# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pf01162s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1876.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1876, 803 aa vs ./tmplib.25089 library 1986702 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5795+/-0.00724; mu= 9.8768+/- 0.490 mean_var=189.7437+/-46.697, 0's: 0 Z-trim: 33 B-trim: 15 in 1/39 Lambda= 0.093109 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0957 ( 693 res) hj05670 ( 693) 451 73.4 9.1e-14 KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089) 437 71.8 4.4e-13 KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777) 351 60.5 1.8e-09 KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059) 344 59.3 2.5e-09 KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486) 308 54.9 1.2e-07 KIAA0396 ( 627 res) hg00180s1 ( 627) 293 52.1 2.1e-07 KIAA1758 ( 1662 res) fh20539(revised) (1662) 296 53.1 2.9e-07 KIAA1785 ( 617 res) fh12727 ( 617) 283 50.8 5.3e-07 KIAA0067 ( 1300 res) ha01038 (1300) 281 50.9 1e-06 KIAA0229 ( 1180 res) ha02570 (1180) 278 50.5 1.3e-06 KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644) 275 50.2 2e-06 KIAA1636 ( 1864 res) ff02660 (1864) 262 48.6 7.4e-06 KIAA0946 ( 667 res) hj04787 ( 667) 254 46.9 8.3e-06 KIAA0865 ( 1900 res) hk06640y1 (1900) 250 47.0 2.3e-05 KIAA1977 ( 606 res) fh18284(revised) ( 606) 237 44.6 3.8e-05 KIAA2015 ( 996 res) fk09763 ( 996) 221 42.7 0.00023 KIAA0388 ( 751 res) hj00039 ( 751) 211 41.2 0.00049 KIAA0771 ( 948 res) hk05113 ( 948) 208 40.9 0.00074 KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 ( 781) 200 39.7 0.0014 KIAA1323 ( 396 res) fh13878 ( 396) 195 38.7 0.0015 KIAA1334 ( 989 res) fh15842 ( 989) 200 39.9 0.0016 KIAA0172 ( 1366 res) ha02512s1 (1366) 200 40.1 0.002 KIAA1074 ( 1715 res) hj06637 (1715) 197 39.8 0.003 KIAA0823 ( 578 res) hh02763s1 ( 578) 188 38.0 0.0035 KIAA1146 ( 271 res) hg00368 ( 271) 183 36.9 0.0035 KIAA1255 ( 1232 res) hh14633s1 (1232) 191 38.8 0.0042 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 184 37.6 0.0062 KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416) 184 37.9 0.0089 >>KIAA0957 ( 693 res) hj05670 (693 aa) initn: 614 init1: 219 opt: 451 Z-score: 339.0 bits: 73.4 E(): 9.1e-14 Smith-Waterman score: 451; 30.108% identity (62.366% similar) in 279 aa overlap (359-635:13-287) 330 340 350 360 370 380 KIAA18 GLSQGPGKETLESALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSARQGELQKVLLMLVDGIDPNFKME ..: .: .:. ..:. .. : KIAA09 FMSQQDAVAALSERLLVAAYKGQTENVVQLINKGARVAVT-- 