# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fk02783.fasta.huge -Q ../query/KIAA1891.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1891, 780 aa vs ./tmplib.25089 library 1986725 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5775+/-0.00566; mu= 20.5741+/- 0.387 mean_var=120.3431+/-30.005, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 135 in 1/39 Lambda= 0.116913 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1372 ( 773 res) fj03335 ( 773) 1152 205.7 1.4e-53 KIAA1057 ( 977 res) hh11838 ( 977) 186 43.0 0.00018 KIAA0570 ( 3412 res) hk03615s2 (3412) 177 42.3 0.001 KIAA1594 ( 931 res) fj09468 ( 931) 170 40.2 0.0011 KIAA1003 ( 917 res) hk09911 ( 917) 159 38.4 0.0041 KIAA1097 ( 980 res) hk07058 ( 980) 156 37.9 0.0061 KIAA1063 ( 593 res) hj04848 ( 593) 150 36.6 0.0093 >>KIAA1372 ( 773 res) fj03335 (773 aa) initn: 2045 init1: 1148 opt: 1152 Z-score: 1053.6 bits: 205.7 E(): 1.4e-53 Smith-Waterman score: 1852; 43.839% identity (64.100% similar) in 844 aa overlap (9-780:22-773) 10 20 30 40 KIAA18 KDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAVQKFTILIDV : :::::.::::....: :.::::::::::.::.:::.: KIAA13 PLGCPHPSILGVPCPCVTVTPLTRMIDWVSWPLGKNIDKWIIALLKGLAAVKKFSILIEV 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 KIAA18 TLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHLIVPHVVNLVHSFKNDGLPS .: ::: ::..: .:.:: .::.::..:::.:::: :::::..::. .: :. .. : KIAA13 SLTKIEKVFSKLLYPIVRGAALSVLKYMLLTFQHSHEAFHLLLPHIPPMVASLVKEDSNS 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 KIAA18 STAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILEAIKDFPKPSEEKIKLILNQSAWTSQSNSL .:. : ::.::.:::.... ::::::::..:::::. :.:..:: .:.:.:::::.. : KIAA13 GTSCLEQLAELVHCMVFRFPGFPDLYEPVMEAIKDLHVPNEDRIKQLLGQDAWTSQKSEL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 KIAA18 ASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLNLNGCNSLMKKLQ :. :: .::.::: ::::::::::.::..::::::.:::. :: :. :. . :: ::: KIAA13 AGFYPRLMAKSDTGKIGLINLGNTCYVNSILQALFMASDFRHCVLRLTENNSQPLMTKLQ 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 KIAA18 HLFAFLAHTQREAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEEEKILKVQASH ::.:: :.:: : .:. :. :: :::.: .::::::::..:::::::::: KIAA13 WLFGFLEHSQRPAISPENFLSASWTPWFSPGTQQDCSEYLKYLLDRLHEEEKT------- 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 KIAA18 KPSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRTSDGEKTLIEKMFGGKLRTHIRCLNCRSTSQK ..: :.. :.. .: . : : :. : .:::::::. :.: :: : ..:.. 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KIAA13 VRTEPTLHKDLMEAISKDNILYLQEQEKEARSRAAYISALPTS--PHWGRGFDEDKDEDE 700 710 720 730 740 750 760 770 780 KIAA18 DPPGSCGPTGGGGGGGFNTVGRLVF ::.:.:.::.:: :. :::: KIAA13 GSPGGCNPAGGNGGD-FH---RLVF 760 770 >>KIAA1057 ( 977 res) hh11838 (977 aa) initn: 236 init1: 96 opt: 186 Z-score: 172.1 bits: 43.0 E(): 0.00018 Smith-Waterman score: 198; 26.452% identity (57.419% similar) in 155 aa overlap (449-602:188-334) 420 430 440 450 460 470 KIAA18 PPNEFYCSENTSVPNESNKILVNKDVPQKPGGETTPSVTDLLNYFLAPEILTGDNQYYCE : . :. :. :. :.: :.: :::: KIAA10 TFQGIYSDQKICKDCPHRYEREEAFMALNLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEGSNAYYCE 160 170 180 190 200 210 480 490 500 510 520 530 KIAA18 NCASLQNAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVRRKILDNVSLPLVLELPVKRITSF .: . . : : : :.. :.::..: . : ... .: .:.. .... KIAA10 KCKEKRITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWMLNMEPYTVSGM 