# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj22905s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1842.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1842, 526 aa vs ./tmplib.25089 library 1986979 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.4665+/-0.00472; mu= 21.6299+/- 0.324 mean_var=76.1872+/-17.874, 0's: 0 Z-trim: 17 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.146938 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1489 ( 511 res) fj07905 ( 511) 587 134.1 2.3e-32 KIAA0132 ( 637 res) ha01449s1 ( 637) 468 109.1 1e-24 KIAA1687 ( 728 res) fh26020 ( 728) 465 108.5 1.7e-24 KIAA1490 ( 749 res) fj08103 ( 749) 444 104.1 3.7e-23 KIAA1378 ( 628 res) fj04831s1 ( 628) 435 102.1 1.3e-22 KIAA1129 ( 625 res) hg04330 ( 625) 420 98.9 1.2e-21 KIAA1309 ( 639 res) fh10381 ( 639) 382 90.8 3.1e-19 KIAA1354 ( 632 res) fj01502 ( 632) 374 89.1 1e-18 KIAA0469 ( 559 res) hg01666 ( 559) 343 82.5 8.9e-17 KIAA1921 ( 545 res) fg00938 ( 545) 318 77.2 3.5e-15 KIAA0795 ( 465 res) hk06104 ( 465) 312 75.8 7.7e-15 KIAA0850 ( 644 res) hk05995 ( 644) 310 75.6 1.2e-14 KIAA1384 ( 652 res) fj06146 ( 652) 294 72.2 1.3e-13 KIAA1900 ( 582 res) fk07650 ( 582) 250 62.8 7.8e-11 KIAA1340 ( 441 res) fj00164 ( 441) 214 55.0 1.3e-08 KIAA0711 ( 661 res) hg00358 ( 661) 164 44.6 2.6e-05 >>KIAA1489 ( 511 res) fj07905 (511 aa) initn: 786 init1: 360 opt: 587 Z-score: 673.0 bits: 134.1 E(): 2.3e-32 Smith-Waterman score: 878; 31.579% identity (63.360% similar) in 494 aa overlap (57-524:1-481) 30 40 50 60 70 80 KIAA18 DLVLNYAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLDPQNSIGVFIFADH . .. ..: .:.:.... .: . .. ::: KIAA14 VEDVLQRCREYLIKKINAENCVRLLSFADL 10 20 30 90 100 110 120 130 140 KIAA18 YGHQELGDRSKEYIRKKFLCVTKEQEFLQLTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWF .. .:: . .:.....:: : ... :.::..: ::.::.::.:::..:: : :. . :. KIAA14 FSCEELKQSAKRMVEHKFTAVYHQDAFMQLSHDLLIDILSSDNLNVEKEETVREAAMLWL 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 KIAA18 EHEQNEREVHLPEIFAKCIRFPLMEDT----FIEKIPPQFAQAIAKSCVEKGPSNTNGCT :.. . : .: .... ::. . .. ... .::. ...... .. :. . KIAA14 EYNTESRSQYLSSVLSQ-IRIDALSEVTQRAWFQGLPPNDKSVVVQGLYKSMPKFFK--- 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 KIAA18 QRLGMTASEMIICFDAAHKHSGKKQTVPCLDIVTGRVFKLCKPPNDLREVGILVSPDNDI ::::: ::.: ..:. .. . . : . . .:.:::.:: ::..:: .:.::::: KIAA14 PRLGMTKEEMMIFIEASSENPCSLYSSVCYSPQAEKVYKLCSPPADLHKVGTVVTPDNDI 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 KIAA18 YIAGGYRP---------SSSEVSIDHKAENDFWMYDHSTNRWLSKPSLLRARIGCKLVYC ::::: : ..:... .. : :. .: . : :. : .: .:: .:: : KIAA14 YIAGGQVPLKNTKTNHSKTSKLQTAFRTVNCFYWFDAQQNTWFPKTPMLFVRIKPSLVCC 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 KIAA18 CGKMYAIGGRVYEGDGRNSLKSVECYDSRENCWTTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKIYVLQG : .::::: :. ..:: ::.... :: : .: : .. :: .. :::. KIAA14 EGYIYAIGGDSVGGELNR--RTVERYDTEKDEWTMVSPLPCAWQWSAAVVVHDCIYVMTL 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 KIAA18 EFFLFYEPQKDYWGFLTPMTVPRIQGLAAVYKDSIYYIAG---TCGNHQRM--------- ... : :..: : .. . : . ::.. :.:.::.: . .. :. KIAA14 NLMYCYFPRSDSWVEMAMRQTSRSFASAAAFGDKIFYIGGLHIATNSGIRLPSGTVDGSS 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 KIAA18 