# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/aj00273.fasta.huge -Q ../query/KIAA1782.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1782, 545 aa vs ./tmplib.25089 library 1986960 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8209+/-0.00842; mu= -2.6886+/- 0.571 mean_var=299.8993+/-73.384, 0's: 0 Z-trim: 67 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.074060 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 359 52.0 2.3e-07 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 351 50.8 2.7e-07 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 355 51.5 2.9e-07 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 348 50.5 3.3e-07 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 353 51.3 3.4e-07 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 350 50.8 3.4e-07 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 342 49.9 5.8e-07 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 344 50.2 5.8e-07 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 345 50.4 6e-07 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 344 50.3 6.1e-07 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 336 49.2 8.1e-07 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 336 49.2 8.6e-07 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 337 49.4 8.7e-07 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 334 49.2 1.3e-06 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 334 49.3 1.4e-06 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 331 48.9 1.6e-06 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 329 48.6 1.7e-06 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 325 48.0 1.8e-06 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 330 48.9 1.9e-06 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 319 47.2 2.2e-06 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 323 47.9 2.4e-06 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 327 48.6 2.5e-06 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 321 47.6 2.5e-06 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 325 48.3 2.8e-06 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 321 47.7 2.9e-06 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 322 47.9 3.1e-06 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 319 47.5 3.5e-06 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 317 47.2 3.7e-06 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 312 46.7 5.3e-06 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 312 46.7 5.3e-06 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 312 46.7 5.5e-06 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 308 46.3 7.5e-06 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 300 45.4 1.3e-05 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 296 45.1 2e-05 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 290 44.4 2.9e-05 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 285 44.2 6.7e-05 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 274 42.7 9.4e-05 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 277 43.3 0.00012 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 266 41.7 0.00015 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 262 41.2 0.00018 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 263 41.5 0.00021 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 258 40.9 0.00027 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 258 41.0 0.00033 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 