# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fk05638.fasta.nr -Q ../query/KIAA1895.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1895, 628 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827309 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1030+/-0.000183; mu= 11.9246+/- 0.010 mean_var=70.7645+/-13.759, 0's: 43 Z-trim: 43 B-trim: 0 in 0/68 Lambda= 0.152464 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|125991848|sp|Q96PZ2.2|F111A_HUMAN RecName: Full ( 611) 4083 907.6 0 gi|47939119|gb|AAH71759.1| FAM111A protein [Homo s ( 611) 4080 907.0 0 gi|109106065|ref|XP_001090771.1| PREDICTED: hypoth ( 611) 3666 815.9 0 gi|54035161|gb|AAH13137.1| FAM111A protein [Homo s ( 417) 2781 621.1 2.1e-175 gi|73982497|ref|XP_852330.1| PREDICTED: hypothetic (1009) 2307 517.2 1e-143 gi|74186465|dbj|BAE42988.1| unnamed protein produc ( 613) 2255 505.6 1.9e-140 gi|149062499|gb|EDM12922.1| similar to expressed s ( 610) 2227 499.4 1.4e-138 gi|81916972|sp|Q9D2L9.1|F111A_MOUSE RecName: Full= ( 613) 2215 496.8 8.6e-138 gi|74210989|dbj|BAE25085.1| unnamed protein produc ( 632) 2148 482.0 2.4e-133 gi|119594243|gb|EAW73837.1| family with sequence s ( 314) 2096 470.4 3.9e-130 gi|109463626|ref|XP_001076444.1| PREDICTED: hypoth ( 607) 1838 413.8 7.9e-113 gi|109459931|ref|XP_001076751.1| PREDICTED: hypoth ( 607) 1834 413.0 1.4e-112 gi|149270391|ref|XP_894682.2| PREDICTED: hypotheti ( 599) 1590 359.3 2.1e-96 gi|148709526|gb|EDL41472.1| mCG65857 [Mus musculus ( 554) 1548 350.0 1.2e-93 gi|18044023|gb|AAH19638.1| 4632417K18Rik protein [ ( 398) 1464 331.4 3.3e-88 gi|23272940|gb|AAH38020.1| 4632417K18Rik protein [ ( 410) 1430 324.0 6e-86 gi|55930993|gb|AAH54515.1| FAM111A protein [Homo s ( 187) 1266 287.6 2.4e-75 gi|10439315|dbj|BAB15486.1| unnamed protein produc ( 158) 1063 242.9 5.7e-62 gi|26337139|dbj|BAC32254.1| unnamed protein produc ( 311) 1051 240.5 6e-61 gi|126303182|ref|XP_001377772.1| PREDICTED: simila ( 520) 961 220.9 8.2e-55 gi|218156273|ref|NP_001136175.1| hypothetical prot ( 704) 884 204.0 1.3e-49 gi|74758524|sp|Q6SJ93.1|F111B_HUMAN RecName: Full= ( 734) 884 204.1 1.3e-49 gi|119594239|gb|EAW73833.1| hCG1729960 [Homo sapie (1200) 884 204.2 2e-49 gi|194382756|dbj|BAG64548.1| unnamed protein produ ( 704) 880 203.2 2.4e-49 gi|114642613|ref|XP_508447.2| PREDICTED: similar t ( 704) 877 202.5 3.8e-49 gi|194673541|ref|XP_586292.4| PREDICTED: hypotheti ( 735) 841 194.6 9.5e-47 gi|126333408|ref|XP_001377688.1| PREDICTED: simila ( 511) 817 189.2 2.8e-45 gi|73982499|ref|XP_852339.1| PREDICTED: hypothetic ( 735) 808 187.3 1.5e-44 gi|74140639|dbj|BAB31452.3| unnamed protein produc ( 170) 563 133.0 7.8e-29 gi|38383159|gb|AAH62456.1| FAM111B protein [Homo s ( 246) 445 107.1 6.7e-21 gi|109106073|ref|XP_001091122.1| PREDICTED: hypoth ( 702) 435 105.3 7e-20 gi|109106071|ref|XP_001091252.1| PREDICTED: hypoth ( 732) 435 105.3 7.2e-20 gi|189542796|ref|XP_001923070.1| PREDICTED: simila ( 538) 379 92.9 2.9e-16 gi|210115615|gb|EEA63365.1| hypothetical protein B ( 587) 241 62.6 4.3e-07 gi|210116320|gb|EEA64065.1| hypothetical protein B ( 766) 233 60.9 1.8e-06 gi|210130601|gb|EEA78272.1| hypothetical protein B ( 667) 230 60.2 2.5e-06 gi|210083789|gb|EEA32365.1| hypothetical protein B (1304) 202 54.2 0.0003 gi|210115605|gb|EEA63355.1| hypothetical protein B ( 585) 188 50.9 0.0014 >>gi|125991848|sp|Q96PZ2.2|F111A_HUMAN RecName: Full=Pro (611 aa) initn: 4083 init1: 4083 opt: 4083 Z-score: 4850.6 bits: 907.