10 20 30 40 390 400 410 420 430 440 KIAA18 HQNKRSPLHAAAEAGHVDICHMLVQAGANIDTCSEDQRTPLMEAAENNHLEAVKYLIKAG .. :.::: ::. ::. . ..:..:: ..:. .. ..: : .:. .. : . ::. : KIAA09 -KHGRTPLHLAANKGHLPVVQILLKAGCDLDVQDDGDQTALHRATVVGNTEIIAALIHEG 50 60 70 80 90 450 460 470 480 490 500 KIAA18 ALVDPKDAEGSTCLHLAAKKGHYEVVQYLLSNGQMDVNCQDDGGWTPMIWATEYKHVDLV .: .: .:.: :: :. .: . .. :.. : .: .. .: : . : . .: . . KIAA09 CALDRQDKDGNTALHEASWHGFSQSAKLLVKAGA-NVLAKNKAGNTALHLACQNSHSQST 100 110 120 130 140 150 510 520 530 540 550 560 KIAA18 KLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCVDIAEILLAAKCDLHAVNIHGDSPLHIAARE ..:: :: ....: . ::: :: . ..: ..::.: :..: : ::. ::.:: KIAA09 RVLLLAGSRADLKNNAGDTCLHVAARYNHLSIIRLLLTAFCSVHEKNQAGDTALHVAAAL 160 170 180 190 200 210 570 580 590 600 610 620 KIAA18 NRYDCVVLFLSRDSDVTLKNKEGETPLQCASLNSQVWSALQMSKALQDS--APDRPSPVE :. . ..: .:.:. :. :.:::. : ... :: ..:: : : : : :: . KIAA09 NHKKVAKILLEAGADTTIVNNAGQTPLETARYHNNPEVALLLTKAPQGSVSAGDTPSSEQ 220 230 240 250 260 270 630 640 650 660 670 680 KIAA18 RIVSRDIARGYERIPIPCVNAVDSEPCPSNYKYVSQNCVTSPMNIDRNITHLQYCVCIDD .. .. :: KIAA09 AVARKEEAREEFLSASPEPRAKDDRRRKSRPKVSAFSDPTPPADQQPGHQKNLHAHNHPK 280 290 300 310 320 330 >>KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089 aa) initn: 384 init1: 238 opt: 437 Z-score: 326.7 bits: 71.8 E(): 4.4e-13 Smith-Waterman score: 437; 35.124% identity (63.223% similar) in 242 aa overlap (365-604:383-619) 340 350 360 370 380 390 KIAA18 GKETLESALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSARQGELQKVLLMLVDGIDPNFKMEHQNKR- : .:. . : :. :: . ...: .: KIAA12 VEHLLDHGAEVNHEDVDGRTALSVAALCVPASKGHASVVSLL----IDRGAEVDHCDKDG 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 KIAA18 -SPLHAAAEAGHVDICHMLVQAGANIDTCSEDQRTPLMEAAENNHLEAVKYLIKAGALVD .:: .:: ::::. .:...::..: ... ::::. :: .: .:. :. :: :: KIAA12 MTPLLVAAYEGHVDVVDLLLEGGADVDHTDNNGRTPLLAAASMGHASVVNTLLFWGAAVD 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 KIAA18 PKDAEGSTCLHLAAKKGHYEVVQYLLSNGQMDVNCQDDGGWTPMIWATEYKHVDLVKLLL :.:: : : .:. .:. :::. ::. : .: : .::.::::. :. : . . :. KIAA12 SIDSEGRTVLSIASAQGNVEVVRTLLDRG-LDENHRDDAGWTPLHMAAFEGHRLICEALI 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 KIAA18 SKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCVDIAEILLAAKCDLHAVNIHGDSPLHIAARENRYD .:. : ::. : . :. : : ..::: : .. . : . :..:: :.. : KIAA12 EQGARTNEIDNDGRIPFILASQEGHYDCVQILLENKSNIDQRGYDGRNALRVAALEGHRD 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 KIAA18 CVVLFLSRDSDVTLKNKEGETPLQCASLNSQVWSALQMSKALQDSAPDRPSPVERIVSRD : :..:. .::. :. .:. : .:..:. KIAA12 IVELLFSHGADVNCKDADGRPTLYILALENQLTMAEYFLENGANVEASDAEGRTALHVSC 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 KIAA18 IARGYERIPIPCVNAVDSEPCPSNYKYVSQNCVTSPMNIDRNITHLQYCVCIDDCSSSNC KIAA12 WQGHMEMVQVLIAYHADVNAADNEKRSALQSAAWQGHVKVVQLLIEHGAVVDHTCNQGAT 650 660 670 680 690 700 >>KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777 aa) initn: 531 init1: 205 opt: 351 Z-score: 261.9 bits: 60.5 E(): 1.8e-09 Smith-Waterman score: 391; 31.513% identity (65.966% similar) in 238 aa overlap (361-598:147-381) 340 350 360 370 380 390 KIAA18 SQGPGKETLESALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSARQGELQKVLLMLVDGIDPNFKMEHQ . ..: .:. . : :.: .: : . .. KIAA12 ACYKGRTDVVELLLSHGANPSVTGLYSVYPIIWAAGRGHADIVHLLLQNGAKVNCSDKYG 120 130 140 150 160 170 400 410 420 430 440 450 KIAA18 NKRSPLHAAAEAGHVDICHMLVQAGANIDTCSEDQRTPLMEAAENNHLEAVKYLIKAGAL . .:: ::. ::.. . :. ::..: . .. : :. :..... ..:: ..: . KIAA12 T--TPLVWAARKGHLECVKHLLAMGADVDQEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRNPN 180 190 200 210 220 230 460 470 480 490 500 510 KIAA18 VDPKDAEGSTCLHLAAKKGHYEVVQYLLSNGQMDVNCQDDGGWTPMIWATEYKHVDLVKL :. : .:.: : .:.:.:: :.:: ::. : . :: : .: : .: :.. ::..:. KIAA12 VNLTDKDGNTALMIASKEGHTEIVQDLLDAGTY-VNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRA 240 250 260 270 280 290 520 530 540 550 560 570 KIAA18 LLSKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCVDIAEILLAAKCDLHAVNIHGDSPLHIAARENR ::.: .::.:: .... :.::. .: . ... .: . : . . :..:: :.. KIAA12 LLQKYADIDIRGQDNKTALYWAVEKGNATMVRDILQCNPDTEICTKDGETPLIKATKMRN 300 310 320 330 340 350 580 590 600 610 620 630 KIAA18 YDCVVLFLSRDSDVTLKNKEGETPLQCASLNSQVWSALQMSKALQDSAPDRPSPVERIVS . : :.:.. . :. .:.:.:::. : KIAA12 IEVVELLLDKGAKVSAVDKKGDTPLHIAIRGRSRKLAELLLRNPKDGRLLYRPNKAGETP 360 370 380 390 400 410 >>KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059 aa) initn: 880 init1: 320 opt: 344 Z-score: 259.3 bits: 59.3 E(): 2.5e-09 Smith-Waterman score: 400; 33.071% identity (62.205% similar) in 254 aa overlap (353-603:11-257) 330 340 350 360 370 380 KIAA18 LGRPTPGLSQGPGKETLESALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSARQGELQKVLLMLVDGID ::: .:. : . .:. ..: .. : KIAA03 GAEATAMAFLKLRDQPS-LVQAIFNGDPDEVRALIFKKED 10 20 30 390 400 410 420 430 440 KIAA18 PNFKMEHQNKRSPLHAAAEAGHVDICHMLVQAGANIDTCSEDQRTPLMEAAENNHLEAVK ::. ..::.:::::: : ..: ..:. .:: ... . ::: .:. . :::. KIAA03 VNFQ--DNEKRTPLHAAAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKWLTPLHRAVASCSEEAVQ 40 50 60 70 80 90 450 