# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh03635.fasta.huge -Q ../query/KIAA1901.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1901, 1265 aa vs ./tmplib.25089 library 1986240 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3245+/-0.00754; mu= -0.1902+/- 0.507 mean_var=251.5128+/-61.242, 0's: 0 Z-trim: 51 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.080871 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 754 102.4 3.9e-22 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 563 80.2 2.4e-15 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 468 68.8 3.4e-12 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 455 67.1 7.4e-12 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 457 67.8 1.1e-11 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 459 68.1 1.1e-11 KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) ( 608) 450 66.7 1.3e-11 KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626) 458 68.1 1.3e-11 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 446 66.2 1.7e-11 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 448 66.8 2.4e-11 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 444 66.1 2.5e-11 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 446 66.5 2.7e-11 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 440 65.6 3.3e-11 KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175) 443 66.2 3.6e-11 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 441 65.9 4e-11 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 416 62.9 2.8e-10 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 412 62.5 4e-10 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 404 61.4 6.4e-10 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 410 62.7 8.9e-10 KIAA0369 ( 794 res) hh00177 ( 794) 397 60.6 1.1e-09 KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 399 61.1 1.4e-09 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 392 59.9 1.5e-09 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 390 59.7 1.8e-09 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 384 59.4 4.9e-09 KIAA0344 ( 2066 res) hg01568 (2066) 379 59.0 9.4e-09 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 367 57.1 1.2e-08 KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 365 57.3 2.6e-08 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 342 54.5 1.5e-07 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 332 52.9 1.7e-07 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 342 54.7 2e-07 KIAA0834 ( 453 res) hj05353 ( 453) 324 51.8 2.9e-07 KIAA1477 ( 870 res) fj04927 ( 870) 328 52.6 3.2e-07 KIAA1101 ( 467 res) hk08029 ( 467) 317 51.0 5.2e-07 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 294 49.1 9.6e-06 KIAA0135 ( 1351 res) ha01203s1 (1351) 281 47.3 1.9e-05 KIAA1459 ( 853 res) fh16961 ( 853) 276 46.5 2.1e-05 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 256 44.4 0.00015 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 258 44.9 0.00017 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 245 43.1 0.00035 KIAA0151 ( 723 res) ha03241 ( 723) 238 42.0 0.00041 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 243 43.0 0.00047 KIAA1883 ( 1480 res) fh02249 (1480) 235 42.0 0.00086 KIAA0137 ( 801 res) ha02915s1 ( 801) 214 39.3 0.0031 KIAA0472 ( 365 res) hh00171 ( 365) 206 38.0 0.0035 KIAA0641 ( 1326 res) hj03494s1 (1326) 213 39.4 0.0047 KIAA1079 ( 1476 res) hj06972 (1476) 205 38.5 0.0097 >>KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011 aa) initn: 721 init1: 695 opt: 754 Z-score: 489.2 bits: 102.4 E(): 3.9e-22 Smith-Waterman score: 754; 42.308% identity (75.000% similar) in 260 aa overlap (11-268:84-343) 10 20 30 40 KIAA19 RCLRKRIMEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIK :. .. .:.:.::.: : . ::: : : KIAA19 SGGCGDSSPGPSASQGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWK 60 70 80 90 100 110 50 60 70 80 90 100 KIAA19 EINISRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRIN :....:.: :::... :...:: ..: ::. : . : .: .: : ..::.::.:. .: KIAA19 EVDLTRLSEKERRDALNEIVILALLQHDNIIAYYNHFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKIL 120 130 140 150 160 170 110 120 130 140 150 160 KIAA19 AQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVL :: ::.:.... .. :: :.. .: :::::::. :::::: . ..:::.:.:. : KIAA19 RQKDKLFEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTKANLIKLGDYGLAKKL 180 190 200 210 220 230 170 180 190 200 210 220 KIAA19 NSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVL :: .:.: .:::::.:::.:.. :: ::::::.:::..:: :::..:.: . :: . 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KIAA18 IIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYL- 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 KIAA19 AQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVL ...: . .: . : :: :... :...:.:::.:..:..: .......:::.. . KIAA18 VSHGRM-KEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEF 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 KIAA19 NSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNN-KSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLV . .: : :.: : .::. ..: :.. . :::.:: .:: : . . :.. ..:.: KIAA18 TLGSKLDTFC-GSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIWSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELR 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 KIAA19 LKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIE-KFLSPQLI ... :.. : ...: : .:.. ... :: : ....:.. .: : . :.: KIAA18 ERVLRGKYR-VPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCTLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTE 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 KIAA19 AEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKKLHE :: KIAA18 PEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEVTATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLAL 330 340 350 360 370 380 >>KIAA1142 ( 467 res) hh05864 (467 aa) initn: 364 init1: 246 opt: 455 Z-score: 304.8 bits: 67.1 E(): 7.4e-12 Smith-Waterman score: 455; 30.859% identity (66.797% similar) in 256 aa overlap (16-267:202-450) 10 20 30 40 KIAA19 RCLRKRIMEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINIS :::::: : . .. .:. ..:.... KIAA11 PQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLR 180 190 200 210 220 230 50 60 70 80 90 100 KIAA19 RMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGV . ...:: ::... ...: :.:.. .:. . :..::.. ::: : .. . KIAA11 K--QQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTR-- 240 250 260 270 280 110 120 130 140 150 160 KIAA19 LFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVE ..:.:: . . ::. .: . ..::::::..:.::.:: :.:.:::. ... : KIAA11 -MNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVP 290 300 310 320 330 340 170 180 190 200 210 220 KIAA19 LARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHA-FEAGSMKNLVLKIIS .. .::::...::. ::. . :::.:: .. :. . :. .: ..:.: KIAA11 RRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLK--AMKMIR 350 360 370 380 390 400 230 240 250 260 270 280 KIAA19 GSFPPV--SLH-YSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAEE ..:: .:: : .:......:. :.: .: .. .:.. :.:: KIAA11 DNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQN 410 420 430 440 450 460 290 300 310 320 330 340 KIAA19 FCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKKLHEKKP KIAA11 RTR >>KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066 aa) initn: 333 init1: 130 opt: 457 Z-score: 301.7 bits: 67.8 E(): 1.1e-11 Smith-Waterman