# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha06731.fasta.huge -Q ../query/KIAA1811.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1811, 715 aa vs ./tmplib.25089 library 1986790 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.3105+/-0.0105; mu= -16.9546+/- 0.711 mean_var=589.8496+/-140.092, 0's: 0 Z-trim: 41 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.052808 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 897 83.6 1.4e-16 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 864 80.7 5e-16 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 857 80.4 8.9e-16 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 688 67.3 5.3e-12 KIAA1477 ( 870 res) fj04927 ( 870) 691 67.7 5.4e-12 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 687 67.3 5.8e-12 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 642 63.9 6.6e-11 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 563 57.7 3.4e-09 KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) ( 608) 493 52.4 1.5e-07 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 469 50.5 5e-07 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 474 51.3 6.7e-07 KIAA0369 ( 794 res) hh00177 ( 794) 458 49.9 1.1e-06 KIAA0135 ( 1351 res) ha01203s1 (1351) 454 49.8 2e-06 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 395 45.4 4.6e-05 KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265) 367 43.2 0.00019 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 365 42.9 0.00019 KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 361 42.6 0.00022 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 360 42.6 0.00024 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 354 42.5 0.00054 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 340 41.5 0.0012 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 319 39.3 0.0017 KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 327 40.3 0.0019 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 316 39.2 0.0026 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 301 37.6 0.0032 KIAA0834 ( 453 res) hj05353 ( 453) 300 37.5 0.0033 >>KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371 aa) initn: 976 init1: 815 opt: 897 Z-score: 389.7 bits: 83.6 E(): 1.4e-16 Smith-Waterman score: 934; 36.489% identity (62.919% similar) in 507 aa overlap (1-477:146-636) 10 20 30 KIAA18 IVNREKLSESVLMKVEREIAILKLIEHPHV :... .:.: : :. ::. :.:.. :::. 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KIAA18 YRLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNI 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 90 KIAA18 LKLHDVYENKKYLYLVLEHVSGGELFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIVSALDFCHSYSIC .:: .: :..: ::::.:..:.::.:::::..::. :::: :::::::. .::. .: KIAA18 VKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIV 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 150 KIAA18 HRDLKPENLLLDEKNNIRIADFGMASLQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIKGEKYDGRRAD ::::: :::::: . ::.:::::... . : :.: :::: :: ::...:.:::: ..: KIAA18 HRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD 180 190 200 210 220 230 160 170 180 190 200 210 KIAA18 MWSCGVILFALLVGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVEPEKR .:: ::::..:. :.:::: ::..: :.: :: ...: .. ::.:.:: .. ..: :: KIAA18 IWSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKR 240 250 260 270 280 290 220 230 240 250 260 270 KIAA18 LSLEQIQKHPWYLGGKHEPDPCLEPAPGRRVAMRSLPSNGELDPDVLESMASLGCFRDRE .::::.: : : .: . :.: . : . : .: :...: :: KIAA18 CTLEQIMKDKWINIG-YEGEE-LKP--------YTEPEEDFGDTKRIEVMVGMG--YTRE 300 310 320 330 340 280 290 300 310 320 KIAA18 RLHRELRSEEENQEKMIYYLLLDRKERYPSCEDQDLP--PRNDVDPPRKRVDSPMLSR-- .... : :.. : : :::: :: . . :. : : : ... :. KIAA18 EIKESLTSQKYN-EVTATYLLLGRKTEEGG--DRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGT 350 360 370 380 390 400 330 340 350 360 370 KIAA18 -HGK-RRPERKSMEVLSITDAGGGGSPVPT--RRA------LEMAQHSQRSRSVSGASTG :.: .: .... . : ::.: .:. :. .. .:..: ...: KIAA18 SHSKGQRSSSSTYHRQRRHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAG 410 420 430 440 450 460 380 390 400 410 420 430 KIAA18 LSSSPLSSPRSPVFSFSPEPGAGD-EARGGGSPTSKTQTLPSRGPRGGGAGEQPPPPSAR .: : : ::. : . .:. .. : : .. .. :: : . : . : KIAA18 SGSRGLP-PSSPMVSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAER 470 480 490 500 510 520 440 450 460 470 480 490 KIAA18 STPLPGPPGSPRSSGGTPLHSPLHTPRASPTGTPGTTPPPSPGGGVGGAAWRSRLNSIRN . ::. :. ::: :: ..: :::.. . ::: : . .: ..::. KIAA18 PSLLPN--GKENSSG-TP-----RVPPASPSS--HSLAPPS-----GERSRLARGSTIRS 530 540 550 560 500 510 520 530 540 550 KIAA18 SFLGSPRFHRRKMQVPTAEEMSSLTPESSPELAKRSWFGNFISLDKEEQIFLVLKDKPLS .: :. :: . ... : .:: ::... KIAA18 TFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNG--PPASPTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTR 570 580 590 600 610 620 560 570 580 590 600 610 KIAA18 SIKADIVHAFLSIPSLSHSVLSQTSFRAEYKASGGPSVFQKPVRFQVDISSSEGPEPSPR KIAA18 RVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRSQTNLRESGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDS 630 640 650 660 670 680 >>KIAA0781 ( 950 res) hk09678 (950 aa) initn: 951 init1: 771 opt: 857 Z-score: 375.1 bits: 80.4 E(): 8.9e-16 Smith-Waterman score: 865; 30.976% identity (57.143% similar) in 707 aa overlap (1-698:74-697) 10 20 30 KIAA18 IVNREKLSESVLMKVEREIAILKLIEHPHV :... .:. : :. ::. :.:...:::. KIAA07 YDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEVAIKIIDKSQLDAVNLEKIYREVQIMKMLDHPHI 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 KIAA18 LKLHDVYENKKYLYLVLEHVSGGELFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIVSALDFCHSYSIC .::..:.:.:..:::: :....::.::::...:::. .:::. : ::.::.:.::. .: KIAA07 IKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFDYLANHGRLNESEARRKFWQILSAVDYCHGRKIV 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 KIAA18 HRDLKPENLLLDEKNNIRIADFGMASLQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIKGEKYDGRRAD ::::: ::::::.. ::.:::::.... . :: : :::: :: :::..:..:.: . : KIAA07 HRDLKAENLLLDNNMNIKIADFGFGNFFKSGELLATWCGSPPYAAPEVFEGQQYEGPQLD 170 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 KIAA18 MWSCGVILFALLVGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVEPEKR .:: ::.:..:. :::::: .: : ..: .: :..:.:. ::. :.: :. ..: :: KIAA07 IWSMGVVLYVLVCGALPFDGPTLPILRQRVLEGRFRIPYFMSEDCEHLIRRMLVLDPSKR 