KIAA1951  ( 679 res)   fj05532                     ( 679)  657 111.5 2.2e-25
KIAA0924  ( 617 res)   hh02883                     ( 617)  637 108.5 1.7e-24
KIAA0557  ( 493 res)   hh01334                     ( 493)  606 103.6 3.9e-23
KIAA1703  ( 1165 res)   fj16891                    (1165)  571 99.0 2.2e-21
KIAA0236  ( 1696 res)   ha04654                    (1696)  531 93.3 1.7e-19
KIAA0478  ( 1253 res)   hh05955                    (1253)  527 92.5 2.3e-19
KIAA1675  ( 1286 res)   ae00102                    (1286)  488 86.6 1.3e-17
KIAA0287  ( 1523 res)   fg06332                    (1523)  453 81.5 5.6e-16
KIAA0296  ( 1838 res)   hf00260                    (1838)  435 78.9   4e-15


>>KIAA1611  ( 813 res)   fj12627                          (813 aa)
 initn: 2111 init1: 2111 opt: 2115  Z-score: 1732.7  bits: 331.1 E(): 2.2e-91
Smith-Waterman score: 2130;  54.191% identity (75.049% similar) in 513 aa overlap (95-607:254-751)

           70        80        90       100       110       120    
KIAA19 EHLREKLTRSDEGRPSFVNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTH
                                     : . :: :: .:.: .         ::  :
KIAA16 THRSKKYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTS---------HRRIH
           230       240       250       260                270    

          130       140       150       160       170       180    
KIAA19 GVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQR
             ::.. :.:..::: :  . .:  :: ::: :.::.: ::::.::.:: :  :.:
KIAA16 ------SGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRR
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          190       200       210       220       230       240    
KIAA19 NHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTR
        ::::.::::.::::::  . :.. :: :::::.:..:.:::: : ..:::..: :::: 
KIAA16 IHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTG
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          250       260       270       280       290       300    
KIAA19 PRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPF
        .:: :.:::::: ... :. :: :::::.:: :::::: : :.: : ::..:::::.:.
KIAA16 EKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPY
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          310       320       330       340       350       360    
KIAA19 YCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSE
        : :::: :    .:  :: .::: ::..::::.: :   : :  :...:::::::.:.:
KIAA16 KCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNE
      450       460       470       480       490       500        

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KIAA19 CGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKF
       ::: :   :.:  :: .:.:::::.: .::: :     :  :. .::::.::.:.:::: 
KIAA16 CGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKV
      510       520       530       540       550       560        

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KIAA19 FVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHN
       :...  :  : ::::::.:..:. ::..:  ::.:  :: :::::.::.: :::: ::::
KIAA16 FAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHN
      570       580       590       600       610       620        

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KIAA19 SNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLI
       :    ::: : ::. ..:.:::..::..:.:  :. .:: :. :::..::: : ..: : 
KIAA16 SYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLA
      630       640       650       660       670       680        

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KIAA19 SHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQK
       .:.:.:::::::.:.::::.:   :::  :. ::::..::.:.:::.::.::.:: .:..
KIAA16 NHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRR
      690       700       710       720       730       740        

                                                                   
KIAA19 VHTR                                                        
       .::                                                         
KIAA16 IHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTG
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>>KIAA1956  ( 680 res)   fk08713                          (680 aa)
 initn: 3095 init1: 1599 opt: 2010  Z-score: 1647.9  bits: 315.2 E(): 1.1e-86
Smith-Waterman score: 2312;  52.648% identity (74.960% similar) in 623 aa overlap (1-607:56-674)

                                             10         20         
KIAA19                               DEEAPSKQCVSVG-VSQVTTLKPALSTQKA
                                     :::::::. .:.  ::::.:   ..: .::
KIAA19 LSEVQRCLYHDVMLENWVLISSLGCWCGSEDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKA
          30        40        50        60        70        80     

