# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh04567.fasta.huge -Q ../query/KIAA1884.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1884, 946 aa vs ./tmplib.25089 library 1986559 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.1039+/-0.00509; mu= 22.2248+/- 0.347 mean_var=113.0822+/-25.018, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.120608 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1894 ( 2977 res) ff08107 (2977) 3359 597.1 1e-170 KIAA1890 ( 1048 res) fk02692 (1048) 279 60.5 1.3e-09 KIAA0927 ( 1001 res) hg03734 (1001) 219 50.0 1.7e-06 >>KIAA1894 ( 2977 res) ff08107 (2977 aa) initn: 4311 init1: 2575 opt: 3359 Z-score: 3157.0 bits: 597.1 E(): 1e-170 Smith-Waterman score: 3702; 48.318% identity (71.121% similar) in 1070 aa overlap (1-946:1913-2977) 10 20 30 KIAA18 VFGKEYTVGTKAMYSCSEGYHLQAGAEATA .. .: :::.. : :..::.:.. .:: KIAA18 SSYGYHAWDAPVPACQAISCGIPKAPTNGGILTTDYLVGTRVTYFCNDGYRLSSKELTTA 1890 1900 1910 1920 1930 1940 40 50 60 70 80 90 KIAA18 ECLDTGLWSNRNVPPQCVPVTCPDVSSISVEHGRWRLIFETQYQFQAQLMLICDPGYYYT : . : :::.: :.:: ::::...:. .::::::.. ..:........ :::::. 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