# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ff08107.fasta.huge -Q ../query/KIAA1894.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1894, 2977 aa vs ./tmplib.25089 library 1984528 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.1106+/-0.00534; mu= 25.8386+/- 0.365 mean_var=97.5631+/-21.975, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.129847 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 45, opt: 33, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1890 ( 1048 res) fk02692 (1048) 3570 681.0 6.4e-196 KIAA1884 ( 946 res) fh04567 ( 946) 3359 641.4 4.8e-184 KIAA0927 ( 1001 res) hg03734 (1001) 894 179.7 5e-45 KIAA0932 ( 1078 res) hh04016s1 (1078) 271 63.0 7.1e-10 KIAA0815 ( 1640 res) sh06087 (1640) 201 50.2 7.9e-06 KIAA0817 ( 2785 res) hg01392s2 (2785) 191 48.6 3.8e-05 >>KIAA1890 ( 1048 res) fk02692 (1048 aa) initn: 5774 init1: 3570 opt: 3570 Z-score: 3609.2 bits: 681.0 E(): 6.4e-196 Smith-Waterman score: 4968; 64.183% identity (84.718% similar) in 1047 aa overlap (442-1418:1-1047) 420 430 440 450 460 470 KIAA18 RGPSGTILSPGYPEFYPNSLNCTWTVDVTHGKGVQFNFHTFHLEDHHDYLLITENGSFTQ :::::. :::::::. ::::::::.:::.. 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KIAA18 EDIHSTFNSLTLQFDSDFFISKSGFSIQFSTSIAATCNDPGMPQNGTRYGDSREAGDTVT 400 410 420 430 440 450 900 910 920 930 940 950 KIAA18 FQCDPGYELQGEERITCIQVENRYFWQPSPPVCIAPCGGNLTGSSGFILSPNFPHPYPHS :::::::.:::. .:::.:..::.::::.::.::: ::::::: .: :::::.:.::: . KIAA18 FQCDPGYQLQGQAKITCVQLNNRFFWQPDPPTCIAACGGNLTGPAGVILSPNYPQPYPPG 460 470 480 490 500 510 960 970 980 990 1000 1010 KIAA18 RDCDWTITVNADYVISLAFISFSIEPNYDFLYIYDGPDSNSPLIGSFQDSKLPERIESSS ..::: . :: :.::.: : ::..::.::::.::.: :::::::::.: :. :::::::. 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KIAA18 FSAKSGASARGFHFVYQAVPRTSDTQCSSVPEPRYGRRIGSEFSAGSIVRFECNPGYLLQ 760 770 780 790 800 810 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA18 GSIAIRCETVPNSLAQWNDSLPTCIVPCGGILTKRKGTILSPGYPEPYDNNLNCVWKITV :: :..:..:::.::::::..:.:.:::.: .:.:.:::::::::::: :::::.::: : KIAA18 GSTALHCQSVPNALAQWNDTIPSCVVPCSGNFTQRRGTILSPGYPEPYGNNLNCIWKIIV 820 830 840 850 860 870 1250 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA18 PEGAGIQVQVVSFATEHNWDSLDFYDGGDNNAPRLGSYSGTTIPHLLNSTSNNLYLNFQS ::.:::.::.:::::.:::::...:::: .::::::.::::.: :::::::.:::.::: KIAA18 TEGSGIQIQVISFATEQNWDSLEIHDGGDVTAPRLGSFSGTTVPALLNSTSNQLYLHFQS 880 890 900 910 920 930 1310 1320 1330 1340 1350 1360 KIAA18 DISVSAAGFHLEYTAIGLDSCPEPQTPSSGIKIGDRYMVGDVVSFQCDQGYSLQGHSHIT ::::.:::::::: ..:: .: :: ::..:::::::::.::.::::. ::.:::.:::. 