# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj18636.fasta.huge -Q ../query/KIAA1867.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1867, 779 aa vs ./tmplib.25089 library 1986726 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3884+/-0.00505; mu= 13.2931+/- 0.343 mean_var=107.5904+/-25.958, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 13 in 1/39 Lambda= 0.123648 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 343 72.8 2.9e-13 KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092) 298 64.9 9.6e-11 KIAA0343 ( 1187 res) hg01457 (1187) 226 51.8 4.8e-07 KIAA1496 ( 920 res) fj09513 ( 920) 223 51.1 5.9e-07 KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222) 155 39.1 0.0032 >>KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496 aa) initn: 183 init1: 126 opt: 343 Z-score: 329.9 bits: 72.8 E(): 2.9e-13 Smith-Waterman score: 354; 26.862% identity (54.853% similar) in 443 aa overlap (130-537:233-649) 100 110 120 130 140 150 KIAA18 YLVVGNHLSGEHHLKILRAELQDDAVYECQAIQAAIRSRPARL----TVLVPPDD----- : ::: : :. .. . :.. KIAA02 RLRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNCER 210 220 230 240 250 260 160 170 180 190 200 KIAA18 PVILGGPV-ISLRAGDPLNLTCHADNAKPAASIIWLRKGEVINGATYSK-TLLRDGKRES : : . : .. .:. . .::.:.. .: :::::... .. : :. .:: :: KIAA02 PRITSEPQDADVTSGNTVYFTCRAEG-NPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDG---- 270 280 290 300 310 210 220 230 240 250 260 KIAA18 IVSTLFISPGDVENGQSIV-CRATNKAIPGGKETSVTIDIQH---PPLVNLSVEPQ--PV ::.:. . :. :.: : : : : :. . . ... : .. ..:: : KIAA02 ---TLMIQ-NTQETDQGIYQCMAKNVA---GEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEV 320 330 340 350 360 370 270 280 290 300 310 KIAA18 LEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKRGQIIKEASGEVYRTTVDYTYFSEPV-------SC : . ::..::: ..: . :.. . .. .: : :... : .: KIAA02 LVGESVTLECSATGHPP-PRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYAC 380 390 400 410 420 320 330 340 350 360 370 KIAA18 EVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQSLLVDLGSDAIFSCAWTGNPSLTIVWMKRGSG .:: . :.. . . : :..:. ::. .: :. . :.: ::: .:.: : :: KIAA02 SATNNIDSVHATAFIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQ 430 440 450 460 470 480 380 390 400 410 420 KIAA18 V-------VLSNEKTLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPRVGAGEREVTLTVNG--PPIISST . :::. :: ...: .: :.: :.:: .:. . . :::. :...: KIAA02 LSVDRRHLVLSS-GTLRISGVALHDQGQYECQAV-NIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASI 490 500 510 520 530 540 430 440 450 460 470 480 KIAA18 QTQHALH-GEKGQIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLESGTSGRYTVETISTEEGVISTLT .. ... : . :. : .. : : : .:... .. ::.. . . :: :: KIAA02 PSDTTVEVGANVQLPCSSQGEPEP---AITWNKDGVQVTESGKFHI----SPEGF---LT 550 560 570 580 590 490 500 510 520 530 540 KIAA18 ISNIVRADFQTIYNCTAWNSFGSDTEIIRLKEQGSEM-KSGAGLEAESVPMAVIIGVAVG :... :: :.:.: :..:: . . :. . .. ..: . : :. :. KIAA02 INDVGPADAGR-YECVARNTIGSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAI 600 610 620 630 640 650 550 560 570 580 590 600 KIAA18 AGVAFLVLMATIVAFCCARSQRNLKGVVSAKNDIRVEIVHKEPASGREGEEHSTIKQLMM KIAA02 NSTRTHLFDSRPRSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLN 660 670 680 690 700 710 >>KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092 aa) initn: 227 init1: 143 opt: 298 Z-score: 284.8 bits: 64.9 E(): 9.6e-11 Smith-Waterman score: 391; 24.851% identity (53.280% similar) in 503 aa overlap (48-518:450-924) 20 30 40 50 60 70 KIAA18 SQELGLQKRGCCLVLGYMAKDKFRRMNEGQVYSFSQQPQDQVVVSGQPVTLLCAIP-EYD : :::.. :: :. .:.:: KIAA11 SGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEK----VVNPGEQFSLMCAAKGAPP 420 430 440 450 460 470 80 90 100 110 120 130 KIAA18 GFVLWIKDGLALGVGRDLSSYP-QYLVV-GNHLSGEHHLKILRAELQDDAVYECQAIQAA : : : . :: : :: . :. .: :... ...: .::.: : . . KIAA11 PTVTWALDDEP--IVRDGSHRTNQYTMSDGTTIS---HMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLV 480 490 500 510 520 530 140 150 160 170 180 190 KIAA18 IRSR-PARLTVLVPPDDPVILGGPVISLRAGDPLNLTCHADNAKPAASIIWLRKGEVING .. ::..: ::. : . :. :: ..:.. . : :: : . . KIAA11 GSAEYQARINVRGPPS---IRAMRNITAVAGRDTLINCRV-IGYPYYSIKWYKDA----- 540 550 560 570 580 200 210 220 230 240 250 KIAA18 ATYSKTLLRDGKRESIVSTLFISPGDVENGQS---IVCRATNKAIPGGKETSVTIDIQHP :: :..:. . . .. ::..:.. .: . . . .. :: . .. : KIAA11 -----LLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQ-SVHVAVKVP 590 600 610 620 630 260 270 280 290 300 KIAA18 PLVNLSVEPQPVLEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKRGQIIKEASG-----EVYRTTVD ::.. : :. ... . : .... . : : ::.: .:: . . .... KIAA11 PLIQ-PFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQ 640 650 660 670 680 690 310 320 330 340 350 360 KIAA18 YTYFSEP----VSCEVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQSLLVDLGSDAIFSCAWTG . : .: ..:: .... : . : ::....:.. :. ....:. : KIAA11 ISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDG 700 710 720 730 740 750 370 380 390 400 KIAA18 NPSLTIVWMK-RGSG-------VVLSNE------KTLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPRVG : ..: . .::: : :... ..: .. : .:: : :.:.: :: KIAA11 YPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQAS-NGVG 760 770 780 790 800 810 410 420 430 440 450 460 KIAA18 AG-EREVTLTVNGPPIISS-TQTQHALHGEKGQIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLESGT . . . :::. : .:.: .: :..:. ...: :. : : : ..:.. KIAA11 TDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPII-IRWEKGDTVIDPDR 820 830 840 850 860 870 470 480 490 500 510 520 KIAA18 SGRYTVETISTEEGVISTLTISNIVRADFQTIYNCTAWNSFGSDTEIIRLKEQGSEMKSG ::.. : .. . :.::: .. :.: .....: : ::.: : .:.: : KIAA11 VMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGD-SVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPE 880 890 900 910 920 930 530 540 550 560 570 580 KIAA18 AGLEAESVPMAVIIGVAVGAGVAFLVLMATIVAFCCARSQRNLKGVVSAKNDIRVEIVHK KIAA11 LEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIVDL 940 950 960 970 980 990 >>KIAA0343 ( 1187 res) hg01457 (1187 aa) initn: 128 init1: 103 opt: 226 Z-score: 218.3 bits: 51.8 E(): 4.8e-07 Smith-Waterman score: 292; 23.611% identity (52.976% similar) in 504 aa overlap (53-516:58-529) 30 40 50 60 70 80 KIAA18 LQKRGCCLVLGYMAKDKFRRMNEGQVYSFSQQPQDQVVVSGQPVTLLC-AIPEYDGFVLW :.:.: .. . ... : : . : KIAA03 LFLCQMISALEVPLDPKLLEDLVQPPTITQQSPKDYIIDPRENIVIQCEAKGKPPPSFSW 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 KIAA18 IKDGLALGVGRDLSSYPQYLVVGNHLSGEHHLKIL---RAELQDDAVYECQAIQAAIRSR ..: . . .: : ::. . .: ..:. .:: . .::.: : . :. KIAA03 TRNGTHFDIDKD----P--LVTMKPGTGTLIINIMSEGKAETYE-GVYQCTARNE--RGA 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 KIAA18 PARLTVLVPPD-DPVILGGPV--ISLRAGDPLNLTCHADNAKPAASIIWL---------- . ...: :. .:. . :.:..:. : : :. . : :.:. KIAA03 AVSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPIIFWMDNSFQRLPQS 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 KIAA18 -RKGEVINGATY-SKTLLRDGKRESIVSTLFISPGDVENGQSIVCRATNKAIPGGKETSV : .. .:: : :..: .: ... : . : ... : : .. . ...: KIAA03 ERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQKQPISVKVISAK--SSRERPP 