# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh13781.fasta.nr -Q ../query/KIAA1822.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1822, 533 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7819012 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9362+/-0.000197; mu= 9.6223+/- 0.011 mean_var=118.7429+/-22.940, 0's: 39 Z-trim: 67 B-trim: 9 in 1/65 Lambda= 0.117698 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|166218135|sp|Q96JK4.2|HIPL1_HUMAN RecName: Full ( 782) 3754 648.6 1.9e-183 gi|74195055|dbj|BAE28276.1| unnamed protein produc ( 727) 3171 549.6 1.1e-153 gi|123792821|sp|Q14DK5.1|HIPL1_MOUSE RecName: Full ( 791) 3171 549.6 1.2e-153 gi|109730179|gb|AAI13774.1| Hedgehog interacting p ( 791) 3171 549.6 1.2e-153 gi|148686770|gb|EDL18717.1| mCG18356 [Mus musculus ( 791) 3168 549.1 1.7e-153 gi|194038099|ref|XP_001925214.1| PREDICTED: simila ( 670) 2879 499.9 8.9e-139 gi|134026300|gb|AAI34905.1| LOC100002738 protein [ ( 820) 2386 416.3 1.6e-113 gi|189530759|ref|XP_001337342.2| PREDICTED: simila ( 850) 2386 416.3 1.7e-113 gi|124375938|gb|AAI32878.1| HHIP-like 1 [Homo sapi ( 608) 2306 402.6 1.6e-109 gi|37181454|gb|AAQ88540.1| ARAR9245 [Homo sapiens] ( 608) 2306 402.6 1.6e-109 gi|118092160|ref|XP_421358.2| PREDICTED: similar t ( 788) 2129 372.7 2.2e-100 gi|126290507|ref|XP_001374683.1| PREDICTED: simila ( 782) 2113 369.9 1.4e-99 gi|74216132|dbj|BAE23730.1| unnamed protein produc ( 600) 2037 356.9 9e-96 gi|94733564|emb|CAK04105.1| novel protein [Danio r ( 788) 1962 344.3 7.4e-92 gi|125844135|ref|XP_687401.2| PREDICTED: si:ch211- ( 838) 1962 344.3 7.7e-92 gi|1234787|gb|AAC59865.1| up-regulated by thyroid ( 995) 1817 319.8 2.2e-84 gi|47212352|emb|CAF93906.1| unnamed protein produc ( 895) 1816 319.6 2.3e-84 gi|194227342|ref|XP_001489641.2| PREDICTED: HHIP-l ( 787) 1805 317.6 7.8e-84 gi|126307114|ref|XP_001376005.1| PREDICTED: simila ( 732) 1804 317.4 8.4e-84 gi|125842833|ref|XP_688873.2| PREDICTED: similar t ( 814) 1798 316.5 1.8e-83 gi|76669880|ref|XP_613279.2| PREDICTED: similar to ( 766) 1788 314.8 5.7e-83 gi|10435980|dbj|BAB14717.1| unnamed protein produc ( 529) 1780 313.2 1.1e-82 gi|49113217|gb|AAH07638.1| HHIP-like 2 [Homo sapie ( 724) 1780 313.4 1.4e-82 gi|50740230|ref|XP_419401.1| PREDICTED: similar to ( 765) 1779 313.2 1.6e-82 gi|114572791|ref|XP_525070.2| PREDICTED: hypotheti ( 724) 1772 312.0 3.6e-82 gi|149040937|gb|EDL94894.1| similar to RIKEN cDNA ( 492) 1762 310.1 8.9e-82 gi|149641585|ref|XP_001512074.1| PREDICTED: simila ( 768) 1764 310.7 9.6e-82 gi|74006205|ref|XP_536153.2| PREDICTED: hypothetic ( 696) 1762 310.3 1.1e-81 gi|109498329|ref|XP_229754.4| PREDICTED: hypotheti ( 712) 1762 310.3 1.2e-81 gi|12859987|dbj|BAB31831.1| unnamed protein produc ( 497) 1752 308.5 2.9e-81 gi|166218133|sp|Q9D2G9.2|HIPL2_MOUSE RecName: Full ( 717) 1752 308.6 3.8e-81 gi|210094800|gb|EEA42975.1| hypothetical protein B ( 586) 1442 255.9 2.3e-65 gi|210094809|gb|EEA42984.1| hypothetical protein B ( 552) 1440 255.5 2.8e-65 gi|115735484|ref|XP_794447.2| PREDICTED: similar t (1074) 1432 254.4 1.1e-64 gi|210094801|gb|EEA42976.1| hypothetical protein B ( 564) 1427 253.3 1.3e-64 gi|210094810|gb|EEA42985.1| hypothetical protein B ( 566) 1423 252.6 2.1e-64 gi|198428877|ref|XP_002125570.1| PREDICTED: simila ( 689) 1236 221.0 8.7e-55 gi|156227806|gb|EDO48608.1| predicted protein [Nem ( 581) 1181 211.6 5e-52 gi|47210600|emb|CAF93516.1| unnamed protein produc ( 357) 1165 208.6 2.3e-51 gi|221111859|ref|XP_002168279.1| PREDICTED: simila ( 616) 1030 185.9 