460 470 480 490 KIAA18 YLIKAGALVDPKDAEGSTCLHLAAKKGHY---EVVQYLLSNGQMDVNCQDDGGWTPMIWA :.: .: :. .: . .: ::.:: . :.. :::: :: .: .: : . : KIAA03 VLLKHSADVNARDKNWQTPLHIAAANKAVKCAEALVPLLSN----VNVSDRAGRTALHHA 100 110 120 130 140 150 500 510 520 530 540 550 KIAA18 TEYKHVDLVKLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCVDIAEILLAAKCDLHAVNIHGD . : ..::::::.:..:: :... .::::. : ......:.. .. . .. KIAA03 AFSGHGEMVKLLLSRGANINAFDKKDRRAIHWAAYMGHIEVVKLLVSHGAEVTCKDKKSY 160 170 180 190 200 210 560 570 580 590 600 610 KIAA18 SPLHIAARENRYDCVVLFLSRDSDVTLKNKEGETPLQCASLNSQVWSALQMSKALQDSAP .::: :: . . : .:. :.. : :.:::. : :.: KIAA03 TPLHAAASSGMISVVKYLLDLGVDMNEPNAYGNTPLHVACYNGQDVVVNELIDCGAIVNQ 220 230 240 250 260 270 620 630 640 650 660 670 KIAA18 DRPSPVERIVSRDIARGYERIPIPCVNAVDSEPCPSNYKYVSQNCVTSPMNIDRNITHLQ KIAA03 KNEKGFTPLHFAAASTHGALCLELLVGNGADVNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQTIIQ 280 290 300 310 320 330 >>KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486 aa) initn: 294 init1: 294 opt: 308 Z-score: 229.1 bits: 54.9 E(): 1.2e-07 Smith-Waterman score: 378; 28.704% identity (62.037% similar) in 324 aa overlap (278-598:109-425) 250 260 270 280 290 300 KIAA18 HCGEESSKAKEVTIAKADTTSTVTPVPGQEKGSALEGRADTTTGSAAGPPLSEDDKLQGA ...: :..:. . . : :: : .... KIAA06 FADPEVLRRLTSSVSCALDEAAAALTRMRAESTANAGQSDNRSLAEA---CSEGD-VNAV 80 90 100 110 120 130 310 320 330 340 350 360 KIAA18 ASHVPEGFDPTGPAGLGRPTPGLSQGPGKETLESALIALDSE-KPKKLRFHPKQLYFSAR . . :: . . . :. :. . : : ..:.:. .. . . .. .:. .: KIAA06 RKLLIEGRSVNEHTEEGESLLCLACSAGYYELAQVLLAMHANVEDRGIKGDITSLMAAAN 140 150 160 170 180 190 370 380 390 400 410 420 KIAA18 QGELQKVLLMLVDGIDPNFKMEHQNKRSPLHAAAEAGHVDICHMLVQAGANIDTCSEDQR :... : :.:. : : . : . : : .:.::. ..:...::.:. .:. . KIAA06 GGHVKIVKLLLAHKADVNAQSSTGN--TALTYACAGGYVDVVKVLLESGASIEDHNENGH 200 210 220 230 240 250 430 440 450 460 470 480 KIAA18 TPLMEAAENNHLEAVKYLIKAGALVDPKDAE-GSTCLHLAAKKGHYEVVQYLLSNGQMDV ::::::. .:.:... :.. :: .. .. : . : :: ::: :.:..:: : : KIAA06 TPLMEAGSAGHVEVARLLLENGAGINTHSNEFKESALTLACYKGHLEMVRFLLEAGA-DQ 260 270 280 290 300 310 490 500 510 520 530 540 KIAA18 NCQDDGGWTPMIWATEYKHVDLVKLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCVDIAEILL . . : : .. : ::....:::..:...:. . . : :: .: :..: .:. KIAA06 EHKTDEMHTALMEACMDGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLI 320 330 340 350 360 370 550 560 570 580 590 600 KIAA18 AAKCDLHAVNIHGDSPLHIAARENRYDCVVLFLSRDSDVTLKNKEG-ETPLQCASLNSQV .:. :: .: .:: ::::.. . :.:.:.. .... ...: :: : : KIAA06 