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FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1793, 1270 aa
 vs ./tmplib.25089 library

1986235 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.4153+/-0.0114; mu= -23.5441+/- 0.766
 mean_var=544.1604+/-134.094, 0's: 0 Z-trim: 27  B-trim: 0 in 0/40
 Lambda= 0.054981

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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>>KIAA1601  ( 690 res)   fj10228                          (690 aa)
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Smith-Waterman score: 430;  30.986% identity (63.380% similar) in 355 aa overlap (129-470:313-655)

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KIAA17 LSVNKHRGLSLTETELEELRAQVLQLVAELEETRELAGQHEDDSLELQGLLEDERLASAQ
       :  .  .:   ...:.:  . .. .:  :: :..:::   ..  .:::.:::.:: :  .
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       :.:  ::::: ::..:. :. .   :..::.::.   ..::  :. ::  :.:::   :.
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       :...:::::::.: ... :::  ..  ..:: ::.::.  .... ..   .    . . :
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KIAA17 QEELQELRERYHFLNEEYRALQESNSSLTGQLADLESERTQRATERWLQSQTLSMTSAES
       : ::..::.... :. : ..:.. :  :...:   :.:  .       :.:.: .::  :
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KIAA17 QTSEMDFLEPDPEMQLLRQQ-LRD----------AEEQMHGMKNKCQELCCELEELQHHR
          .:.  : . ..  :..: :::          ::.: . .... ..    : ::. . 
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KIAA17 QVSEEEQRRLQRELK-CAQN-EVLRFQTSHSVTQNEELKSRLCTLQKKYDTSQDEQNELL
       ...:.:.. .  ::: : .: ..::                                   
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>>KIAA1565  ( 1313 res)   bf00184                         (1313 aa)
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Smith-Waterman score: 431;  23.634% identity (55.147% similar) in 952 aa overlap (167-1069:400-1281)

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KIAA17 EEEEEEVEEEEEQVQKGGSVGSLSVNKHRGLSLTETELEELRAQVLQLVAELEETRELAG
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KIAA17 QHEDDSLELQGLLEDERLASAQQAEV--------FTKQIQQLQGELRSLREEISLLEHEK
       . :  .  . . ..:.. :  .. :         . ..:  :..:::. ::.:  :..  
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       ::    .:. ..:   .:  :.:   : :. .  :::  ::   . .::   ...   : 
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        :. .:.::  . ::  : :.   : . .. :.  : .    .::  :  ..    . ..
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KIAA17 HGMKNKCQELCCELEELQHHRQVSEEEQRRLQRELKCAQNEVLRFQTSHSVTQNEELKSR
       ..      ::  :  . ::::..      ::. : :  . :    .:  :  . .:    
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KIAA17 LCTLQKKYDTSQDEQNELLKMQLQLQTELRQLKVMKSTLVENQSEKELLCRLQKLHLQHQ
         .......   .: . : :.  .:..:. .:. . ..: :  ...:  :: .. . : :
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              :: :.. .:::.:.  :: ::. .: .. :::..  :        . ....  
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       ::..:..: .   : :..    ..:...::   : ::.: .  :. . ....   :.  :
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       :   . ...:.    ..::.:: . .  . :    :. ... . :..: ...   : : .
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KIAA17 ESHFQEVLENP-DDSKLAKSSKCNRNKQSKLLMEQMQALQVMYDAGQAKQEL--LQQEQG
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       .::.:.. :. .:. :....   .::. .  ..:.  .:. .. .:.    : :.:. ..
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       .  .  : :  .. .    ..:.    .. ::.. ::       : ..:    :.:.  :
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       :. ..     :. . .  ..  :.:     .:: . ..: ..: : : .... :. .:. 
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       ..:. ..   .: .:   .:::                                      
KIAA15 IHLENEGLKKKQVKL---DEQLMENSVVGSSREGCSSLPEIVCEDAAPEVHCDA      
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KIAA17 EEEEEEEEEVEEEEEQVQKGGSVGSLSVNKHRGLSLTETELEELRAQVLQLVAELEETRE
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KIAA17 QGNNQACNSTSEVKDLLEQKSKLTIEVAELQRQLQLEVKNQQNIKEERERMRANLEELRS
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         ... :..:   : : :.:     .  :.:  ...  : : :.:.:....: .. :   
KIAA17 QHNEKVEENSTLQQRLEESEGELRKNLEELFQVKMEREQHQTEIRDLQDQLSEMHDELDS
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KIAA17 -KESELKE---IEQELHLAQAEIQSL---RQAAEDSATEHESDIASLQEDLCR-MQNELE
        :.:: .:   . .::  :. ..:.:   ..  ::   ..: ....:.  : . .... .
KIAA17 AKRSEDREKGALIEELLQAKQDLQDLLIAKEEQEDLLRKRERELTALKGALKEEVSSHDQ
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       .:.... .:. :. .::  .:  ...     . :. :  ..   :.:          . :
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]