# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh19201x1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1777.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1777, 954 aa
 vs /cdna2/lib/nr/nr library

2693465022 residues in 7827732 sequences
 statistics sampled from 60000 to 7821122 sequences
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 Lambda= 0.151257

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
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gi|81230838|gb|ABB59710.1| Unc5C [Danio rerio]     ( 948) 2891 640.8 8.9e-181
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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Smith-Waterman score: 6322;  99.782% identity (99.891% similar) in 919 aa overlap (36-954:35-953)

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KIAA17 WMILVLVKALSDVCAGTSGFLLDFSSQTSPGTDNGEALPESIPSAPGTLPHFIEEPDDAY
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KIAA17 IIKSNPIALRCKARPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEETLDESSGLKVREVFINVTRQQVE
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KIAA17 GVPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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KIAA17 PLHEIKPQSIENASDIALYSGLGAAVVAVAVLVIGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSALTGGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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KIAA17 TGVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIPEENSWEIYMSINQGEPSLQSDGSEVLLSPEVT
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KIAA17 SDERHQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSLQISVLDIPPFLWRIKPFTACQEVPFSRVWCSNRQ
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KIAA17 PLHCAFSLERYTPTTTQLSCKICIRQLKGHEQILQVQTSILESERETITFFAQEDSTFPA
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       ::::::::     .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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>>gi|119918194|ref|XP_598235.3| PREDICTED: similar to ne  (975 aa)
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>>gi|54036591|sp|Q8K1S2.1|UNC5D_MOUSE RecName: Full=Netr  (956 aa)
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
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       :::::::::::::::::::::::::::: :::::::..:::.::::: ::::::::::::
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KIAA17 TELRTTGVFGHLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIPEENSWEIYMSINQGEPSLQSDGSEVLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
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        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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KIAA17 STFPAQTGPKAFKIPYSIRQRICATFDTPNAKGKDWQMLAQKNSINRNLSYFATQSSPSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::.: :.:.:::::::::::
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       :.:::::::: ... .:.:::::::::::: .::::::.::::.:.:::::::: .::::
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KIAA17 VYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTSLCPVD
       :.:::::: :::::.:.: :::: :::::::::::::::::::::::::::.:...::::
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KIAA17 GSWEVWSEWSVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDKKPLHE
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KIAA17 IKPQSIENASDIALYSGLGAAVVAVAVLVIGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSALTGGFQTFN
       .::::.::. :.::::::.:.:.::.::....::::.:::.:::::::::::.::::.::
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KIAA17 FKTVRQGNSLLLNSAMQPDLTVSRTYSGPICLQDPLDKELMTESSLFNPLSDIKVKVQSS
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       : . .. : :.:: :::.::.:.:::.::..:...::::.:::.:::::::::.:  .::
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       .:::. : :::.:::::: :.:.:..:::: :  .::::.:::.:::.:: ::: ::. :
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       :::::.:.. .:.:::::: .::.::::::::: ::. :.:.::. :: : : :  .:::
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KIAA17 PKAFKIPYSIRQRICATFDTPNAKGKDWQMLAQKNSINRNLSYFATQSSPSAVILNLWEA
        :::::: :::::::.:::: ::::::::.::::  :.::::::. :.:::::::.::::
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KIAA17 RHQHDGDLDSLACALEEIGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNGL
       ::: .::::::: ::::::. : :    : .. .:.::..      
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KIAA17 LVKALSDVCAGTSGFLLDFSSQTSPGTDNGEALPESIPSAPGTLPHFIEEPDDAYIIKSN
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KIAA17 PIALRCKARPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEETLDESSGLKVREVFINVTRQQVEDFHGP
       :: :::.: ::.::::::::::::::.: :.: .:...:.:.::: ::::::::::::::
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KIAA17 EDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGMIVLHCRPPEGVPAA
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KIAA17 EVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSLSATVVV
       .:::::::: ... .:.:::::::::::: .::::::.::::.:.:::::::: .:::::
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KIAA17 YVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTSLCPVDG
       .:::::: :::::.:.: :::: :::::::::::::::::::::::::::.:...:::::
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       ::::.::. :.::::::.:.:.::.::....::::.:::.:::::::::::.::::.:::
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KIAA17 MVSLGVSERAEYHGKNHSRTFPHGNNHSFSTMHPRNKMPYIQNLSSLPTRTELRTTGVFG
       ::::::..::::: : : .:.: . . ..: .. ..   .  :    : . .:.:..:::
gi|126 MVSLGVADRAEYHVKAHPQTLPANLHPNYSMVEGKKTATMAPNGLHTPGKIQLKTSAVFG
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KIAA17 HLGGRLVMPNTGVSLLIPHGAIPEENSWEIYMSINQGEPSLQSDGS-EVLLSPEVTCGPP
       :::::::.::.:::::.::::: ...:::.:: ::::: : ::.   :.::.::.: :::
gi|126 HLGGRLVIPNAGVSLLVPHGAIADDTSWEMYMLINQGETSAQSEERCEILLGPEITYGPP
           510       520       530       540       550       560   