      30        40        50                60             70      
KIAA19 QPCETCSSLLKDILHLAEHDGTHPKRT--------AKLYL-----HQKEHLREKLTRSDE
       . :: :...: ::::::.:.::: :.          :::      ::...: ::  ::. 
KIAA19 HSCEMCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLHRCEAWGNKLYDSSNRPHQNQYLGEKPYRSSV
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KIAA19 GRPSFVND-SVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQ-QQALHSGWKPHRDTHGVEAFQSGQN
        .  ::.  . :.....   .:.::::  .: :  :.: :.: : .   .    :: :..
KIAA19 EEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDT
         150       160       170       180       190       200     

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KIAA19 NYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKC
       .::: .: :    .:.. ..:.. ..:. : : :::: :   ... .::: :::.:::.:
KIAA19 HYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECY-CWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYEC
         210       220       230        240       250       260    

          200       210       220       230       240       250    
KIAA19 SECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECG
       .::::.:: : ..::::..:::.:::::.::::.: .:. :.::::.::  ::: :.:::
KIAA19 GECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECG
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KIAA19 KAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFM
       :.:  .. :. ::..::::::: :.:::: :  .. ::.::. ::.:::. : :::: : 
KIAA19 KSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFS
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KIAA19 DSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTST
       .. ::  :.:::: :.::::.:::: :  .. :  ::. ::::.::::.:::: :   ..
KIAA19 QKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGN
          390       400       410       420       430       440    

