# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg00938.fasta.huge -Q ../query/KIAA1921.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1921, 545 aa vs ./tmplib.25089 library 1986960 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.9662+/-0.00487; mu= 18.9348+/- 0.332 mean_var=77.7029+/-18.238, 0's: 0 Z-trim: 19 B-trim: 9 in 1/39 Lambda= 0.145498 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1129 ( 625 res) hg04330 ( 625) 917 202.4 8.4e-53 KIAA0795 ( 465 res) hk06104 ( 465) 802 178.0 1.3e-45 KIAA1378 ( 628 res) fj04831s1 ( 628) 704 157.7 2.4e-39 KIAA0469 ( 559 res) hg01666 ( 559) 670 150.4 3.2e-37 KIAA1490 ( 749 res) fj08103 ( 749) 669 150.4 4.4e-37 KIAA1687 ( 728 res) fh26020 ( 728) 602 136.3 7.4e-33 KIAA0132 ( 637 res) ha01449s1 ( 637) 552 125.8 9.8e-30 KIAA1900 ( 582 res) fk07650 ( 582) 457 105.8 9.4e-24 KIAA1384 ( 652 res) fj06146 ( 652) 400 93.9 4e-20 KIAA1677 ( 521 res) fh18965 ( 521) 345 82.2 1.1e-16 KIAA1489 ( 511 res) fj07905 ( 511) 331 79.2 8e-16 KIAA1842 ( 526 res) fj22905s1 ( 526) 318 76.5 5.4e-15 KIAA1354 ( 632 res) fj01502 ( 632) 312 75.4 1.4e-14 KIAA1309 ( 639 res) fh10381 ( 639) 282 69.1 1.1e-12 KIAA1340 ( 441 res) fj00164 ( 441) 264 65.1 1.3e-11 KIAA0711 ( 661 res) hg00358 ( 661) 255 63.4 5.9e-11 KIAA0850 ( 644 res) hk05995 ( 644) 238 59.9 6.9e-10 KIAA1880 ( 642 res) ah02167 ( 642) 183 48.3 2e-06 KIAA0952 ( 539 res) hj05359 ( 539) 136 38.3 0.0017 >>KIAA1129 ( 625 res) hg04330 (625 aa) initn: 889 init1: 483 opt: 917 Z-score: 1039.8 bits: 202.4 E(): 8.4e-53 Smith-Waterman score: 917; 31.518% identity (66.342% similar) in 514 aa overlap (34-540:120-623) 10 20 30 40 50 60 KIAA19 AGRSSPVRKRHGGRRAGGKDTLVSVPRSVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFVY : ... .:.: ........: :....: KIAA11 VMIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIE--IKDVDGQTLSKLIDYIY 90 100 110 120 130 140 70 80 90 100 110 120 KIAA19 TGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYH :. . . :...:: ::: .:. . : .::..:: .::::. :.:.. :..: . KIAA11 TAEIEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQ 150 160 170 180 190 200 130 140 150 160 170 180 KIAA19 MAKAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRT .:.:.: : :::: ::.::.: :. . .:.:.:....:: :.:.::.::. . :: KIAA11 QANAYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRL 210 220 230 240 250 260 190 200 210 220 230 240 KIAA19 QYAAELLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLP-HARQEMQTP .. :.:. ::::.. .::...:..: :::....:.:.. :: .::.:: : ...: KIAA11 EHMAKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNP 270 280 290 300 310 320 250 260 270 280 290 300 KIAA19 RTRPRLSAGVAEVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVV ::.:: ... .:...:::. . ... .: :.. ....: .: :: : .:: KIAA11 RTKPRTPVSLPKVMIVVGGQ-----APKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELP-SRRCRAGVV 330 340 350 360 370 380 310 320 330 340 350 360 KIAA19 SAGDNIYLSGGMESGVTLADVWCYMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLG . ..: ::..... . : : .. :.:. .. : : .. : . .:..::. KIAA11 FMAGHVYAVGGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFD 390 400 410 420 430 440 370 380 390 400 410 420 KIAA19 VAGNVDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAA-GVLQSY . .. :: :. ::.: :::. :... : ::.:. :: . :.: .....: KIAA11 GSTGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQY 450 460 470 480 490 500 430 440 450 460 470 KIAA19 VPQTNTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFVFILGGAYA----RATTIYDPEKGNIKAGPNM : :: : .. . . : . .:.: .. :: . ... .::: .. : .: KIAA11 NPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADM 510 520 530 540 550 560 480 490 500 510 520 530 KIAA19 NHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNMEAYEPTTNTWTLLP-HMPCPVFRHGCV : :. .. ...: .:..:: .: . :...: :.:.:. ::::: .: : . KIAA11 NMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCN--LASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVA 570 580 590 600 610 540 KIAA19 VIKKYIQSG ::.: KIAA11 VIHKSL 620 >>KIAA0795 ( 465 res) hk06104 (465 aa) initn: 811 init1: 502 opt: 802 Z-score: 910.7 bits: 178.0 E(): 1.3e-45 Smith-Waterman score: 802; 32.104% identity (62.039% similar) in 461 aa overlap (76-528:1-450) 50 60 70 80 90 100 KIAA19 VLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASN .:: .:: .:.... .: .::...: .: KIAA07 SLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKN 10 20 30 110 120 130 140 150 160 KIAA19 CLGVLAMAEAMQCSELYHMAKAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEE :::: .::.:.:. :: :..: : : ::. .::.:.. .: . :: : ::.:.:: KIAA07 CLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEE 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 KIAA19 LVYETVIKWIKKDPATRTQYAAELLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNE :.:... :.. : : : :::. .:::. .:..: . :....:.. . :::::.: KIAA07 QVFEAALAWVRYDREQRGPYLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDE 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 KIAA19 AKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVAEVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKW :: ::..:. : .. . ::::: ...: .: ::: . .: :: .: ..: : : KIAA07 AKDYHLMPERRPHLPAFRTRPRCCTSIAGLIYAVGGLNSAG---DSLNVVEVFDPIANCW 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 KIAA19 ---YPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGGMESGVTLADVWCYMSLLDNWNLVSRMTVP :... : .:. .. .: ::... . :. : : :.:. :. :. KIAA07 ERCRPMTTA----RSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEAYNPETDTWTRVGSMNSK 210 220 230 240 250 260 350 360 370 380 390 400 KIAA19 RCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKI : ...: ::.::. :: .... :: :. :..: .:. . . .:..:: :.: KIAA07 RSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVETYSPETDKWTVVTSMSSNRSAAGVTVFEGRI 270 280 290 300 310 320 410 420 430 440 450 KIAA19 YVFGGVNEAGRAAGVLQSYVPQTNTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFVFILGG----AYA :: :: ... . . .. : .: :: . . :..:.. .:. :: .. KIAA07 YVSGG-HDGLQIFSSVEHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAASLGSKMFVCGGYDGSGFL 330 340 350 360 370 380 460 470 480 490 500 510 KIAA19 RATTIYDPEKGNIKAGPNMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPA-LGNMEAYEPTT . .:. . :. :. : :. :..::.:: .: . :...: :.: : KIAA07 SIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGY---DGQSNLSSVEMYDPET 390 400 410 420 430 520 530 540 KIAA19 NTWTLLPHMPCPVFRHGCVVIKKYIQSG . ::.. : : KIAA07 DCWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI 440 450 460 >>KIAA1378 ( 628 res) fj04831s1 (628 aa) initn: 679 init1: 396 opt: 704 Z-score: 798.2 bits: 157.7 E(): 2.4e-39 Smith-Waterman score: 704; 29.243% identity (62.577% similar) in 489 aa overlap (47-523:118-592) 20 30 40 50 60 70 KIAA19 RRAGGKDTLVSVPRSVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSANAKT . ....:..: :..:::.. :.. :.. KIAA13 CHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQP 90 100 110 120 130 140 80 90 100 110 120 130 KIAA19 LLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYHMAKAFALQIFPEV :: :: .: . ..: ... .. ::::.: :.::. . .:. :: .: . : :: KIAA13 LLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHFTEV 150 160 170 180 190 200 140 150 160 170 180 190 KIAA19 AAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQYAAELLAVVRLP . :...:.: . . .:...:: . :. ::...:::. .: .... : :: :::: KIAA13 VECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDETLAQVRLP 210 220 230 240 250 260 200 210 220 230 240 250 KIAA19 FIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHAR---QEMQTPRTRPRLSAGVA .. ..:..:: .:...:.. ::::..::. ::. .: . . :: :: .: KIAA13 LLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYSIRTTPR--KHTA 270 280 290 300 310 320 260 270 280 290 300 310 KIAA19 EVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGG :. :::: : :: . :.. ..:.:. . :. .:.:. ..: :: KIAA13 GVLFCVGGRGGSGDPFRS---IECYSINKNSWFFGPEMNSR-RRHVGVISVEGKVYAVGG 330 340 350 360 370 380 320 330 340 350 360 370 KIAA19 MESGVTLADVWCYMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLV-YDGKIYTLGGLGVAGNVDHVER ... :... . : ..: . . :.. : : .:. : ::..::: . ::: KIAA13 HDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKR-RGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVER 390 400 410 420 430 440 380 390 400 410 420 430 KIAA19 YDTITNQWEAVAPL--PKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVLQSYVPQTNTWSF :: ..:: .:::. :.. ...: : ...:. :: :.. . . .. : :. . : KIAA13 YDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALV--NHVYAVGG-NDGMASLSSVERYDPHLDKWIE 450 460 470 480 490 440 450 460 470 480 KIAA19 IESPMIDNKYAPAVT-LNGFVFILGG----AYARATTIYDPEKGNIKAGPNMNHSRQFCS .. : . . . .:. :.: ....:: . .. :::.... .. : . KIAA13 VKE-MGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVG 500 510 520 530 540 550 490 500 510 520 530 540 KIAA19 AVVLDGKIYATGGIVSSEGPA-LGNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHGCVVIKKYIQS ... :::.:.:: .: : :...::..:. : : :. KIAA13 IATVMGKIFAVGG---HNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCSCLTSQ 560 570 580 590 600 610 KIAA19 G KIAA13 IRDVGHGSNNVVDCM 620 >>KIAA0469 ( 559 res) hg01666 (559 aa) initn: 473 init1: 230 opt: 670 Z-score: 760.1 bits: 150.4 E(): 3.2e-37 Smith-Waterman score: 876; 34.590% identity (65.410% similar) in 451 aa overlap (35-479:86-520) 10 20 30 40 50 60 KIAA19 GRSSPVRKRHGGRRAGGKDTLVSVPRSVQDSGQGGREKLELV-LSNLQADVLELLLEFVY .:: . . : : : .. :.:.:::.: : KIAA04 DVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSY 60 70 80 90 100 110 70 80 90 100 110 120 KIAA19 TGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYH :: ..... ::. ::.::. .:: . ..: .::..:: .::: . .:::..:: : KIAA04 TGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLAS 120 130 140 150 160 170 130 140 150 160 170 180 KIAA19 MAKAFALQIFPEVAAQE-EILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATR :. : :. :..:.. : : ... .. :. .:.: . :: .:. ...:.. :: : KIAA04 AAQRFILRHVGELGAEQLERLPLAR--LLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRR 180 190 200 210 220 230 190 200 210 220 230 240 KIAA19 TQYAAELLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEM-QT . . .:: .:::::.. ::: :. : :. : :. ::. .. . :.. KIAA04 AAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVEAEPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPC 240 250 260 270 280 290 250 260 270 280 290 300 KIAA19 PRTRPRLSAGVAEVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSV :: ::: :.:.::..::::: . ::.: :.:::...: :: .: . .:. KIAA04 PRMRPRPSTGLAEILVLVGG---CDQDCDELVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSI 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 KIAA19 VSAGDNIYLSGGMESGVTLAD-VWCYMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGG :. :..::..:: . : : : :: : : ...: :. : : :.: : :: .:.... KIAA04 VALGNDIYVTGGSD-GSRLYDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAA 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 