FTVEAYDIELNKWTRKKDFPCDQSINPYLKLVLFQNKLHLFVRATQVTVEEHVFRTSRKN ::: ::.. :.: ..: . .: .. :...:.: .:.: :... . : KIAA14 VTVEIYDVNKNEWKMAANIPAKRYSDPCVRAVVISNSLCVFMRETHLNERA-------KY 390 400 410 420 430 490 500 510 520 KIAA18 SLYQYDDIADQWMKVYETPDR-LWDLGRHFECAVAKLYPQCLQKVL :::: :.: . .: :::::: :.:.:.::::.::.. KIAA14 VTYQYDLELDRWSLRQHISERVLWDLGRDFRCTVGKLYPSCLEESPWKPPTYLFSTDGTE 440 450 460 470 480 490 KIAA14 EFELDGEMVALPPV 500 510 >>KIAA0132 ( 637 res) ha01449s1 (637 aa) initn: 580 init1: 363 opt: 468 Z-score: 535.7 bits: 109.1 E(): 1e-24 Smith-Waterman score: 553; 28.281% identity (55.656% similar) in 442 aa overlap (1-434:121-510) 10 20 30 KIAA18 RSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESMDLVL ..:::.:: :. .. : : :.. . :. .. KIAA01 DVTLQVKYQDAPAAQFMAHKVVLASSSPVFKAMFTNGLREQGMEVVSIEGIHPKVMERLI 100 110 120 130 140 150 40 50 60 70 80 90 KIAA18 NYAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLDPQNSIGVFIFADHYGHQ ..:::. . . : : ....: ..:: :. :. .....:::.:.::. ::.. : KIAA01 EFAYTASISMGEKCVLHVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLDPSNAIGIANFAEQIGCV 160 170 180 190 200 210 100 110 120 130 140 150 KIAA18 ELGDRSKEYIRKKFLCVTKEQEFLQLTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHEQ :: .:..::: .: :.:..::..:.. ::..... ::::: : .:... : : ... KIAA01 ELHQRAREYIYMHFGEVAKQEEFFNLSHCQLVTLISRDDLNVRCESEVFHACINWVKYDC 220 230 240 250 260 270 160 170 180 190 200 210 KIAA18 NEREVHLPEIFAKCIRFPLMEDTFIEKIPPQFAQAIAKSCVEKGPSNTNGCTQRLGMTAS ..:. .. .. . .: ... :.: : ..: : :.. : . : KIAA01 EQRRFYVQALL-RAVRC--------HSLTPNFLQMQLQKC-EILQSDSR-CKDYLVKIFE 280 290 300 310 220 230 240 250 260 KIAA18 EMIICFDAAHKHSGKKQTVPCLDIVTGRVFKLCKPPNDLREVGILVSPDNDIYIAGGY-R :. . :: . :..:: . : .:: : :: :::: : KIAA01 ELTL-----HKPT---QVMPC------------RAP----KVGRL------IYTAGGYFR 320 330 340 270 280 290 300 310 320 KIAA18 PSSSEVSIDHKAENDFWMYDHSTNRWLSKPSLLRARIGCKLVYCCGKMYAIGGRVYEGDG : : . :. : . :: .: : : : .::.::: :: KIAA01 QSLSYLEA----------YNPSDGTWLRLADLQVPRSGLAGCVVGGLLYAVGGRNNSPDG 350 360 370 380 390 330 340 350 360 370 380 KIAA18 RNSLKSVECYDSRENCWTTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKIYVLQGEFFLF-------YEPQ .. ....::. : :. : : . .. .::.. : . :::. KIAA01 NTDSSALDCYNPMTNQWSPCAPMSVPRNRIGVGVIDGHIYAVGGSHGCIHHNSVERYEPE 400 410 420 430 440 450 390 400 410 420 430 440 KIAA18 KDYWGFLTPMTVPRIQGLAAVYKDSIYYIAGTCGNHQRMFTVEAYDIELNKWTRKKDFPC .: : ...:: . :: .:: . .: ..: :.. :. ..: : : :.: KIAA01 RDEWHLVAPMLTRRIGVGVAVLNRLLYAVGGFDGTN-RLNSAECYYPERNEWRMITAMNT 460 470 480 490 500 510 450 460 470 480 490 500 KIAA18 DQSINPYLKLVLFQNKLHLFVRATQVTVEEHVFRTSRKNSLYQYDDIADQWMKVYETPDR KIAA01 IRSGAGVCVLHNCIYAAGGYDGQDQLNSVERYDVETETWTFVAPMKHRRSALGITVHQGR 520 530 540 550 560 570 >>KIAA1687 ( 728 res) fh26020 (728 aa) initn: 527 init1: 360 opt: 465 Z-score: 531.8 bits: 108.5 E(): 1.7e-24 Smith-Waterman score: 535; 26.346% identity (54.423% similar) in 520 aa overlap (2-443:219-714) 10 20 30 KIAA18 RSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESMDLVLN .:::. . :. :.:::. ::. .... ... KIAA16 KQLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQ 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 KIAA18 YAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLDPQNSIGVFIFADHYGHQE ::::. . : : ....:..:: ..:. .. : :....:..: :.: .:. :.: : : KIAA16 YAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTE 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 KIAA18 LGDRSKEYIRKKFLCVTKEQEFLQLTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHEQN : . ...: ..:. : :.:::: : ... ..: :::.:: :: .......: :. . KIAA16 LLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQ 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 KIAA18 EREVHLPEIFAKCIRFPLMEDTFIEKIPPQFAQAIAKSCVEKGPSNTNGCTQRLGMTASE .:. .: ... ::.::. :::. . : . : . : :.: : : . KIAA16 NRQGELGMLLSY-IRLPLL--------PPQLLADLETSSMFTGDLE---C-QKLLMEAMK 370 380 390 400 410 220 230 240 250 KIAA18 MIICFD-----AAHKHSGKKQTVPCLDIVTG--------RVFKLCKPPNDLREVGIL--- . . . . . . .:.:: : : : . : :. ..: . KIAA16 YHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGR 420 430 440 450 460 470 260 270 280 KIAA18 ------VSPDNDIYIAGG------------YRPSSSEVSI-----DHK------------ . :: .:..:: . : .. .. :. KIAA16 RLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPM 480 490 500 510 520 530 290 300 310 320 KIAA18 ---AENDFWMYDHSTNRW---------LSKPSLLRARIGCKLVYCCGKMYAIGGRVYEGD . .: : : ....:: ... : :. .: .: .:.:::::: : KIAA16 YAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVG--VVALNNKLYAIGGR----D 540 550 560 570 580 330 340 350 360 370 KIAA18 GRNSLKSVECYDSRENCWTTVCAMPVAMEFHNA--VEYKEKIYVLQG------------- : . :::.: .: . : :. .:: :.. . .. . :. .::. : KIAA16 GSSCLKSMEYFDPHTNKWS-LCA-PMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLS 590 600 610 620 630 640 380 390 400 410 420 430 KIAA18 EFFLFYEPQKDYWGFLTPMTVPRIQGLAAVYKDSIYYIAGTCGNHQRMFTVEAYDIELNK . :.:. : :. ..:..::: . :..: ..: : : . :::.:: . :. KIAA16 DCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDG-HTYLNTVESYDAQRNE 650 660 670 680 690 700 440 450 460 470 480 490 KIAA18 WTRKKDFPCDQSINPYLKLVLFQNKLHLFVRATQVTVEEHVFRTSRKNSLYQYDDIADQW : :.. : . KIAA16 W--KEEVPVNIGRAGACVVVVKLP 710 720 >>KIAA1490 ( 749 res) fj08103 (749 aa) initn: 591 init1: 324 opt: 444 Z-score: 507.6 bits: 104.1 E(): 3.7e-23 Smith-Waterman score: 490; 26.304% identity (56.916% similar) in 441 aa overlap (2-434:240-628) 10 20 30 KIAA18 RSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESM-DLVL .:::: . :. :.:... :.. ... ::: KIAA14 QQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLV- 210 220 230 240 250 260 40 50 60 70 80 90 KIAA18 NYAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLDPQNSIGVFIFADHYGHQ ..:::. . : : ... :..:: ..:.:.. . : ..... : :.: .:. ::: : KIAA14 QFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCI 270 280 290 300 310 320 100 110 120 130 140 150 KIAA18 ELGDRSKEYIRKKFLCVTKEQEFLQLTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHEQ :: .. : .... : ..:::: : ..: ..: :::.:: :: ...... : .... KIAA14 ELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDM 330 340 350 360 370 380 160 170 180 190 200 210 KIAA18 NEREVHLPEIFAKCIRFPLMEDTFIEKIPPQFAQAIAKSCVEKGPSNTNGCTQRLGMTAS . : : ..: ::.::. :::. . . . : : : :.: . : KIAA14 QSRCNDLSMLLA-FIRLPLL--------PPQILADLENHALFK---NDLEC-QKLILEAM 390 400 410 420 430 220 230 240 250 260 270 KIAA18 EMIICFDAAHKHSGKKQTVPCLDIVTGRVFKLCKPPNDLREVGILVSPDNDIYIAGGYRP : . .: : . .: . :. : . .: .::. KIAA14 --------------KYHLLPE------RRTLMQSPRTKPRK-----STVGTLYAVGGMDN 440 450 460 470 280 290 300 310 320 330 KIAA18 