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KIAA19 LIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSH
       :: ::: ::::.:::: .: :.::    : .:::::.:::::::.:::: : ::  .. :
KIAA19 LIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVH
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KIAA19 QRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNH
       :::::::.::::: :::::    .:  :.:.:::::::::.:::: :...:. .::...:
KIAA19 QRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTH
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KIAA19 FGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEK
        .:: .:: :::. ::.   :..:..::: :: :.: .::: :   :. ..:.:.::  :
KIAA19 TAERPYECRECGKFFSS---LLEHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGK
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KIAA19 PYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQKVHTR     
       ::::::::: :  . :: .:::.:::::::.:::::. :...: :..::.:::      
KIAA19 PYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGKSFHRSSSLLRHQRVHTERSPYK
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>>KIAA1349  ( 752 res)   fj00940                          (752 aa)
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KIAA19                 DEEAPSKQCVSVGVSQVTTLKPALSTQKAQPCETCSSLLKDILH
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KIAA13 FTENLNLITDTHLGKIICKEMKGSKAIRQTSELTLGKKSNNKEKPYKCSTCEK-------
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KIAA19 LAEHDGTHPKRTAKLYLHQKEHLREKLTRSDE-GR----PSFVND--SVHLAKRNLTCMQ
        : :        . :  ::. : .::  . .: :.    ::....  ..: ...   : .
KIAA13 -AFH------YRSLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLSQHKKIHTGEKPYKCNE
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KIAA19 GGKDFTGDSDLQ-QQALHSGWKPHRDTHGVEAF------------QSGQNNYSCTQCGKD
        :: : ..:.:. .: .:.  ::.. .   ..:            :.:.. :.:..::: 
KIAA13 CGKAFIASSSLMVHQRIHTKEKPYQCNVCGKSFSQCARLNQHQRIQTGEKPYKCSECGKA
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KIAA19 FCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAF--S
       :  .  : .::. :. :.::.:..::: :: .: :  ::..:: :.::.:.::::.:  .
KIAA13 FSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEKPYQCNECGKSFKNT
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KIAA19 LKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAH
         .::  ::.:::::.:..:.:::::.  .: :. : : ::  .:: :.::::::   :.
KIAA13 TIFNV--HQRIHTGEKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYECNECGKAFNRIAN
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KIAA19 LVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIH
       .. ::.:::::.:: :::::: :.  : :  :...::::.:. : :::: :: : .::::
KIAA13 FTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECGKAFMRSSSLIIH
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KIAA19 QRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVH
       ::.:: :::: :::::. :: .: :  ::..:::::::.:..: . :    .:  ::..:
KIAA13 QRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFTKMVNLKEHQKIH
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KIAA19 TGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGER
       :: :::.:  ::: ::    :  :::.:.::.::.:.:: : :...  :  ::: ::::.
KIAA13 TGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQLTVHQRRHTGEK
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KIAA19 PFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFEC
       :..:. ::: :   : ..:::: ::::.:..:..::: : .  .  .:.. : ::. ..:
KIAA13 PYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEHQKIHSGEKPYKC
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KIAA19 TECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECG
         ::..: ..:.:  : ..:: :. : :..:::  .  : :  :.:.::::.::.: :::
KIAA13 DVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIHTGERPYKCEECG
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KIAA19 KVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQKVHTR     
       :.:: ::..  : :.::::.::.:.:::..: ..: :  ::..: :     
KIAA13 KAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRETQLI
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>>KIAA0065  ( 848 res)   ha00946                          (848 aa)
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KIAA19                        DEEAPSKQCVSVG-----VSQVTTLKPALSTQKAQPC
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KIAA00 NEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQCDSCGMSFNTVSELVISKINYLGKKSDEF
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KIAA19 ETCSSLLKDILHLAEHDGTHPK--RTAKLYLHQKEHLR-EKLTRSDEG------RPSFVN
       ..:..:: .: :   :   . .  .. .   :..: :. ::.   ...      . ....
KIAA00 NACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNRNTLSHHEETLQHEKIQTLEHNFEYSICQETLLE
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KIAA19 DSVHLAKRNLTCMQGGKDFT--GDS--DLQQQALHSGWKPHRDTH----GVEAFQS----
        .:  ...  .  ... :..  : .  : ..  .:.  .: ::.:      : :      
KIAA00 KAVFNTQKRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQ-ISPSRDNHYEFSDCEKFLCVKST
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KIAA19 -------GQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQR
              ....:.: . :..: ..  : . ::    :. .::.:::: :  .: : .:::
KIAA00 LSKPHGVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQR
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KIAA19 NHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTR
        :::..:..:.:: :::  : :...::. ::::.:.::.:::::: .:: :  ::: :: 
KIAA00 VHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTG
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KIAA19 PRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPF
        .:: :. :::.:  .. :. ::. ::: .:: : :::: :  .: :  ::..::::.::
KIAA00 EKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPF
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KIAA19 YCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSE
        : :::: : .. .:  :::.: :.: :::: ::: : ..: : ::: .::: ::::: :
KIAA00 ECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYE
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KIAA19 CGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKF
       ::: :   : : .:::.:::.::. : .::::: .  ::..: :.:.::.:::: ::::.
KIAA00 CGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKI
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KIAA19 FVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHN
       : ..  : .:.:.::::.:.::. :::.:  .: :  ::::: ::.::.:.:::: : :.
KIAA00 FYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHK
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KIAA19 SNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLI
       :  : :.:.:  :. ..:.:::. :  .: :: :.. :: :. :.:..:::::  .:.: 
KIAA00 SALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLT
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KIAA19 SHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQK
        :.:.:::::  .:.::::.:  .: : .:.: ::::.::.:. : ..:.:.:.:: ::.
KIAA00 VHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQR
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KIAA19 VHTR                                      
        :                                        
KIAA00 RHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYSHCGESPDDILNVQ
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>>KIAA2033  ( 766 res)   ej00602s1                        (766 aa)
 initn: 1897 init1: 1897 opt: 1898  Z-score: 1556.4  bits: 298.4 E(): 1.4e-81
Smith-Waterman score: 1940;  45.709% identity (72.329% similar) in 571 aa overlap (44-607:207-761)

