# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fk00438.fasta.huge -Q ../query/KIAA1806.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1806, 481 aa vs ./tmplib.25089 library 1987024 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5165+/-0.00477; mu= 10.0799+/- 0.325 mean_var=151.2769+/-39.421, 0's: 0 Z-trim: 82 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.104277 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 1296 207.1 2.5e-54 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 1278 204.7 2.2e-53 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 1270 203.1 3.6e-53 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 1264 202.4 8.4e-53 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 1263 202.3 9.8e-53 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 1239 198.5 9.8e-52 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 1238 198.6 1.4e-51 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 1230 197.5 3.3e-51 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 1226 196.5 3.7e-51 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 1226 196.6 3.9e-51 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 1221 195.8 6.3e-51 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 1219 195.6 9e-51 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 1216 194.9 9.6e-51 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 1217 195.5 1.3e-50 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 1201 192.8 5.2e-50 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 1200 192.8 6.3e-50 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 1198 192.3 6.8e-50 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 1198 192.4 7.1e-50 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 1191 191.3 1.4e-49 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 1188 191.0 2.4e-49 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 1179 189.4 4.9e-49 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 1178 189.4 5.8e-49 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 1172 188.3 9.7e-49 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 1172 188.5 1.2e-48 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 1172 188.6 1.2e-48 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 1166 187.6 2.1e-48 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 1164 187.3 2.5e-48 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 1130 182.2 9.5e-47 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 1110 179.1 6.8e-46 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 1087 175.5 6.6e-45 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 1073 173.4 2.9e-44 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 989 161.2 2.7e-40 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 982 159.9 4.4e-40 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 889 146.1 8.5e-36 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 832 137.5 3.3e-33 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 806 133.4 4.1e-32 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 803 132.8 4.8e-32 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 780 129.6 6.7e-31 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 694 116.3 3.9e-27 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 630 106.5 2.6e-24 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 608 104.0 5.5e-23 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 599 102.3 1e-22 