ERGASLEEVNDEGYTPLMEAAREGHEEMVALLLGQGANINAQTEETQETALTLACCGGFL 380 390 400 410 420 430 610 620 630 640 650 660 KIAA18 WSALQMSKALQDSAPDRPSPVERIVSRDIARGYERIPIPCVNAVDSEPCPSNYKYVSQNC KIAA06 EVADFLIKAGADIELGCSTPLMEAAQEGHLELVKYLLAAGANVHATTATGDTALTYACEN 440 450 460 470 480 490 >>KIAA0396 ( 627 res) hg00180s1 (627 aa) initn: 342 init1: 206 opt: 293 Z-score: 224.8 bits: 52.1 E(): 2.1e-07 Smith-Waterman score: 298; 31.646% identity (59.072% similar) in 237 aa overlap (394-616:90-320) 370 380 390 400 410 420 KIAA18 SARQGELQKVLLMLVDGIDPNFKMEHQNKRSPLHAAAEAGHVDICHMLVQAGANIDTCSE . : :: ::: .. ..::. :::.. . KIAA03 KVVRLLLEHYRVQTQQTGTVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTV 60 70 80 90 100 110 430 440 450 460 470 480 KIAA18 DQRTPLMEAAENNHLEAVKYLIKAGALVDPKDAEGSTCLHLAAKKGHYEVVQYLLSNGQM . ::: : ...:. ::::.. .: .. . .::: .:: ::: .::.::: . . KIAA03 TNSTPLRAACFDGRLDIVKYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQ-RA 120 130 140 150 160 170 490 500 510 520 530 540 KIAA18 DVNCQDDGGWTPMIWATEYKHVDLVKLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCVDIAEI : : . : : . .:.: :.:.:: :.. . : . ... :. :: : .:..:. KIAA03 DPNAKAHCGATALHFAAEAGHIDIVKELIKWRAAI-VVNGHGMTPLKVAAESCKADVVEL 180 190 200 210 220 230 550 560 570 580 KIAA18 LLA-AKCD----LHAVNIHGDSPLHIAARENRYDCV----VLFLS-----RDSDVTLKNK ::. : :: ..:... : : ::: :: . :.:. .:.: :. : KIAA03 LLSHADCDRRSRIEALELLGAS--FANDREN-YDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILE-K 240 250 260 270 280 290 590 600 610 620 630 640 KIAA18 EGETPLQCASLNSQVWSALQMSKALQDSAPDRPSPVERIVSRDIARGYERIPIPCVNAVD : :.. . .. . .. . :: KIAA03 EVLPPIHAYGNRTECRNPQELESIRQDRDALHMEGLIVRERILGADNIDVSHPIIYRGAV 300 310 320 330 340 350 >>KIAA1758 ( 1662 res) fh20539(revised) (1662 aa) initn: 354 init1: 186 opt: 296 Z-score: 222.3 bits: 53.1 E(): 2.9e-07 Smith-Waterman score: 300; 25.216% identity (52.155% similar) in 464 aa overlap (252-676:567-1004) 230 240 250 260 270 280 KIAA18 CQPESSISHRFHKDCASRVNNASYCPHCGEESSKAKEVTIAKADTTSTVTPVPGQEKGSA .::.:.. : ::.:. .... . .:. KIAA17 DRGNPPPIPPKKPGLSQTPSPPHPQLKVIIDSSRASN-TGAKVDNKTVASTPSSLPQGNR 540 550 560 570 580 590 290 300 310 320 330 340 KIAA18 LEGRADTTTGSAAG-PPLSEDDKLQGAASHVPEGFDPTGPAGLGRPTPGLSQGPGKETLE . .. . .:. :: : . :. . .. . .. ::::.: :. . KIAA17 VINEENLPKSSSPQLPPKPSIDLTVAPAGCAVSALATSQVGAWPAATPGLNQ-PACS--D 600 610 620 630 640 650 350 360 370 380 390 KIAA18 SALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSA---RQGELQKVLLMLVDGIDPNFK-MEHQNKRSPL :.:. : . : . :: : : . ::. ..: .:.. . .. .:: KIAA17 