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KIAA19 VSQVTTLKPALSTQKAQPCETCSSLLKDILHLAEHDGTHPKRTAKLYLHQKEHLREKLTR
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KIAA20 EEKIDNQVVKSIHDASLVSTAQRISCRPKTHISNNHGNNFWNSSLLTQKQEVHMREKSFQ
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KIAA19 SDEGRPSFVNDS-------VHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTHGV
        .:.  .:  .:       .::: .   :   :: :.     :.. :      ::  :  
KIAA20 CNESGKAFNYSSLLRKHQIIHLADK-YKCDVCGKLFN-----QKRNLAC----HRRCH--
        240       250       260        270                280      

        130       140       150       160       170       180      
KIAA19 EAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNH
           .:.: :.:..::: : .  .:  :...:: :.::.: :: : :...: : .:.  :
KIAA20 ----TGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIH
              290       300       310       320       330       340

        190       200       210       220       230       240      
KIAA19 TGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPR
       : :.::::.::::.:  :  ...:...::::.::.:.::::.: .:: :  :.:.::  .
KIAA20 TEEKPYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEK
              350       360       370       380       390       400

        250       260       270       280       290       300      
KIAA19 PYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYC
       :: :.::::.:  .. :. :...::::.:: :.:: : . . : .  :.:.:: .  . :
KIAA20 PYKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKC
              410       420       430       440       450       460

        310       320       330       340       350       360      
KIAA19 CECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECG
        :::: :  . .:  :.: ::::.::.:.:: : ::..:.: ::...:::::::.:.:::
KIAA20 NECGKTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECDKAFRFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNECG
              470       480       490       500       510       520

        370       380       390       400       410       420      
KIAA19 KFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFV
       : :   : :  :.:.::::: :.::.:.: : .  .:. :.:.::::.::.:.:::: : 
KIAA20 KTFSRKSYLTCHHRLHTGEKAYKCNECSKTFSWKSSLTCHRRLHSGEKPYKCKECGKTFN
              530       540       550       560       570       580

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KIAA19 DSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSN
       .. ::: :.:.:.:: :..:    :..  .:.:. ::.::: . ::.:.:::: : ..:.
KIAA20 QQLTLKRHRRLHSGENPYKCEDSDKAYSFKSNLEIHQKIHTEQNPYKCNECGKTFSRTSS
              590       600       610       620       630       640

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KIAA19 HIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISH
          ::: : ::. ..: :: ..:  .:.:  :...:: :. :::..::: :  .: .. :
KIAA20 LTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFRVKSNLEGHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYFVCH
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KIAA19 ERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQKVH
       .:.:::::::.:.:::: :  .:::: :.:.::::.::.:.:::..:.:.:.:  :...:
KIAA20 HRLHTGEKPYKCNECGKNFSQKSSLICHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSQKSNLTCHRRLH
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KIAA19 TR    
       :     
KIAA20 TGEKQV
             

>>KIAA1396  ( 551 res)   hj08221                          (551 aa)
 initn: 3362 init1: 1171 opt: 1878  Z-score: 1541.3  bits: 295.1 E(): 9.8e-81
Smith-Waterman score: 1878;  54.120% identity (78.396% similar) in 449 aa overlap (136-583:103-551)

         110       120       130       140       150       160     
KIAA19 SDLQQQALHSGWKPHRDTHGVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYE
                                     :. :.  :.: ..  ...:.:... .. ..
KIAA13 THKETITKETEFKYTKFGKCIHLENIEESIYNHTSDKKSFSKNSIVIKHKKVYVGKKLFK
             80        90       100       110       120       130  

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KIAA19 CSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSEC
       :.:: : : ..:.:  : : ::::.:: : ::::::. . ...::.. ::::. .::.::
KIAA13 CNECDKTFTHSSSLTVHFRIHTGEKPYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKLFECKEC
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KIAA19 GKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYF
        ::: .. ::.:::::::  .:: :.:: :::   :::. ::.:::::.:: :.:::: :
KIAA13 RKAFKQSEHLIQHQRIHTGEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAF
            200       210       220       230       240       250  