SSSEVSIDHKAENDFWMYDHSTNRWLSKPSLLRARIGCKLVYCCGKMYAIGGRVYEGDGR ... ..:.. :: :: :.. . :. .. :...:::: :: KIAA14 NKGATTIEK--------YDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGR----DGL 480 490 500 510 340 350 360 370 380 KIAA18 NSLKSVECYDSRENCWTTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKIYVLQGE---FFL----FYEPQK ..:..::::. . . ::.. : . . ... . ::.. :. .: ..::. KIAA14 KTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQS 520 530 540 550 560 570 390 400 410 420 430 440 KIAA18 DYWGFLTPMTVPRIQGLAAVYKDSIYYIAGTCGNHQRMFTVEAYDIELNKWTRKKDFPCD . : :.. :.. : .:. . ..: ..: :. . . ..: :: . ::: KIAA14 QQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGS-SCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKR 580 590 600 610 620 630 450 460 470 480 490 500 KIAA18 QSINPYLKLVLFQNKLHLFVRATQVTVEEHVFRTSRKNSLYQYDDIADQWMKVYETPDRL KIAA14 RGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVC 640 650 660 670 680 690 >>KIAA1378 ( 628 res) fj04831s1 (628 aa) initn: 406 init1: 245 opt: 435 Z-score: 498.0 bits: 102.1 E(): 1.3e-22 Smith-Waterman score: 495; 25.813% identity (56.616% similar) in 461 aa overlap (1-434:101-542) 10 20 30 KIAA18 RSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESMDLVL :.:: : ..:. : ..: ...... .. KIAA13 NGELCDVTLKVGSKLISCHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLV 80 90 100 110 120 130 40 50 60 70 80 90 KIAA18 NYAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLDPQNSIGVFIFADHYGHQ ...:.::. :: ::: :. :: :.:. . : .:: :. :.: ..: ::. ... KIAA13 KFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRI 140 150 160 170 180 190 100 110 120 130 140 150 KIAA18 ELGDRSKEYIRKKFLCVTKEQEFLQLTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHEQ .: : . .: .: :.. ..:.... ..: ..:.:.:::.. :..::.. :.:. . KIAA13 DLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANP 200 210 220 230 240 250 160 170 180 190 200 210 KIAA18 NEREVHLPEIFAKCIRFPLMEDTFIEKIPPQFAQAIAKSCVEKGPSNTNGCTQRLGMTAS ... : : .:. .:.::. :. . . . :.:. .. .. . .: .. : KIAA13 QHHSKWLDETLAQ-VRLPLLPVDFLMGVVAK--EQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLS-S 260 270 280 290 300 220 230 240 250 KIAA18 EMIICFDAAHKHSGKKQTVPCLDIVTGR-----VFKL--CKPPND------------LRE . . :. . . . .:.:. : : :: :. : : :. KIAA13 RAVPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRH 310 320 330 340 350 360 260 270 280 290 300 310 KIAA18 VGILVSPDNDIYIAGGYRPSSSEVSIDHKAENDFWMYDHSTNRWLSKPSLLRARIGCKLV ::. .: .. .: .::. . :.. :.: ::.:. : :. : : :. KIAA13 VGV-ISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSME--------MFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALA 370 380 390 400 410 320 330 340 350 360 370 KIAA18 YCCGKMYAIGGRVYEGDGRNSLKSVECYDSRENCWTTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKIYVL : .::::: : . ...:: :: . . :.:: : . ..: ...:.. KIAA13 SLGGPIYAIGGL----DDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAV 420 430 440 450 460 470 380 390 400 410 420 KIAA18 QGEFFLF-------YEPQKDYWGFLTPMTVPRI-QGLAAVYKDSIYYIAGTCGNHQRMFT :. . :.:. : : . : : .:.. .. . :..: ... . . KIAA13 GGNDGMASLSSVERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLH--GCLYVVGGFDDNSPLSS 480 490 500 510 520 530 430 440 450 460 470 480 KIAA18 VEAYDIELNKWTRKKDFPCDQSINPYLKLVLFQNKLHLFVRATQVTVEEHVFRTSRKNSL :: :: . ::: KIAA13 VERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWEL 540 550 560 570 580 590 >>KIAA1129 ( 625 res) hg04330 (625 aa) initn: 480 init1: 370 opt: 420 Z-score: 480.8 bits: 98.9 E(): 1.2e-21 Smith-Waterman score: 525; 25.380% identity (55.531% similar) in 461 aa overlap (2-439:115-560) 10 20 30 KIAA18 RSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESMDLVLN .:::. ..:: :...: :...... ... KIAA11 QLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLID 90 100 110 120 130 140 40 50 60 70 80 90 KIAA18 YAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLDPQNSIGVFIFADHYGHQE : ::... .:: :::.:. :::..:. .....: .. :.: : : .:. ::: . . KIAA11 YIYTAEIEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTD 150 160 170 180 190 200 100 110 120 130 140 150 KIAA18 LGDRSKEYIRKKFLCVTKEQEFLQLTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHEQN : .... : ...: : .:::.:. ::. :...:: :.:. ::.:.:..: :...:.. KIAA11 LLQQANAYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKE 210 220 230 240 250 260 160 170 180 190 200 KIAA18 EREVHLPEIFAKCIRFPLM-EDTFIEKIPPQFAQAIAKSC----VEKGPSNTNGCTQRLG : :. ... . .:.::. .: ... . . ..: .: . ::: KIAA11 TRLEHMAKLMEH-VRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLL 270 280 290 300 310 320 210 220 230 240 250 KIAA18 M----TASEMIICFDAAHKHSGKK-----QTVPCLDIVTGRVFKLCKPPNDLREVGILVS . : . . . . : . ..: : :. : .. . :. ..:.. KIAA11 IKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFM 330 340 350 360 370 380 260 270 280 290 300 310 KIAA18 PDNDIYIAGGYRPSSSEVSIDHKAENDFWMYDHSTNRWLSKPSLLRARIGCKLVYCCGKM . .: .::. : ..: .:: ..: : :. . : . . KIAA11 AGH-VYAVGGFNGSLRVRTVD--------VYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLL 390 400 410 420 430 320 330 340 350 360 370 KIAA18 YAIGGRVYEGDGRNSLKSVECYDSRENCWTTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKIYVLQG---- ::.:: :: ..: ::: :. . : : : : . .. . :.:.. : KIAA11 YAVGGF----DGSTGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGA 440 450 460 470 480 490 380 390 400 410 420 KIAA18 -----EFFLFYEPQKDYWGFLTPMTVPRIQGLAAVYKDSIYYIAGTCGNHQRMFTVEAYD :.: . : ... :.. : . ..: . ..: .: : : .::.:: KIAA11 SRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRK-SVEVYD 500 510 520 530 540 430 440 450 460 470 480 KIAA18 IELNKWTRKKDFPCDQSINPYLKLVLFQNKLHLFVRATQVTVEEHVFRTSRKNSLYQYDD : : . : KIAA11 PGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNM 550 560 570 580 590 600 >>KIAA1309 ( 639 res) fh10381 (639 aa) initn: 409 init1: 224 opt: 382 Z-score: 437.2 bits: 90.8 E(): 3.1e-19 Smith-Waterman score: 460; 24.453% identity (52.372% similar) in 548 aa overlap (1-520:104-624) 10 20 30 KIAA18 RSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESMDLVL ..:::.:. :. ... :: .. .. KIAA13 LLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKII 80 90 100 110 120 130 40 50 60 70 80 90 KIAA18 NYAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLDPQNSIGVFIFADHYGHQ .. ::... :. :.: . :::..:: . : : ..:: . .: . : .:. :. KIAA13 DFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLT 140 150 160 170 180 190 100 110 120 130 140 150 KIAA18 ELGDRSKEYIRKKFLCVTKEQEFLQLTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHEQ :. . .. :.: . . :::.: ..: .:.:..:. : ..... ::.. : KIAA13 EVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLE- 