SSLVI-----PTTIAFCSSINPVSASSCRPGA-SDSLLVTASGWSPSLTPLLMSGGPAPL 660 670 680 690 700 400 410 420 430 440 KIAA18 -------HAAAEAGHVDICHMLV-QAGANIDTCSEDQRTPLMEAAENNHLEAVKYLIKAG . :: :.: . ::. . : .:. :: .. :. ::.:.: . :. :..: KIAA17 AGRPTLLQQAAAQGNVTLLSMLLNEEGLDINYSCEDGHSALYSAAKNGHTDCVRLLLSAE 710 720 730 740 750 760 450 460 470 480 490 500 KIAA18 ALVDPKDAEGSTCLHLAAKKGHYEVVQYLLSNGQMDVNCQDDGGWTPMIWATEYKHVDLV : :. : .: : : :: .::.: :. :.: . ..: ::: ::. : . . . . KIAA17 AQVNAADKNGFTPLCAAAAQGHFECVELLISY-DANINHAADGGQTPLYLACKNGNKECI 770 780 790 800 810 820 510 520 530 540 550 560 KIAA18 KLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCVDIAEILLAAKCDLHAVNIHGDSPLHIAARE :::: :.. ... .. .: :. .: :: ..:. : . ::.: : KIAA17 KLLLEAGTNRSVKTTDGWTPVHAAVDTGNVDSLKLLM-----YHRIPAHGNS-----FNE 830 840 850 860 870 570 580 590 600 610 KIAA18 NRYDCVVLFLSRDSDVTLKNKEGET-PLQCASL----NSQVWSALQM--SKALQDS---- .. . :. : : .. :: . :. :.: : . :.: .. ::.... KIAA17 EESESSVF----DLDGGEESPEGISKPVVPADLINHANREGWTAAHIAASKGFKNCLEIL 880 890 900 910 920 930 620 630 640 650 660 KIAA18 ------APDRPSPVERIVSRDIARGYERIPIPCVNAVD-------SEPCPSNYKYVSQNC :.: . .: : .:.: . . .::. .: :::: . .: KIAA17 CRHGGLEPERRDKCNRTV-HDVATDDCKHLLENLNALKIPLRISVGEIEPSNYGSDDLEC 940 950 960 970 980 990 670 680 690 700 710 720 KIAA18 VTS--PMNIDRNITHLQYCVCIDDCSSSNCMCGQLSMRCWYDKDGRLLPEFNMAEPPLIF .. .:: .. . KIAA17 ENTICALNIRKQTSWDDFSKAVSQALTNHFQAISSDGWWSLEDVTCNNTTDSNIGLSARS 1000 1010 1020 1030 1040 1050 >>KIAA1785 ( 617 res) fh12727 (617 aa) initn: 290 init1: 233 opt: 283 Z-score: 217.6 bits: 50.8 E(): 5.3e-07 Smith-Waterman score: 296; 25.850% identity (57.483% similar) in 294 aa overlap (361-638:7-297) 340 350 360 370 380 KIAA18 SQGPGKETLESALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSARQGELQKVLLMLVDGIDPNFKM--- .. .::.:.:. . .:.. . . KIAA17 MDLKTAVFNAARDGKLRLLTKLLASKSKEEVSSLIS 10 20 30 390 400 410 420 430 KIAA18 EHQNKRSPLHAAAEAGHVDI-------CHMLVQAGA--NIDTCSEDQRTPLMEAAENNHL :. : .:: ::. ::.:. : ...:. :.: . . :: :. .:: KIAA17 EKTNGATPLLMAARYGHLDMVEFLLEQCSASIEVGGSVNFDGETIEGAPPLWAASAAGHL 40 50 60 70 80 90 440 450 460 470 480 490 KIAA18 EAVKYLIKAGALVDPKDAEGSTCLHLAAKKGHYEVVQYLLSNGQMDVNCQDDGGWTPMIW ..:. :.. :: :. .:: :. : :: :.:.::. . . :.. .. : : .. 