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KIAA19 MYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQR-VHTGEKPYECNECGKFFRYR
         .:.. :::. :::.::. : :::: :  . ..: : :  ::::::..: .::: :  .
KIAA13 SDGSSFARHQRCHTGKRPYECIECGKAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVH
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KIAA19 STLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLN
         :: :...:::::::.:. ::: : . :.  .:::.:::::::::. ::: : .  .:.
KIAA13 IGLILHRRIHTGEKPYKCDVCGKTFSSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLT
            320       330       340       350       360       370  

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KIAA19 RHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQR
       .::::::::.::::.:::: : ..  : :: :.::::.:.::. :::.::  : : ::::
KIAA13 QHQRVHSGEKPYECKECGKAFRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQR
            380       390       400       410       420       430  

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KIAA19 IHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTR
       :::::.:::: :::. :.. :.  .:...: ::. .::.:::..:::. .: .::..:: 
KIAA13 IHTGEKPYECIECGNAFKQRSHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTG
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KIAA19 ERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPY
       :. :::..::: : :::.  .:.:.:::..::.: ::::.:: . ::: :.: ::::.: 
KIAA13 EKPYKCTECGKAFSDSSSCAQHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP 
            500       510       520       530       540       550  

          590       600        
KIAA19 QCSECGRVFNQNSHLIQHQKVHTR

>>KIAA1982  ( 599 res)   fk06527(revised)                 (599 aa)
 initn: 1867 init1: 1867 opt: 1868  Z-score: 1532.9  bits: 293.7 E(): 2.9e-80
Smith-Waterman score: 1906;  45.234% identity (74.393% similar) in 535 aa overlap (86-607:2-536)

          60        70        80        90       100        110    
KIAA19 TAKLYLHQKEHLREKLTRSDEGRPSFVNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQ-QQALH
                                     .: ...  :: . :: :  ...:  .. .:
KIAA19                              RIHTGEKPYTCGECGKTFRQSANLYVHRRIH
                                            10        20        30 

          120                   130       140       150       160  
KIAA19 SGWKPHRDTHGVEAF------------QSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEER
       .: ::..     .::            ..:.. :.: .::: :  . .:  :..:::.:.
KIAA19 TGEKPYKCEDCGKAFGRYTALNQHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNSSTNLTAHKRIHTREK
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            170       180       190       200       210       220  
KIAA19 PYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYEC
       :: : . :. :  ...: .... :::..::::.::::::  . .. .:.:::::..::.:
KIAA19 PYTCEDRGRAFGLSTNLNEYKKIHTGDKPYKCKECGKAFIHSLHLNKHEKIHTGKKPYKC
             100       110       120       130       140       150 

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KIAA19 SECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECG
       ..:::..  .: . .:.::::  .:. : :::::: ... :. :..:::::.:: :. ::
KIAA19 KQCGKVITSSSSFAKHKRIHTGEKPFECLECGKAFTSSTTLTKHRRIHTGEKPYTCEVCG
             160       170       180       190       200       210 

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KIAA19 KYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFR
       : :  :. :  :...::::.:. : :::: : .: .: .:.:.:::::::.:.:::: : 
KIAA19 KAFRQSAILYVHRRIHTGEKPYTCEECGKTFRQSANLYVHRRIHTGEKPYKCEECGKAFG
             220       230       240       250       260       270 

            350       360       370       380       390       400  
KIAA19 YRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFT
         . : .:.:.::::: :.: :::: :.  . :  .....::::::.:..::: :     
KIAA19 RYTDLNQHKKIHTGEKLYKCEECGKDFVWYTDLNQQKKIYTGEKPYKCEECGKAFAPSTD
             280       290       300       310       320       330 

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KIAA19 LNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTH
       ::.: .. .::. :.: :::: :  : .:..:...::::.:..:  :::.:    .: ::
KIAA19 LNQHTKILTGEQSYKCEECGKAFGWSIALNQHKKIHTGEKPYKCEECGKAFSRSRNLTTH
             340       350       360       370       380       390 