230 240 250 260 270 280 220 230 240 250 260 270 KIAA18 LSLEQIQKHPWYLGGKHEPDPCLEPAPGRRVAMRSLPSNGELDPDVLESMASLGCFRDRE :.. ::..: :.: : : : ... :: ::.. .::. : ::: :.. KIAA07 LTIAQIKEHKWMLIEVPVQRPVLYPQE-----QENEPSIGEFNEQVLRLMHSLGI--DQQ 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 KIAA18 RLHRELRSEEENQEKMIYYLLLDRKERYPSCEDQDLPPRNDVDPPRKRVDSPMLSRHGKR . . :... :. ::.::..: . . : : ..:.:. .: KIAA07 KTIESLQNKSYNHFAAIYFLLVERLKSHRSSF-----------PVEQRLDG------RQR 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 KIAA18 RPERKSMEVLSITDAGGGGSPVPTRRALEMAQHSQRSRSVSGASTGLSSSPLSSPRSPVF :: ... ... : : :: ..:: : . .: : .: .: KIAA07 RP--STIAEQTVAKAQTVGLPV--------TMHSPNMRLLRSALL-----PQAS-NVEAF 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 KIAA18 SFSPEPGAGDEARGGGSPTSKTQTLPSRGPRGGGAGEQPPPPS-ARSTPLPGPPGSPRSS :: :..: .:... ..: :. .: .: :: .:. : . : . KIAA07 SF---PASGCQAEAAFMEEECVDT-----PKVNGCLLDPVPPVLVRK----GCQSLPSNM 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 KIAA18 GGTPLHSPLHTPRASPTGTPGTTPPPSPGGGVGGAAWRSRLNSIRNSFLGSPRFHRRKMQ : . :.: : : . :..: .. : :. . . . KIAA07 METSIDEGLETE-----GEAEEDPAHAF------EAFQSTRSGQRRHTLS--EVTNQLVV 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 KIAA18 VPTAEEMSSLTPESSPELAKRSWFGNFISLDKEEQIFLVLKDKPLSSIKADIVHAFLSIP .: : .. :.. .:: : . . .. :.... .. :.:.: :.: ::. : : KIAA07 MPGAGKIFSMN--DSPSLDSVDSEYDMGSVQRDLNF---LEDNP--SLK-DIMLANQPSP 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 KIAA18 SLSHSVLSQTSFRAEYKASGGPSVFQKPVRFQVDISSSEGPEPSPRRDGSGGGGIYSVTF .. .: .: : . : .. :. . .: :: . : : : :: :.: KIAA07 RMTSPFIS---LRPTNPAMQALSSQKREVHNRSPVSFREGRRAS---DTSLTQGI--VAF 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 KIAA18 TLISGPSRRFKRVVETIQAQLLSTH-----DQ---PSVQALADEKNGAQTRPAGAPPRSL : : ..: ..::: . : :.. : : .. . .. .:. KIAA07 RQHLQNLARTKGILELNKVQLLYEQIGPEADPNLAPAAPQLQDLASSCPQEEVSQQQESV 630 640 650 660 670 680 690 700 710 KIAA18 QPPPGRPDPELSSSPRRGPPKDKKLLATNGTPLP . :. :.:: ::. KIAA07 STLPASVHPQLS--PRQSLETQYLQHRLQKPSLLSKAQNTCQLYCKEPPRSLEQQLQEHR 690 700 710 720 730 740 >>KIAA0175 ( 656 res) ha02337 (656 aa) initn: 671 init1: 353 opt: 688 Z-score: 307.4 bits: 67.3 E(): 5.3e-12 Smith-Waterman score: 692; 37.458% identity (65.886% similar) in 299 aa overlap (1-297:46-331) 10 20 30 KIAA18 IVNREKLSESVLMKVEREIAILKLIEHPHV :.... :. : : ... :: :: ..: :. KIAA01 YELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTLG-SDLPRIKTEIEALKNLRHQHI 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 KIAA18 LKLHDVYENKKYLYLVLEHVSGGELFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIVSALDFCHSYSIC .:. : :. . ...:::. :::::::.... ::. .:.: :::::::. . :: . KIAA01 CQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYA 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 KIAA18 HRDLKPENLLLDEKNNIRIADFGMASLQVG--DSLLETSCGSPHYACPEVIKGEKYDGRR ::::::::::.:: ..... :::. . : : :.: ::: :: ::.:.:..: : . KIAA01 HRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELIQGKSYLGSE 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 200 KIAA18 ADMWSCGVILFALLVGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVEPE ::.:: :..:..:. : :::::::. : .:. :: . .:... :. ::. :..:.:. KIAA01 ADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPK 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 KIAA18 KRLSLEQIQKHPWYLGGKHEPDPCLEPAPGRRVAMRSLPSNGELDPDVLESMASLGCFRD ::.:.... .::: . . : : .: .:: : . . :. . KIAA01 KRISMKNLLNHPWIMQDYNYP-----------VEWQSKNPFIHLDDDCVTEL-SVHHRNN 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 KIAA18 RERLHRELRSEEENQEKMIYYLLLDRKERYPSCEDQDLPPRNDVDPPRKRVDSPMLSRHG :. .. . . .. : ::: .: : KIAA01 RQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTDIKSNNWSL 310 320 330 340 350 360 >>KIAA1477 ( 870 res) fj04927 (870 aa) initn: 695 init1: 628 opt: 691 Z-score: 307.2 bits: 67.7 E(): 5.4e-12 Smith-Waterman score: 735; 32.258% identity (56.452% similar) in 558 aa overlap (1-508:202-715) 10 20 30 KIAA18 IVNREKLSESVLMKVEREIAILKLIEHPHV :... .:. . :.:. ::. :.:...::.. KIAA14 YRLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI 180 190 200 210 220 230 40 50 60 70 80 90 KIAA18 LKLHDVYENKKYLYLVLEHVSGGELFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIVSALDFCHSYSIC ::.::::: .::. :::: :::::::...::. : KIAA14 ----------------------GEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIV 240 250 260 100 110 120 130 140 KIAA18 HRDLKPENLLLDEKNNIRIADFGMAS-LQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIKGEKYDGRRA ::::: :::::: ::.:::::... . ::..: .: :::: :: ::...:.:::: .. KIAA14 HRDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKL-DTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEV 270 280 290 300 310 320 150 160 170 180 190 200 KIAA18 DMWSCGVILFALLVGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVEPEK :.:: ::::..:. :.:::: .::..: :.: :: ...: .. ::..::. .. ..: : KIAA14 DVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIK 330 340 350 360 370 380 210 220 230 240 250 260 KIAA18 RLSLEQIQKHPWYLGGKHEPD--PCLEPAPGRRVAMRSLPSNGELDPDVLESMASLGCFR : :::::.: :. :..: . : :: : : .. :...: : KIAA14 RGSLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFN------------DTKRIDIMVTMGFAR 390 400 410 420 430 270 280 290 300 310 320 KIAA18 DRERLHRELRSEEENQEKMIYYLLLDRKERYPSCED-QDLPPRNDVDPPRKRVD---SPM :. .. : ... . : : :.:: :: : : ..: : . : : : . KIAA14 DE--INDALINQKYD-EVMATYILLGRKP--PEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTL 440 450 460 470 480 490 330 340 350 360 370 KIAA18 LS-RHGK-RRPERKSMEVLSITDAGGGGSPV-------PTRRALEMAQHSQRSRSVS--- : : : .: ... ..: .: . : : ..: :. . ...:. KIAA14 QSPAHLKVQRSISANQKQRRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKL 500 510 520 530 540 550 380 390 400 410 420 KIAA18 -----GASTGLSSSPLSSPRSPVFSFSPEPGAGDEARGGGSPTSKTQTLPSRGPR----- :... ...::: .:. : : .... .::: . .. . : KIAA14 GSTTVGSKSEMTASPLVGPERKKSSTIP----SNNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVAL 560 570 580 590 600 430 440 450 460 KIAA18 GGGAGEQPPPPSARSTPLPG-------PPGSPR-----SSGGTPLHSPLHTPR-ASPTGT .: . :. : : : . :: :..: :.. : : . .: . KIAA14 QNGKDSSLTEMSVSSISSAGSSVASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYR 610 620 630 640 650 660 470 480 490 500 510 520 KIAA18 PGTT---PPPSPGGGVGGAAW--RSRL---NSIRNSFLGSPRFHRRKMQVPTAEEMSSLT :::: : ::.. ..: :.:. .: :..: : .::.. KIAA14 PGTTQRVPAASPSAHSISTATPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVAYNGPPASPSHE 670 680 690 700 710 720 530 540 550 560 570 580 KIAA18 PESSPELAKRSWFGNFISLDKEEQIFLVLKDKPLSSIKADIVHAFLSIPSLSHSVLSQTS KIAA14 TGAFAHARRGTSTGIISKITSKFVRRSTSGEPKERDKEEGKDSKPRSLRFTWSMKTTSSM 730 740 750 760 770 780 >>KIAA0537 ( 698 res) hg03925 (698 aa) initn: 631 init1: 603 opt: 687 Z-score: 306.7 bits: 67.3 E(): 5.8e-12 Smith-Waterman score: 695; 29.412% identity (58.254% similar) in 527 aa overlap (2-509:123-626) 10 20 30 KIAA18 IVNREKLS-ESVLMKVEREIAILKLIEHPHV . ..:.. :. .....::: :.. ..:::. KIAA05 ELQETLGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHI 100 110 120 130 140 150 40 50 60 70 80 90 KIAA18 LKLHDVYENKKYLYLVLEHVSGGELFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIVSALDFCHSYSIC .....:.::: . ...:..: :::.::. .. ::. .:.:.::::::::. .::. .. KIAA05 ISIYEVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVV 160 170 180 190 200 210 100 110 120 130 140 150 KIAA18 HRDLKPENLLLDEKNNIRIADFGMASLQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIKGEKYDGRRAD ::::: ::.:::.. ::.:::::...: :..:.: :::: :: ::...:. : : ..: KIAA05 HRDLKLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGPEVD 220 230 240 250 260 270 160 170 180 190 200 210 KIAA18 MWSCGVILFALLVGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVEPEKR :. ::.:..:. :..::: . ..:..... : .. : : : ..:.: :. :.:..: KIAA05 SWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPT-QPSDARGLIRWMLMVNPDRR 280 290 300 310 320 330 220 230 240 250 260 KIAA18 LSLEQIQKHPWY-LGGKHEPDPC--LEPAPG---RRVAMRSLPSNGELDPDVLESMASLG ..:.: .: : : : : :. . . :. :.: :. :. .: .:. KIAA05 ATIEDIANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESPLLARIIDWHHRSTG-LQADTEAKMKGLA 340 350 360 370 380 390 270 280 290 300 310 320 KIAA18 CFRDRERLHRELRSEEENQEKMIYYLLLDRKERYPSCEDQDLPPRNDVDPPRKRVDSPML : . .. :: ... .:: . :: :.. :: . . KIAA05 KPTTSEVMLERQRSLKKS-----------KKENDFAQSGQDAVPESPSKLSSKRPKGILK 400 410 420 430 330 340 350 360 370 380 KIAA18 SRHGKRRPERKSMEVLSITDAGGGGSPVPTRRALEMAQHSQRSRSVSGASTGLSSSPLSS .: .. :..: . : . : . : . .. . . : : . . :: .: KIAA05 KRSNS---EHRSHSTGFIEGVVGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPEAEVPGKLSPKQS 440 450 460 470 480 490 390 400 410 420 430 440 KIAA18 ---PRSPVFSFSPEPGAGDEARGGGSPTSKTQTLPSRGPRGGGAGEQPPPPSARSTPLPG :.. ... . . .: . : .: . : : :.. :: :: : KIAA05 ATMPKKGILKKTQQRESGYYSSPERSESS--ELLDSNDVMGSSIPSPSPPDPARVTSHSL 500 510 520 530 540 550 450 460 470 480 490 KIAA18 P---PG----SPRSSGGTPLHSPLHTPRASPTGTPGTTPPPSPGGGVGGAAWRSRLNSI- : : . :.:: . : .:. :: . . : :. :.. . :: .:. KIAA05 SCRRKGILKHSSKYSAGT-MDPALVSPEM-PT-LESLSEPGVPAEGLSRS--YSRPSSVI 560 570 580 590 600 500 510 520 530 540 550 KIAA18 -RNSFLGSPRFHRRKMQVPTAEEMSSLTPESSPELAKRSWFGNFISLDKEEQIFLVLKDK .: :.: : .: KIAA05 SDDSVLSSDSFDLLDLQENRPARQRIRSCVSAENFLQIQDFEGLQNRPRPQYLKRYRNRL 610 620 630 640 650 660 >>KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 (766 aa) initn: 513 init1: 318 opt: 642 Z-score: 287.7 bits: 63.9 E(): 6.6e-11 Smith-Waterman score: 644; 29.484% identity (61.425% similar) in 407 aa overlap (1-404:47-439) 10 20 30 KIAA18 IVNREKLSESVLMKVEREIAILKLIEHPHV .... ::. . .. .:. .::..::.. KIAA00 YDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLATGHLFQEVRCMKLVQHPNI 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 KIAA18 LKLHDVYENKKYLYLVLEHVSGGELFDYLVKKGR-LTPKEARKFFRQIVSALDFCHSYSI ..:..: ... :::.:: .::..:::..:. . :. :.:.: ::: :...::. . KIAA00 VRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHV 80 90 100 110 120 130 90 100 110 120 130 140 KIAA18 CHRDLKPENLLLDEKNN-IRIADFGMAS-LQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIKGEKYDGR ::::::::... ::.. ....:::... .: : .: ::::: :. ::.. :..::. KIAA00 VHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLT-TSCGSLAYSAPEILLGDEYDAP 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 200 KIAA18 RADMWSCGVILFALLVGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVEP .:.:: ::::: :. : ::.. : . : . . .: . .:..:. :.. .: KIAA00 AVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPSHVSKECKDLITRMLQRDP 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 KIAA18 EKRLSLEQIQKHPWYLGGKHEPDPCLEPAPGRRVAMRSLPSNGELDPDVLESMASLGCFR ..: :::.:..::: : :: :: . . : . .: . . . . :: . KIAA00 KRRASLEEIENHPWLQG----VDPS--PATKYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQRMVLGDIA 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 KIAA18 DRERLHRELRSEEENQEKMIYYLLLDRKERYPSCEDQDLPPRNDVDPPRKRVDSPMLSRH ::. . . :.... :. :.:: .: : ..... :. ..: ... . : KIAA00 DRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREK--QEKEIQTRS-ASPSNIKAQFRQ-SWP 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 KIAA18 GKRRPERKSMEVLSITDAGGGGSPVPTRRALEMAQHSQRSRSVSGASTGLSSSPLSSPRS : . . :. : . . : :: . . ...::. : . ... : . KIAA00 TKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVLNGHRSK---GLCDSAKKDDLPELAG 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 KIAA18 PVFSFSPEPGAGDEARGGGSPTSKTQTLPSRGPRGGGAGEQPPPPSARSTPLPGPPGSPR :..: : . : : KIAA00 PALSTVPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSRK 430 440 450 460 470 480 >>KIAA0968 ( 527 res) hj06483 (527 aa) initn: 475 init1: 289 opt: 563 Z-score: 257.0 bits: 57.7 E(): 3.4e-09 Smith-Waterman score: 563; 37.118% identity (67.249% similar) in 229 aa overlap (1-221:92-319) 10 20 30 KIAA18 IVNREKLSESVLMKVEREIAILKLIEHPHV :.: .::: .:.::: : .:..::.. KIAA09 YQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNI 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 90 KIAA18 LKLHDVYENKKYLYLVLEHVSGGELFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIVSALDFCHSYSIC ..::: .. . ::... :.:::::. .: . . .: . ..::. :. ::.... KIAA09 VRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILEAVLHCHQMGVV 130 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 KIAA18 HRDLKPENLLLDEK---NNIRIADFGMASLQVGDSLLETS-CGSPHYACPEVIKGEKYDG ::::::::::: : ...::::.: :.. . :.: : :::.. . : : KIAA09 HRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPY-G 190 200 210 220 230 240 150 160 170 180 190 200 KIAA18 RRADMWSCGVILFALLVGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPH----FIPPDCQSLLRGM . .:.:.:::::. :::: :: :.. ..: ...: :.. .: . :. ..:. : KIAA09 KPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKM 250 260 270 280 290 300 210 220 230 240 250 260 KIAA18 IEVEPEKRLSLEQIQKHPWYLGGKHEPDPCLEPAPGRRVAMRSLPSNGELDPDVLESMAS . ..: ::.. . :::: KIAA09 LTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATR 310 320 330 340 350 360 >>KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) (608 aa) initn: 407 init1: 256 opt: 493 Z-score: 227.5 bits: 52.4 E(): 1.5e-07 Smith-Waterman score: 493; 37.179% identity (67.949% similar) in 234 aa overlap (1-221:346-572) 10 20 30 KIAA18 IVNREKLSESVLMKVEREIAILKLIEHPHV :... .:. . : :. :: :.. . ::.. KIAA17 YETGRVIGDGNFAVVKECRHRETRQAYAMKIIDKSRLKGKEDM-VDSEILIIQSLSHPNI 320 330 340 350 360 370 40 50 60 70 80 90 KIAA18 LKLHDVYENKKYLYLVLEHVSGGELFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIVSALDFCHSYSIC .:::.:::. .::.::.:.::.::: .... .. .: .. .. .:: :. :: KIAA17 VKLHEVYETDMEIYLILEYVQGGDLFDAIIESVKFPEPDAALMIMDLCKALVHMHDKSIV 380 390 400 410 420 430 100 110 120 130 140 KIAA18 HRDLKPENLLL----DEKNNIRIADFGMASLQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIKGEKYDG ::::::::::. :.......::::.:. : . : ::.: :. ::... :: : KIAA17 HRDLKPENLLVQRNEDKSTTLKLADFGLAKHVVRP--IFTVCGTPTYVAPEILS-EKGYG 440 450 460 470 480 490 150 160 170 180 190 KIAA18 RRADMWSCGVILFALLVGALPFDDDNLRQ--LLEKVKRGVFHMPHFIPP--D-----CQS ..:::. ::::. :: : :: . . : :.. .. : :. :.:: : .. KIAA17 LEVDMWAAGVILYILLCGFPPFRSPERDQDELFNIIQLGHFE---FLPPYWDNISDAAKD 500 510 520 530 540 200 210 220 230 240 250 KIAA18 LLRGMIEVEPEKRLSLEQIQKHPWYLGGKHEPDPCLEPAPGRRVAMRSLPSNGELDPDVL :. .. :.:.:: . .:. .::: KIAA17 LVSRLLVVDPKKRYTAHQVLQHPWIETAGKTNTVKRQKQVSPSSEGHFRSQHKRVVEQVS 550 560 570 580 590 600 >>KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 (557 aa) initn: 307 init1: 153 opt: 469 Z-score: 218.0 bits: 50.5 E(): 5e-07 Smith-Waterman score: 469; 34.222% identity (67.556% similar) in 225 aa overlap (14-231:233-456) 10 20 30 40 KIAA18 IVNREKLSESVLMKVEREIAILKLIEHPHVLKLHDVYE--NKK .: .:::::: ..::.:.:: .: . :. KIAA07 IRQAGFPRRPPPRGTRPAPGGCIQPRGPIEQVYQEIAILKKLDHPNVVKLVEVLDDPNED 210 220 230 240 250 260 50 60 70 80 90 100 KIAA18 YLYLVLEHVSGGELFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIVSALDFCHSYSICHRDLKPENLLL .::.:.: :. : ... . : :. .:: .:......... : .: :::.:: :::. KIAA07 HLYMVFELVNQGPVMEVPTLKP-LSEDQARFYFQDLIKGIEYLHYQKIIHRDIKPSNLLV 270 280 290 300 310 320 110 120 130 140 150 KIAA18 DEKNNIRIADFGMAS-LQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIKGEK--YDGRRADMWSCGVIL : ..:.:::::... .. .:.:: .. :.: . :: .. . ..:. :.:. :: : KIAA07 GEDGHIKIADFGVSNEFKGSDALLSNTVGTPAFMAPESLSETRKIFSGKALDVWAMGVTL 330 340 350 360 370 380 160 170 180 190 200 210 KIAA18 FALLVGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHF--IPPDCQSLLRGMIEVEPEKRLSLEQI . .. : :: :. . : :.: ....: : : ..:. :.. .::.:. . .: KIAA07 YCFVFGQCPFMDERIMCLHSKIKSQALEFPDQPDIAEDLKDLITRMLDKNPESRIVVPEI 390 400 410 420 430 440 220 230 240 250 260 270 KIAA18 QKHPWYLGGKHEPDPCLEPAPGRRVAMRSLPSNGELDPDVLESMASLGCFRDRERLHREL . ::: :: : KIAA07 KLHPWVTRHGAEPLPSEDENCTLVEVTEEEVENSVKHIPSLATVILVKTMIRKRSFGNPF 450 460 470 480 490 500 715 residues in 1 query sequences 1986790 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:17:55 2008 done: Thu Dec 18 15:17:56 2008 Total Scan time: 0.570 Total Display time: 0.170 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]