KIAA19 LGVAGNVDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVLQS : .:::: :..:::. :. . . ..:.: :..:..:.. ::. . :.: KIAA04 -------DSTERYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSL--AGKETMVMQC 410 420 430 440 450 460 430 440 450 460 470 KIAA19 YVPQTNTWSFIESPMIDN-KYAP-AVTLNGFVFILGGAYARATTIYDPEKGNIKAGPNMN : :.:. ::... .. ..:: ..::::..... :.. .:.: ... :.:: KIAA04 YDPDTDLWSLVDCGQLPPWSFAPKTATLNGLMYFVRDDSAEVD-VYNPTRNEWDKIPSMN 470 480 490 500 510 480 490 500 510 520 530 KIAA19 HSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHGCVVI . KIAA04 QVNFQAGQHWKHRLVLILQPKCHRDECLGSTAMMDGSHLN 520 530 540 550 >>KIAA1490 ( 749 res) fj08103 (749 aa) initn: 745 init1: 296 opt: 669 Z-score: 757.7 bits: 150.4 E(): 4.4e-37 Smith-Waterman score: 778; 29.608% identity (61.569% similar) in 510 aa overlap (44-540:253-747) 20 30 40 50 60 70 KIAA19 HGGRRAGGKDTLVSVPRSVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSAN :. . ... ..: :..:.::: : . . KIAA14 KIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDT 230 240 250 260 270 280 80 90 100 110 120 130 KIAA19 AKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYHMAKAFALQIF ..:: :: .:. .:: :: : : :::::. :.:.:. : ::...:...... . KIAA14 IENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENI 290 300 310 320 330 340 140 150 160 170 180 190 KIAA19 PEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQYAAELLAVV :: ..:.: . ... ...:..:. :: ...... :.: : .: . . ::: . KIAA14 MEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFI 350 360 370 380 390 400 200 210 220 230 240 250 KIAA19 RLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVA :::.. :. : .. .:. :.:.. :. :. :: .::.::. : ::.:::.:: :. . KIAA14 RLPLLPPQILADL-ENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKST--V 410 420 430 440 450 260 270 280 290 300 310 KIAA19 EVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGG .. ::: . .... ... .. ..: : :.. : :.:. :.... :: KIAA14 GTLYAVGGMD----NNKGATTIEKYDLRTNLWIQ-AGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGG 460 470 480 490 500 510 320 330 340 350 360 370 KIAA19 MESGVTLADVWCYMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVERY .. :: : :: .:... :.. : . : .: ::..:: . .. :::. KIAA14 RDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERW 520 530 540 550 560 570 380 390 400 410 420 430 KIAA19 DTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVLQSYVPQTNTWSFIES : ..:: :: . : ...... .::.: :: ... . .. : :.:: :. . . KIAA14 DPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGG-RDGSSCLSSMEYYDPHTNKWN-MCA 580 590 600 610 620 630 440 450 460 470 480 KIAA19 PMIDNKYAPAV-TLNGFVFILGGAYARATTI----------YDPEKGNIKAGPNMNHSRQ :: . . .: : .::.. .:: : :.. :::. . .. :. KIAA14 PMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRD 640 650 660 670 680 690 490 500 510 520 530 540 KIAA19 FCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPA-LGNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHG-CVVIKK .. .: ..::.:: .: . :..::.:.: :: :: . . . : : :::. : KIAA14 AVGVCLLGDRLYAVGGY---DGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASL--NIGRAGACVVVIK 700 710 720 730 740 KIAA19 YIQSG KIAA14 QP >>KIAA1687 ( 728 res) fh26020 (728 aa) initn: 529 init1: 293 opt: 602 Z-score: 681.8 bits: 136.3 E(): 7.4e-33 Smith-Waterman score: 716; 27.451% identity (61.569% similar) in 510 aa overlap (44-540:232-726) 20 30 40 50 60 70 KIAA19 HGGRRAGGKDTLVSVPRSVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSAN :. . ... ..:. :....::: : . . KIAA16 RIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDT 210 220 230 240 250 260 80 90 100 110 120 130 KIAA19 AKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYHMAKAFALQIF ..:: :: .:. :: .:: ::: :::::. ....:. :.:: ..:. .... : KIAA16 IESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHF 270 280 290 300 310 320 140 150 160 170 180 190 KIAA19 PEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQYAAELLAVV :: ..:.: . ... . .:..:. :: .......:. .: .: . ::. . KIAA16 IEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYI 330 340 350 360 370 380 200 210 220 230 240 250 KIAA19 RLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVA :::.. :. :: ... .. .. :. :. :: .::.::. :. ::.:::.:: :. . KIAA16 RLPLLPPQ-LLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKST--V 390 400 410 420 430 260 270 280 290 300 310 KIAA19 EVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGG .. ::: : .: .. ... .. ..:.: .... : :.:. ...:. :: KIAA16 GALYAVGG--MDAM--KGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGR-RLQFGVAVIDNKLYVVGG 440 450 460 470 480 490 320 330 340 350 360 370 KIAA19 MESGVTLADVWCYMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVERY .. :: : :. . :... :.. : . . .: .:..:: . .. :::. KIAA16 RDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERW 500 510 520 530 540 550 380 390 400 410 420 430 KIAA19 DTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVLQSYVPQTNTWSFIES : ::. :: . ...... ..:.:..:: ... .. . :.:: :: . . KIAA16 DPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGG-RDGSSCLKSMEYFDPHTNKWS-LCA 560 570 580 590 600 610 440 450 460 470 480 KIAA19 PMIDNKYAPAV-TLNGFVFILGGAYARATTI----------YDPEKGNIKAGPNMNHSRQ :: . . .: : :::....:: : :.. :::. . .. .. :. KIAA16 PMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRD 620 630 640 650 660 670 490 500 510 520 530 540 KIAA19 FCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPA-LGNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHG-CVVIKK .. : :.:..:: .: . :...:.:. : : ..: . : : :::. : KIAA16 AVAVCPLGDKLYVVGGY---DGHTYLNTVESYDAQRNEWK--EEVPVNIGRAGACVVVVK 680 690 700 710 720 KIAA19 YIQSG KIAA16 LP >>KIAA0132 ( 637 res) ha01449s1 (637 aa) initn: 507 init1: 302 opt: 552 Z-score: 625.7 bits: 125.8 E(): 9.8e-30 Smith-Waterman score: 663; 28.287% identity (59.163% similar) in 502 aa overlap (38-526:127-610) 10 20 30 40 50 60 KIAA19 SPVRKRHGGRRAGGKDTLVSVPRSVQDSGQGGREK-LELV-LSNLQADVLELLLEFVYTG : ::. .:.: . ... :.: :.::.::. KIAA01 KYQDAPAAQFMAHKVVLASSSPVFKAMFTNGLREQGMEVVSIEGIHPKVMERLIEFAYTA 100 110 120 130 140 150 70 80 90 100 110 120 KIAA19 SLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYHMA :. . . ....: .:. . ..: .:: .:: :: .:. .:: . : ::.. : KIAA01 SISMGEKCVLHVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLDPSNAIGIANFAEQIGCVELHQRA 160 170 180 190 200 210 130 140 150 160 170 180 KIAA19 KAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQY . . . : ::: :::....:. .... .: :.::.. : :... :.:.: : : : KIAA01 REYIYMHFGEVAKQEEFFNLSHCQLVTLISRDDLNVRCESEVFHACINWVKYDCEQRRFY 220 230 240 250 260 270 190 200 210 220 230 240 KIAA19 AAELLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTR . :: .:: . :..: ... :...:. :.: . .: .. : . . : KIAA01 VQALLRAVRCHSLTPNFLQMQLQKCEILQSDSRCKDYL--VKIFEELTLHKPTQVMPCRA 280 290 300 310 320 330 250 260 270 280 290 300 KIAA19 PRLSAGVAEVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAG :. :...: .:: . ..:: . .::... : ::.: : .. .: KIAA01 PK----VGRLIYTAGG-----YFRQSLSYLEAYNPSDGTWLRLADLQV-PRSGLAGCVVG 340 350 360 370 380 310 320 330 340 350 360 KIAA19 DNIYLSGGMES---GVTLADVW-CYMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGL .: :: .. : : ... :: . ..:. . :.::: : . : ::.::..:: KIAA01 GLLYAVGGRNNSPDGNTDSSALDCYNPMTNQWSPCAPMSVPRNRIGVGVIDGHIYAVGG- 