220 230 240 250 260 270 540 550 560 570 580 590 KIAA18 SSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKLVP-YLLSSVVVHSGISSESGHYY . . : ....:: . . .: . . . :. : : .:.:::: ....:::: KIAA10 ARQDSS-------SEVGENGRSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSG-QAHAGHYY 280 290 300 310 320 600 610 620 630 640 650 KIAA18 SYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGRDSPSAVFEQDLENKEMSKEWFLFNDS :. .. KIAA10 SFIKDRRGCGKGKWYKFNDTVIEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQTNPYTDVRRRYW 330 340 350 360 370 380 >>KIAA0570 ( 3412 res) hk03615s2 (3412 aa) initn: 176 init1: 103 opt: 177 Z-score: 158.6 bits: 42.3 E(): 0.001 Smith-Waterman score: 195; 21.708% identity (56.228% similar) in 281 aa overlap (455-731:1906-2140) 430 440 450 460 470 480 KIAA18 CSENTSVPNESNKILVNKDVPQKPGGETTPSVTDLLNYFLAPEILTGDNQYYCENCASLQ .. . :. . : :::.: : .:.. KIAA05 TNNVVSLDCEHVSQTAEEFYTVRCQVADMKNIYESLDEVTIKDTLEGDNMYTCSHCGKKV 1880 1890 1900 1910 1920 1930 490 500 510 520 530 540 KIAA18 NAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVRRKILDNVSLPLVLELPVKRITSFSSLSES ::: . . :. : .. .:..... ...:. . :.:: :.. : .. KIAA05 RAEKRACFKKLPRILSFNTMRYTFNMVTMMKEKVNTHFSFPLRLDM-----TPYTE---- 1940 1950 1960 1970 1980 550 560 570 580 590 600 KIAA18 WSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKLVPYLLSSVVVHSGISSESGHYYSYARNIT :: .... :. .:... .. : : .:.::.: ....:::::. :.:. KIAA05 -----DFL-MGKSERKEGFKEVSDHSKDSESYEYDLIGVTVHTG-TADGGHYYSFIRDIV 1990 2000 2010 2020 2030 610 620 630 640 650 660 KIAA18 ST----DSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGRDSPSAVFEQDLENKEMSKEWFLFNDSRVT . .... .....:. . :.: : : .. .: ... .:. . KIAA05 NPHAYKNNKWYLFNDAEVKPFDSAQL-------ASECFGGEMTTKTYDS----VTDKFMD 2040 2050 2060 2070 2080 670 680 690 700 710 720 KIAA18 FTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQHSTNGLSGNNPTSGLWINGDPPLQKELMDAITK : ::.... .::.:.::... . .: . : ...::.. : . KIAA05 F-SFEKTH---------SAYMLFYKRMEP-------EEENGREYKFD--VSSELLEWIWH 2090 2100 2110 2120 730 740 750 760 770 780 KIAA18 DNKLYLQEQELNARARALQAASASCSFRPNGFDDNDPPGSCGPTGGGGGGGFNTVGRLVF :: .::.... KIAA05 DNMQFLQDKNIFEHTYFGFMWQLCSCIPSTLPDPKAVSLMTAKLSTSFVLETFIHSKEKP 2130 2140 2150 2160 2170 2180 >>KIAA1594 ( 931 res) fj09468 (931 aa) initn: 234 init1: 112 opt: 170 Z-score: 157.7 bits: 40.2 E(): 0.0011 Smith-Waterman score: 170; 25.514% identity (52.263% similar) in 243 aa overlap (143-371:257-475) 120 130 140 150 160 KIAA18 VQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILEAIKDFPKP---SEEKIKLILNQSAWTSQSNSLAS .:.: : .:.. . ..:.. :.: KIAA15 GSKEHSSGGTNLDRTNVSSQTPSAKRSLGFLPQPVPLSVKKLRCNQDYTGWNKPRVPLSS 230 240 250 260 270 280 170 180 190 200 210 220 KIAA18 CLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALF----MATDFRRQVLSLNLNGCNSLMKK ... :. :::::::::...:.:: .:.:. .: . . :.:... KIAA15 -------HQQQQLQGFSNLGNTCYMNAILQSLFSLQSFANDLLKQGIPWKKIPLNALIRR 290 300 310 320 330 230 240 250 260 270 280 KIAA18 LQHLFA----FLAHTQREAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEE-EKI . ::.. ..:... .. :. :.: :.: ::.:.:. ::. KIAA15 FAHLLVKKDICNSETKKDLLKKVKNAISATAERFSGYMQNDAHEFLSQCLDQLKEDMEKL 340 350 360 370 380 390 290 300 310 320 330 340 KIAA18 LKVQASHKPSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRTSDGEKTLIEKMFGGKLRTHIRCLN :. . : . :.: . :..: . : .. : : ... : : KIAA15 NKTWKT----EPVSGEENSPDISATRAYT---CPVITNLE-------F--EVQHSIICKA 400 410 