200 210 220 230 240 250 160 170 180 190 200 KIAA18 NEREVHLPEIFAKCIRFPLME-DTFIEKIPPQFAQAIAKSCV----EKGPSNTNGCTQRL : .. . . : :::::: . .:. . . ..:: : . . : . KIAA13 -EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPV 260 270 280 290 300 310 210 220 230 240 250 KIAA18 GMTASEMIICFDAAH--KHSG--KKQTVPCLDIVT----GRVFKLCKPPNDLR-EVGILV : ... : :..: .: ..: : .. .. .: : . : . :: : KIAA13 -MQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAV 320 330 340 350 360 370 260 270 280 290 300 310 KIAA18 SPDNDIYIAGGYRPSSSEVSIDHKAENDFWMYDHSTNRWLSKPSLLRARIGCKLVYCCGK : .:..:: .:. . . : . . .: :.:.. :: . : .: : KIAA13 I-GNFLYVVGG---QSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGY 380 390 400 410 420 320 330 340 350 360 370 KIAA18 MYAIGGRVYEGDGRNSLKSVECYDSRENCWTTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKIYVLQG--- .::.::: :. : .::::. : : :: : : : .. : .:. : KIAA13 LYAVGGRNAAGE----LPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITH 430 440 450 460 470 480 380 390 400 410 420 KIAA18 ----EFFLFYEPQKDYWGFLTPMTVPRIQGLAAVYKDSIYYIAGT----CGNHQRMFTVE . .. ..:. : : .:::. : . . .: :.:. .... ... : KIAA13 DTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCE 490 500 510 520 530 540 430 440 450 460 470 480 KIAA18 AYDIELNKWTRKKDFPCDQSINPYLKLVLFQNKLHL---FVRATQVTVEEHVFRTSRKNS :. :..:: . :: . ...:.::... . .. :: KIAA13 YYSPILDQWTPIAAMLRGQS---DVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVE----------I 550 560 570 580 490 500 510 520 KIAA18 LYQYDDIADQWMKVYETPDRLWDLGRHFECAVAKLYPQCLQKVL . .:: :.: ::.. :. .:: :... . :. KIAA13 VQKYDPDKDEWHKVFDLPE---SLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP 590 600 610 620 630 >>KIAA1354 ( 632 res) fj01502 (632 aa) initn: 408 init1: 225 opt: 374 Z-score: 428.1 bits: 89.1 E(): 1e-18 Smith-Waterman score: 469; 25.137% identity (53.734% similar) in 549 aa overlap (1-520:93-613) 10 20 30 KIAA18 RSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESMDLVL ..:::.:. :. ... ::. .. .. KIAA13 LLCDVTLVPGDGDEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKII 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 90 KIAA18 NYAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLDPQNSIGVFIFADHYGHQ .. ::... :. :.: . :::..:: . : : ..:: .. .: . : .:. :. KIAA13 DFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLI 130 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 150 KIAA18 ELGDRSKEYIRKKFLCVTKEQEFLQLTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHEQ :. ...: :.: . . :::.: ..: .:.:..:. : ..... ::.. : KIAA13 EVDKYVNNFILKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLE- 190 200 210 220 230 240 160 170 180 190 200 KIAA18 NEREVHLPEIFAKCIRFPLME-DTFIEKIPPQFAQAIAKSCV----EKGPSNTNGCTQRL . : . ... : :::::: . .:. . . ..:: : . . : . KIAA13 DPRMDYAAKLM-KNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPV 250 260 270 280 290 300 210 220 230 240 250 KIAA18 GMTASEMIICFDAAH--KHSG--KKQTVPC--LDIVTGRV--FKLCKPPNDLR-EVGILV : ... : :..: .: ..: : : . :. .. : . : . :: : KIAA13 -MQSDRTAIRSDSTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAV 310 320 330 340 350 260 270 280 290 300 310 KIAA18 SPDNDIYIAGGYRPSSSEVSIDHKAENDFWMYDHSTNRWLSKPSLLRARIGCKLVYCCGK : .:..:: .:. . . : . . .: :.:.. :: . : .: :. KIAA13 