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 590 100.9 2.5e-22 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 583 99.7 4.6e-22 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 568 97.8 2.9e-21 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 508 89.2 2.3e-18 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 488 86.0 1.6e-17 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 465 82.4 1.6e-16 KIAA0296 ( 1838 res) hf00260 (1838) 428 77.2 1e-14 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 402 72.7 8.4e-14 >>KIAA1396 ( 551 res) hj08221 (551 aa) initn: 2574 init1: 1095 opt: 1296 Z-score: 1067.2 bits: 207.1 E(): 2.5e-54 Smith-Waterman score: 1311; 51.622% identity (76.991% similar) in 339 aa overlap (122-459:183-521) 100 110 120 130 140 150 KIAA18 PQCQPQEAIPSQDTFTEILSIDVKGEQPQPGEKLYKYNELEKPFNSIEPLFQYQRIHAGE ::::.. .: .: :.. : :.:.::::.:: KIAA13 HTGEKPYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKLFECKECRKAFKQSEHLIQHQRIHTGE 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 KIAA18 ASCECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEKTHTAEKCFD .:.: :..: : ::: ..:..:.: : :..: :.: .:.. ::.. ::... .. KIAA13 KPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSDGSSFARHQRCHTGKRPYE 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 KIAA18 CQECGQAFKYSSNLRRHMRT-HTGEKPFECSQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEKPYECKD : :::.::.:.... :: :. :::::::.: .:::.:. ...::::.: :::::::.: KIAA13 CIECGKAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVHIGLILHRRIHTGEKPYKCDV 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 KIAA18 CGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHLRTHTREKPYECNQCGKP :::.:.. :: : : ::::::.::. ::: : .:.:: : :.:. ::::::..::: KIAA13 CGKTFSSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLTQHQRVHSGEKPYECKECGKA 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 KIAA18 FRTSTHLNVHKRIHTGEKLYECATCGQVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYVCQECGRAFSEP :: ..:: : ::::::: ::: ::... : : .:.: ::::::: : ::: ::.. KIAA13 FRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQRIHTGEKPYECIECGNAFKQR 400 410 420 430 440 450 400 410 420 430 440 450 KIAA18 SSLRKHARTHSGKKPYACQECGRAFGQSSHLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAFRHSSSLT : : .: .::.:.::: :.:::.::.:. .: : : :.. .::.:..: ::: ::: . KIAA13 SHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSDSSSCA 460 470 480 490 500 510 460 470 480 KIAA18 VHKRTHVGRETIRNGSLPLSMSHPYCGPLAN :.: :.:. KIAA13 QHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP 520 530 540 550 >>KIAA1852 ( 948 res) fj01514 (948 aa) initn: 6014 init1: 1272 opt: 1278 Z-score: 1050.1 bits: 204.7 E(): 2.2e-53 Smith-Waterman score: 1278; 49.856% identity (74.640% similar) in 347 aa overlap (114-460:572-918) 90 100 110 120 130 140 KIAA18 VLSDTCAEPQCQPQEAIPSQDTFTEILSIDVKGEQPQPGEKLYKYNELEKPFNSIEPLFQ .. .. . ::: :. .. : : . : . KIAA18 FLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKTHTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTK 550 560 570 580 590 600 150 160 170 180 190 200 KIAA18 YQRIHAGEASCECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEKT ..: :.: ::.. ..: ..:::: ..:..:.: :.::.: ::: ..: :: :..: KIAA18 HERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRT 610 620 630 640 650 660 210 220 230 240 250 260 KIAA18 HTAEKCFDCQECGQAFKYSSNLRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGE ::.:: :.: :::..:..::.: ::: :::::::.:..: :.: : :.:.:.: KIAA18 HTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGA 670 680 690 700 710 720 270 280 290 300 310 320 KIAA18 KPYECKDCGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHLRTHTREKPYE :::.: .:::.:. : : .: ::::::::..:..:::::::.:.: : :. :::: KIAA18 KPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYE 730 740 750 760 770 780 330 340 350 360 370 380 KIAA18 CNQCGKPFRTSTHLNVHKRIHTGEKLYECATCGQVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYVCQEC ::.::: .:: :.: ::::: ::: ::. .:. : .: : ::::::: :..: KIAA18 CNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQC 790 800 810 820 830 840 390 400 410 420 430 440 KIAA18 GRAFSEPSSLRKHARTHSGKKPYACQECGRAFGQSSHLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAF :.:. : : : :::.:.::: :.:::.::..:: ::::.:.:.. .::.::.::::: KIAA18 ERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAF 850 860 870 880 890 900 450 460 470 480 KIAA18 RHSSSLTVHKRTHVGRETIRNGSLPLSMSHPYCGPLAN ..::: .:.: : :.. KIAA18 CKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQHQRNHSEEKLN 910 920 930 940 >>KIAA1710 ( 515 res) fj18457 (515 aa) initn: 4514 init1: 1200 opt: 1270 Z-score: 1046.4 bits: 203.1 E(): 3.6e-53 Smith-Waterman score: 1425; 46.072% identity (71.762% similar) in 471 aa overlap (6-456:46-513) 10 20 30 KIAA18 VEEEAMAPGLPTACSQEPVTFADVAVVFTPEEWVF :: : : :: :::: :.:. .: ::: KIAA17 RSSGSFAGQERCLLAAFPALSPWRRTLVLEMAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRP 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 KIAA18 LDSTQRSLYRDVMLENYRNLASVADQLCKPNALSYLEERGEQWTTDRGVLSDTCAE-PQC ::..::.:::::: ::: :..:. .. . : .. .: .:. .. :. :. :: . KIAA17 LDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSENEVNPKQEISED--VQFGTTSERPAENAEE 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 KIAA18 QPQ--EAIPSQDTFTEILSIDVKGEQ----P-QPGEKLYKYNELE------------KPF .:. :.. : : .: :. .:. : :: : ..:.. : : KIAA17 NPESEEGFESGDR-SERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAF 140 150 160 170 180 190 140 150 160 170 180 190 KIAA18 NSIEPLFQYQRIHAGEASCECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRYSS ..: : ..:. :.:. .: : ..: .:.::: .. ..:.. : ::.: ::: :: KIAA17 SQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSS 200 210 220 230 240 250 200 210 220 230 240 250 KIAA18 DLIRHEKTHTAEKCFDCQECGQAFKYSSNLRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTFTRNFNLIL ::.:. ::.:: :.:::..: :.: .:.:::.::::.:: .:::.:.:. .: KIAA17 HLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQ 260 270 280 290 300 310 260 270 280 290 300 310 KIAA18 HQRNHTGEKPYECKDCGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHLRT :::.:::::::::..::..:.. :.: .: :.::::.:..:..::: : ..:.: : :. KIAA17 HQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRA 320 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 370 KIAA18 HTREKPYECNQCGKPFRTSTHLNVHKRIHTGEKLYECATCGQVLSRLSTLKSHMRTHTGE :: ::::.::.::. : .:: :.: ::::: ::: .::. .:: : : .:.. :::: KIAA17 HTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGE 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 430 KIAA18 KPYVCQECGRAFSEPSSLRKHARTHSGKKPYACQECGRAFGQSSHLIVHVRTHSAGRPYQ ::: :.:: :.:.: :.: :: :::.:.::: : .::..: :::.::.: :.:.. .::. KIAA17 KPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYE 440 450 460 470 480 490 440 450 460 470 480 KIAA18 CNQCEKAFRHSSSLTVHKRTHVGRETIRNGSLPLSMSHPYCGPLAN :..:::.: .::.: :::.: KIAA17 CTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD 500 510 >>KIAA1349 ( 