420 430 440 350 360 370 380 390 KIAA18 CRSTSQKVEAFTDLSLAFCP--SSSLENMSVQDPASSPSIQDGGLMQASVPGPSEEPVVY : : : :.:::. . : .. : :.:: KIAA15 CGEIIPKREQFNDLSIDL-PRRKKPLPPRSIQDSLDLFFRAEELEYSCEKCGGKCALVRH 450 460 470 480 490 500 400 410 420 430 440 450 KIAA18 NPTTAAFICDSLVNEKTIGSPPNEFYCSENTSVPNESNKILVNKDVPQKPGGETTPSVTD KIAA15 KFNRLPRVLILHLKRYSFNVALSLNNKIGQQVIIPRYLTLSSHCTENTKPPFTLGWSAHM 510 520 530 540 550 560 >>KIAA1003 ( 917 res) hk09911 (917 aa) initn: 460 init1: 111 opt: 159 Z-score: 147.7 bits: 38.4 E(): 0.0041 Smith-Waterman score: 247; 23.973% identity (43.664% similar) in 584 aa overlap (141-603:114-654) 120 130 140 150 160 170 KIAA18 FLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILEAIKDFPKPSEEKIKLILNQSAWTSQSNSLASC .: : ::. .: . : ..:.: . KIAA10 RLWCYACEKEVFLEQRLAAPLLGSSSKFSEQDSPPPSHP-LKAVPIAVADEGESESEDDD 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 KIAA18 LSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLS----LNLNGCNSLMKKL :. : ::. ::::.::::...::: . . : . . .: :. KIAA10 LK------PRGLTGMKNLGNSCYMNAALQALSNCPPLTQFFLECGGLVRTDKKPALCKSY 150 160 170 180 190 230 240 250 260 270 280 KIAA18 QHLFAFLAHTQREAYA-PRIFFEASR--PPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEE--EKIL :.: . . : .: .:. : . .. . : : .::: .:.:: :.:.:::: : .. KIAA10 QKLVSEVWHKKRPSYVVPTSLSHGIKLVNPMFRGYAQQDTQEFLRCLMDQLHEELKEPVV 200 210 220 230 240 250 290 300 KIAA18 ------------------KVQASHKPSE--ILECSETSLQ-------------EVASKAA : .....::: .: :. .: . .. .. KIAA10 ATVALTEARDSDSSDTDEKREGDRSPSEDEFLSCDSSSDRGEGDGQGRGGGSSQAETELL 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 KIAA18 VLTETPRTSDGEKTLIEKMFG-GKLRTHIRCLNCRSTSQKVEAFTDLSLAFCPSSSLENM . :. :. . .. . .. :. :. ::. . .. . . . : : : : . 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KIAA10 RRRKEQRYRSVISDIFDGSILSLVQCLTCDRVSTTVETFQDLSLPIPGKEDLAKLHSAIY 440 450 460 470 480 490 450 460 470 KIAA18 KDVPQKPG--GET---------------------TPS------VT--DLLNYFLAPEILT ..:: ::: :.. ::: :: : : :.: . : KIAA10 QNVPAKPGACGDSYAAQGWLAFIVEYIRRFVVSCTPSWFWGPVVTLEDCLAAFFAADELK 500 510 520 530 540 550 480 490 500 510 520 530 KIAA18 GDNQYYCENCASLQNAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVRRKILDNVSLPLVLEL :::.: :: : .:.:. : .. . :: : . : :: .. : :: ..::.:: KIAA10 GDNMYSCERCKKLRNGVKYCKVLRLPEILCIHLKRFRHEVMYSF--KINSHVSFPL---- 560 570 580 590 600 610 540 550 560 570 580 KIAA18 PVKRITSFSSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCT-KLVPYLLSSVVVHSGI . :: :::. :: ... : : ::. : : KIAA10 -------------------EGLDLRPFLAKE----------CTSQITTYDLLSVICHHGT 620 630 640 590 600 610 620 630 640 KIAA18 SSESGHYYSYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGRDSPSAVFEQDLENKEMSK .. :::: .: .:. KIAA10 AG-SGHYIAYCQNVINGQWYEFDDQYVTEVHETVVQNAEGYVLFYRKSSEEAMRERQQVV 650 660 670 680 690 700 >>KIAA1097 ( 980 res) hk07058 (980 aa) initn: 349 init1: 114 opt: 156 Z-score: 144.7 bits: 37.9 E(): 0.0061 Smith-Waterman score: 221; 22.586% identity (49.100% similar) in 611 aa overlap (129-686:171-752) 100 110 120 130 140 150 KIAA18 SFKNDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEP--ILE-AIKDFPKPSEEKIKLIL .: . .: : : ...:: ::. .: : KIAA10 LTVNLTTLRVWCYACSKEVFLDRKLGTQPSLPHVRQPHQIQENSVQDFKIPSNTTLKTPL 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 KIAA18 NQSAWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLN : .. . :. ..: .. : ::: :.:::::::...::: . . :. . 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