390 400 410 420 430 440 370 380 390 400 410 KIAA19 GVAGNVDH--VERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVLQ : . : ::::. ..:. :::. .....: . .:. :: . ..: .. . KIAA01 -SHGCIHHNSVERYEPERDEWHLVAPMLTRRIGVGVAVLNRLLYAVGGFDGTNRLNSA-E 450 460 470 480 490 500 420 430 440 450 460 470 KIAA19 SYVPQTNTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFVFILGGAYAR----ATTIYDPEKGNIKAGP : :. : : .: . . : . .:.. .. :: .. .. :: : . KIAA01 CYYPERNEWRMITAMNTIRSGAGVCVLHNCIYAAGGYDGQDQLNSVERYDVETETWTFVA 510 520 530 540 550 560 480 490 500 510 520 530 KIAA19 NMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPA-LGNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHG :.: :. . .: .:.::. :: .: . : ..: :.: :.::. . .: KIAA01 PMKHRRSALGITVHQGRIYVLGGY---DGHTFLDSVECYDPDTDTWSEVTRMTSGRSGVG 570 580 590 600 610 540 KIAA19 CVVIKKYIQSG KIAA01 VAVTMEPCRKQIDQQNCTC 620 630 >>KIAA1900 ( 582 res) fk07650 (582 aa) initn: 292 init1: 138 opt: 457 Z-score: 518.3 bits: 105.8 E(): 9.4e-24 Smith-Waterman score: 462; 24.742% identity (57.526% similar) in 485 aa overlap (44-498:44-516) 20 30 40 50 60 70 KIAA19 HGGRRAGGKDTLVSVPRSVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSAN :. : .. . :. :::.:::..... . KIAA19 KFHAHKAVLAACSDYFRAMFSLCMVESGADEVNLHGVTSLGLKQALEFAYTGQILLEPGV 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 KIAA19 AKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYHMAKAFALQIF . .: :.:..:. . ..: .: ..:.. : : . .:. .. . : . . : .. . KIAA19 IQDVLAAGSHLQLLELLNLCSHYLIQELNSFNYLDLYRLADLFNLTLLEKAVIDFLVKHL 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 KIAA19 PEV--AAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQYAAELLA :. . ::.:.. . ...: :.. .:: ... ...:.... . :: ::: KIAA19 SELLKSRPEEVLTLPYCLLQEVLKSDRLTSLSEEQIWQLAVRWLEHN--CHYQYMDELLQ 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 KIAA19 VVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAG .:. .. . : .:. .. :...::. ::::: .::. .:. :: ::.::... KIAA19 YIRFGLMDVDTLHTVALSHPLVQASETATALVNEALEYHQSIYAQPVWQTRRTKPRFQS- 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 KIAA19 VAEVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNP--QNN-------KWYPLASLPFYDREFFSVV ... ..::.. . : .:: :.: .: :: .: : :. KIAA19 --DTLYIIGGKKREVCKVKEL---RYFNPVDQENALIAAIANWSELAPMPV-GRSHHCVA 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 KIAA19 SAGDNIYLSGG---MESGVTLA-DVWC-YMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLV--YDGKI :: ....:: :: : : . : : ..: .. : ::.. .. .. . KIAA19 VMGDFLFVAGGEVEHASGRTCAVRTACRYDPRSNSWAEIAPM--KNCREHFVLGAMEEYL 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 KIAA19 YTLGGLGVAGNV-DHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRA :..:: . .: :::: :.: : . ... :. : : ... :::..... KIAA19 YAVGGRNELRQVLPTVERYCPKKNKWTFVQSFDRSLSCHAGYVADGLLWISGGVTNTAQY 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 KIAA19 AGVLQSYVPQTNTWSFIESPMIDNK-YAPAVTLNGFVFILGGA---------YARATTIY . :. : :. : : . .:::.. . : .... ...::: .: : KIAA19 QNRLMVYEPNQNKW-ISRSPMLQRRVYHSMAAVQRKLYVLGGNDLDYNNDRILVRHIDSY 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 KIAA19 DPEKGN-IKAGPNMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNMEAYEPTTNTWTLL . . . . . :. ... ...: .:.:: .:: KIAA19 NIDTDQWTRCNFNLLTGQNESGVAVHNGRIYLVGGYSIWTNEPLACIQVLDVSREGKEEV 490 500 510 520 530 540 530 540 KIAA19 PHMPCPVFRHGCVVIKKYIQSG KIAA19 FYGPTLPFASNGIAACFLPAPYFTCPNLQTLQVPHHRIGTI 550 560 570 580 >>KIAA1384 ( 652 res) fj06146 (652 aa) initn: 351 init1: 149 opt: 400 Z-score: 453.1 bits: 93.9 E(): 4e-20 Smith-Waterman score: 514; 24.270% identity (55.839% similar) in 548 aa overlap (9-538:123-642) 10 20 30 KIAA19 PRCAGRSSPVRKRHGGRRAGGKDTLVSVPRSVQDSGQG : ... : .. : :.. ::.... 