score: 457; 30.996% identity (66.052% similar) in 271 aa overlap (10-265:31-294) 10 20 30 KIAA19 RCLRKRIMEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVI .. : . ::.:.: :.. :. . .. . KIAA07 RLGPPPPAPRPRPACAMEPGRGGTETVGKFEFSRKDLIGHGAF--AVVFKGRHREKHDL- 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 KIAA19 KEINISRMSSKEREESR----REVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDL :. .. ...:. .:. .:. .: ..:: ::: . : .:.:.::.::.:::: KIAA07 -EVAVKCINKKNLAKSQTLLGKEIKILKELKHENIVALYDFQEMANSVYLVMEYCNGGDL 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 KIAA19 FKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDG-------- ..:.. ..:: : .. :: :.. .:.. :.:::.: :::.:.. . KIAA07 ADYLHAMR--TLSEDTIRLFLQQIAGAMRLLHSKGIIHRDLKPQNILLSNPAGRRANPNS 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 KIAA19 -TVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTL :...:::.:: :.:.. : : :.:.:..::. .. :..:.:.:..: ..:. : KIAA07 IRVKIADFGFARYLQSNMMAATLC-GSPMYMAPEVIMSQHYDGKADLWSIGTIVYQCLTG 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 KIAA19 KHAFEAGSMKNLVLKIISGS--FPPVSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGF : :.:.: ..: : ... : . . : ::.:. :..:: .:: . . .... : KIAA07 KAPFQASSPQDLRLFYEKNKTLVPTIPRETSAPLRQLLLALLQRNHKDRMDFDEFFHHPF 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 KIAA19 IAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGI . KIAA07 LDASPSVRKSPPVPVPSYPSSGSGSSSSSSSTSHLASPPSLGEMQQLQKTLASPADTAGF 300 310 320 330 340 350 >>KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385 aa) initn: 334 init1: 267 opt: 459 Z-score: 301.6 bits: 68.1 E(): 1.1e-11 Smith-Waterman score: 488; 22.010% identity (51.579% similar) in 1045 aa overlap (17-980:56-1059) 10 20 30 40 KIAA19 RCLRKRIMEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISR .:.:..:.. . .. :. .:: .... KIAA05 MASDSPARSLDEIDLSALRDPAGIFELVELVGNGTYGQVYKGRHVKTGQLAAIKVMDVT- 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 KIAA19 MSSKEREESRREVAVLANMKHP-NIVQYRESFEE------NGSLYIVMDYCEGGDLFKRI . :.:: ..:. .: ...: ::. : .: . . .:..::..: .:.. : KIAA05 --GDEEEEIKQEINMLKKYSHHRNIATYYGAFIKKNPPGMDDQLWLVMEFCGAGSVTDLI 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 KIAA19 NAQKGVLFQEDQILDWFVQICL----ALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFG . :: ..: .:.. :: .:.:.:..:..:::::.::..::... :.: ::: KIAA05 KNTKGNTLKE----EWIAYICREILRGLSHLHQHKVIHRDIKGQNVLLTENAEVKLVDFG 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 KIAA19 IARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEI--CENKP---YNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAF .. :. :: : :::::...::. :...: :. :::.:.:: . :. . KIAA05 VSAQLDRTVGRRNTFIGTPYWMAPEVIACDENPDATYDFKSDLWSLGITAIEMAEGAPPL 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 KIAA19 -EAGSMKNLVLKIISGSFPPV-SLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKR . :. : : : . : . : ..: ..:.. . . .: .::........ :: . KIAA05 CDMHPMRALFL-IPRNPAPRLKSKKWSKKFQSFIESCLVKNHSQRPATEQLMKHPFIRDQ 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 KIAA19 I-EKFLSPQL------IAEEFCLKTFSKF---GSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKP :. . :: .. : ... ::. . .. .:: .:... . KIAA05 PNERQVRIQLKDHIDRTKKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEENDSGEPSSILNLPGESTLRR 320 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 370 KIAA19 AAKYGIPLAYKKYGDKKLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGEERRKISEEAARKRRLEFI . :: :. .. :.... :.... .. .:: .:....: :. ..:::: KIAA05 DFLR-LQLANKERSEA-LRRQQLEQQQRENEE--HKRQLLAERQKRIEEQKEQRRRLEEQ 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 KIAA19 ---EKE-KKQKDQIISLMKAEQMKRQEKER-----LERINRAREQGWRN--VLSAGGSGE ::: .::... :::.:.:..: : : : :. :. .:. : KIAA05 