# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg01285.fasta.nr -Q ../query/KIAA1783.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1783, 1560 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7808456 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7622+/-0.000211; mu= 9.9040+/- 0.012 mean_var=160.2453+/-30.266, 0's: 44 Z-trim: 102 B-trim: 131 in 1/66 Lambda= 0.101317 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|150384690|sp|Q96JP2.2|MY15B_HUMAN RecName: Full (1530) 10472 1544.0 0 gi|119609694|gb|EAW89288.1| hCG1987119, isoform CR (1530) 10446 1540.2 0 gi|109118397|ref|XP_001095714.1| PREDICTED: simila (1550) 6874 1018.1 0 gi|123262062|emb|CAM21226.1| myosin XVB [Mus muscu (2336) 6742 999.0 0 gi|119609692|gb|EAW89286.1| hCG1987119, isoform CR ( 986) 6521 966.3 0 gi|73965027|ref|XP_540435.2| PREDICTED: similar to (2874) 5499 817.4 0 gi|149262702|ref|XP_986778.2| PREDICTED: similar t (1241) 5474 813.4 0 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