I-GNFLYVVGG---QSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGH 360 370 380 390 400 410 320 330 340 350 360 370 KIAA18 MYAIGGRVYEGDGRNSLKSVECYDSRENCWTTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKIYV------ .::.::: :. : .::::. : : :. : : : .. : .:. KIAA13 LYAVGGRSAAGE----LATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITH 420 430 440 450 460 470 380 390 400 410 420 KIAA18 --LQGEFFLFYEPQKDYWGFLTPMTVPRIQGLAAVYKDSIYYIAGT----CGNHQRMFTV .:.:.. : .:. : : .:::. : . :..: :.:. .... ... KIAA13 DTFQNELMCF-DPDTDKWMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSC 480 490 500 510 520 530 430 440 450 460 470 480 KIAA18 EAYDIELNKWTRKKDFPCDQSINPYLKLVLFQNKLHL---FVRATQVTVEEHVFRTSRKN : :. :..:: . :: . ...:.::... . .. :: KIAA13 EYYSPTLDQWTPIAAMLRGQS---DVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVE---------- 540 550 560 570 490 500 510 520 KIAA18 SLYQYDDIADQWMKVYETPDRLWDLGRHFECAVAKLYPQCLQKVL . .:: :.: ::.. :. .:: :... . :. KIAA13 IVQKYDPEKDEWHKVFDLPE---SLGGIRACTLTVFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS 580 590 600 610 620 630 >>KIAA0469 ( 559 res) hg01666 (559 aa) initn: 397 init1: 204 opt: 343 Z-score: 393.1 bits: 82.5 E(): 8.9e-17 Smith-Waterman score: 429; 24.764% identity (52.930% similar) in 529 aa overlap (1-521:82-541) 10 20 30 KIAA18 RSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESMDLVL :.::.. : :: ..::. :: . ..:.: KIAA04 RKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLL 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 90 KIAA18 NYAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLDPQNSIGVFIFADHYGHQ ...::.:: .. :.. :. ::...:.:.... :. .. ..:: : . . ::. .. . KIAA04 DFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCS 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 KIAA18 ELGDRSKEYIRKKFLCVTKEQ-EFLQLTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHE :.. ....: .. . :: : : :.. :. : .: : : .:: .:. .:: . . KIAA04 GLASAAQRFILRHVGELGAEQLERLPLAR--LLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRAD 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 KIAA18 QNEREVHLPEIFAKCIRFPLMEDTFIEKIPPQFAQAIAKSCVEKGPSNTNGCTQRLGMTA .: .: :... . .:.:... .. .:.. :. : . : : :: : KIAA04 PPRRAAHWPQLL-EAVRLPFVRRFYL------LAHVEAEPLVARCPP----CL-RLLREA 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 KIAA18 SEMIICFDAAHKHSGKKQTVPCLDIVTGRVFKLCKPPNDLREVGILVSPDNDIYIAGGYR . :.::. ... :: . .: . : :. .:: :: KIAA04 RD----FQAARYD--RHDRGPCPRMRP-------RPSTGLAEILVLV---------GGCD 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 KIAA18 PSSSE-VSIDHKAENDFWMYDHSTNRW--LSK-PSLLRARIGCKLVYCCGKMYAIGGRVY . .: :..: :. .:..: :.. :. : . : ..: . .:. :: KIAA04 QDCDELVTVD--------CYNPQTGQWRYLAEFPDHLGG--GYSIVALGNDIYVTGG--- 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 KIAA18 EGDGRNSLKSVECYDSRENCWTTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKIYVLQGEFFLFYEPQKDY .:: : :.: : :. : : : :.:.. .::. .. :. : KIAA04 -SDGSRLYDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAADSTERYDHTTDS 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 KIAA18 WGFLTPMTVPRIQGLAAVYKDSIYYIAGTCGNHQRMFTVEAYDIELNKWTRKKDFPCDQS : : ::: : . ... . .: :.. : .. .... :: . . :. : : KIAA04 WEALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSLAG--KETMVMQCYDPDTDLWSL---VDCGQ- 