257 40.9 0.00034 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 263 42.0 0.00042 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 248 39.8 0.0006 KIAA0760 ( 1224 res) hk04642s1 (1224) 253 40.8 0.00071 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 251 40.6 0.00085 KIAA0198 ( 562 res) ha02521 ( 562) 239 38.9 0.0012 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 240 39.2 0.0014 >>KIAA1852 ( 948 res) fj01514 (948 aa) initn: 285 init1: 285 opt: 359 Z-score: 223.9 bits: 52.0 E(): 2.3e-07 Smith-Waterman score: 381; 30.952% identity (60.000% similar) in 210 aa overlap (121-328:642-832) 100 110 120 130 140 150 KIAA17 SLSEPLGYCDGSGPEPHSPGGIRLPNGKLKCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCN :. :: . :. :.:.::::.::.:. KIAA18 YECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECT 620 630 640 650 660 670 160 170 180 190 200 210 KIAA17 QCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCNYACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYKC .:: ::. ...:. :...:.::::::: :. : : .::. : :::: . ::::: KIAA18 ECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGA-----KPYKC 680 690 700 710 720 220 230 240 250 260 270 KIAA17 NYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLSTEAQALAGQPGDEIRDLEMVPDSMLHSSSERP . ::.:.. .: : :. : :. . . . . : .:. . . :. .: KIAA18 TECGKSFSWSSHLIAHQ-RTHTGEKPYNCQ------ECGKAFRERSALTKHEIIHSGIKP 730 740 750 760 770 280 290 300 310 320 KIAA17 TFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRFSLSDLPYDVNSGG--YEKDVELVAHHSLEPG .. ..: .. . . ...: .. ::. :. : . .. .::::. .. : KIAA18 YECNKCGKSCSQMAHLV-------RHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTG 780 790 800 810 820 830 330 340 350 360 370 380 KIAA17 FGSSLAFVGAEHLRPLRLPPTNCISELTPVISSVYTQMQPLPGRLELPGSREAGEGPEDL KIAA18 EKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHLRNHTGEKPY 840 850 860 870 880 890 >>KIAA1806 ( 481 res) fk00438 (481 aa) initn: 710 init1: 272 opt: 351 Z-score: 222.8 bits: 50.8 E(): 2.7e-07 Smith-Waterman score: 353; 30.233% identity (58.605% similar) in 215 aa overlap (112-322:229-424) 90 100 110 120 130 KIAA17 KDDSVIVEDSLSEPLGYCDGSGPEPHSPGGIRLPNGK--LKCDVCGMVCIGPNVLMVHKR .: .:. ..:. :: . :..:.: KIAA18 RHEKTHTAEKCFDCQECGQAFKYSSNLRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTFTRNFNLILHQR 200 210 220 230 240 250 140 150 160 170 180 190 KIAA17 SHTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCNYACRRRDALTGHLRTHSV .::::.:..:..:: .:.: ..: :.. :.:::::.: :. : :....: ::::: KIAA18 NHTGEKPYECKDCGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHLRTH-- 260 270 280 290 300 310 200 210 220 230 240 250 KIAA17 SSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLSTEAQALAGQPGDEIRDLEMVP : :::.:: ::. .. .. :. :: : : . : . :. . : . KIAA18 ---TREKPYECNQCGKPFRTSTHLNVHK-RIH------TGEKLYECATCGQVLSRLSTLK 320 330 340 350 360 260 270 280 290 300 310 KIAA17 DSMLHSSSERPTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRFSLSDLPYDVNSGG--YEKDV . : ..:.: .. . : : :... .:. : . :: . : . .. KIAA18 SHMRTHTGEKPYVCQECG-----RAFSEPSSL--RKHARTHSGKKPYACQECGRAFGQSS 370 380 390 400 410 320 330 340 350 360 370 KIAA17 ELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHLRPLRLPPTNCISELTPVISSVYTQMQPLPGRLELPG .:..: KIAA18 HLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAFRHSSSLTVHKRTHVGRETIRNGSLPLSMSHPYCGPL 420 430 440 450 460 470 >>KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) (841 aa) initn: 447 init1: 288 opt: 355 Z-score: 222.2 bits: 51.5 E(): 2.9e-07 