# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg04492.fasta.huge -Q ../query/KIAA1851.ptfa ./tmplib.25089 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1851, 523 aa
 vs ./tmplib.25089 library

1986982 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0976+/-0.00531; mu= 13.9223+/- 0.362
 mean_var=107.6930+/-25.737, 0's: 0 Z-trim: 24  B-trim: 2 in 1/39
 Lambda= 0.123589

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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KIAA0814  ( 1559 res)   fh16048                    (1559)  353 74.2 7.4e-14
KIAA0813  ( 1618 res)   pf00581                    (1618)  327 69.6 1.9e-12
KIAA0416  ( 529 res)   hh00236                     ( 529)  272 59.2 8.4e-10
KIAA0230  ( 1496 res)   ha02538                    (1496)  273 60.0 1.4e-09
KIAA1465  ( 785 res)   fh13187                     ( 785)  256 56.6 7.7e-09
KIAA1910  ( 760 res)   fh21867                     ( 760)  242 54.1 4.3e-08
KIAA1246  ( 832 res)   hh00149a                    ( 832)  228 51.6 2.6e-07
KIAA0644  ( 887 res)   hj03618                     ( 887)  224 50.9 4.4e-07
KIAA0918  ( 966 res)   hk09360(revised)            ( 966)  220 50.3 7.5e-07
KIAA0405  ( 706 res)   hg01274                     ( 706)  204 47.3 4.5e-06
KIAA1854  ( 572 res)   fg02232                     ( 572)  200 46.4 6.4e-06
KIAA0806  ( 1073 res)   hk04165(revised)           (1073)  200 46.8 9.6e-06
KIAA1531  ( 1206 res)   ph00937                    (1206)  166 40.8 0.00069
KIAA1904  ( 821 res)   af00058                     ( 821)  161 39.7   0.001
KIAA1469  ( 662 res)   fj01881                     ( 662)  155 38.5  0.0018
KIAA1916  ( 542 res)   hg01117                     ( 542)  153 38.0  0.0021
KIAA1497  ( 730 res)   hg01608                     ( 730)  153 38.2  0.0025
KIAA0848  ( 988 res)   hk05607                     ( 988)  148 37.5  0.0056
KIAA1580  ( 640 res)   fj04979                     ( 640)  143 36.3  0.0079


>>KIAA1163  ( 437 res)   hj05329                          (437 aa)
 initn: 791 init1: 279 opt: 554  Z-score: 540.6  bits: 109.4 E(): 5.4e-25
Smith-Waterman score: 878;  37.307% identity (64.459% similar) in 453 aa overlap (78-521:3-435)

        50        60        70        80        90       100       
KIAA18 RALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAP-LFQL
                                     ::. :: :::::: :.:::  :    : ::
KIAA11                             HSLPSYTALLDLSHNNLSRLRAEWTPTRLTQL
                                           10        20        30  

        110       120       130       140       150       160      
KIAA18 RALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVH
       ..: :.::.:. ..  .:  . .:: :::::: ::.: .  .. : .:: :::.::... 
KIAA11 HSLLLSHNHLNFISSEAFSPVPNLRYLDLSSNQLRTLDEFLFSDLQVLEVLLLYNNHIMA
             40        50        60        70        80        90  

        170       180       190        200       210       220     
KIAA18 LDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLH-GLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAAL
       .:. ::  .  :..:::. :... : .. .. : .  .:  ::::::.: .. .:.:  :
KIAA11 VDRCAFDDMAQLQKLYLSQNQISRFPLELVKEGAKLPKLTLLDLSSNKLKNLPLPDLQKL
            100       110       120       130       140       150  

         230       240       250       260       270       280     
KIAA18 PAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQH
       ::..::::::::::: :::.::.:...:. : ::.: :: ..  :.  :   .    :. 
KIAA11 PAWIKNGLYLHNNPLNCDCELYQLFSHWQYRQLSSVMDFQEDLYCMNSK---KLHNVFNL
            160       170       180       190       200            