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KIAA17 NMRYSDRTNIISKPVPQTLIMAYDYAKEVNSAEELEGLIADPDEMRMQALLIRERILGPS 280 290 300 310 320 330 >>KIAA0067 ( 1300 res) ha01038 (1300 aa) initn: 261 init1: 221 opt: 281 Z-score: 212.6 bits: 50.9 E(): 1e-06 Smith-Waterman score: 397; 36.264% identity (63.187% similar) in 182 aa overlap (632-798:690-868) 610 620 630 640 650 660 KIAA18 SQVWSALQMSKALQDSAPDRPSPVERIVSRDIARGYERIPIPCVNAVDSEPCPSNYKYVS ::. : : .:. ::: .:. : : . : . KIAA00 DFLFLEMFCLDPYVLVDRKFQPYKPFYYILDITYGKEDVPLSCVNEIDTTP-PPQVAYSK 660 670 680 690 700 710 670 680 690 700 710 KIAA18 QNCVTSPMNIDRNITHLQYCVCIDDC-SSSNCMCGQLSMR---CWYDKDGRLLP----EF . . . :. . : : : : : ..:.: : ::... : :.. : .. KIAA00 ERIPGKGVFINTGPEFLVGCDCKDGCRDKSKCACHQLTIQATAC--TPGGQINPNSGYQY 720 730 740 750 760 770 720 730 740 750 760 KIAA18 NMAE---PPLIFECNHACSCWRN-CRNRVVQNGLRARLQLYRTRDMGWGVRSLQDIPPGT . : : ..:::. :.: : : ::.::.::..::::..:.. :::.: :.:: :. 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KIAA00 FVCIYAGKILTDDFADKEGLEMGDEYFANLDHIESVENFKEGYESDAPCSSDSSGVDLKD 840 850 860 870 880 890 KIAA00 QEDGNSGTEDPEESNDDSSDDNFCKDEDFSTSSVWRSYATRRQTRGQKENGLSETTSKDS 900 910 920 930 940 950 >>KIAA0229 ( 1180 res) ha02570 (1180 aa) initn: 361 init1: 166 opt: 278 Z-score: 210.9 bits: 50.5 E(): 1.3e-06 Smith-Waterman score: 314; 32.447% identity (65.957% similar) in 188 aa overlap (415-600:116-302) 390 400 410 420 430 440 KIAA18 FKMEHQNKRSPLHAAAEAGHVDICHMLVQAGANIDTCSEDQRTPLMEAAENNHLEAVKYL : :.. . ::: .:: :.: ..:. : KIAA02 SGGGGGGSGGGGGGLGSSSHPLSSLLSMWRGPNVNCVDSTGYTPLHHAALNGHKDVVEVL 90 100 110 120 130 140 450 460 470 480 490 500 KIAA18 IKAGALVDPKDAEGSTCLHLAAKKGHYEVVQYLLSNG--QMDVNCQDDGGWTPMIWATEY .. ::.. :..: ::::: :: ..:. :. .: . :: :.. . : . :..: KIAA02 LRNDALTNVADSKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPSHTRVNEQNNDNETALHCAAQY 150 160 170 180 190 200 510 520 530 540 550 560 KIAA18 KHVDLVKLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCVDIAEILLAAKCDLHAVNIHGDSPL :...::.:: . .: ..:.:. . : ::. : ......:: :. .: . : . .:: KIAA02 GHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSCNTKKHTPL 210 220 230 240 250 260 570 580 590 600 610 620 KIAA18 HIAARENRYDCVVLFLSRDSDVTLKNKEGETPLQCASLNSQVWSALQMSKALQDSAPDRP :.:::... : ..:. : . ... : . :. :.: KIAA02 HLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMG-SALHEAALFGKTDVVQILLAAGTDVNIKDN 270 280 290 300 310 320 630 640 650 660 670 680 KIAA18 SPVERIVSRDIARGYERIPIPCVNAVDSEPCPSNYKYVSQNCVTSPMNIDRNITHLQYCV KIAA02 HGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKEVDKTPPPQPPLISSMDSISQKSQG 330 340 350 360 370 380 803 residues in 1 query sequences 1986702 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:20:25 2008 done: Thu Dec 18 15:20:26 2008 Total Scan time: 0.590 Total Display time: 0.220 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]