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KIAA17 DMIVTTPFALTIPHCADVSSEHWNIHLKKRTQQGKWEEVMSVEDESTSCYCLLDPFACHV
        . .. : :.:: :::.::.:.:::.::..:...::::.:::.:::::::::.:  .::.
gi|126 GLSLSCPVAMTIAHCAEVSAENWNIKLKRQTKDNKWEEIMSVDDESTSCYCLMDSHSCHL
           570       580       590       600       610       620   

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KIAA17 LLDSFGTYALTGEPITDCAVKQLKVAVFGCMSCNSLDYNLRVYCVDNTPCAFQEVVSDER
       :::. : :::.:::::: :.:.:..:::: :  .::::.:::.:::.:: ::: ::. : 
gi|126 LLDQPGCYALVGEPITDAAIKRLRIAVFGSMEASSLDYSLRVHCVDDTPHAFQGVVTAET
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KIAA17 HQGGQLLEEPKLLHFKGNTFSLQISVLDIPPFLWRIKPFTACQEVPFSRVWCSNRQPLHC
        .::::::::: : :::: .:::.:. ::: ::: :::::.:::  :..:: ::.::.::
gi|126 CRGGQLLEEPKTLFFKGNCLSLQVSIQDIPQFLWSIKPFTTCQEFSFTQVWYSNQQPVHC
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KIAA17 AFSLERYTPTTTQLSCKICIRQLKGHEQILQVQTSILESERETITFFAQEDSTFPAQTGP
       ::::.:.. .:.:::::: .::.::::::::: ::. :.:.::. :: : : :  .::: 
gi|126 AFSLQRHSAATNQLSCKISVRQVKGHEQILQVYTSVGENEKETVPFFMQADCTVTSQTGA
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KIAA17 KAFKIPYSIRQRICATFDTPNAKGKDWQMLAQKNSINRNLSYFATQSSPSAVILNLWEAR
       :::::: :::::::.:::: ::::::::.::::  :.::::::. :.:::::::.:::::
gi|126 KAFKIPLSIRQRICTTFDTANAKGKDWQLLAQKLHIQRNLSYFTKQKSPSAVILSLWEAR
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KIAA17 HQHDGDLDSLACALEEIGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNGL
       :: .::::::: ::::::. : :    : .. .:.::..      
gi|126 HQDSGDLDSLASALEEIGKIHCKSLPQSPDE-NETDFTF      
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>>gi|81230842|gb|ABB59712.1| Unc5Db [Danio rerio]         (894 aa)
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Smith-Waterman score: 4358;  68.147% identity (86.681% similar) in 901 aa overlap (49-948:2-894)