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 4083; 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99.836% identity (100.000% similar) in 611 aa overlap (18-628:1-611) 10 20 30 40 50 60 KIAA18 KFEISVSAEPSVHLQAIMSCKKQRSRKHSVNEKCNMKIEHYFSPVSKEQQNNCSTSLMRM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|479 MSCKKQRSRKHSVNEKCNMKIEHYFSPVSKEQQNNCSTSLMRM 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 KIAA18 ESRGDPRATTNTQAQRFHSPKKNPEDQTMPQNRTIYVTLKVNHRRNQDMKLKLTHSENSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: gi|479 ESRGDPRATTNTQAQRFHSPKKNPEDQTMPQNRTIYVTLKVNHRRNQDMKLKLSHSENSS 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 KIAA18 LYMALNTLQAVRKEIETHQGQEMLVRGTEGIKEYINLGMPLSCFPEGGQVVITFSQSKSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|479 LYMALNTLQAVRKEIETHQGQEMLVRGTEGIKEYINLGMPLSCFPEGGQVVITFSQSKSK 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 KIAA18 QKEDNHIFGRQDKASTECVKFYIHAIGIGKCKRRIVKCGKLHKKGRKLCVYAFKGETIKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|479 QKEDNHIFGRQDKASTECVKFYIHAIGIGKCKRRIVKCGKLHKKGRKLCVYAFKGETIKD 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 KIAA18 ALCKDGRFLSFLENDDWKLIENNDTILESTQPVDELEGRYFQVEVEKRMVPSAAASQNPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|479 ALCKDGRFLSFLENDDWKLIENNDTILESTQPVDELEGRYFQVEVEKRMVPSAAASQNPE 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 KIAA18 SEKRNTCVLREQIVAQYPSLKRESEKIIENFKKKMKVKNGETLFELHRTTFGKVTKNSSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|479 SEKRNTCVLREQIVAQYPSLKRESEKIIENFKKKMKVKNGETLFELHRTTFGKVTKNSSS 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 KIAA18 IKVVKLLVRLSDSVGYLFWDSATTGYATCFVFKGLFILTCRHVIDSIVGDGIEPSKWATI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|479 IKVVKLLVRLSDSVGYLFWDSATTGYATCFVFKGLFILTCRHVIDSIVGDGIEPSKWATI 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 KIAA18 IGQCVRVTFGYEELKDKETNYFFVEPWFEIHNEELDYAVLKLKENGQQVPMELYNGITPV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|479 IGQCVRVTFGYEELKDKETNYFFVEPWFEIHNEELDYAVLKLKENGQQVPMELYNGITPV 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 540 KIAA18 PLSGLIHIIGHPYGEKKQIDACAVIPQGQRAKKCQERVQSKKAESPEYVHMYTQRSFQKI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|479 PLSGLIHIIGHPYGEKKQIDACAVIPQGQRAKKCQERVQSKKAESPEYVHMYTQRSFQKI 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 KIAA18 VHNPDVITYDTEFFFGASGSPVFDSKGSLVAMHAAGFAYTYQNETRSIIEFGSTMESILL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|479 VHNPDVITYDTEFFFGASGSPVFDSKGSLVAMHAAGFAYTYQNETRSIIEFGSTMESILL 530 540 550 560 570 580 610 620 KIAA18 DIKQRHKPWYEEVFVNQQDVEMMSDEDL :::::::::::::::::::::::::::: gi|479 DIKQRHKPWYEEVFVNQQDVEMMSDEDL 590 600 610 >>gi|109106065|ref|XP_001090771.1| PREDICTED: hypothetic (611 aa) initn: 3666 init1: 3666 opt: 3666 Z-score: 4354.9 bits: 815.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 3666; 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