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 KIAA18 INP--YLKLVLFQNKLHLFVRATQVTVEEHVFRTSRKNSLYQYDDIADQWMKVYETPDRL . : . . : : ::: .. :. :. .: ..: :. . KIAA04 LPPWSFAPKTATLNGLMYFVRDDSAEVD--VYNPTR-----------NEWDKIPSMNQVN 480 490 500 510 520 510 520 KIAA18 WDLGRHFECA-VAKLYPQCLQKVL .. :.:.. : : :.: KIAA04 FQAGQHWKHRLVLILQPKCHRDECLGSTAMMDGSHLN 530 540 550 >>KIAA1921 ( 545 res) fg00938 (545 aa) initn: 435 init1: 277 opt: 318 Z-score: 364.5 bits: 77.2 E(): 3.5e-15 Smith-Waterman score: 454; 24.819% identity (54.710% similar) in 552 aa overlap (1-520:30-543) 10 20 30 KIAA18 RSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESMDLVLN ::. :: . :. . ...:. ..:.:. KIAA19 PRCAGRSSPVRKRHGGRRAGGKDTLVSVPRSVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLE 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 KIAA18 YAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLDPQNSIGVFIFADHYGHQE ..::. ... ::...:. ::: ::. .. :.... ..: .: .::. .:. . .: KIAA19 FVYTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSE 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 KIAA18 LGDRSKEYIRKKFLCVTKEQEFLQLTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHEQN : .: . . : :. ..:.:...::..:. ...:.::. :: :::..:.:.... KIAA19 LYHMAKAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPA 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 KIAA18 EREVHLPEIFAKCIRFPLMEDTFIEKIPPQFAQAIAKS---CVE--------------KG : . :..: .:.:... ... .. . . . :: : . . KIAA19 TRTQYAAELLA-VVRLPFIHPSYLLNVVDN--EELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQ 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 KIAA18 PSNTNGCTQRLGMTASEMIICFDAAHKHSGKKQ----TVPCLDIVTGRVFKLCKPPNDLR .: ::. ..:.:. . .... : : .: : . ... . : . : : KIAA19 EMQTPRTRPRLSAGVAEVIV-LVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDR 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 KIAA18 EVGILVSPDNDIYIAGGYRPSSSEVSIDHKAENDFWMYDHSTNRW--LSKPSLLRARIGC : .:: ..::..::.. : :.. : : : . : .:. .. : : KIAA19 EFFSVVSAGDNIYLSGGME---SGVTL-----ADVWCYMSLLDNWNLVSRMTVPRCR-HN 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 360 KIAA18 KLVYCCGKMYAIGGRVYEGDGRNSLKSVECYDSRENCWTTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKI .::: ::.:..:: :. . :: ::. : : .: .: :.. :. :: KIAA19 SLVYD-GKIYTLGGLGVAGN----VDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKI 350 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 KIAA18 YVLQGE--------FFLFYEPQKDYWGFL-TPMTVPRIQGLAAVYKDSIYYIAGTCGNHQ ::. : . : :: . :.:. .:: . :: ... .: : : . KIAA19 YVFGGVNEAGRAAGVLQSYVPQTNTWSFIESPMIDNKYA--PAVTLNGFVFILG--GAYA 410 420 430 440 450 420 430 440 450 460 470 KIAA18 RMFTVEAYDIELNKWTRKKDFPCDQSINPYLKLVLFQNKLHLFVRATQVTVEEHVFRTSR : :. :: : .. : : . . . :....:. .. . :. : .. KIAA19 RATTI--YDPEKGNI---KAGPNMNHSRQFCSAVVLDGKI--YATGGIVSSEGPAL---- 460 470 480 490 500 480 490 500 510 520 KIAA18 KNSLYQYDDIADQWMKVYETPDRLWDLGRHFECAVAKLYPQCLQKVL ... :. .. : . . : .. :: :.: : : : KIAA19 -GNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPVF---RH-GCVVIKKYIQSG 510 520 530 540 526 residues in 1 query sequences 1986979 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:19:06 2008 done: Thu Dec 18 15:19:07 2008 Total Scan time: 0.460 Total Display time: 0.150 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]