# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh19201x1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1777.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1777, 954 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7821122 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0421+/-0.000185; mu= 14.3685+/- 0.010 mean_var=71.8984+/-13.817, 0's: 35 Z-trim: 81 B-trim: 5 in 1/66 Lambda= 0.151257 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|54036576|sp|Q6UXZ4.1|UNC5D_HUMAN RecName: Full= ( 953) 6333 1391.9 0 gi|109086131|ref|XP_001088208.1| PREDICTED: netrin ( 953) 6322 1389.5 0 gi|194226449|ref|XP_001494141.2| PREDICTED: simila ( 953) 6285 1381.4 0 gi|73979331|ref|XP_539972.2| PREDICTED: similar to ( 958) 6232 1369.9 0 gi|119918194|ref|XP_598235.3| PREDICTED: similar t ( 975) 6200 1362.9 0 gi|54036591|sp|Q8K1S2.1|UNC5D_MOUSE RecName: Full= ( 956) 6171 1356.6 0 gi|125816113|ref|XP_001342230.1| PREDICTED: Unc5Db ( 936) 4385 966.8 0 gi|126540859|emb|CAM47035.1| novel unc-5 homolog f ( 901) 4377 965.1 0 gi|81230842|gb|ABB59712.1| Unc5Db [Danio rerio] ( 894) 4358 960.9 0 gi|119583786|gb|EAW63382.1| unc-5 homolog D (C. el ( 924) 3913 863.8 0 gi|148877523|gb|AAI45696.1| Unc5d protein [Mus mus ( 884) 3819 843.3 0 gi|193783712|dbj|BAG53621.1| unnamed protein produ ( 529) 3536 781.4 0 gi|54036590|sp|Q8JGT4.1|UNC5B_XENLA RecName: Full= ( 943) 3456 764.1 0 gi|219521598|gb|AAI44785.1| Unknown (protein for M ( 882) 3448 762.3 0 gi|24710917|gb|AAM95701.1| transmembrane receptor ( 934) 3305 731.1 5.6e-208 gi|109089526|ref|XP_001106162.1| PREDICTED: simila (1131) 3295 729.0 2.9e-207 gi|73952838|ref|XP_861399.1| PREDICTED: similar to ( 934) 3264 722.2 2.8e-205 gi|34785821|gb|AAH57560.1| Unc5b protein [Mus musc ( 934) 3244 717.8 5.7e-204 gi|29145032|gb|AAH48162.1| Unc5b protein [Mus musc (1008) 3244 717.9 6e-204 gi|148700216|gb|EDL32163.1| unc-5 homolog B (C. el (1008) 3244 717.9 6e-204 gi|114595238|ref|XP_001164977.1| PREDICTED: unc5C ( 951) 3240 717.0 1.1e-203 gi|74188527|dbj|BAE28019.1| unnamed protein produc ( 901) 3221 712.8 1.8e-202 gi|114595236|ref|XP_001164941.1| PREDICTED: unc5C ( 951) 3200 708.2 4.5e-201 gi|47228412|emb|CAG05232.1| unnamed protein produc ( 837) 3177 703.2 1.3e-199 gi|74210877|dbj|BAE25058.1| unnamed protein produc ( 950) 3077 681.4 5.4e-193 gi|148680122|gb|EDL12069.1| unc-5 homolog C (C. el ( 988) 3077 681.4 5.5e-193 gi|74001972|ref|XP_850643.1| PREDICTED: similar to ( 950) 3068 679.4 2.1e-192 gi|74189886|dbj|BAE24575.1| unnamed protein produc ( 950) 3068 679.4 2.1e-192 gi|26327503|dbj|BAC27495.1| unnamed protein produc ( 950) 3060 677.7 7e-192 gi|190339920|gb|AAI63497.1| Unc-5 homolog B (C. el ( 940) 3035 672.2 3.1e-190 gi|190339930|gb|AAI63521.1| Unc-5 homolog B (C. el ( 940) 3031 671.4 5.6e-190 gi|62955977|gb|AAY23344.1| Unc5B [Danio rerio] ( 940) 3030 671.1 6.5e-190 gi|219519736|gb|AAI44784.1| Unknown (protein for M ( 875) 2999 664.3 6.7e-188 gi|81230838|gb|ABB59710.1| Unc5C [Danio rerio] ( 948) 2891 640.8 8.9e-181 gi|74211267|dbj|BAE37698.1| unnamed protein produc ( 876) 2770 614.4 7.4e-173 gi|114595232|ref|XP_001164902.1| PREDICTED: unc5C ( 940) 2643 586.7 1.7e-164 gi|73952832|ref|XP_861315.1| PREDICTED: similar to ( 970) 2632 584.3 9.3e-164 gi|149633658|ref|XP_001513625.1| PREDICTED: simila ( 621) 2564 569.3 1.9e-159 gi|189526972|ref|XP_001919921.1| PREDICTED: hypoth ( 924) 2560 568.6 4.8e-159 gi|81230840|gb|ABB59711.1| Unc5Da [Danio rerio] ( 934) 2507 557.0 1.5e-155 gi|33305855|gb|AAQ02790.1|AF380352_1 UNC5H2 [Gallu ( 945) 2495 554.4 9.1e-155 gi|194205985|ref|XP_001917727.1| PREDICTED: simila ( 935) 2483 551.8 5.6e-154 gi|54036589|sp|Q8IZJ1.2|UNC5B_HUMAN RecName: Full= ( 945) 2479 550.9 1e-153 gi|148744913|gb|AAI42197.1| UNC5B protein [Bos tau ( 945) 2474 549.8 2.2e-153 gi|73952840|ref|XP_850428.1| PREDICTED: similar to ( 945) 2465 547.8 8.5e-153 gi|74199411|dbj|BAE34445.1| unnamed protein produc ( 945) 2462 547.2 1.3e-152 gi|54036592|sp|Q8K1S3.1|UNC5B_MOUSE RecName: Full= ( 945) 2462 547.2 1.3e-152 gi|148700837|gb|EDL32784.1| unc-5 homolog D (C. el ( 836) 2461 546.9 1.4e-152 gi|149057865|gb|EDM09108.1| unc-5 homolog D (C. el ( 836) 2461 546.9 1.4e-152 gi|54036537|sp|O08722.1|UNC5B_RAT RecName: Full=Ne ( 945) 2457 546.1 2.9e-152 >>gi|54036576|sp|Q6UXZ4.1|UNC5D_HUMAN RecName: Full=Netr (953 aa) initn: 6333 init1: 6333 opt: 6333 Z-score: 7461.0 bits: 1391.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 6333; 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