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KIAA18 ECLDTGLWSNRNVPPQCVPVTCPDVSSISVEHGRWRLIFETQYQFQAQLMLICDPGYYYT 40 50 60 70 80 90 2010 2020 2030 2040 2050 2060 KIAA18 GPASIECLPNGTWSWRNERPYCQIISCGELPTPPNGNKIGTQTSYGSTAIFTCDLGFMLV : :.: :: :: . : :.:::::::: ::::..::: . ::.::::.:. :. :: KIAA18 GQRVIRCQANGKWSLGDSTPTCRIISCGELPIPPNGHRIGTLSVYGATAIFSCNSGYTLV 100 110 120 130 140 150 2070 2080 2090 2100 2110 2120 KIAA18 GSAVRECLSSGLWSESETRCLAGHCGIPELIVNGQVIGENYGYRDTVVYQCNPGFRLIGS :: ::::...:::: ::.:::::::: :: ::::.. ::::.:: .:::::: :::::: KIAA18 GSRVRECMANGLWSGSEVRCLAGHCGTPEPIVNGHINGENYSYRGSVVYQCNAGFRLIGM 160 170 180 190 200 210 2130 2140 2150 2160 2170 2180 KIAA18 SVRICQQDHNWSGQLPSCVPVSCGHPGSPIYGRTSGNGFNFNDVVTFSCNIGYLMQGPTK :::::::::.:::. : :: ::::::::: KIAA18 SVRICQQDHHWSGKTPFCVLVSCGHPGSP------------------------------- 220 230 2190 2200 2210 2220 2230 2240 KIAA18 AQCQANRQWSHPPPMCKVVNCSDPGIPANSKRESKIEHGNFTYGTVVFYDCNPGYFLFGS KIAA18 ------------------------------------------------------------ 2250 2260 2270 2280 2290 2300 KIAA18 SVLICQPNGQWDKPLPECIMIDCGHPGVPPNAVLSGEKYTFGSTVHYSCTGKRSLLGQSS :.. .::..:: :..:.::: :::.:.:.:. KIAA18 -----------------------------PHSQMSGDSYTVGAVVRYSCIGKRTLVGNST 240 250 260 270 2310 2320 2330 2340 2350 2360 KIAA18 RTCQLNGHWSGSQPHCSGDATGTCGDPGTPGHGSRQESNFRTKSTVRYACDTGYILHGSE : : :.:::.:: ::::: ..:.::::: :.:: : ..: ...:..:..:..:.:: KIAA18 RMCGLDGHWTGSLPHCSGTSVGVCGDPGIPAHGIRLGDSFDPGTVMRFSCEAGHVLRGSS 280 290 300 310 320 330 2370 2380 2390 2400 2410 2420 KIAA18 ERTCLANGSWTGRQPECKAVQCGNPGTTANGKVFRIDGTTFSSSVIYSCMEGYILSGPSV :::: :::::.: :::: ...:::::: .:..: :: .::::..: : ::: .: KIAA18 ERTCQANGSWSGSQPECGVISCGNPGTPSNARVVFSDGLVFSSSIVYECREGYYATGLLS 340 350 360 370 380 390 2430 2440 2450 2460 2470 2480 KIAA18 RQCTANGTWSGTLPNCTIISCGDPGIPANGLRYGDDYVVGQNVSYMCQPGYTMELNGSRI :.:..::::.:. :.: .:.:::::::::::: :.:. ...:.:.: ::: :: . . KIAA18 RHCSVNGTWTGSDPECLVINCGDPGIPANGLRLGNDFRYNKTVTYQCVPGYMMESHRVSV 400 410 420 430 440 450 2490 2500 2510 2520 2530 2540 KIAA18 RTCTINGTWSGVMPTCRAVTCPTPPQISNGRLEGTNFDWGFSISYICSPGYELSFPAVLT .:: . ::.:. :.:.:. : :: : ::.. :..: :: :..: : ::.::.:::.: KIAA18 LSCTKDRTWNGTKPVCKALMCKPPPLIPNGKVVGSDFMWGSSVTYACLEGYQLSLPAVFT 460 470 480 490 500 510 2550 2560 2570 2580 2590 2600 KIAA18 CVGNGTWSGEVPQCLPKFCGDPGIPAQGKREGKSFIYQSEVSFSCNFPFILVGSSTRICQ : :::.:.::.:::.: ::::::.:..:.:: ..: :.: :::::. :..:::: :.:: KIAA18 CEGNGSWTGELPQCFPVFCGDPGVPSRGRREDRGFSYRSSVSFSCHPPLVLVGSPRRFCQ 520 530 540 550 560 570 2610 2620 2630 2640 2650 2660 KIAA18 ADGTWSGSSPHCIEPTQTSCENPGVPRHGSQNNTFGFQVGSVVQFHCKKGHLLQGSTTRT .::::::..: ::.:: :.: .::::. : :::. :.::::.: :.:.::.::::::::: KIAA18 SDGTWSGTQPSCIDPTLTTCADPGVPQFGIQNNSQGYQVGSTVLFRCQKGYLLQGSTTRT 580 590 600 610 620 630 2670 2680 2690 2700 2710 2720 KIAA18 CLPDLTWSGIQPECIPHSCKQPETPAHANVVGMDLPSHGYTLIYTCQPGFFLAGGTEHRV :::.::::: :.:.:: :.:::::.:::: ..:::: ::::::.:: :: : ::.:::. KIAA18 CLPNLTWSGTPPDCVPHHCRQPETPTHANVGALDLPSMGYTLIYSCQEGFSLKGGSEHRT 640 650 660 670 680 690 2730 2740 2750 2760 2770 KIAA18 CRSDNTWTGKVPICEAGSKILVK-DPRPALGTPSPKLS---VPDDVFAQNYIWKGSYNFK :..:..:::: ::: . :. . :: . : :. .: ::::.: .:::.:... KIAA18 CKADGSWTGKPPIC-----LEVRPNGRPINTAREPPLTQALIPGDVFAKNSLWKGAYEYQ 700 710 720 730 740 2780 2790 2800 2810 2820 2830 KIAA18 