# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/aj00515.fasta.nr -Q ../query/KIAA1882.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1882, 1176 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827235 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3395+/-0.000187; mu= 14.0327+/- 0.010 mean_var=74.3589+/-14.803, 0's: 30 Z-trim: 35 B-trim: 1187 in 1/65 Lambda= 0.148733 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|34536287|dbj|BAC87600.1| unnamed protein produc (1246) 7686 1659.4 0 gi|190359999|sp|Q96Q05.2|TPPC9_HUMAN RecName: Full (1148) 7665 1654.8 0 gi|114621885|ref|XP_001142596.1| PREDICTED: hypoth (1246) 7655 1652.7 0 gi|73974771|ref|XP_539179.2| PREDICTED: similar to (1147) 7324 1581.7 0 gi|190360000|sp|Q3U0M1.2|TPPC9_MOUSE RecName: Full (1148) 7174 1549.5 0 gi|109480849|ref|XP_235402.4| PREDICTED: similar t (1147) 7005 1513.2 0 gi|52545861|emb|CAH56384.1| hypothetical protein [ ( 950) 6299 1361.7 0 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gi|14042557|dbj|BAB55299.1| unnamed protein produc ( 545) 3604 783.2 0 gi|169642261|gb|AAI60882.1| Nibp protein [Rattus n ( 569) 3483 757.3 5.7e-216 gi|194035526|ref|XP_001926231.1| PREDICTED: simila (1117) 3351 729.2 3.3e-207 gi|119612606|gb|EAW92200.1| NIK and IKK{beta} bind (1096) 2961 645.5 5e-182 gi|210121256|gb|EEA68969.1| hypothetical protein B (2239) 2900 632.6 7.7e-178 gi|38196982|gb|AAH03650.3| NIBP protein [Homo sapi ( 432) 2881 628.0 3.5e-177 gi|90077000|dbj|BAE88180.1| unnamed protein produc ( 406) 2672 583.2 1.1e-163 gi|148725967|emb|CAN88308.1| novel protein [Danio ( 449) 2668 582.3 2.1e-163 gi|210103829|gb|EEA51860.1| hypothetical protein B ( 957) 2635 575.5 5.1e-161 gi|74216184|dbj|BAE23746.1| unnamed protein produc ( 696) 2611 570.2 1.4e-159 gi|109087567|ref|XP_001090245.1| PREDICTED: simila ( 394) 2590 565.5 2.1e-158 gi|47227543|emb|CAG04691.1| unnamed protein produc ( 885) 2578 563.2 2.3e-157 gi|115655484|ref|XP_790265.2| PREDICTED: similar t ( 989) 2572 562.0 6.2e-157 gi|26327613|dbj|BAC27550.1| unnamed protein produc ( 494) 1900 417.6 9.1e-114 gi|40850946|gb|AAH65288.1| NIBP protein [Homo sapi ( 279) 1888 414.8 3.5e-113 gi|215501330|gb|EEC10824.1| NIK- and IKBKB-binding (1195) 1490 329.8 5.6e-87 gi|212509059|gb|EEB12556.1| conserved hypothetical (1210) 1477 327.1 3.9e-86 gi|110762004|ref|XP_391949.3| PREDICTED: similar t (1181) 1476 326.8 4.5e-86 gi|193643531|ref|XP_001944574.1| PREDICTED: simila (1148) 1466 324.7 1.9e-85 gi|156552426|ref|XP_001600534.1| PREDICTED: simila (1169) 1460 323.4 4.8e-85 gi|54289213|gb|AAV31908.1| NIK and IKKbetta-bindin ( 211) 1450 320.7 5.4e-85 gi|148697463|gb|EDL29410.1| RIKEN cDNA 1810044A24 ( 365) 1368 303.3 1.7e-79 gi|12841522|dbj|BAB25242.1| unnamed protein produc ( 211) 1284 285.1 2.9e-74 gi|194148661|gb|EDW64359.1| GJ17430 [Drosophila vi (1345) 1179 263.1 7.5e-67 gi|193914640|gb|EDW13507.1| GI19653 [Drosophila mo (1316) 1166 260.4 5.1e-66 gi|194107207|gb|EDW29250.1| GL19601 [Drosophila pe (1311) 1153 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