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KIAA18 SRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRD
       :  : ::.       :  :.   : .: .: . :.:.  .:  .::.:..: .    . .
KIAA11 S--FLNCG-------EYKERAWEAHLGDTLIIKCDTKQQGMTKVWVTPSNERVLDEVT-N
     210                220       230       240       250          

         350       360       370       380       390       400     
KIAA18 GSIAVLADGSLAIGNVQEQHAGLFVCLATGPRLHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFT
       :...:  :::: . .:: . .:...: : :  .... . : .:     . . ...::..:
KIAA11 GTVSVSKDGSLLFQQVQVEDGGVYTCYAMGETFNETLSVELKVHNFTLHGHHDTLNTAYT
     260       270       280       290       300       310         

         410       420        430       440       450       460    
KIAA18 TLLGCAVGLVLVLLYLFAPPCRC-CRRACRCRRWPQTPSPLQELSAQSSVLSTTPPDAP-
       ::.:: ...::::.::.  :::: :: .       . ::  :  : .::.:::::   : 
KIAA11 TLVGCILSVVLVLIYLYLTPCRCWCRGV-------EKPSSHQGDSLSSSMLSTTPNHDPM
     320       330       340              350       360       370  

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KIAA18 ---SRKASVHKHVVFLEPGR--RGLNGRVQLAVAEEFDLYNPGGLQLKAGSESASSIGSE
          ..  .  ..:.::::.   .: ::... . .      .  : .  .  ::.::. :.
KIAA11 AGGDKDDGFDRRVAFLEPAGPGQGQNGKLKPGNTLPVPEATGKGQRRMSDPESVSSVFSD
            380       390       400       410       420       430  

      520   
KIAA18 GPMTT
        :.  
KIAA11 TPIVV
            

>>KIAA0814  ( 1559 res)   fh16048                         (1559 aa)
 initn: 334 init1: 276 opt: 353  Z-score: 340.6  bits: 74.2 E(): 7.4e-14
Smith-Waterman score: 358;  29.000% identity (59.333% similar) in 300 aa overlap (6-303:23-307)

                                10        20          30        40 
KIAA18                  VLELQPAQSCSVLSLVVAAMT--WLVLLGTLLCMLRVGLGTPD
                             ::.. :  : .. .:.  :  . ...   : ..:.  .
KIAA08 LRRPLPRPPALPARLLGLHASCPAEAASSRSGALHTMAPGWAGVGAAVRARLALALALAS
               10        20        30        40        50        60

              50        60        70        80        90       100 
KIAA18 SEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQRLRPGWLA
         . :: .   :: :: :.:  ..: ::::. ::  .:  .  :::..: . :.    .:
KIAA08 VLSGPPAV--ACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIPRNAERLDLDRNNITRITKMDFA
                 70        80        90       100       110        

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KIAA18 PLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFN
        : .::.:::. :..... ::.: . . :. : :..: :..: .  ...   : .: : .
KIAA08 GLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSE
      120       130       140       150       160       170        

             170       180       190       200       210       220 
KIAA18 NRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPE
       :..  . ..::.:.  ...: :  :... .    ...:   ..:::.  .: ...: :  
KIAA08 NQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRALRDLEILTLN--NNNISRILVTS
      180       190       200       210       220         230      

             230       240       250       260       270       280 
KIAA18 LAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVR
       .  .: .    : ::.: : :::.:  : .  .::     :  ..  .:.:   :. ..:
KIAA08 FNHMPKI--RTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQR-----RTVGQFTLCMA---PV-HLR
        240         250       260            270       280         

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KIAA18 FFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAP
        :. . : ..    ::   : :                                      
KIAA08 GFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLMEIPANLPEGI
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>>KIAA0813  ( 1618 res)   pf00581                         (1618 aa)
 initn: 355 init1: 261 opt: 327  Z-score: 315.4  bits: 69.6 E(): 1.9e-12
Smith-Waterman score: 327;  31.863% identity (61.275% similar) in 204 aa overlap (53-256:118-317)