Smith-Waterman score: 355; 32.353% identity (61.275% similar) in 204 aa overlap (39-236:473-662) 10 20 30 40 50 60 KIAA17 LQLYLPSCSLLQGSGDSSLEKEFLGAPVGPSVSTPNSQHSSPSRSLSANSIK-VEMYSDE ::. :..: . ::... . : . .: KIAA10 RHSHLIEHLKRHFREKSQRCSDKRSKNTKLSVKKKISEYSEADMELSGKTQRNVSQVQDF 450 460 470 480 490 500 70 80 90 100 110 120 KIAA17 -ESSRLLGPDERLLEKDDSVIVEDSLSEP----LGYCDGSGPEPHSPGGIRLPNGKLKCD :. .. : :.. ... ... :..: ..: . . .: : : :. ::. KIAA10 GEGCEFQGK----LDRKQGIPMKEILGQPSSKRMNYSEVPYVHKKSSTGER-PH---KCN 510 520 530 540 550 130 140 150 160 170 180 KIAA17 VCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCNY :: : :. :.: ::::.::.:..:: :..:. .: .: ..:.::::. ::.:. KIAA10 ECGKSFIQSAHLIQHQRIHTGEKPFRCEECGKSYNQRVHLTQHQRVHTGEKPYTCPLCGK 560 570 580 590 600 610 190 200 210 220 230 240 KIAA17 ACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLSTEAQ : : :. :. : .:: .:.::: ::... ..: : : : :. .: KIAA10 AFRVRSHLVQHQSVHSGE-----RPFKCNECGKGFGRRSHLAGHL-RLHSREKSHQCREC 620 630 640 650 660 250 260 270 280 290 300 KIAA17 ALAGQPGDEIRDLEMVPDSMLHSSSERPTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRFSLS KIAA10 GEIFFQYVSLIEHQVLHMGQKNEKNGICEEAYSWNLTVIEDKKIELQEQPYQCDICGKAF 670 680 690 700 710 720 >>KIAA2003 ( 460 res) ah02593 (460 aa) initn: 653 init1: 275 opt: 348 Z-score: 221.3 bits: 50.5 E(): 3.3e-07 Smith-Waterman score: 348; 41.071% identity (71.429% similar) in 112 aa overlap (120-231:241-346) 90 100 110 120 130 140 KIAA17 DSLSEPLGYCDGSGPEPHSPGGIRLPNGKLKCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHC .:: :: . . . :. :.: ::::::..: KIAA20 PYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYEC 220 230 240 250 260 270 150 160 170 180 190 200 KIAA17 NQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCNYACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYK ..:: ::.:.. ::.: .:.::.:..: :. ...: : ..:: : .::. KIAA20 SECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGS-----RPYE 280 290 300 310 320 210 220 230 240 250 260 KIAA17 CNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLSTEAQALAGQPGDEIRDLEMVPDSMLHSSSER :. ::.:..:.:.: ::. : : KIAA20 CSECGKSFSQNSSLIEHH-RVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSE 330 340 350 360 370 380 >>KIAA0065 ( 848 res) ha00946 (848 aa) initn: 279 init1: 279 opt: 353 Z-score: 221.0 bits: 51.3 E(): 3.4e-07 Smith-Waterman score: 400; 24.131% identity (50.307% similar) in 489 aa overlap (88-536:323-776) 60 70 80 90 100 KIAA17 SIKVEMYSDEESSRLLGPDERLLEKDDSVIVEDSLSEPLGY------CDGSGPE------ :...::.: : : :: . KIAA00 LCDSSSLLFHQISPSRDNHYEFSDCEKFLCVKSTLSKPHGVSMKHYDCGESGNNFRRKLC 300 310 320 330 340 350 110 120 130 140 150 160 KIAA17 -PHSPGGIRLPNGKLKCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLR : : . . ...:. :: . . : :.: :::..::.::.: .: .:.:: . KIAA00 LSHLQKGDK-GEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTK 360 370 380 390 400 410 170 180 190 200 210 220 KIAA17 HIKLHSGEKPFKCPFCNYACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLE : . :.:::::.: :. : ...::: : ::: : :::.:: ::... :.: : KIAA00 HQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTH-----TGEKPYQCNACGKTFCQKSDLT 420 430 440 450 460 230 240 250 260 270 280 KIAA17 EHKERCHNYLQSLSTEAQALAGQPGDEIRDLEMVPDSMLHSSSERPTFIDRLANSLTKRK .:. : :. :. . : .: . . ..:.: . ..:..... KIAA00 KHQ-RTHTGLKPYECY------ECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKS 470 480 490 500 510 290 300 310 320 330 340 KIAA17 RSTPQKFVGEKQMRFSLSDLPYDVNSGG---YEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHL : ...:. ..: :. :. : :.:.. :. :. .. :. . .. KIAA00 NLT-------QHQRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSL-LTRHQIIHTGWKPYECYECGK-- 520 530 540 550 560 350 360 370 380 390 KIAA17 RPLRLPPTNCISELTPVISSVYTQMQPL--P--GRLELPGSR-------EAGEGPEDLAD : :.. : . ..: ..:. : :.. : ..:: : . . KIAA00 -------TFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHE 570 580 590 600 610 620 400 410 420 430 KIAA17 GGPLLYRP----RGPLTDPGASP--SNGCQDSTDTESN--HEDRVAGVVSLPQ-----GP : ..: . : : .: : : . .:. ...:. . : : KIAA00 CGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIH-IGEKPYKCNECGK 630 640 650 660 670 680 440 450 460 470 480 490 KIAA17 PPQPPPTIVVGRHSPAYAKEDPKPQEGLLRGTPGPSKEVLRVVGESGEPVKAFKCEHCRI ...: :. ....: : . .. : ... ..:: : ..:..: KIAA00 AFCHKSALIV--HQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFHERKHTGE--KPYECNECGK 690 700 710 720 730 500 510 520 530 540 KIAA17 LFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHSQDRYEFSSHIVRGEHKVG .: . .:.: : . .:: :: . :...: KIAA00 FFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQ 740 750 760 770 780 790 KIAA00 KSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYSHCGESPDDILNVQ 800 810 820 830 840 >>KIAA0426 ( 613 res) hh01274 (613 aa) initn: 366 init1: 280 opt: 350 Z-score: 221.0 bits: 50.8 E(): 3.4e-07 Smith-Waterman score: 363; 30.303% identity (58.874% similar) in 231 aa overlap (120-328:340-558) 90 100 110 120 130 140 KIAA17 DSLSEPLGYCDGSGPEPHSPGGIRLPNGKLKCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHC ::. :: . ..: :.: ::::. .:: KIAA04 PYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHC 310 320 330 340 350 360 150 160 170 180 190 200 KIAA17 NQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCNYACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYK :.:: .:.::..:..:::.:. .::..: :: . ::. :: : .: : .:::. KIAA04 NDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVH-----TGAKPYE 370 380 390 400 410 420 210 220 230 240 250 KIAA17 CNYCGRSYKQQSTL---EE--HKERCHNYLQSLSTEAQALAGQ-----PGDEIRDLEMVP :: ::... .:.: .: :::.:.. . .. .:. : :.. .. KIAA04 CNECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQSGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCE 430 440 450 460 470 480 260 270 280 290 300 KIAA17 DSMLHSSS----------ERPTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRFSLSDLPYDVN .... .: ::: :. ....:.:. : :.: :. .. :: . KIAA04 KAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLT------EHQ-RIHTGERPYKCD 490 500 510 520 530 310 320 330 340 350 360 KIAA17 SGG--YEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHLRPLRLPPTNCISELTPVISSVYTQMQ : .. . :. :. .. : KIAA04 ECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQAGVNLL 540 550 560 570 580 590 >>KIAA1396 ( 551 res) hj08221 (551 aa) initn: 1097 init1: 278 opt: 342 Z-score: 216.9 bits: 49.9 E(): 5.8e-07 Smith-Waterman score: 342; 40.496% identity (68.595% similar) in 121 aa overlap (113-231:320-434) 90 100 110 120 130 140 KIAA17 DDSVIVEDSLSEPLGYCDGSGPEPHSPGGIRLPNGK--LKCDVCGMVCIGPNVLMVHKRS :. .:. :::::: . . . ::.: KIAA13 WRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVHIGLILHRRIHTGEKPYKCDVCGKTFSSGSSRTVHQRI 290 300 310 320 330 340 150 160 170 180 190 200 KIAA17 HTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCNYACRRRDALTGHLRTHSVS ::::.:..:. :: .:.....: .: ..::::::..: :. : :. :..::: : KIAA13 HTGEKPYECDICGKDFSHHASLTQHQRVHSGEKPYECKECGKAFRQNVHLVSHLRIH--- 350 360 370 380 390 400 210 220 230 240 250 260 KIAA17 SPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLSTEAQALAGQPGDEIRDLEMVPD : :::.:. ::.... .: : :. : : KIAA13 --TGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQ-RIHTGEKPYECIECGNAFKQRSHLAQHQKTHT 410 420 430 440 450 460 270 280 290 300 310 320 KIAA17 SMLHSSSERPTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRFSLSDLPYDVNSGGYEKDVELV KIAA13 GEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSDSSSCAQHQRLHTGQRP 470 480 490 500 510 520 >>KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 (702 aa) initn: 424 init1: 273 opt: 344 Z-score: 216.8 bits: 50.2 E(): 5.8e-07 Smith-Waterman score: 344; 28.571% identity (51.737% similar) in 259 aa overlap (23-267:207-453) 10 20 30 40 50 KIAA17 AMDSRYLQLQLYLPSCSLLQGSGDSSLEKEFLGAPVGPSVSTPNSQHSSPSR :::.. .: ..: : :. . ::: KIAA04 QEEKSELAAEEEIQLRVNNSVQNRQNFVVKGDSGVLNEQIAAKEKEE-SEPTCE---PSR 180 190 200 210 220 230 60 70 80 90 100 110 KIAA17 SLSANSIKVEMYSDEESSRLLGPDERLLEKD--DSVIVEDSLSEPLGYCDGSGPEPHSPG : : : : .. . . : .. :: ..: . .: . : . : KIAA04 EEEMPVEKDENY-DPKTEDGQASQSRYSKRRIWRSVKLKD--YKLVGDQEDHGSAKRICG 240 250 260 270 280 120 130 140 150 160 KIAA17 GIRLPNG-KLKCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCNQCGASFTQKGNLLRHIKLH . :.: . .: :: : . : .:.:::::::::.::.:: .:.:: .: : ..: KIAA04 RRKRPGGPEARCKDCGKVFKYNHFLAIHQRSHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMH 290 300 310 320 330 340 170 180 190 200 210 220 KIAA17 SGEKPFKCPFCNYACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHK-- .::.:. : :. : . .: :. :: . : . :. ::. ..:. :. : KIAA04 TGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLHSGQ-----KSFTCDQCGKYFSQNRQLKSHYRV 350 360 370 380 390 400 230 240 250 260 270 KIAA17 ---------ERCHNYLQSLSTEAQALAGQPGDEIRDLEMVPDSMLHSSSERPTFIDRLAN . :: ....: . : . :.. :. :. .:: KIAA04 HTGHSLPECKDCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGE 410 420 430 440 450 460 280 290 300 310 320 330 KIAA17 SLTKRKRSTPQKFVGEKQMRFSLSDLPYDVNSGGYEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGA KIAA04 KPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQFARLDNLKAHLKIHSKEKHAS 470 480 490 500 510 520 >>KIAA1611 ( 813 res) fj12627 (813 aa) initn: 275 init1: 275 opt: 345 Z-score: 216.6 bits: 50.4 E(): 6e-07 Smith-Waterman score: 393; 26.164% identity (50.554% similar) in 451 aa overlap (117-544:249-664) 90 100 110 120 130 140 KIAA17 IVEDSLSEPLGYCDGSGPEPHSPGGIRLPNGK-LKCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGER :: ::. :: . . : :.: :.::. KIAA16 PSSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEK 220 230 240 250 260 270 150 160 170 180 190 200 KIAA17 PFHCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCNYACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVG :..:..:: .:: ..:: : .:.::::.:: :. . :. . :. : : : : KIAA16 PYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIH-----TGE 280 290 300 310 320 330 210 220 230 240 250 260 KIAA17 KPYKCNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLS-TEAQALAGQPGDEIRDLEMVPDSMLH :::::: ::.... .:.: :. :. . .. .: : : . ... .: KIAA16 KPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQL-IHTGEKPFKCNECGKLFTQ------NSHLISHWRIH 340 350 360 370 380 270 280 290 300 310 KIAA17 SSSERPTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFV--GEKQMRFSLSDLPYDVNSG-GYEKDVEL-- .. :.: .. ..... :. . .. . ::: .. . . :: : .. :. KIAA16 TG-EKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGE 390 400 410 420 430 440 320 330 340 350 360 370 KIAA17 VAHHSLEPGFGSSLAFVGAEH-LRPLRLPPTNCISELTPVISSVYTQMQPLPGRLELPGS .. : : . :. : : . : .: .: :.:.:: . : .. .. KIAA16 KPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKC-NEC----SKVFTQNSQLANHRRI--- 450 460 470 480 490 380 390 400 410 420 430 KIAA17 REAGEGPEDLADGGPLLYRPRGPLTD-----PGASPSNG--CQDSTDTESNHEDRVAGVV ..:: : . : . :. :: : .: . : : :...: :. KIAA16 -HTGEKPYKCNECGKA-FSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSF-TQKSHLRSHRGIH 500 510 520 530 540 550 440 450 460 470 480 KIAA17 SLPQGPPPQP--------PPTIVVGRHSPAYAKEDPKPQEGLLRGTPGPSKEVLRVVGES : : : : ..:: ... : : . :. :. ... . .. KIAA16 S---GEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHT 560 570 580 590 600 610 490 500 510 520 530 540 KIAA17 GEPVKAFKCEHCRILFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHSQDRYEFSSHIVRGEHK :: : .::..: .: . ... : : . :..:: :: :: : :: KIAA16 GE--KPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECG------KAFSMHSNLTTHK 620 630 640 650 660 KIAA17 VG : KIAA16 VIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHT 670 680 690 700 710 720 >>KIAA1349 ( 752 res) fj00940 (752 aa) initn: 305 init1: 305 opt: 344 Z-score: 216.5 bits: 50.3 E(): 6.1e-07 Smith-Waterman score: 413; 23.963% identity (50.461% similar) in 434 aa overlap (120-536:332-741) 90 100 110 120 130 140 KIAA17 DSLSEPLGYCDGSGPEPHSPGGIRLPNGKLKCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHC .:. :: . ... ::.: ::::.::.: KIAA13 PYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEKPYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFRC 310 320 330 340 350 360 150 160 170 180 190 200 KIAA17 NQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCNYACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYK :.:: .. ....:. ::. :.::::..: :. : : .: : : : : :::: KIAA13 NECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYECNECGKAFNRIANFTEHQRIH-----TGEKPYK 370 380 390 400 410 210 220 230 240 250 260 KIAA17 CNYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLSTEAQALAGQPGDEIRDLEMVPDSMLHSSSER :: ::... . : : :. : :. . . . : .:. .. . .:. :. KIAA13 CNECGKAFINYSCLTVHH-RMHTGEKPYKCTECGKA-----FMRSSSLIIHQRIHTE-EK 420 430 440 450 460 270 280 290 300 310 320 KIAA17 PTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRFSLSDLPYDVNSGGYEKDVELVAHHSLEPGF : . .. ..:. ... : .. . . .. .: .. : :.: :.... : KIAA13 PYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCER-----AFTKMVNLKEHQKIHTGV 470 480 490 500 510 520 330 340 350 360 370 380 KIAA17 GSSLAFVGAEHLRP---LRLPPTNCISELTPVISSVYTQMQPLPGRLELPGSREAGEGPE . .. .: : . . .: : . . ..: . :..:: : KIAA13 KPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGE-KPYKCNECEKAFTNTSQLTVHQRRHTGEKPY 530 540 550 560 570 580 390 400 410 420 430 440 KIAA17 DLADGGPLLYRPRG----PLTDPGASPSNGCQDSTDTESNHEDRVAGVVSLPQGPPPQPP . : .. : : : .: . :.: . :. .:. .. .: .: KIAA13 KCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFK-CNDCGKAFSQMV-HVTEHQKIHSGE--KPY 590 600 610 620 630 450 460 470 480 490 KIAA17 PTIVVGR----------HSPAYAKEDPKPQEGLLRGTPGPSKEVLRVVGESGEPVKAFKC : :. : ... : : . .: :. .:. ..:: . .:: KIAA13 KCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIHTGE--RPYKC 640 650 660 670 680 690 500 510 520 530 540 KIAA17 EHCRILFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHSQDRYEFSSHIVRGEHKVG :.: : . ::.:. : . :..:: :: .. .. : KIAA13 EECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRETQLI 700 710 720 730 740 750 545 residues in 1 query sequences 1986960 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:16:50 2008 done: Thu Dec 18 15:16:51 2008 Total Scan time: 0.470 Total Display time: 0.110 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]