# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha00534.fasta.nr -Q ../query/KIAA1815.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1815, 881 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826235 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0680+/-0.000187; mu= 14.6773+/- 0.010 mean_var=80.5561+/-16.504, 0's: 29 Z-trim: 35 B-trim: 6507 in 2/64 Lambda= 0.142898 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|117949602|sp|Q7Z2K6.2|ERMP1_HUMAN RecName: Full ( 904) 5911 1228.9 0 gi|194034135|ref|XP_001924252.1| PREDICTED: endopl ( 905) 5390 1121.5 0 gi|149736855|ref|XP_001493226.1| PREDICTED: endopl ( 893) 5330 1109.1 0 gi|81864306|sp|Q6UPR8.1|ERMP1_RAT RecName: Full=En ( 898) 5112 1064.2 0 gi|118597349|sp|Q3UVK0.2|ERMP1_MOUSE RecName: Full ( 898) 5083 1058.2 0 gi|148709742|gb|EDL41688.1| mCG124990, isoform CRA ( 918) 5083 1058.2 0 gi|74209380|dbj|BAE23269.1| unnamed protein produc ( 898) 5077 1057.0 0 gi|73946936|ref|XP_852123.1| PREDICTED: similar to ( 917) 5010 1043.2 0 gi|109111623|ref|XP_001108869.1| PREDICTED: simila (1016) 5005 1042.2 0 gi|126335629|ref|XP_001365350.1| PREDICTED: hypoth ( 899) 4966 1034.1 0 gi|26349293|dbj|BAC38286.1| unnamed protein produc ( 680) 4153 866.4 0 gi|118597350|sp|Q0VGW4.1|ERMP1_XENLA RecName: Full ( 876) 3852 804.4 0 gi|66347358|emb|CAI95005.1| endoplasmic reticulum ( 518) 3548 741.5 2.1e-211 gi|211826946|gb|AAH31630.2| ERMP1 protein [Homo sa ( 376) 2625 551.1 3.3e-154 gi|47077855|dbj|BAD18796.1| unnamed protein produc ( 419) 2545 534.7 3.2e-149 gi|210091075|gb|EEA39335.1| hypothetical protein B ( 889) 2353 495.4 4.6e-137 gi|193787467|dbj|BAG52673.1| unnamed protein produ ( 351) 2304 484.9 2.6e-134 gi|149062677|gb|EDM13100.1| rCG48104 [Rattus norve ( 850) 2284 481.1 8.5e-133 gi|148709741|gb|EDL41687.1| mCG124990, isoform CRA ( 850) 2267 477.6 9.7e-132 gi|10439948|dbj|BAB15604.1| unnamed protein produc ( 317) 2206 464.7 2.9e-128 gi|55731416|emb|CAH92422.1| hypothetical protein [ ( 303) 2008 423.8 5.4e-116 gi|190583340|gb|EDV23411.1| hypothetical protein T ( 846) 2006 423.8 1.5e-115 gi|21618719|gb|AAH31519.1| Ermp1 protein [Mus musc ( 317) 1996 421.4 3.1e-115 gi|156546880|ref|XP_001606695.1| PREDICTED: simila ( 883) 1876 397.0 1.8e-107 gi|47223597|emb|CAF99206.1| unnamed protein produc ( 913) 1874 396.6 2.5e-107 gi|83318276|gb|AAI08866.1| LOC398673 protein [Xeno ( 408) 1821 385.4 2.7e-104 gi|170285061|gb|AAI61393.1| LOC100145630 protein [ ( 400) 1819 385.0 3.6e-104 gi|189539973|ref|XP_001921528.1| PREDICTED: simila ( 663) 1799 381.1 9e-103 gi|32766491|gb|AAH55270.1| LOC398673 protein [Xeno ( 380) 1707 361.9 3.1e-97 gi|157018304|gb|EAA07277.4| AGAP003432-PA [Anophel ( 874) 1589 337.9 1.2e-89 gi|189534531|ref|XP_699324.3| PREDICTED: similar t ( 445) 1545 328.5 3.9e-87 gi|193910545|gb|EDW09412.1| GI19045 [Drosophila mo ( 862) 1537 327.1 2e-86 gi|187029005|emb|CAP31863.1| Hypothetical protein ( 894) 1535 326.7 2.7e-86 gi|193910546|gb|EDW09413.1| GI20486 [Drosophila mo ( 861) 1529 325.5 6.2e-86 gi|198136160|gb|EDY69036.1| GA24794 [Drosophila ps ( 862) 1527 325.1 8.2e-86 gi|194157383|gb|EDW72284.1| GK20844 [Drosophila wi ( 861) 1522 324.1 1.7e-85 gi|194110367|gb|EDW32410.1| GL11618 [Drosophila pe ( 862) 1522 324.1 1.7e-85 gi|194145573|gb|EDW61969.1| GJ20013 [Drosophila vi ( 865) 1519 323.4 2.6e-85 gi|193902156|gb|EDW01023.1| GH20682 [Drosophila gr ( 862) 1515 322.6 4.6e-85 gi|193910549|gb|EDW09416.1| GI19043 [Drosophila mo ( 892) 1509 321.4 1.1e-84 gi|198136158|gb|EAL25416.2| GA11297 [Drosophila ps ( 894) 1505 320.6 2e-84 gi|193902157|gb|EDW01024.1| GH21200 [Drosophila gr ( 882) 1504 320.3 2.2e-84 gi|21903501|sp|Q09216.2|YP67_CAEEL RecName: Full=U ( 895) 1504 320.4 2.3e-84 gi|194177895|gb|EDW91506.1| GE12043 [Drosophila ya ( 862) 1503 320.1 2.5e-84 gi|194145577|gb|EDW61973.1| GJ20011 [Drosophila vi ( 892) 1500 319.5 4e-84 gi|198136159|gb|EAL25420.2| GA21772 [Drosophila ps ( 861) 1499 319.3 4.5e-84 gi|194110366|gb|EDW32409.1| GL10445 [Drosophila pe ( 861) 1497 318.9 6e-84 gi|194145574|gb|EDW61970.1| GJ22338 [Drosophila vi ( 883) 1493 318.1 1.1e-83 gi|194110364|gb|EDW32407.1| GL11616 [Drosophila pe ( 894) 1491 317.7 1.4e-83 gi|190657986|gb|EDV55199.1| GG20912 [Drosophila er ( 854) 1490 317.5 1.6e-83 >>gi|117949602|sp|Q7Z2K6.2|ERMP1_HUMAN RecName: Full=End (904 aa) initn: 5911 init1: 5911 opt: 5911 Z-score: 6581.1 bits: 1228.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 5911; 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