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KIAA19 QRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVH
       .:.:: :.::.: . :. :  ..:  .... : :.. ..: :::.::.:.::: ::.:.:
KIAA19 RRVHTREKPYKCEDRGRSFGWSTNLNEYKKIHTGDKLYKCKECGKVFKQSSHLNRHEKIH
             400       410       420       430       440       450 

            530       540       550       560       570       580  
KIAA19 TRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGER
       : .. :::..::: . .::.. .:.:.::::::..: ::::.:  ...: :::::::::.
KIAA19 TGKKPYKCKECGKVITSSSSFAKHKRIHTGEKPFKCLECGKAFTSSTTLTKHRRIHTGEK
             460       470       480       490       500       510 

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KIAA19 PYQCSECGRVFNQNSHLIQHQKVHTR                                  
       :: : :::..: :.. :  :...::                                   
KIAA19 PYTCEECGKAFRQSAILYVHRRIHTGEKPYTCGECGKTFRQSANLYAHKKIHTGEKPYTC
             520       530       540       550       560       570 

>>KIAA0798  ( 682 res)   hk06584                          (682 aa)
 initn: 3401 init1: 1842 opt: 1843  Z-score: 1512.1  bits: 290.0 E(): 4.2e-79
Smith-Waterman score: 1872;  47.120% identity (70.855% similar) in 573 aa overlap (38-606:127-677)

        10        20        30        40          50        60     
KIAA19 QCVSVGVSQVTTLKPALSTQKAQPCETCSSLLKDILHLAEHD--GTHPKRTAKLYLHQKE
                                     .::.. .  ::.  :.  ..: .: : ...
KIAA07 WTMEDERHSRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHNAFGNTASQTKSLCLFREN
        100       110       120       130       140       150      

          70        80        90        100       110       120    
KIAA19 HLREKLTRSDEGRPSFVNDSVHLAKRNLTC-MQGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTH
       :   .:        . ..... :...: .: ....  :.::.   .. ::....   . .
KIAA07 HDTFEL------YIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDG---KSFLHGNYE---ELY
        160             170       180       190          200       

          130        140       150       160       170       180   
KIAA19 GVEAFQ-SGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQ
       ..  :. : . : . .: .:          ::. :  :. . :::::: :  .:.:  :.
KIAA07 SAAKFSVSTKANSTKSQVSK----------HQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHE
          210       220                 230       240       250    

           190       200       210       220       230       240   
KIAA19 RNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHT
       : ::::.:: :. :.:.:: :  . .::.::  :. . ::::::.:  ::.:..::: ::
KIAA07 RVHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHT
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KIAA19 RPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERP
         .::.:.::::.:  . .:. ::. ::::. : :.:::: :  .: :: ::..::::.:
KIAA07 GEKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKP
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KIAA19 FYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECS
       . : :::: :  .  .::::: ::::::: :::::: : ..: .:.::..::::::: ::
KIAA07 YICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICS
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KIAA19 ECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGK
       :::: :   :.::.::: :: :: : :..::: :     :  :::.:.::.:: ::::::
KIAA07 ECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGK
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KIAA19 FFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRH
        :  .  :  :::.::::.:..:: :::.:   : :  ::: ::::.:: :.:::: :  
KIAA07 GFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAF
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KIAA19 NSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTL
       .:: . :.:.: ::. : :.:::. :... .:: ::..::.:..  ::.::. :   . :
KIAA07 KSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETEL
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KIAA19 ISHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQ
         :..:::::::: :.:::: : ..: :: :.: ::::.:. :::: ..:... .:: ::
KIAA07 ALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQ
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KIAA19 KVHTR   
       ..:     
KIAA07 RTHNGNKP
          680  