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 KIAA18 TIDIQHPPLVNLSVEPQPVLEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKR-GQIIKEASGEVYRT :. : : : . . :. ::....: :.. :. : :::. :.. :. . ::.. KIAA03 TF---LTPEGNASNKEE--LRGNVLSLECIAEGLPTPIIY-WAKEDGMLPKNRT--VYKN 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 KIAA18 ---TVDYTYFSEPVS----CEVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQSLLVDLGSDAIF :.. . :: : : . ::::. . . .: : .: : ::.:... : :. . KIAA03 FEKTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIHHTISVRVKAAPYWITAPQNLVLSPGEDGTL 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 KIAA18 SCAWTGNPSLTIVWMKRGSGVVLSNEK--------TLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPRVG : .:::. : :. : . .. . :. ...:...... : : : . : KIAA03 ICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKIDGDTIIFSNVQERSSAVYQCNAS-NEYG 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 KIAA18 A--GEREVTLTVNGPPIISSTQTQHALHGEK-GQIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLESG .. :.. .. : :.. ..: . . ... . . : . ..: : : : .: : KIAA03 YLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAFFGSPLPT-IEW-FK------G 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 KIAA18 TSGRYTVETIST--EEGVISTLTISNIVRADFQTIYNCTAWNSFGSDTEIIRLKEQGSEM ..: : : . :.: :: : ... : :.:.: :..: . ..:. KIAA03 AKGSALHEDIYVLHENG---TLEIP-VAQKDSTGTYTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDATW 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 KIAA18 KSGAGLEAESVPMAVIIGVAVGAGVAFLVLMATIVAFCCARSQRNLKGVVSAKNDIRVEI KIAA03 IVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNRELPSDERFTVDKDHLVVADVS 540 550 560 570 580 590 >>KIAA1496 ( 920 res) fj09513 (920 aa) initn: 100 init1: 58 opt: 223 Z-score: 216.7 bits: 51.1 E(): 5.9e-07 Smith-Waterman score: 226; 23.620% identity (51.214% similar) in 453 aa overlap (42-459:7-430) 20 30 40 50 60 70 KIAA18 VCFFLFSQELGLQKRGCCLVLGYMAKDKFRRMNEGQVYSFSQQPQDQVVVS-GQPVTLLC ... . . .:. . .. : : :: :.::: KIAA14 IVSREAKLQFAYLENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLC 10 20 30 80 90 100 110 120 KIAA18 AIPEYDGFV--LWIKDGLALGVGRDLSSYPQYLVVGNH--LSGEH-HLKILRAELQDDAV . : ..: . :: .. ::... .. .: : :: : ..: .: . KIAA14 GPPPHSGELSYAWI-----------FNEYPSFVEEDSRRFVSQETGHLYISKVEPSDVGN 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 KIAA18 YEC----QAIQAAIRSRPARLTV----LVPPDDPVI-LGGP-VISLRAGDPLNLTCHADN : : .. .: . . :. :.. .. .: : . : .. :. ..: : : . KIAA14 YTCVVTSMVTNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYEPKIEVQFPETLPAAKGSTVKLECFALG 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 KIAA18 AKPAASIIWLRKGEVINGATYSKTLLRDGKRESIVSTLFISPGDVENGQSIVCRATN--- .: .: : :. .: .:. . : ... ..: : . :.. : : : : KIAA14 -NPIPQINWRRS----DGLPFSSKI----KLRKFSGVLEIPNFQQEDAGSYECIAENSRG 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 KIAA18 KAIPGGKETSVTIDIQHPPLVNLSVEPQPVLEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKRGQ-I : . :. : . .: :.: . . ..::.. ..: :...: .::: : : . KIAA14 KNVARGRLTYYA----KPHWVQLIKDVEIAVEDSLY-WECRASGKPK-PSYRWLKNGAAL 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 KIAA18 IKEASGEVYRTTVDYTYFSEPVS----CEVTNALGSTNLSRTVDVYFG-PRMTTEPQSLL . : .. .. . .: : : . : : . : . : . : .. .:.. : KIAA14 VLEERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPMKKL 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 KIAA18 VDL--GSDAIFSCAWTGNPSLTIVWMKRGSGVV-------LSNEKTLTLKSVRQEDAGKY :.. :: . ..: ..: : :.:. : : :. : . .: . ::: : KIAA14 