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KIAA13 LPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQSVDFMRTD 260 270 280 290 300 310 220 230 240 250 260 270 KIAA19 EACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVAEVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVT .:. :. .: ::..: .. :. .: : . ....:::: : . : KIAA13 PVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSNK---KMLLLVGGLPP-GPDRLPSNLVQ 320 330 340 350 360 280 290 300 310 320 330 KIAA19 CWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGGME----SGVTLAD-VWCYMSLLD .. ... : :. .: :. :: . . ... :: . .: .. : : .. KIAA13 YYDDEKKTWKILTIMP-YNSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHSTNFVSRYDPRFN 370 380 390 400 410 420 340 350 360 370 380 390 KIAA19 NWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVH .: . : : . : ..:..:: . .: .. :: :. ::.:. :. ::. . KIAA13 SWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNETGYLSSVECYNLETNEWRYVSSLPQPLA 430 440 450 460 470 480 400 410 420 430 440 450 KIAA19 SAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVLQSYVPQTNTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFVF . :..: .::::. :::.. :. . : : : ..:. .. ...: .. KIAA13 AHAGAVHNGKIYISGGVHN-GEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKRAIHTLAVMNDRLY 490 500 510 520 530 540 460 470 480 490 500 KIAA19 ILGGAYARATT--------IYDP--EKGNIKAGPNMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVS .:: . .. . ::: .. :: : .. .:. . .::: .:: .:: KIAA13 AIGGNHLKGFSHLDVMLVECYDPKGDQWNILQTPILE-GRSGPGCAVLDDSIYLVGGYSW 550 560 570 580 590 600 510 520 530 540 KIAA19 SEGPALGNMEAYEPTTNTWTLLP-HMPCPVFRHGCVVIKKYIQSG : : .. : : .::: : . :. .::.. KIAA13 SMGAYKSSTICYCPEKGTWTELEGDVAEPLAGPACVTVILPSCVPYNK 610 620 630 640 650 >>KIAA1677 ( 521 res) fh18965 (521 aa) initn: 279 init1: 121 opt: 345 Z-score: 391.8 bits: 82.2 E(): 1.1e-16 Smith-Waterman score: 426; 23.077% identity (52.663% similar) in 507 aa overlap (58-528:2-497) 30 40 50 60 70 80 KIAA19 VPRSVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFH .:.:.: :.. .. ... .:.:: :. 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KIAA16 VNSKILLLKKPRVWWELEGPQVPLR--P----DCLAIVN--NFVFLLGGEELGPDGEFHA 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 KIAA19 LADVWCYMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVERYDTITNQ . :. : ..: .. :.::: . : ::...: . .:::: ... KIAA16 SSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDK 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 KIAA19 WEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVL------QSYVPQ--------T :: : : : .. .:: ..:... ::.. .. . : .. . : : KIAA16 WEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVT 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 KIAA19 NTWSFIESPMIDNK-YAPAVTLNGFVFILGGAYA--RA---------TTIYDPEKGNIKA : : .: : . . .. :: ....::. . :: : .:.:: . KIAA16 NCWE-NKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPETDQWTI 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 KIAA19 GPNMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNMEAYEPTTNTWTL--LPHMPCPVF .: .:. ...::: .:.. ::. . : .. ...: : : :.::: KIAA16 LASMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYN-GHYSDSILTFDPDENKWKEDEYPRMPCKLD 450 460 470 480 490 500 540 KIAA19 RHGCVVIKKYIQSG KIAA16 GLQVCNLHFPDYVLDEVRRCN 510 520 545 residues in 1 query sequences 1986960 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:22:11 2008 done: Thu Dec 18 15:22:12 2008 Total Scan time: 0.470 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]