QRREKELRKQQEREQRRHYEEQMRREEERRRAEHEQEYIRRQLEEEQRQLEILQQQLLHE 440 450 460 470 480 490 430 440 450 460 470 KIAA19 VKAPFLGSGGTIAPSSFSSRGQYE--HYHAIFDQMQQQRAEDNEAKWK------------ . . . . . : : . . . . ..:.:: :. .. : KIAA05 QALLLEYKRKQLEEQRQAERLQRQLKQERDYLVSLQHQRQEQRPVEKKPLYHYKEGMSPS 500 510 520 530 540 550 480 490 500 510 520 KIAA19 -REIYGRGLPERGILP-GVRPGFPYGAAGHHHFPD---------ADDIR--KTLKRLKAV . ... . ::. : :..:. .:.. :. . .. .: :. : KIAA05 EKPAWAKEVEERSRLNRQSSPAMPHKVANRISDPNLPPRSESFSISGVQPARTPPMLRPV 560 570 580 590 600 610 530 540 550 560 570 KIAA19 SKQAN---ANRQKGQLAVERAKQVEEFLQRKREAMQNKARAEGHMVYLARLRQIRLQNFN . : : ...: :. ...:.: . ..:. . .: : . : . . . KIAA05 DPQIPHLVAVKSQGP-ALTASQSVHEQPTKGLSGFQEALNVTSHRVEMPRQNS---DPTS 620 630 640 650 660 580 590 600 610 620 630 KIAA19 ERQQIKAKLRGEKKEANHSEGQEGSEEADMRRKKIESLKAHAN------ARAAVLKEQLE : . .... . . . .. .. .: .: :. : : . : : KIAA05 ENPPLPTRIEKFDRSSWLRQEEDIPPKVPQRTTSISPALARKNSPGNGSALGPRLGSQPI 670 680 690 700 710 720 640 650 660 670 680 KIAA19 RKRKEAYEREKKVWEEHL--VAKGVKSSDVSPPLGQHETGGSPSKQQMRSVISVTSALKE : . .: . . : : ...: .::. .: ::: .: : : . KIAA05 RASNPDLRRTEPILESPLQRTSSGSSSSSSTPSSQPSSQGGSQPGSQAGS-----SERTR 730 740 750 760 770 780 690 700 710 720 730 740 KIAA19 VGVDSSLTDTRETSEEMQKTNNAISSKREILR-RLNENLKAQEDEKGKQNLSDTFEINVH : ..:. . .: :.. : :.: : . : :: .. :. .. KIAA05 VRANSKSEGSPVLPHEPAKVKPEES--RDITRPSRPASYKKAIDEDLTALAKELRELRIE 790 800 810 820 830 840 750 760 770 780 790 800 KIAA19 EDAKEHEKEKSVSSDRKKWEAGGQLVIPLDELTLDTSFSTTERHTVGEVIKLGPNGSPRR : . .: . ::. .. :.. . . : : . . :... .: :.:.: KIAA05 ETNRPMKKVTDYSSSSEESESSEEEEEDGESETHDGTVA------VSDIPRLIPTGAP-- 850 860 870 880 890 810 820 830 840 850 860 KIAA19 AWGKSPTDSVLKILGEAELQLQTELLENTTIRSEISPEGEKYKPLITGEKKVQCISHEIN :.. .: ..: : : . .. . :: :: . .:::: . : . KIAA05 --GSNEQYNV-GMVGTHGL----ETSHADSFSGSISREGTLMIRETSGEKKRSGHSDSNG 900 910 920 930 940 870 880 890 900 910 920 KIAA19 PSAIVDSPVETKSPEFSEASPQMSLKLEGNLEEPDDLETEILQEPSGTNKDESLPCTITD .. .. : ... . ..: .: .. . : :: . ....: : . KIAA05 FAGHINLPDLVQQSHSPAGTPTEGLGRVSTHSQEMDSGTEYGM--GSSTKASFTPFVDPR 950 960 970 980 990 1000 930 940 950 960 970 980 KIAA19 VWIS---EEKETKETQSADRITIQENEVSEDGVSSTVDQLSDIHIEPGTNDSQHSKCDVD :. . .: : : .:: . .: .:.. . . ..: ....: :: :: KIAA05 VYQTSPTDEDEEDEESSAAALFTSELLRQEQAKLNEARKISVVNVNP-TNIRPHSDTPEI 1010 1020 1030 1040 1050 1060 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA19 KSVQPEPFFHKVVHSEHLNLVPQVQSVQCSPEESFAFRSHSHLPPKNKNKNSLLIGLSTG KIAA05 RKYKKRFNSEILCAALWGVNLLVGTENGLMLLDRSGQGKVYNLINRRRFQQMDVLEGLNV 1070 1080 1090 1100 1110 1120 >>KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) (608 aa) initn: 310 init1: 135 opt: 450 Z-score: 300.2 bits: 66.7 E(): 1.3e-11 Smith-Waterman score: 450; 32.090% identity (64.179% similar) in 268 aa overlap (8-265:312-573) 10 20 30 KIAA19 RCLRKRIMEKYVRLQK-IGEGSFGKAILVKSTEDGRQ .::. . . ::.:.:. . . : . KIAA17 EKEPKTRPEENKPERPSGRKPRPMGIIAANVEKHYETGRVIGDGNFAVVKECRHRETRQA 290 300 310 320 330 340 40 50 60 70 80 90 KIAA19 YVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLF :..: :. ::...:: . :. .. ...:::::. .: .: . .:....: .::::: KIAA17 YAMKIIDKSRLKGKE-DMVDSEILIIQSLSHPNIVKLHEVYETDMEIYLILEYVQGGDLF 350 360 370 380 390 400 100 110 120 130 140 150 KIAA19 KRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLT----KDGTVQLG : ..: : : . ....: :: :.::..:.:::.: .:... :. :..:. KIAA17 DAI--IESVKFPEPDAALMIMDLCKALVHMHDKSIVHRDLKPENLLVQRNEDKSTTLKLA 410 420 430 440 450 160 170 180 190 200 210 KIAA19 DFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLY-ELCTLKHAFE :::.:. .:. : ::: :..::: .: :. . :.:: : .:: :: . KIAA17 DFGLAK---HVVRPIFTVCGTPTYVAPEILSEKGYGLEVDMWAAGVILYILLCGFPPFRS 460 470 480 490 500 510 220 230 240 250 260 KIAA19 AGSMKNLVLKIIS-GSF---PPVSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAK .. ...::. : : :: . : ..:::.:. .:. : .....:.. .: KIAA17 PERDQDELFNIIQLGHFEFLPPYWDNISDAAKDLVSRLLVVDPKKRYTAHQVLQHPWIET 520 530 540 550 560 570 270 280 290 300 310 320 KIAA19 RIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLA KIAA17 AGKTNTVKRQKQVSPSSEGHFRSQHKRVVEQVS 580 590 600 >>KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626 aa) initn: 386 init1: 187 opt: 458 Z-score: 300.1 bits: 68.1 E(): 1.3e-11 Smith-Waterman score: 458; 30.627% identity (65.683% similar) in 271 aa overlap (5-265:1355-1619) 10 20 30 KIAA19 RCLRKRIMEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDG ... :. : .:::::..::. :.. : KIAA02 KRYREMRRKNIIGQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTG 1330 1340 1350 1360 1370 1380 40 50 60 70 80 90 KIAA19 RQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGD . ...::: .. . : .:. :. .. ..::::.:.: . .:: :.::. : KIAA02 ELMAMKEIRFQPNDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGT 1390 1400 1410 1420 1430 1440 100 110 120 130 140 150 KIAA19 LFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDF : . .. :. :: : . :: .:.. .:.. :.:::::. :::::..: ..:::: KIAA02 LEE--VSRLGL--QEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIKLGDF 1450 1460 1470 1480 1490 1500 160 170 180 190 200 KIAA19 GIARVLNSTVEL----ARTCIGTPYYLSPEI---CENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLK : . :..... . . .:: :..::. ... .. .:::.::::. :. : : KIAA02 GCSVKLKNNAQTMPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRAKGEGHGRAADIWSLGCVVIEMVTGK 1510 1520 1530 1540 1550 1560 210 220 230 240 250 260 KIAA19 ---HAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGF : .: . . .. :. : ::. . : . ....:. .. .:. : .....:...: KIAA02 RPWHEYEHNFQ--IMYKVGMGHKPPIPERLSPEGKDFLSHCLESDPKMRWTASQLLDHSF 1570 1580 1590 1600 1610 270 280 290 300 310 320 KIAA19 IAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGI . KIAA02 VKVCTDEE 1620 >>KIAA0968 ( 527 res) hj06483 (527 aa) initn: 299 init1: 158 opt: 446 Z-score: 298.4 bits: 66.2 E(): 1.7e-11 Smith-Waterman score: 446; 29.553% identity (63.230% similar) in 291 aa overlap (6-288:57-343) 10 20 30 KIAA19 RCLRKRIMEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGR :. :.: ....:.:.:. . .. :. KIAA09 GAEQQRLSPGPPVPSLTCLPSARMATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQ 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 KIAA19 QYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDL .:. : :: ...:...... .::. . .::::::. ..:. :.: :...: ::.: KIAA09 EYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGEL 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 KIAA19 FKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLT---KDGTVQLG :. : :.. ..: . . :: :. : :. ..:::.: .:..:. : ..:.:. KIAA09 FEDIVARE--YYSEADASHCIQQILEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLA 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 KIAA19 DFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEA :::.: ... . ::: :::::. .. ::.. :.:: : .:: : . : KIAA09 DFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWD 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 KIAA19 GSMKNLVLKIISGS--FP-PVSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKR- ... : .: .:. :: : . . ..:..... :: : .. :.. .:..: KIAA09 EDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRS 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 KIAA19 -IEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLA . . . : .. ::: :. KIAA09 TVASCMHRQETVD--CLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVKESSES 330 340 350 360 370 380 >>KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164 aa) initn: 398 init1: 202 opt: 448 Z-score: 295.6 bits: 66.8 E(): 2.4e-11 Smith-Waterman score: 488; 22.932% identity (54.637% similar) in 798 aa