             30        40        50        60        70        80  
KIAA18 LVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAAT
                                     ::  : :..  ..: : ::: .: ..:  :
KIAA08 TPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIPRNT
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             90       100       110       120       130       140  
KIAA18 ADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRA
         :.:. : . :.. . .: : :::.:.: .:.. .. ::.: . . :. : :. : :. 
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KIAA18 LGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSAT
       : .  ...  :: .: : .: .  . ..::.:   :..: :  :... .    ...: . 
KIAA08 LPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRALRGL
       210       220       230       240       250       260       

            210       220       230       240       250       260  
KIAA18 HLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVR
       ..:::.  .: .  : :  .  .: .    . ::.: : :::.:  : :  .::      
KIAA08 EVLTLN--NNNITTIPVSSFNHMPKL--RTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLF
       270         280       290         300       310       320   

            270       280       290       300       310       320  
KIAA18 DFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYCNTS
                                                                   
KIAA08 TQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKG
           330       340       350       360       370       380   

>>KIAA0416  ( 529 res)   hh00236                          (529 aa)
 initn: 387 init1: 246 opt: 272  Z-score: 267.9  bits: 59.2 E(): 8.4e-10
Smith-Waterman score: 272;  32.979% identity (56.915% similar) in 188 aa overlap (53-240:47-230)

             30        40        50        60        70        80  
KIAA18 LVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAAT
                                     :: :: :   :. : . :...::     ..
KIAA04 HFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATDKGS
         20        30        40        50        60        70      

             90       100       110       120       130       140  
KIAA18 ADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRA
         :.: :: . .:.   .: . ::  ::::::..... . .: .   :. : :::: .  
KIAA04 LGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFY
         80        90       100       110       120       130      

            150       160       170       180       190       200  
KIAA18 LGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSAT
       :    .  :  :..: :  :.:  :  . :.::: :. :.:  : : ..    .   .  
KIAA04 LPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLF--WDCR
        140       150       160       170       180       190      

            210       220       230       240       250       260  
KIAA18 HLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVR
        :  ::::.:::  ..   .:.:  . .  :.:..: :                      
KIAA04 SLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRE--LHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWN
          200       210       220         230       240       250  

            270       280       290       300       310       320  
KIAA18 DFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYCNTS
                                                                   
KIAA04 KISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNS
            260       270       280       290       300       310  

>>KIAA0230  ( 1496 res)   ha02538                         (1496 aa)
 initn: 296 init1: 181 opt: 273  Z-score: 263.7  bits: 60.0 E(): 1.4e-09
Smith-Waterman score: 325;  27.134% identity (51.829% similar) in 328 aa overlap (53-373:53-336)

             30        40        50        60        70        80  
KIAA18 LVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAAT
                                     :: .:.:    . :  : :. :::  :  :
KIAA02 RGPGRRCLLALVLFCAWGTLAVVAQKPGAGCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVPAVAPQ-T
             30        40        50        60        70        80  

             90       100       110       120       130       140  
KIAA18 ADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRA
       . :::  : .....:: .  : .: .: :..:..  .  :.: .  .:. : : .: ...
KIAA02 SILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKNEIQS
              90       100       110       120       130       140 

            150       160       170       180       190       200  
KIAA18 LGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSAT
       . :. . ::..::.: :  :..  ::  .:. :  : .:.:  :...     ::   . .
KIAA02 IDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRIT-----HLVPGTFN
             150       160       170       180            190      

            210       220       230       240          250         
KIAA18 HLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCR---LYHLLQRWHQRG--
       :: ..    .:                   : : .: : :::.   :  ::. . . :  
KIAA02 HLESM----KR-------------------LRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNA
        200                              210       220       230   

        260       270       280       290       300       310      
KIAA18 -LSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLR
         .:. .. :       .. .  :  .   ..  ::   : .  : :..   .  : .. 
KIAA02 QAAAICEYPR-------RIQGRSVATITPEEL--NCER-PRITSE-PQDA-DVTSGNTVY
           240              250         260         270        280 