VQVQVGSLVSLDCKPRASPRALSSW-KKGDVSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKADAGTY 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 KIAA18 VCRAVVPRVGAGEREVTLTVNGPPIISSTQTQHALH-GEKGQIKCFIRSTPPPDRIAWSW .: : . : .. . :.:. : :. . .. . ::. . : .. : : : ..: KIAA14 TCMAE-NQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLD-IIFTW 370 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 KIAA18 KENVLESGTSGRYTVETISTEEGVISTLTISNIVRADFQTIYNCTAWNSFGSDTEIIRLK : KIAA14 YFNGALADFKKDGSHFEKVGGSSSGDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDSVSSAADLIVR 430 440 450 460 470 480 >>KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222 aa) initn: 109 init1: 109 opt: 155 Z-score: 149.7 bits: 39.1 E(): 0.0032 Smith-Waterman score: 278; 24.330% identity (50.575% similar) in 522 aa overlap (42-509:180-665) 20 30 40 50 60 70 KIAA18 VCFFLFSQELGLQKRGCCLVLGYMAKDKFRRMNEGQVYSFSQQPQDQVVVS-GQPVTLLC :.. .. . .. : :::. : :.:: : KIAA07 FRSGGRPEEYEGEYQCFARNKFGTALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQC 150 160 170 180 190 200 80 90 100 110 120 KIAA18 AIPEY--DGFVLWIKDGLALGVGRDLSSYPQYLVVGNHLSGEHHLKILRAELQDDAVYEC : . ..:..... . .: : .: . . ... ..: : : : KIAA07 NPPPGLPSPVIFWMSSSME-PITQDKR------VSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTD--YSC 210 220 230 240 250 260 130 140 150 160 KIAA18 QA---IQAAIRSR-PARLTVLV--PPDDPVILGGP-VISLRA------------------ .: . .:... : : ::. : .: . . : . : :. KIAA07 NARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTNHPYNDSSLRNHPDMYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQ 270 280 290 300 310 320 170 180 190 200 210 KIAA18 ----GDPLNLTCHADNAKPAASIIWLRKGEVINGATYSKTLLRDGKRESIVSTLFISPGD : : : : :... :. .: : .:: : : .: :.. ..: :. . KIAA07 MVLRGMDLLLECIASGV-PTPDIAWYKKG----GDLPSDK----AKFENFNKALRITNVS 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 KIAA18 VENGQSIVCRATNKAIPGGKETSVTIDIQHPPLVNLSVEPQPVL----EDNVVTFHCSAK :.. : :.:: :. . .... .. : :. ::. .. ::. .. : :. KIAA07 EEDSGEYFCLASNKM--GSIRHTISVRVKAAPYW-LD-EPKNLILAPGEDGRLV--CRAN 380 390 400 410 420 280 290 300 310 320 KIAA18 ANPAVTQYRWAKRGQIIKEA----SGEVYRTTV---DYTYFSEPV-SCEVTNALGSTNLS .:: : .: :. .. : . :: :. : :. : .:...: : . KIAA07 GNPKPT-VQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSRAVYQCNTSNEHGYLLAN 430 440 450 460 470 480 330 340 350 360 370 380 KIAA18 RTVDVY-FGPRMTTEPQSLL-VDLGSDAIFSCAWTGNPSLTIVWMKRGSGVVLSN----- :.: ::: . ..:. : : . . ..: . :.: :. :.: :.: :.. KIAA07 AFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFGSPIPTLRWFKNGQGSNLDGGNYHV 490 500 510 520 530 540 390 400 410 420 430 KIAA18 --EKTLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPRVGAGEREVTLTVNGPP-IISSTQTQHALHGEKG . .: .: .:.:: : :.: :. .: .: .: : :. : : . : : .: KIAA07 YENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNI-LGKAENQVRLEVKDPTRIYRMPEDQVARRGTTV 550 560 570 580 590 600 440 450 460 470 480 490 KIAA18 QIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLESGTSGRYTVETISTEEGVISTLTISNIVRADFQTI :..: .. : ... :: .. : . .. :. ..::: .... : : KIAA07 QLECRVKHDPSL-KLTVSWLKD-----DEPLYIGNRMKKED---DSLTIFGVAERD-QGS 610 620 630 640 650 500 510 520 530 540 550 KIAA18 YNCTAWNSFGSDTEIIRLKEQGSEMKSGAGLEAESVPMAVIIGVAVGAGVAFLVLMATIV :.:.: . . .: KIAA07 YTCVASTELDQDLAKAYLTVLGRPDRPRDLELTDLAERSVRLTWIPGDANNSPITDYVVQ 660 670 680 690 700 710 779 residues in 1 query sequences 1986726 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:20:04 2008 done: Thu Dec 18 15:20:05 2008 Total Scan time: 0.580 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]