752 res) fj00940 (752 aa) initn: 8470 init1: 1253 opt: 1264 Z-score: 1039.8 bits: 202.4 E(): 8.4e-53 Smith-Waterman score: 1264; 43.734% identity (72.634% similar) in 391 aa overlap (73-463:223-612) 50 60 70 80 90 100 KIAA18 LYRDVMLENYRNLASVADQLCKPNALSYLEERGEQWTTDRGVLSDTCAEPQCQPQEAIPS : :. . .. ... . . .: . KIAA13 CNECGKTFSQPSYLSQHKKIHTGEKPYKCNECGKAFIASSSLMVHQRIHTKEKPYQCNVC 200 210 220 230 240 250 110 120 130 140 150 160 KIAA18 QDTFTEILSIDVKGEQPQPGEKLYKYNELEKPFNSIEPLFQYQRIHAGEASCECQEIRNS .:.. .. . .. : ::: :: .: : :.. : ..:. : :: .:.. .. KIAA13 GKSFSQCARLN-QHQRIQTGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKA 260 270 280 290 300 310 170 180 190 200 210 220 KIAA18 FFQSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEKTHTAEKCFDCQECGQAFKYS : ....: : .: .. .: : ::.: :::. .. . :.. ::.:: : :.:::.:.. . KIAA13 FRNKSYLSVHQKTHTEEKPYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFRCNECGKAYRSN 320 330 340 350 360 370 230 240 250 260 270 280 KIAA18 SNLRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEKPYECKDCGKAFNQPSSLR :.: :.::::::::.::..:::.:.: :. ::: :::::::.:..::::: . : : KIAA13 SSLIVHIRTHTGEKPYECNECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLT 380 390 400 410 420 430 290 300 310 320 330 340 KIAA18 SHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHLRTHTREKPYECNQCGKPFRTSTHLNVHKR : : ::::::..:..::::: . ::: : : ::.:::: ::.::. :: ..::.::.: KIAA13 VHHRMHTGEKPYKCTECGKAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQR 440 450 460 470 480 490 350 360 370 380 390 400 KIAA18 IHTGEKLYECATCGQVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYVCQECGRAFSEPSSLRKHARTHSG :::::: :.:. : ...... .:: :.. ::: ::: : .::..: : : : :::.: KIAA13 IHTGEKPYKCTDCERAFTKMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTG 500 510 520 530 540 550 410 420 430 440 450 460 KIAA18 KKPYACQECGRAFGQSSHLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAFRHSSSLTVHKRTHVGRETI .::: :.:: .:: ..:.: :: : :.. .::.::.: :.: .:....:.:::.:.. . KIAA13 EKPYKCNECEKAFTNTSQLTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPF 560 570 580 590 600 610 470 480 KIAA18 RNGSLPLSMSHPYCGPLAN . KIAA13 KCNDCGKAFSQMVHVTEHQKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKE 620 630 640 650 660 670 >>KIAA1611 ( 813 res) fj12627 (813 aa) initn: 10709 init1: 1263 opt: 1263 Z-score: 1038.6 bits: 202.3 E(): 9.8e-53 Smith-Waterman score: 1263; 49.708% identity (73.392% similar) in 342 aa overlap (122-463:332-673) 100 110 120 130 140 150 KIAA18 PQCQPQEAIPSQDTFTEILSIDVKGEQPQPGEKLYKYNELEKPFNSIEPLFQYQRIHAGE ::: :: :: : : . : .: ::.:: KIAA16 HTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGE 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 KIAA18 ASCECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEKTHTAEKCFD .:.: . : :..::: .:..:.: : ::.: :.: :.: :. ::.:: . KIAA16 KPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYK 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 KIAA18 CQECGQAFKYSSNLRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEKPYECKDC :.:::..:.:.: : :: :.::::::..:..:::.:. . :: :: ::: ::..:..: KIAA16 CNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNEC 430 440 450 460 470 480 280 290 300 310 320 330 KIAA18 GKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHLRTHTREKPYECNQCGKPF .:.:.: :.: .: : ::::::..:..::::: .::: :: :. ::::.: .::: : KIAA16 SKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSF 490 500 510 520 530 540 340 350 360 370 380 390 KIAA18 