        320        330       340       350       360       370     
KIAA18 LYCNT-SVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGNVQEQHAGLFVCLATG
       . : . . :  .: :.  ..::     ::   . .: ::.: : :.::   :.. :.:  
KIAA02 FTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSR---LNLLDDGTLMIQNTQETDQGIYQCMAKN
             290       300       310          320       330        

         380       390       400       410       420       430     
KIAA18 PRLHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAVGLVLVLLYLFAPPCRCCRRACRC
                                                                   
KIAA02 VAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVTLECSATGHPPPRISWTRGDRT
      340       350       360       370       380       390        

>>KIAA1465  ( 785 res)   fh13187                          (785 aa)
 initn: 224 init1: 224 opt: 256  Z-score: 250.5  bits: 56.6 E(): 7.7e-09
Smith-Waterman score: 272;  27.297% identity (51.706% similar) in 381 aa overlap (52-403:59-425)

              30        40        50            60        70       
KIAA18 WLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCIC----AADLLSCTGLGLQDVPAE
                                     .::  : :    : .. .:.   :..::  
KIAA14 TFTESRRILGAAMFPLRALWLVWALLGVAGSCPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEG
       30        40        50        60        70        80        

        80        90       100       110       120       130       
KIAA18 LPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSS
       ::: .. :.:: : .  :: : .: . :. .: : :::. ..  :...  : :. :::: 
KIAA14 LPANVTTLSLSANKITVLRRGAFADVTQVTSLWLAHNEVRTVEPGALAVLSQLKNLDLSH
       90       100       110       120       130       140        

       140       150       160       170       180       190       
KIAA18 NTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLH
       : . ..   :: .:.::. : . .:::  : . :. .:  :  : .. :.: ...   . 
KIAA14 NFISSFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLAPGTFD
      150       160       170       180       190       200        

       200       210                    220           230          
KIAA18 GLSATHLLTLDLSSNRLG-------------HISVPE---LA-ALPAFLKNGLYLHNNP-
       .:::   : :  .  . :             ..:.::   .: : :  :. :. ..  : 
KIAA14 ALSALSHLQLYHNPFHCGCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPALQ-GVPVYRLPA
      210       220       230       240       250        260       

     240       250         260       270       280       290       
KIAA18 LPCDCRLYHLLQR--WHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKVPASRVRFFQHSRVFENCSSAPA
       :::     ::  .   .  :      .:    :.:   :. :...  .          :.
KIAA14 LPCAPPSVHLSAEPPLEAPGTPLRAGLAFVLHCIADGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLEPPV
       270       280       290       300       310       320       

       300       310            320       330       340       350  
KIAA18 LGLERPEEHLYALVGRS-----LRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLA
       :. :  .. . :  :..     :    ....:.   :: .:       :..    . .::
KIAA14 LSGE--DDGVGAEEGEGEGDGDLLTQTQAQTPTPAPAWPAP-------PAT--PRFLALA
       330         340       350       360                370      

            360       370       380       390       400       410  
KIAA18 DGSLAIGNVQEQHAGLFVCLATGPRLHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAV
       .::: .  .. ..::...: : . .:  :.:    :.:    :  .: ..:         
KIAA14 NGSLLVPLLSAKEAGVYTCRAHN-ELGANSTS-IRVAVAATGPPKHAPGAGGEPDGQAPT
        380       390        400        410       420       430    

            420       430       440       450       460       470  
KIAA18 GLVLVLLYLFAPPCRCCRRACRCRRWPQTPSPLQELSAQSSVLSTTPPDAPSRKASVHKH
                                                                   
KIAA14 SERKSTAKGRGNSVLPSKPEGKIKGQGLAKVSILGETETEPEEDTSEGEEAEDQILADPA
          440       450       460       470       480       490    

