# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fk04595.fasta.huge -Q ../query/KIAA1937.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1937, 704 aa vs ./tmplib.25089 library 1986801 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6821+/-0.00946; mu= -20.1614+/- 0.636 mean_var=537.5329+/-128.128, 0's: 0 Z-trim: 31 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.055319 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0004 ( 1307 res) ha00065 (1307) 383 46.1 2.4e-05 KIAA0866 ( 1984 res) hk00546s1 (1984) 329 42.0 0.00063 KIAA1601 ( 690 res) fj10228 ( 690) 277 37.3 0.0057 >>KIAA0004 ( 1307 res) ha00065 (1307 aa) initn: 145 init1: 69 opt: 383 Z-score: 187.7 bits: 46.1 E(): 2.4e-05 Smith-Waterman score: 390; 24.133% identity (58.252% similar) in 721 aa overlap (15-696:547-1229) 10 20 30 40 KIAA19 VLGGLLLLGVAQLGLFLEEKLREHLAEKEKLNEERLEQEEKLKA : ...:...: . . ...:...::.:. 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