overlap (16-742:51-807) 10 20 30 40 KIAA19 RCLRKRIMEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINIS ..:.:.:::. ... : . . : :. . KIAA02 IFKLGSEKKKKQYEHVKRDLNPEDFWEIIGELGDGAFGKVYKAQNKETSVLAAAKVIDTK 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 KIAA19 RMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGV : .: :. :. .::. :::::. ..: ...:.:....: :: . . . KIAA02 --SEEELEDYMVEIDILASCDHPNIVKLLDAFYYENNLWILIEFCAGGAV-DAVMLELER 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 KIAA19 LFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVE . :.:: : ::...:: ::.:::.:. ::..: :: ..:.:::.. . :.. KIAA02 PLTESQIQVVCKQTLDALNYLHDNKIIHRDLKAGNILFTLDGDIKLADFGVSAKNTRTIQ 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 KIAA19 LARTCIGTPYYLSPEI--CE---NKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAF-EAGSMKNLV . :::::...::. :: ..::. :.:.:.:: .: :. .. : . :. : KIAA02 RRDSFIGTPYWMAPEVVMCETSKDRPYDYKADVWSLGITLIEMAEIEPPHHELNPMR--V 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 KIAA19 LKIISGSFPPVSLH---YSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQ : :. : ::. . .: ........ ...: : .....:.. :.. .: . . KIAA02 LLKIAKSEPPTLAQPSRWSSNFKDFLKKCLEKNVDARWTTSQLLQHPFVTVDSNKPIR-E 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 KIAA19 LIAEEFCLKTFS------------KFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAA---- :::: : .: ::::.. ::.. ::. .:... : KIAA02 LIAEAKAEVTEEVEDGKEEDEEEETENSLPIPASKRASSDLSIASSEEDKLSQNACILES 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 KIAA19 ---KYGIPLAYKKYGDKKLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGE--------ERRKISEEA : . : ..: :.:: .. ..: . ..... .. .: . .: KIAA02 VSEKTERSNSEDKLNSKILNEKPTTDEPEKAVEDINEHITDAQLEAMTELHDRTAVIKEN 380 390 400 410 420 430 370 380 390 400 410 KIAA19 ARKRR--LEFIE-------------KEKKQKDQIISL-MKAEQMKRQEKERLERINRARE :..: :: . .: :... .:.: . :. ..:.:. .. .. KIAA02 EREKRPKLENLPDTEDQETVDINSVSEGKENNIMITLETNIEHNLKSEEEK----DQEKQ 440 450 460 470 480 490 420 430 440 450 460 470 KIAA19 QGWRNVLSAGGSGEVKAPFLGSGGTIAPSSFSSRGQYEHYHAIFDQMQQQRAEDNEAKWK : ..: : : :.: .: . .. . :. : :. ::.. : KIAA02 QMFENKLIK--SEEIKDTILQTVDLVSQET----GEKEANIQAVDSEVGLTKEDTQEKLG 500 510 520 530 540 480 490 500 510 520 530 KIAA19 REIYGRGLPERGILPGVRPGFPYGAAGHHHFPDADDIRKTLKRLKAVSKQANANRQKGQL .. .. .. .. . :. .: :. . . . .: . :.: :. KIAA02 ED----DKTQKDVISNTSDVI--GTC------EAADVAQKVDEDSAEDTQSN----DGKE 550 560 570 580 540 550 560 570 580 590 KIAA19 AVERAKQVEEFLQRKREAMQNKARAEGHMVYLARLRQIRLQNFNERQQIKAK--LRGEKK .:: .... . . :: .: ..: . .... . :..: :... . .. KIAA02 VVEVGQKLINKPMVGPEAGGTKEVPIKEIVEMNEIEEGK----NKEQAINSSENIMDINE 590 600 610 620 630 640 600 610 620 630 640 KIAA19 EANHSEGQEGSEEADMRRKKIESLKAHANARA--------AVLKEQLERKRKEAYEREKK : . .::.: .: .. .. ...:. : .. .: . . :.....:: :: KIAA02 EPGTTEGEEITESSSTEEMEVRSVVADTDQKALGSEVQDASKVTTQIDKEKKEIPVSIKK 650 660 670 680 690 700 650 660 670 680 690 KIAA19 VWEEHLVAKGVKSSDVSPPLGQHETGGSPSKQQMRSVISVTSAL-------KEVGVDSSL : .:.. .. . : : . .. .. .:... :. .. . : :: ::. KIAA02 EPEVTVVSQPTEPQPVLIPSININSDSGENKEEIGSLSKTETILPPESENPKENDNDSGT 710 720 730 740 750 760 700 710 720 730 740 750 KIAA19 TDTRETSEEMQKTNNAISSKREILRRLNEN--LKAQEDEKGKQNLSDTFEINVHEDAKEH .: .:: : .::: .: . ... .. :: .. :..:. : KIAA02 GSTADTSS--IDLNLSISS---FLSKTKDSGSISLQETRRQKKTLKKTRKFIVDGVEVSV 770 780 790 800 810 760 770 780 790 800 810 KIAA19 EKEKSVSSDRKKWEAGGQLVIPLDELTLDTSFSTTERHTVGEVIKLGPNGSPRRAWGKSP KIAA02 TTSKIVTDSDSKTEELRFLRRQELRELRFLQKEEQRAQQQLNSKLQQQREQIFRRFEQEM 820 830 840 850 860 870 1265 residues in 1 query sequences 1986240 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:21:24 2008 done: Thu Dec 18 15:21:26 2008 Total Scan time: 0.780 Total Display time: 0.310 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]