>>KIAA1910  ( 760 res)   fh21867                          (760 aa)
 initn: 204 init1: 154 opt: 242  Z-score: 237.2  bits: 54.1 E(): 4.3e-08
Smith-Waterman score: 242;  28.226% identity (54.839% similar) in 248 aa overlap (15-253:61-290)

                               10        20        30        40    
KIAA18                 VLELQPAQSCSVLSLVVAAMTWLVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEG
                                     :..  . :..:: : :: . .:  : :   
KIAA19 SDIGALNELELCLWRAGWSLLLCDEIGDELLALKMLLWILLLETSLC-FAAGNVTGDV--
               40        50        60        70         80         

           50         60            70        80           90      
KIAA18 FPPRALHNCPYK-CICA---ADL-LSCTGLGLQDVPAELPAATAD---LDLSHNALQRLR
               :  : : :    .:: ..:   :. ..  .. : :..   : :  :.: :: 
KIAA19 --------CKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQ-RFTAPTSQFYHLFLHGNSLTRLF
                90       100       110        120       130        

        100       110       120       130       140       150      
KIAA18 PGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEK
       :. .: ...  .::...: :  .  :.:.. . .. : ...: .... .. . ::  :: 
KIAA19 PNEFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHINNNKIKSFRKQTFLGLDDLEY
      140       150       160       170       180       190        

        160       170       180       190       200       210      
KIAA18 LLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSATHLLTLDLSSNRLGH
       :    : :  .:  ::. :  :  : :. : ....  . .. .  :::   :: .:::  
KIAA19 LQADFNLLRDIDPGAFQDLNKLEVLILNDNLISTLPANVFQYVPITHL---DLRGNRLKT
      200       210       220       230       240          250     

        220        230       240       250       260       270     
KIAA18 ISVPE-LAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKV
       .   : :  .:.. .  . :..::  : : :  : ..:                      
KIAA19 LPYEEVLEQIPGIAE--ILLEDNPWDCTCDLLSL-KEWLENIPKNALIGRVVCEAPTRLQ
         260       270         280        290       300       310  

         280       290       300       310       320       330     
KIAA18 PASRVRFFQHSRVFENCSSAPALGLERPEEHLYALVGRSLRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQ
                                                                   
KIAA19 GKDLNETTEQDLCPLKNRVDSSLPAPPAQEETFAPGPLPTPFKTNGQEDHATPGSAPNGG
            320       330       340       350       360       370  

>>KIAA1246  ( 832 res)   hh00149a                         (832 aa)
 initn: 177 init1: 145 opt: 228  Z-score: 223.3  bits: 51.6 E(): 2.6e-07
Smith-Waterman score: 314;  28.256% identity (52.334% similar) in 407 aa overlap (5-373:27-404)

                                     10        20        30        
KIAA18                       VLELQPAQSCSVLSLVVAAMTWLVLLGTLLCMLRVGLG
                                 .:: .   :. ... .:  .::: :: .      
KIAA12 LESVSGGEGCVAEPGSPGAPRSRPRCHPAGGRCCLAQALSDQTMETLLGGLLAF------
               10        20        30        40        50          

       40        50        60            70        80        90    
KIAA18 TPDSEGFPPRALHNCPYKCICA--ADLLS--CTGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQR
            :.   ..  ::  :.:   .. :.  : . ::  :: ..   :..: :. : . .
KIAA12 -----GMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLGGNFIIH
                60        70        80        90       100         

          100       110       120       130       140       150    
KIAA18 LRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGAL
       .    .: .  :  : :..: .. .    :..  .:: : :.:: : .::.  : ::  :
KIAA12 ISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRGLVNL
     110       120       130       140       150       160         

          160       170        180       190             200       
KIAA18 EKLLLFNNRLVHLDEHAFHG-LRALSHLYLGCNELASFSFD------HLHGLSATH----
       ..:.. ::.:  . ..::.  : .:  : :. :.: .. .:      .:: ::  :    
KIAA12 QHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSLDHNLLD
     170       180       190       200       210       220         

