# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh01321.fasta.huge -Q ../query/KIAA1820.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1820, 1644 aa vs ./tmplib.25089 library 1985861 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.8202+/-0.0109; mu= -25.8276+/- 0.734 mean_var=513.0896+/-123.488, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.056621 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0292 ( 1716 res) ha06353 (1716) 729 75.5 1.1e-13 >>KIAA0292 ( 1716 res) ha06353 (1716 aa) initn: 542 init1: 296 opt: 729 Z-score: 337.8 bits: 75.5 E(): 1.1e-13 Smith-Waterman score: 913; 25.316% identity (51.761% similar) in 1505 aa overlap (207-1601:3-1389) 180 190 200 210 220 230 KIAA18 VQQPPPPQQPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQG ::. .: : .::. : . ... : :.. 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