2.7e-44 gi|210111871|gb|EEA59659.1| hypothetical protein B ( 446) 966 174.9 4.1e-41 gi|15929541|gb|AAH15201.1| HHIPL2 protein [Homo sa ( 256) 875 159.2 1.2e-36 gi|87290201|gb|EAQ82089.1| protein up-regulated by ( 404) 869 158.4 3.4e-36 gi|210131098|gb|EEA78768.1| hypothetical protein B ( 479) 848 154.9 4.6e-35 gi|148847883|gb|EDL62215.1| protein up-regulated b ( 659) 846 154.7 7.3e-35 gi|210126180|gb|EEA73868.1| hypothetical protein B ( 475) 841 153.7 1e-34 gi|184206768|gb|EDU03815.1| protein up-regulated b ( 421) 815 149.3 2e-33 gi|210096168|gb|EEA44318.1| hypothetical protein B ( 322) 812 148.6 2.4e-33 gi|171915227|ref|ZP_02930697.1| protein up-regulat ( 393) 792 145.3 2.9e-32 gi|32446810|emb|CAD76646.1| protein up-regulated b ( 468) 787 144.6 5.9e-32 >>gi|166218135|sp|Q96JK4.2|HIPL1_HUMAN RecName: Full=HHI (782 aa) initn: 3754 init1: 3754 opt: 3754 Z-score: 3449.9 bits: 648.6 E(): 1.9e-183 Smith-Waterman score: 3754; 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83.022% identity (92.351% similar) in 536 aa overlap (1-533:256-791) 10 20 30 KIAA18 GFLGIAFHPSFQHNRRLYVYYSVGIRSSEW ::::.:::: : : .::::::::. :: gi|123 TYLPDRSRLEKPFLNVSQAVLTSPWEGDERGFLGLAFHPRFPHPSKLYVYYSVGVGFREW 230 240 250 260 270 280 40 50 60 70 80 90 KIAA18 IRISEFRVSEDDENAVDHSSERIILEVKEPASNHNGGQLLFGDDGYLYIFTGDGGMAGDP :::::::::: :::.:::.:::::::..:::::::::::::::::.:::::::::::::: gi|123 IRISEFRVSEGDENTVDHGSERIILEIEEPASNHNGGQLLFGDDGFLYIFTGDGGMAGDP 290 300 310 320 330 340 100 110 120 130 140 150 KIAA18 FGTFGNAQNKSALLGKVLRIDVDRKERGLPYGIPPDNPFVGDPAAQPEVYALGVRNMWRC :: :::::::::::::::::::::::::: :::::::::: ::.:.:::::::::::::: gi|123 FGKFGNAQNKSALLGKVLRIDVDRKERGLHYGIPPDNPFVDDPGARPEVYALGVRNMWRC 350 360 370 380 390 400 160 170 180 190 200 210 KIAA18 SFDRGDPSSGTGRGRLFCGDVGQNKFEEVDVVERGGNYGWRAREGFECYDRSLCANTSLN ::::::: :::::::::::::::::.::::.:::: :::::::::::::::.:::::::. gi|123 SFDRGDPMSGTGRGRLFCGDVGQNKYEEVDLVERGRNYGWRAREGFECYDRKLCANTSLD 410 420 430 440 450 460 220 230 240 250 260 270 KIAA18 DLLPIFAYPHTVGKSVTGGYVYRGCEYPNLNGLYIFGDFMSGRLMSLQENPGTGQWQYSE :.:::::::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: ::::.::: gi|123 DVLPIFAYPHKLGKSVTGGYVYRGCEYPNLNGLYIFGDFMSGRLMSLRENPETGQWKYSE 470 480 490 500 510 520 280 290 300 310 320 330 KIAA18 ICMGHGQTCEFPGLINNYYPYIISFGEDEAGELYFMSTGEPSATAPRGVVYKIIDASRRA .:::.:::: :::::::::::::::.::::::::::::: ::::: .::.::.:: :::: gi|123 VCMGRGQTCAFPGLINNYYPYIISFAEDEAGELYFMSTGVPSATAAHGVIYKVIDPSRRA 530 540 550 560 570 580 340 350 360 370 380 390 KIAA18 PPGKCQIQPAQVKIRSRLIPFVPKEKFIPKTRSTPRPTARAPTRAPRRGRPTAAPPAPTP :::::.:.:::::.::.::::::::::: .:::::::::::.:::: ::::::::::: gi|123 PPGKCKIRPAQVKVRSHLIPFVPKEKFIRTPESTPRPTARAPTKAPRRRRPTAAPPAPTP 590 600 610 620 630 640 400 410 420 430 440 KIAA18 RP---ARPTQQPGSRRGGGRRRGRLNSASRAFRDGEVRLVRPAGLSSGSGRVEVFVGGRW :: ::::..::.:.:::::::: ..: ..: :::::::::: : ::::::.:::: gi|123 RPTKPARPTRRPGARKGGGRRRGRPSTAVPEPENGSVRLVRPAGLSPGRGRVEVFIGGRW 650 660 670 680 690 700 450 460 470 480 490 500 KIAA18 GTVCDDSWNISGAAVVCRQLGFAYAVRAVKRAEFGQGGSLPILLDDVRCAGWERNLLECQ ::::::.:. ..:::::::::::.::::.::::::.: .: :::::::::: ::::::: gi|123 GTVCDDAWDTKAAAVVCRQLGFAHAVRAAKRAEFGEGRALRILLDDVRCAGSERNLLECA 710 720 730 740 750 760 510 520 530 KIAA18 HNGVGTHNCEHDEDAGVVCSHQNPDL : :::::::.::::::: ::::.:.: gi|123 HAGVGTHNCKHDEDAGVECSHQDPNL 770 780 790 >>gi|109730179|gb|AAI13774.1| Hedgehog interacting prote (791 aa) initn: 3276 init1: 2440 opt: 3171 Z-score: 2914.8 bits: 549.6 E(): 1.2e-153 Smith-Waterman score: 3171; 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