                       210                220       230       240  
KIAA18 ------------LLTLDLSSNRLGHI---------SVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPC
                   :  :::.:::: ..         ..  :.: :     .. . .::: :
KIAA12 HIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFGGNPLHC
     230       240       250       260       270       280         

            250       260       270        280       290       300 
KIAA18 DCRLYHLLQRWHQRGLSAVRDFAREYVCLAFKVPAS-RVRFFQHSRVFENCSSAPALGLE
       .:.:      : .:     ::   : .: .   :.. . :.: : :  :.    : : . 
KIAA12 NCELL-----WLRR---LERDDDLE-TCGS---PGGLKGRYFWHVRE-EEFVCEPPL-IT
     290               300        310          320        330      

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KIAA18 RPEEHLYALVGRSLRLYCNT-SVPAMRIAWVSPQQELLRAPGSRDGSIAVLADGSLAIGN
       .  ..: .: :..  : :.. . :.  : ::.:...:. . .::    ::  .:.: :  
KIAA12 QHTHKLLVLEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLV-GNSSRT---AVYDNGTLDIFI
         340       350       360       370           380       390 

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KIAA18 VQEQHAGLFVCLATGPRLHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNTGFTTLLGCAVGLVLVLLY
       .  : .: :.:.:                                               
KIAA12 TTSQDSGAFTCIAANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRG
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>>KIAA0644  ( 887 res)   hj03618                          (887 aa)
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KIAA18 YKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAATADLDLSHNALQ-RLR-PGWLAPLFQLRALHLD
                                     :.:: : ::  ::  . .::: .: .: :.
KIAA06 LGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILS
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KIAA18 HNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAF
        : :. ::  .: .   : ::.: .: :  :. . . :: ::..: : .::: .:    .
KIAA06 ANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALL
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KIAA18 HGLRALSHLYLGCNELASF---SFDHLHGLSATHLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFL
       . :..:  : :. :::...   .: ::      .:  :.: .: :. .:   .:: ::. 
KIAA06 EPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLG-----RLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALY
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       .  : : .:   :::::  : .::     :  : ..    :   . :: : .....  ..
KIAA06 R--LDLDGNGWTCDCRLRGL-KRWMGDWHSQGRLLTVFVQCR--HPPALRGKYLDYLDDQ
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KIAA18 VFENCSSA---PALGL--ERPEEHLYALVGRSLRLYCNTSVPAMRIAWVSPQQELLRAPG
        ..: : :   :. .:  .: .. : . .:. .       .:   .:   : :  :.  :
KIAA06 QLQNGSCADPSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEM-------TPPAGLAEELPPQPQLQQQG
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KIAA18 SRDGSIAVLADGSLAIGNVQEQHAGLFVCLATGPRLHHNQTHEYNVSVHFPRPEPEAFNT
          ...:  . .   .::                                          
KIAA06 RFLAGVAWDGAARELVGNRSALRLSRRGPGLQQPSPSVAAAAGPAPQSLDLHKKPQRGRP
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>>KIAA0918  ( 966 res)   hk09360(revised)                 (966 aa)
 initn: 258 init1: 152 opt: 220  Z-score: 214.8  bits: 50.3 E(): 7.5e-07
Smith-Waterman score: 220;  31.429% identity (52.381% similar) in 210 aa overlap (53-253:56-257)

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KIAA18 LVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAAD----LLSCTGLG---LQDV-
                                     :   : :        .:: . :   :... 
KIAA09 MHSWMLQTLAFAVTSLVLSCAETIDYYGEICDNACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEIS
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KIAA18 PAELPAATADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLD
       : ..:     : :: : :.:: :. ..       :::  : .. .  :.: .  ::: : 
KIAA09 PPRFPIY--HLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASILHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLH
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KIAA18 LSSNTLRALGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFD
       :..: :. :    . ::  :: : .  : .  .. .::  :. :. : :. : :.:.  .
KIAA09 LNNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIEPNAFGKLHLLQVLILNDNLLSSLPNN
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]