RTSTHLNVHKRIHTGEKLYECATCGQVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYVCQECGRAFSEPS ..:: :. ::.::: :.: ::.:... : : : :.::::::: :..::::::. : KIAA16 TQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRS 550 560 570 580 590 600 400 410 420 430 440 450 KIAA18 SLRKHARTHSGKKPYACQECGRAFGQSSHLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAFRHSSSLTV :: : :.:.::: :.:::..: ..:.: .: : :.. .::.::.: ::: :.::. KIAA16 SLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTT 610 620 630 640 650 660 460 470 480 KIAA18 HKRTHVGRETIRNGSLPLSMSHPYCGPLAN :: :.:.. . KIAA16 HKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAI 670 680 690 700 710 720 >>KIAA1508 ( 573 res) hk06576 (573 aa) initn: 1223 init1: 1223 opt: 1239 Z-score: 1020.7 bits: 198.5 E(): 9.8e-52 Smith-Waterman score: 1239; 39.503% identity (69.977% similar) in 443 aa overlap (15-457:138-572) 10 20 30 40 KIAA18 VEEEAMAPGLPTACSQEPVTFADVAVVFTPEEWVFLDSTQRSLY : .: ::..:. :. .. .. .. KIAA15 HQLQKLDNGEKLFKVDGDQASFMMNCRFHVSGKPFTFGEVGRDFSATSGLLQHQVTPTIE 110 120 130 140 150 160 50 60 70 80 90 100 KIAA18 RDVMLENYRNLASVADQLCKPNALSYLEERGEQWTTDRGVLSDTCAEPQCQPQEAIPSQD : :.: . . :: :.: : : ... .. :. .: . KIAA15 RP--HSRIRHLRVPTGR--KP--LKYTESR-KSFREKSVFIQHQRADSGERPYKCSECGK 170 180 190 200 210 220 110 120 130 140 150 160 KIAA18 TFTEILSIDVKGEQPQPGEKLYKYNELEKPFNSIEPLFQYQRIHAGEASCECQEIRNSFF .:.. .. .. .. . . .. .: : :. : :.::.:.:: .:.: .:: KIAA15 SFSQSSGF-LRHRKAHGRTRTHECSECGKSFSRKTHLTQHQRVHTGERPYDCSECGKSFR 230 240 250 260 270 170 180 190 200 210 220 KIAA18 QSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEKTHTAEKCFDCQECGQAFKYSSN : . :: .....:.. : :..: ::: .:..: ::...::. . ..:.:::..:..:.: KIAA15 QVSVLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSHSTNLYRHRSAHTSTRPYECSECGKSFSHSTN 280 290 300 310 320 330 230 240 250 260 270 280 KIAA18 LRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEKPYECKDCGKAFNQPSSLRSH : :: :.::: .:.:::.:::.:. :. :: ::: ::::.:: :..:::.:.: : : .: KIAA15 LFRHWRVHTGVRPYECSECGKAFSCNIYLIHHQRFHTGERPYVCSECGKSFGQKSVLIQH 340 350 360 370 380 390 290 300 310 320 330 340 KIAA18 VRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHLRTHTREKPYECNQCGKPFRTSTHLNVHKRIH :.::::.:.:::.:::.: . :.: : :.::. :::::..: : : .: : :. .: KIAA15 QRVHTGERPYECSECGKVFSQSSGLFRHRRAHTKTKPYECSECEKSFSCKTDLIRHQTVH 400 410 420 430 440 450 350 360 370 380 390 400 KIAA18 TGEKLYECATCGQVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYVCQECGRAFSEPSSLRKHARTHSGKK :::. :::..::. . : . : :. .::.:.:: :.:::...:. :.: .: :.:.:.. KIAA15 TGERPYECSVCGKSFIRKTHLIRHQTVHTNERPYECDECGKSYSQSSALLQHRRVHTGER 460 470 480 490 500 510 410 420 430 440 450 460 KIAA18 PYACQECGRAFGQSSHLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAFRHSSSLTVHKRTHVGRETIRN :: :.:::..: ...::: : .:.. :::.:..: :.: .::.: :.:.:: KIAA15 PYECRECGKSFTRKNHLIQHKTVHTGERPYECSECGKSFSQSSGLLRHRRVHVQ 520 530 540 550 560 570 470 480 KIAA18 GSLPLSMSHPYCGPLAN >>KIAA0065 ( 848 res) ha00946 (848 aa) initn: 6929 init1: 1232 opt: 1238 Z-score: 1018.1 bits: 198.6 E(): 1.4e-51 Smith-Waterman score: 1248; 44.612% identity (70.426% similar) in 399 aa overlap (73-463:277-675) 50 60 70 80 90 100 KIAA18 LYRDVMLENYRNLASVADQLCKPNALSYLEERGEQWTTDRGVLSDT-CAEPQCQPQEAIP : .:. . : . .. : : . .. : KIAA00 EKIQTLEHNFEYSICQETLLEKAVFNTQKRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQISP 250 260 270 280 290 300 110 120 130 140 150 KIAA18 SQDTFTEILSID----VKGEQPQP-GEKLYKYN--ELEKPFNSIEPLFQYQRIHAGEASC :.:. :. . . ::. .: : .. .:. : . : : . :. :: KIAA00 SRDNHYEFSDCEKFLCVKSTLSKPHGVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHF 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 KIAA18 ECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEKTHTAEKCFDCQE ::.: ..:....:: .....:.: . ::.:::.: .:.: .:...::.:: :.:.: KIAA00 ECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEKPFECNE 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 KIAA18 CGQAFKYSSNLRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEKPYECKDCGKA ::.::...: : :.::::::::..:. ::::: .. .: :::.::: ::::: .:::. 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KIAA00 IHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFHERKHTG 670 680 690 700 710 720 >>KIAA0326 ( 927 res) hg00579 (927 aa) initn: 6450 init1: 1228 opt: 1230 Z-score: 1011.2 bits: 197.5 E(): 3.3e-51 Smith-Waterman score: 1232; 43.860% identity (69.173% similar) in 399 aa overlap (65-463:161-545) 40 50 60 70 80 90 KIAA18 FLDSTQRSLYRDVMLENYRNLASVADQLCKPNALSYLEERGEQWTTDRGVLSDTCAEPQC :. . : . :: :.:. . : KIAA03 PQNPPTPLGHSNPLDHQIPLDPPAPEVVPTPSDWTKACEASWQW----GALTTWNSPP-- 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 150 KIAA18 QPQEAIPSQDTFTEILSIDVKGEQPQPGEKLYKYNELEKPFNSIEPLFQYQRIHAGEASC ..:... . : :.: .: .:: : :: : :.. :...::::.:: KIAA03 ----VVPANEPSLREL---VQG-RPAGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHTGERPN 190 200 210 220 230 160 170 180 190 200 210 KIAA18 ECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEKTHTAEKCFDCQE :.: .:: ::.::. .. ..:.: : : : : : .::.:..:..:::.:: . : : KIAA03 TCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCTE 240 250 260 270 280 290 220 230 240 250 260 270 KIAA18 CGQAFKYSSNLRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEKPYECKDCGKA : .:: :.:: .:.:.::::::..:..: ..: :. .:: :: .:::::::.: .::: KIAA03 CEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGKR 300 310 320 330 340 350 280 290 300 310 320 330 KIAA18 FNQPSSLRSHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHLRTHTREKPYECNQCGKPFRTS :.: .: .: . :.::::..:..:::.: . : : : :::: :::::: .::: : : KIAA03 FGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGKSFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLECGKSFGHS 360 370 380 390 400 410 340 350 360 370 380 390 KIAA18 THLNVHKRIHTGEKLYECATCGQVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYVCQECGRAFSEPSSLR . : :.: : : ..: .::.... .:: :.::::::.:: : :::..:: :.: KIAA03 STLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFSVSSNLI 420 430 440 450 460 470 400 410 420 430 440 450 KIAA18 KHARTHSGKKPYACQECGRAFGQSSHLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAFRHSSSLTVHKR .: : : :..:: : .::..: .:: :: : : :.. .::.:..: :.: .:: : :.: KIAA03 NHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSFIRSSHLIQHRR 480 490 500 510 520 530 460 470 480 KIAA18 THVGRETIRNGSLPLSMSHPYCGPLAN ::.:.. . KIAA03 THTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAHELEQHRVIHER 540 550 560 570 580 590 >>KIAA1829 ( 557 res) hj00069 (557 aa) initn: 4741 init1: 1221 opt: 1226 Z-score: 1010.2 bits: 196.5 E(): 3.7e-51 Smith-Waterman score: 1226; 48.256% identity (73.837% similar) in 344 aa overlap (121-463:189-531) 100 110 120 130 140 KIAA18 EPQCQPQEAIPSQDTFTEILSIDVKGEQPQPGEKLYKYNELEKPFNSIEPLF-QYQRIHA :::: :. ... : . :.. :: :.: : KIAA18 RLHAEKESLIGNECEEFNQSTYLSKDIGIPPGEKPYESHDFSKLL-SFHSLFTQHQTTHF 160 170 180 190 200 210 150 160 170 180 190 200 KIAA18 GEASCECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEKTHTAEKC :. .: ..: . . :..:.::.: :::: : :.: .. : .:..:: .:: KIAA18 GKLPHGYDECGDAFSCYSFFTQPQRIHSGEKPYACNDCGKAFSHDFFLSEHQRTHIGEKP 220 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 KIAA18 FDCQECGQAFKYSSNLRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEKPYECK ..:.::..::. :..: .:.: ::::::: :..:::.:.: :. ::: :::::::::: KIAA18 YECKECNKAFRQSAHLAQHQRIHTGEKPFACNECGKAFSRYAFLVEHQRIHTGEKPYECK 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 KIAA18 DCGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHLRTHTREKPYECNQCGK .:.::: : . : .: : ::::::.::.:::::: .. .: : : :: :::..:..::: KIAA18 ECNKAFRQSAHLNQHQRIHTGEKPYECNQCGKAFSRRIALTLHQRIHTGEKPFKCSECGK 340 350 360 370 380 390 330 340 350 360 370 380 KIAA18 PFRTSTHLNVHKRIHTGEKLYECATCGQVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYVCQECGRAFSE : .::: :.::::::: ::: ::. . : :. : : ::::.:. :..::.:::. KIAA18 TFGYRSHLNQHQRIHTGEKPYECIKCGKFFRTDSQLNRHHRIHTGERPFECSKCGKAFSD 400 410 420 430 440 450 390 400 410 420 430 440 KIAA18 PSSLRKHARTHSGKKPYACQECGRAFGQSSHLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAFRHSSSL : .: :.:.:.::: :..::.::. .:.: : : :.. .::.:..: :::.. :: KIAA18 ALVLIHHKRSHAGEKPYECNKCGKAFSCGSYLNQHQRIHTGEKPYECSECGKAFHQILSL 460 470 480 490 500 510 450 460 470 480 KIAA18 TVHKRTHVGRETIRNGSLPLSMSHPYCGPLAN .:.: :.:.. . KIAA18 RLHQRIHAGEKPYKCNECGNNFSCVSALRRHQRIHNRETL 520 530 540 550 >>KIAA1947 ( 608 res) fh23660 (608 aa) initn: 7849 init1: 1224 opt: 1226 Z-score: 1009.8 bits: 196.6 E(): 3.9e-51 Smith-Waterman score: 1226; 48.246% identity (73.977% similar) in 342 aa overlap (116-456:265-606) 90 100 110 120 130 140 KIAA18 SDTCAEPQCQPQEAIPSQDTFTEILSIDVKGEQP-QPGEKLYKYNELEKPFNSIEPLFQY :.: . ::. : :: : : :... KIAA19 LLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRH 240 250 260 270 280 290 150 160 170 180 190 200 KIAA18 QRIHAGEASCECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEKTH :..:.:: : : . :..: ::. .....:.: : ::.: : ::: : ::::.:.: KIAA19 QKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVH 300 310 320 330 340 350 210 220 230 240 250 260 KIAA18 TAEKCFDCQECGQAFKYSSNLRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEK :.:: ..:.:::. : .:.: :.:.::::::.::..::: : :.: ::: :.::. KIAA19 TGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGER 360 370 380 390 400 410 270 280 290 300 310 320 KIAA18 PYECKDCGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHLRTHTREKPYEC ::::..::: : . .:.:: :.::::.::::: :::.:: .:.: :: : :: :.:::: KIAA19 PYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYEC 420 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 380 KIAA18 NQCGKPFRTSTHLNVHKRIHTGEKLYECATCGQVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYVCQECG ..::: :: ... :.: : ::. .::. ::.:.:. : : :...:: :. : :..:: KIAA19 SECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCG 480 490 500 510 520 530 390 400 410 420 430 440 KIAA18 RAFSEPSSLRKHARTHSGKKPYACQECGRAFGQSSHLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAFR . : . :.: .: :.:.:.::: :.:::..: .: :: : : :.. :::::..: ..: KIAA19 KFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFN 540 550 560 570 580 590 450 460 470 480 KIAA18 HSSSLTVHKRTHVGRETIRNGSLPLSMSHPYCGPLAN ..: : :...: KIAA19 QNSHLIQHQKVHTR 600 481 residues in 1 query sequences 1987024 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:17:45 2008 done: Thu Dec 18 15:17:45 2008 Total Scan time: 0.430 Total Display time: 0.130 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]