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KIAA18                              STHASDNFDHAPLLPQEQKAHIREKAYKCNE
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KIAA19 CGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKA
        :..:: ...:  .:  :... :::::::::.:: . ..: :...::::.::.: :::: 
KIAA18 HGQVFRASASLT-NQVIHNADNPYKCSECGKVFSCSSKLVIHRRMHTGEKPYKCHECGKL
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KIAA19 FLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYS
       :  .:.: :::::::  .:: : :: :.: ....:. ::.:::::.:: :.:: : :   
KIAA18 FSSNSNLSQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFRSSSKLAQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFNQI
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KIAA19 SALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLI
       . :.::::.::::.:. : .::: :     :  :: ::::::::.:.:::: :  ::.::
KIAA18 AHLVRHQKIHTGEKPYSCNKCGKVFSRHSYLAEHQTVHTGEKPYKCEECGKAFSVRSSLI
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KIAA19 RHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQR
        :: .:::.:::.:.:: : :     :  :::.:: :.:: :..:::.:     : ::..
KIAA18 THQLIHTGRKPYKCKECDKVFGRKCFLTSHQRIHTRERPYGCSQCGKIFSQKSDLIRHRK
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KIAA19 VHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTG
       .:. :.::.:..::  : .   : .:  .:.::.:.::. ::: :: .:.: .:.:::::
KIAA18 THTDEKPYKCNKCGTAFREFSDLTAHFLIHSGEKPYECKECGKVFRYKSSLTSHHRIHTG
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KIAA19 ERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTY
       :.::.:..::: : ..:: . :.. : ::. ..:..::.::.: :.: ::: .:: :: :
KIAA18 EKPYKCNRCGKVFSRSSNLVCHQKIHTGEKPYKCNQCGKVFNQASYLTRHQIIHTGERPY
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KIAA19 KCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSE
       .:::::: :   : : .:  .:: .: .::.::::.:  .::: .:.::: ::.::.:. 
KIAA18 RCSKCGKAFRGCSGLTAHLAIHTEKKSHECKECGKIFTQKSSLTNHHRIHIGEKPYKCTL
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KIAA19 CGRVFNQNSHLIQHQKVHTR
       :..::..:: : :::.::. 
KIAA18 CSKVFSHNSDLAQHQRVHS 
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KIAA18 LSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKPDTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENN
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KIAA19 GKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTHGVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIH
         : :  ...:         : :       .:.:.: ..::.  :.: :   . .:. ::
KIAA18 DYDKTVYQSIQPIY------PAR-------IQTGDNLFKCTDAVKSFNHIIHFGDHKGIH
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KIAA19 TEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGER
       : :. :: .:: ..:  . .. .: : :.::  :. .:  . : .. . ..:::: : :.
KIAA18 TGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFS-SFMEHQKIGTVEK
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KIAA19 PYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGC
        :. .:  :.:   : : ::   .:  .::  .::: .:. ...:. :.: ::::.:: :
KIAA18 AYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKTHTGEKPYEC
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KIAA19 NECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECG
       ..::: :   ::: .:...::: .:. : .::: :  .  ::.:.:.::::::: :::::
KIAA18 DKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEKPYVCNECG
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KIAA19 KFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFR
       : : . : :: ::..::::::.::.:::: :  .: :: :.:.::::::..:..: : ::
KIAA18 KSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKCDECEKAFR
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KIAA19 YCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRST
          .:..:.:.::: .::.:.:::: :  :  : .:::.::::.:..:. :::.:: ::.
KIAA18 DYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFRERSA
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KIAA18 LTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHLVAH
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KIAA19 QKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIH
       ...:: :. :::..: . :  :: ::.:.:.:::::::.:.::::.:  .:::: : : :
KIAA18 RRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHLRNH
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KIAA19 TGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQKVHTR                              
       :::.::.:..: ..: .:: :: ::..:.                               
KIAA18 TGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQHQRNHSEEK
        890       900       910       920       930       940      




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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]