GRKQPMTLTVTSFNASTGRVNATL-SNSNMELLLSGVYKSQEARLMLRIYLIKVPAHASV :.::: : ::.:......::::. ..:..:: :.:.::... .:.:..: : :.. . KIAA18 GKKQPAMLRVTGFQVANSKVNATMIDHSGVELHLAGTYKKEDFHLLLQVYQITGPVEIFM 750 760 770 780 790 800 2840 2850 2860 2870 2880 2890 KIAA18 KKMKEENWAMDGFVSAEPDGATYVFQGFIQGKDYGQFGLQRLGLNMSEGSNSSNQPH-GT .:.:...::.:: ::.: .:::...:: ..:. .::::.::: : . :.. : : .. KIAA18 NKFKDDHWALDGHVSSESSGATFIYQGSVKGQGFGQFGFQRLDLRLLESDPESIGRHFAS 810 820 830 840 850 860 2900 2910 2920 2930 2940 2950 KIAA18 NSSSVAIAILVPFFALIFAGFGFYLYKQRTAPKTQYTGCSVHENNNGQAAFENPMYDTNA :::::: ::::::.:::.::: .::::.: ::. ..: . :::.: .:.::::::: : KIAA18 NSSSVAAAILVPFIALIIAGFVLYLYKHRRRPKVPFNGYAGHENTNVRATFENPMYDRNI 870 880 890 900 910 920 2960 2970 KIAA18 KSVEGKAVRFDPNLNTVCTMV . .. : . . ...:::: : KIAA18 QPTDIMASEAEFTVSTVCTAV 930 940 >>KIAA0927 ( 1001 res) hg03734 (1001 aa) initn: 443 init1: 203 opt: 894 Z-score: 900.2 bits: 179.7 E(): 5e-45 Smith-Waterman score: 938; 30.945% identity (56.098% similar) in 656 aa overlap (579-1218:331-931) 550 560 570 580 590 600 KIAA18 SSGYRLEGTSEIICLGGGRRVWSAPLPRCVAECGASATNNEGILLSPNYPLNYENNH-EC : :..: .: :: . : .::: :: :: KIAA09 ELTGSASEESQETTTSTIITTTVITTEQAPALCSVSFSNPEGYIDSSDYPLLPLNNFLEC 310 320 330 340 350 360 610 620 630 640 650 660 KIAA18 IYSIQVQAGKGINISARTFHLAQGDVLKIYDGKDKTTHLLGAFTGASMRGLTLSSTSNQL :.. : .: :....... .:..:..:.: : : : . : ..: .. : .: . KIAA09 TYNVTVYTGYGVELQVKSVNLSDGELLSIR-GVDGPTLTVLANQTLLVEGQVIRSPTNTI 370 380 390 400 410 670 680 690 700 710 720 KIAA18 ---WLEFNSDTEGTDEGFQLVYTSFELSHCEDPGIPQFGYKISDQGHFAGSTIIYGCNPG . :..: :: ::: : .: :: :. : :. : .. . .:.. . :. : KIAA09 SVYFRTFQDDGLGT---FQLHYQAFMLS-CNFPRRPDSG-DVTVMDLHSGGVAHFHCHLG 420 430 440 450 460 470 730 740 750 760 770 780 KIAA18 YTLHGSSLLKCMTGERRAWDYPLPSCIAECGGRFKGESSGRILSPGYPFPYDNNLRCMWM : :.:...: :... . :. : : : ::: .. . ::.:::.:: ... :.: KIAA09 YELQGAKMLTCINASKPHWSSQEPICSAPCGGAVHNATIGRVLSPSYPENTNGSQFCIWT 480 490 500 510 520 530 790 800 810 820 830 840 KIAA18 IEVDPGNIVSLQFLAFDTEASHDILRVWDGPPENDMLLKE-ISGSLIP-EGIHSTLNIVT ::. :. . :.: . . ..: . : .: ... :: . .. .: ::. : : . 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KIAA09 VGEEKRIFLD-IQFLNLSNSDILTIYDGDEVMPHILGQYLGNSGPQKLYSSTPDLTIQFH 720 730 740 750 760 770 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA18 SD--GSV--SYTGFHLEYKAKLR-ESCFDPGNIMNGTRLGMDYKL--GSTVTYYCDAGYV :: : . . :: ..: : .:: : .:.:: . .: :. .:: :: :: KIAA09 SDPAGLIFGKGQGFIMNYIEVSRNDSCSDLPEIQNGWKTTSHTELVRGARITYQCDPGYD 780 790 800 810 820 830 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA18 LQGYSTLTCIMGDDGRPGWNRALPSCHAPCGSRSTGSEGTVLSPNYPKNYSVGHNCVYSI . : .:::: . : .:. : :. : . . :. :.: :.. .: KIAA09 IVGSDTLTC-QWD---LSWSSDPPFCEKTEESLACDN------PGLPEN---GYQILY-- 840 850 860 870 1140 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA18 AVPKEFAVPRTSSTQCSSVPEPRFGRRIGNEFAVGSSVLFDCNPGYILHGSIAIRCETVP :.. .: : :. : : :. : : ..::: . 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