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KIAA17 CAGTSGFLLDFSSQTSPGTDNGEALPESIPSAPGTLPHFIEEPDDAYIIKSNPIALRCKA
                                     :. ::::::..::.::::::.::: :::.:
gi|812                              SSVGGTLPHFLQEPEDAYIIKNNPIKLRCRA
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KIAA17 RPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEETLDESSGLKVREVFINVTRQQVEDFHGPEDYWCQCV
        ::.::::::::::::::.: :.: .:...:.:.::: ::::::::::::::::::: ::
gi|812 TPALQIFFKCNGEWVHQNQHSSQEYMDQNTGVKIREVTINVTRQQVEDFHGPEDYWCLCV
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KIAA17 AWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGMIVLHCRPPEGVPAAEVEWLKNE
       :::::::::::.:.::::::::::::::::.::::.:::::::::::::: :.:::::::
gi|812 AWSHLGTSKSRRATVRIAYLRKNFEQDPQGKEVPIKGMIVLHCRPPEGVPMAKVEWLKNE
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KIAA17 EPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSLSATVVVYVNGGWSS
       : ... .:.:::::::::::: .::::::.::::.:.:::::::: .:::::.:::::: 
gi|812 ELVSALEDDNIDTRADHNLIINEARLSDSANYTCLATNIVAKRRSTTATVVVFVNGGWSL
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KIAA17 WTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTSLCPVDGSWEVWSEW
       :::::.:.: :::: :::::::::::::::::::::::::::.:...::::: :: ::::
gi|812 WTEWSSCSVNCGRGVQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKIACNAVCPVDGVWEEWSEW
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KIAA17 SVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDKKPLHEIKPQSIENA
       ..:: .::. : :::. ::::. ::.::: .: .:::: :::  . : .:..::::.::.
gi|812 TMCSAQCERQRWRECNDPPPRHRGKMCEGEGQSTENCTGGLCTQNGKLMHDVKPQSMENS
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KIAA17 SDIALYSGLGAAVVAVAVLVIGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSALTGGFQTFNFKTVRQGNS
        :.::::::.:.:.::.::....::::.:::.:::::::::::.::::.:::::.:::: 
gi|812 MDVALYSGLAAGVIAVVVLIVAITLYRKSQSEYGVDVIDSSALAGGFQSFNFKTTRQGNP
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KIAA17 LLLNSAMQPDLTVSRTYSGPICLQDPLDKELMTESSLFNPLSDIKVKVQSSFMVSLGVSE
       :::::.::::.::..:::.:::.:: .::::      :.:: : ::::::::::::::..
gi|812 LLLNSSMQPDITVGQTYSSPICFQDSIDKEL------FDPLPD-KVKVQSSFMVSLGVAD
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KIAA17 RAEYHGKNHSRTFPHGNNHSFSTMHPRNKMPYIQNLSSLPTRTELRTTGVFGHLGGRLVM
       ::::: : : .:.: . . ..: .. ..   .  :    : . .:.:..::::::::::.
gi|812 RAEYHVKAHPQTLPANLHPNYSMVEGKKTATMAPNGLHTPGKIQLKTSAVFGHLGGRLVI
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KIAA17 PNTGVSLLIPHGAIPEENSWEIYMSINQGEPSLQSDGS-EVLLSPEVTCGPPDMIVTTPF
       ::.:::::.::::: ...:::.:: ::::: : ::.   :.::.::.: ::: . .. : 
gi|812 PNAGVSLLVPHGAIADDTSWEMYMLINQGETSAQSEERCEILLGPEITYGPPGLSLSCPV
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       :.:: :::.::.:.:::.::..:...::::.:::.:::::::::.:  .::.:::. : :
gi|812 AMTIAHCAEVSAENWNIKLKRQTKDNKWEEIMSVDDESTSCYCLMDSHSCHLLLDQPGCY
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       ::.:::::: :.:.:..:::: :  .::::.:::.:::.:: ::: ::. :  .::::::
gi|812 ALVGEPITDAAIKRLRIAVFGSMEASSLDYSLRVHCVDDTPHAFQGVVTAETCRGGQLLE
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       ::: : :::: .:::.:. ::: ::: :::::.:::  :..:: ::.::.::::::.:..
gi|812 EPKTLFFKGNCLSLQVSIQDIPQFLWSIKPFTTCQEFSFTQVWYSNQQPVHCAFSLQRHS
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KIAA17 PTTTQLSCKICIRQLKGHEQILQVQTSILESERETITFFAQEDSTFPAQTGPKAFKIPYS
        .:.:::::: .::.::::::::: ::. :.:.::. :: : : :  .::: :::::: :
gi|812 AATNQLSCKISVRQVKGHEQILQVYTSVGENEKETVPFFMQADCTVTSQTGAKAFKIPLS
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KIAA17 IRQRICATFDTPNAKGKDWQMLAQKNSINRNLSYFATQSSPSAVILNLWEARHQHDGDLD
       ::::::.:::: ::::::::.::::  :.::::::. :.:::::::.::::::: .::::
gi|812 IRQRICTTFDTANAKGKDWQLLAQKLHIQRNLSYFTKQKSPSAVILSLWEARHQDSGDLD
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KIAA17 SLACALEEIGRTHTKLSNISESQLDEADFNYSRQNGL
       ::: ::::::. : :    : .. .:.::..      
gi|812 SLASALEEIGKIHCKSLPQSPDE-NETDFTF      
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               10        20        30        40        50        60
KIAA17 YVIWGWMILVLVKALSDVCAGTSGFLLDFSSQTSPGTDNGEALPESIPSAPGTLPHFIEE
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gi|119               MCYQCRLCSDVFFDFT-----GTDNGEALPESIPSAPGTLPHFIEE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 RQQVEDFHGPEDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGMIVLH
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KIAA17 CRPPEGVPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 CRPPEGVPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 RRSLSATVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKI
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KIAA17 TCTSLCPVDGSWEVWSEWSVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 TCTSLCPVDGSWEVWSEWSVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGGKFCEGLSQESENCTDGLC
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KIAA17 ILDKKPLHEIKPQSIENASDIALYSGLGAAVVAVAVLVIGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSA
       ::           .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 IL-----------GIENASDIALYSGLGAAVVAVAVLVIGVTLYRRSQSDYGVDVIDSSA
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KIAA17 LTGGFQTFNFKTVRQGNSLLLNSAMQPDLTVSRTYSGPICLQDPLDKELMTESSLFNPLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 LTGGFQTFNFKTVRQGNSLLLNSAMQPDLTVSRTYSGPICLQDPLDKELMTESSLFNPLS
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KIAA17 DIKVKVQSSFMVSLGVSERAEYHGKNHSRTFPHGNNHSFSTMHPRNKMPYIQNLSSLPTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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