# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj12188mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1765.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1765, 608 aa vs ./tmplib.25089 library 1986897 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4977+/-0.00549; mu= 9.0104+/- 0.368 mean_var=191.2459+/-47.194, 0's: 0 Z-trim: 44 B-trim: 116 in 1/39 Lambda= 0.092742 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0369 ( 794 res) hh00177 ( 794) 1063 154.9 2.3e-38 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 717 108.4 1.5e-24 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 620 95.8 1.8e-20 KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 622 96.2 1.8e-20 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 586 91.0 3.3e-19 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 570 88.9 1.5e-18 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 562 87.9 3.3e-18 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 538 84.6 2.9e-17 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 509 81.0 5.7e-16 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 501 80.0 1.3e-15 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 497 79.4 1.7e-15 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 493 78.6 1.9e-15 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 468 75.0 1.5e-14 KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265) 450 73.2 1.5e-13 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 443 71.9 2.1e-13 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 439 71.8 4.4e-13 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 429 70.8 1.6e-12 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 412 67.6 3e-12 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 417 69.1 4.4e-12 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 399 66.3 1.6e-11 KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 383 64.4 8.9e-11 KIAA1477 ( 870 res) fj04927 ( 870) 373 62.7 1.5e-10 KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626) 363 61.7 5.4e-10 KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 359 60.9 5.9e-10 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 345 58.7 1.6e-09 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 330 57.0 8.7e-09 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 330 57.2 1.1e-08 KIAA0834 ( 453 res) hj05353 ( 453) 321 55.3 1.2e-08 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 319 55.6 2.5e-08 KIAA0135 ( 1351 res) ha01203s1 (1351) 289 51.7 4.7e-07 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 291 52.2 5.2e-07 KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175) 286 51.2 5.6e-07 KIAA0151 ( 723 res) ha03241 ( 723) 269 48.6 2e-06 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 254 47.0 1.2e-05 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 254 47.0 1.2e-05 KIAA0344 ( 2066 res) hg01568 (2066) 256 47.5 1.3e-05 KIAA1459 ( 853 res) fh16961 ( 853) 237 44.5 4.4e-05 KIAA0472 ( 365 res) hh00171 ( 365) 225 42.4 8e-05 KIAA0965 ( 489 res) hj06174s1 ( 489) 225 42.5 9.5e-05 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 226 43.3 0.00018 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 227 43.6 0.00019 KIAA1790 ( 1369 res) fh24104 (1369) 200 39.8 0.0018 KIAA1028 ( 501 res) fh00176s1 ( 501) 179 36.4 0.0069 >>KIAA0369 ( 794 res) hh00177 (794 aa) initn: 1064 init1: 1031 opt: 1063 Z-score: 780.8 bits: 154.9 E(): 2.3e-38 Smith-Waterman score: 1063; 52.721% identity (79.592% similar) in 294 aa overlap (308-601:447-739) 280 290 300 310 320 330 KIAA17 PAKLEKEPKTRPEENKPERPSGRKPRPMGIIAANVEKHYETGRVIGDGNFAVVKECRHRE : :.. ..:..::.:::::::::::: .: KIAA03 SSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERS 420 430 440 450 460 470 340 350 360 370 380 390 KIAA17 TRQAYAMKIIDKSRLKGKEDMVDSEILIIQSLSHPNIVKLHEVYETDMEIYLILEYVQGG : . ::.::: ::. .::: :...:. :.. ..::::: : : ... :.::..: :.:: KIAA03 TAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGG 480 490 500 510 520 530 400 410 420 430 440 450 KIAA17 DLFDAIIESVKFPEPDAALMIMDLCKALVHMHDKSIVHRDLKPENLLVQRNEDKSTTLKL :::::: . :. : ::. :...: .:. ..:. .:::::.::::::: ...: : .::: KIAA03 DLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKL 540 550 560 570 580 590 460 470 480 490 500 510 KIAA17 ADFGLAKHVVRPIFTVCGTPTYVAPEILSEKGYGLEVDMWAAGVILYILLCGFPPFRSPE .::::: : :..:::::::::::::..: ::::.::.:::::: :::::::::::. 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KIAA09 FSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEG 80 90 100 110 120 130 390 400 410 420 430 440 KIAA17 EIYLILEYVQGGDLFDAIIESVKFPEPDAALMIMDLCKALVHMHDKSIVHRDLKPENLLV . :::.. : ::.::. :. . : ::. :... .:..: :. ..:::::::::::. KIAA09 HHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLL 140 150 160 170 180 190 450 460 470 480 490 500 KIAA17 QRNEDKSTTLKLADFGLAKHVV---RPIFTVCGTPTYVAPEILSEKGYGLEVDMWAAGVI .. :....:::::::: .: . : ::: :..::.: . :: ::.:: ::: KIAA09 A-SKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVI 200 210 220 230 240 250 510 520 530 540 550 560 KIAA17 LYILLCGFPPFRSPERDQDELFNIIQLGHFEFLPPYWDNISDAAKDLVSRLLVVDPKKRY ::::: :.::: ..:: .:.. :. : ..: : ::... ::::....:...:.:: KIAA09 LYILLVGYPPFW--DEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPSKRI 260 270 280 290 300 570 580 590 600 KIAA17 TAHQVLQHPWIETAGKTNT-VKRQKQVSPSSEGHFRSQHKRVVEQVS :: ..:.:::: . . . ..::. : KIAA09 TAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSGGKSGG 310 320 330 340 350 360 >>KIAA0781 ( 950 res) hk09678 (950 aa) initn: 436 init1: 207 opt: 620 Z-score: 459.6 bits: 95.8 E(): 1.8e-20 Smith-Waterman score: 626; 34.294% identity (63.112% similar) in 347 aa overlap (277-607:1-331) 250 260 270 280 290 300 KIAA17 LRRTRGEEKEAEKEKKPCMSGGRRMTLRDDQPAKLEKEPKTRPEENKPERPSGRKPRPMG .:.. .: .::. : .: : . KIAA07 KPSR-AANPPARPRSCPPCLAAG--P---S 10 20 310 320 330 340 350 KIAA17 IIAANVEKHYETGRV----------IGDGNFAVVKECRHRETRQAYAMKIIDKSRLKGKE .. :. .: . : : .: ::::::: ::: :. :.::::::.: . . KIAA07 MVMADGPRHLQRGPVRVGFYDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEVAIKIIDKSQLDAVN 30 40 50 60 70 80 360 370 380 390 400 410 KIAA17 -DMVDSEILIIQSLSHPNIVKLHEVYETDMEIYLILEYVQGGDLFDAIIESVKFPEPDAA . . :. :.. :.::.:.::..:.:: .::. ::...:..:: . . .. : .: KIAA07 LEKIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFDYLANHGRLNESEAR 90 100 110 120 130 140 420 430 440 450 460 470 KIAA17 LMIMDLCKALVHMHDKSIVHRDLKPENLLVQRNEDKSTTLKLADFGLAKHVVRP--IFTV . .. .:. . : ..::::::: ::::. :.. ..:.::::... . : KIAA07 RKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDLKAENLLL----DNNMNIKIADFGFGNFFKSGELLATW 150 160 170 180 190 200 480 490 500 510 520 530 KIAA17 CGTPTYVAPEILSEKGY-GLEVDMWAAGVILYILLCGFPPFRSPERDQDELFNIIQLGHF ::.: :.:::.. . : : ..:.:. ::.::.:.:: :: .: : . . :.: KIAA07 CGSPPYAAPEVFEGQQYEGPQLDIWSMGVVLYVLVCGALPFDGP--TLPILRQRVLEGRF 210 220 230 240 250 540 550 560 570 580 590 KIAA17 EFLPPYWDNISDAAKDLVSRLLVVDPKKRYTAHQVLQHPW--IETAGKTNTVKRQKQVSP .. ::. .:. . :. :.::.::.:: : :. .: : ::. . .. :.: . KIAA07 RI--PYF--MSEDCEHLIRRMLVLDPSKRLTIAQIKEHKWMLIEVPVQRPVLYPQEQENE 260 270 280 290 300 310 600 KIAA17 SSEGHFRSQHKRVVEQVS : :.: : :..... KIAA07 PSIGEFNEQVLRLMHSLGIDQQKTIESLQNKSYNHFAAIYFLLVERLKSHRSSFPVEQRL 320 330 340 350 360 370 >>KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371 aa) initn: 454 init1: 216 opt: 622 Z-score: 459.3 bits: 96.2 E(): 1.8e-20 Smith-Waterman score: 622; 35.625% identity (64.062% similar) in 320 aa overlap (293-593:99-397) 270 280 290 300 310 320 KIAA17 PCMSGGRRMTLRDDQPAKLEKEPKTRPEENKPERPSGRKPRPMGIIAANVEKHYETGRVI .: :..: : : : .:: :.: KIAA09 GAGPAGRLLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMPARI------GYYEIDRTI 70 80 90 100 110 120 330 340 350 360 370 380 KIAA17 GDGNFAVVKECRHRETRQAYAMKIIDKSRLKGKEDM--VDSEILIIQSLSHPNIVKLHEV : :::::::. : :. :.:::::..: .:.. . :. :.. : ::.:..:..: KIAA09 GKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLD-EENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQV 130 140 150 160 170 180 390 400 410 420 430 440 KIAA17 YETDMEIYLILEYVQGGDLFDAIIESVKFPEPDAALMIMDLCKALVHMHDKSIVHRDLKP .::. :::. ::..::..:: .. .. : .: . .. :. : ..::::::: KIAA09 METERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKA 190 200 210 220 230 240 450 460 470 480 490 KIAA17 ENLLVQRNEDKSTTLKLADFGLAKHVVRP---IFTVCGTPTYVAPEILSEKGY-GLEVDM ::::. : . ..:.::::.. .. : . : ::.: :.:::.. : : : .::. KIAA09 ENLLL----DANLNIKIADFGFS-NLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDI 250 260 270 280 290 500 510 520 530 540 550 KIAA17 WAAGVILYILLCGFPPFRSPERDQDELFNI---IQLGHFEFLPPYWDNISDAAKDLVSRL :. ::.::.:.:: :: : . : :. . :.:.. :.. .: . :. .. KIAA09 WSLGVVLYVLVCGALPF-----DGSTLQNLRARVLSGKFRI--PFF--MSTECEHLIRHM 300 310 320 330 340 560 570 580 590 600 KIAA17 LVVDPKKRYTAHQVLQHPWIETA----------GKTNTVKRQKQVSPSSEGHFRSQHKRV ::.::.:: . .:. .: :.. . .. . .:...::.: .: KIAA09 LVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMG 350 360 370 380 390 400 KIAA17 VEQVS KIAA09 LDKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAEQA 410 420 430 440 450 460 >>KIAA0175 ( 656 res) ha02337 (656 aa) initn: 522 init1: 333 opt: 586 Z-score: 436.8 bits: 91.0 E(): 3.3e-19 Smith-Waterman score: 586; 38.806% identity (67.910% similar) in 268 aa overlap (314-573:14-268) 290 300 310 320 330 340 KIAA17 EPKTRPEENKPERPSGRKPRPMGIIAANVEKHYETGRVIGDGNFAVVKECRHRETRQAYA :.:: ..:: :.:: :: : : . : KIAA01 TCKRTMKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVA 10 20 30 40 350 360 370 380 390 400 KIAA17 MKIIDKSRLKGKEDMVDSEILIIQSLSHPNIVKLHEVYETDMEIYLILEYVQGGDLFDAI .::.::. : . . .:: ...: : .: .:..: :: .:...::: ::.::: : KIAA01 IKIMDKNTLGSDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYI 50 60 70 80 90 100 410 420 430 440 450 460 KIAA17 IESVKFPEPDAALMIMDLCKALVHMHDKSIVHRDLKPENLLVQRNEDKSTTLKLADFGL- : . .. : .. ... .. .:....:... .:::::::::: :. ::: :::: KIAA01 ISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLF----DEYHKLKLIDFGLC 110 120 130 140 150 470 480 490 500 510 KIAA17 AKHVVRPIF---TVCGTPTYVAPEILSEKGY-GLEVDMWAAGVILYILLCGFPPFRSPER :: . : ::. .:.:::... :.: : :.:.:. :..::.:.::: :: KIAA01 AKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPF----- 160 170 180 190 200 210 520 530 540 550 560 570 KIAA17 DQDE---LFNIIQLGHFEFLPPYWDNISDAAKDLVSRLLVVDPKKRYTAHQVLQHPWIET :.:. :.. :. :... : : .: .. :....: :::::: . ...:.:::: KIAA01 DDDNVMALYKKIMRGKYDV--PKW--LSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQ 220 230 240 250 260 270 580 590 600 KIAA17 AGKTNTVKRQKQVSPSSEGHFRSQHKRVVEQVS KIAA01 DYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKA 280 290 300 310 320 330 >>KIAA1860 ( 689 res) fh18358 (689 aa) initn: 444 init1: 223 opt: 570 Z-score: 425.0 bits: 88.9 E(): 1.5e-18 Smith-Waterman score: 570; 37.729% identity (68.498% similar) in 273 aa overlap (315-583:59-321) 290 300 310 320 330 340 KIAA17 PKTRPEENKPERPSGRKPRPMGIIAANVEKHYETGRVIGDGNFAVVKECRHRETRQAYAM .:. :.:: :::: :: :: : . :. KIAA18 DKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYRLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAI 30 40 50 60 70 80 350 360 370 380 390 400 KIAA17 KIIDKSRLKGKE-DMVDSEILIIQSLSHPNIVKLHEVYETDMEIYLILEYVQGGDLFDAI :::::..:. . . . :. :...:.::::::: :: ::. .::..::...:..:: . KIAA18 KIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYL 90 100 110 120 130 140 410 420 430 440 450 460 KIAA17 IESVKFPEPDAALMIMDLCKALVHMHDKSIVHRDLKPENLLVQRNEDKSTTLKLADFGLA . .. : .: . .. .:. . :.:.::::::: ::::. : ...:.::::.. KIAA18 VSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHRDLKAENLLL----DAEANIKIADFGFS 150 160 170 180 190 200 470 480 490 500 510 520 KIAA17 KHVV--RPIFTVCGTPTYVAPEILSEKGY-GLEVDMWAAGVILYILLCGFPPFRSPERDQ .. . . : ::.: :.:::... : : : :::.:. ::::: :. : :: . .. KIAA18 NEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIWSLGVILYTLVSGSLPFDG--HNL 210 220 230 240 250 260 530 540 550 560 570 580 KIAA17 DELFNIIQLGHFEFLPPYWDNISDAAKDLVSRLLVVDPKKRYTAHQVLQHPWIETAGKTN :: . . :... :.. .: .... :.::..: :: : .:... ::. . . . KIAA18 KELRERVLRGKYRV--PFY--MSTDCESILRRFLVLNPAKRCTLEQIMKDKWINIGYEGE 270 280 290 300 310 590 600 KIAA17 TVKRQKQVSPSSEGHFRSQHKRVVEQVS .: KIAA18 ELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEVTATYLLLGRKTEEGGDR 320 330 340 350 360 370 >>KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 (766 aa) initn: 424 init1: 149 opt: 562 Z-score: 418.7 bits: 87.9 E(): 3.3e-18 Smith-Waterman score: 562; 33.670% identity (65.993% similar) in 297 aa overlap (316-607:17-303) 290 300 310 320 330 340 KIAA17 KTRPEENKPERPSGRKPRPMGIIAANVEKHYETGRVIGDGNFAVVKECRHRETRQAYAMK :. ...: :.::::: :: : . :.: KIAA00 SMAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVK 10 20 30 40 350 360 370 380 390 400 KIAA17 IIDKSRLKG-KEDMVDSEILIIQSLSHPNIVKLHEVYETDMEIYLILEYVQGGDLFDAII .:::..: . .:. .. ..:::::.:.:: .:. ..::::: .:::.:: :. KIAA00 VIDKTKLDTLATGHLFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIM 50 60 70 80 90 100 410 420 430 440 450 460 KIAA17 ESVK-FPEPDAALMIMDLCKALVHMHDKSIVHRDLKPENLLVQRNEDKSTTLKLADFGLA . . . : : .. .. .:. . : .:::::::::.. .:. .::.:::.. 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KIAA00 ATKYNIPLV-SYKNLSEEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAER 280 290 300 310 320 330 >>KIAA0537 ( 698 res) hg03925 (698 aa) initn: 346 init1: 214 opt: 538 Z-score: 401.8 bits: 84.6 E(): 2.9e-17 Smith-Waterman score: 538; 34.471% identity (66.894% similar) in 293 aa overlap (293-580:72-350) 270 280 290 300 310 320 KIAA17 PCMSGGRRMTLRDDQPAKLEKEPKTRPEENKPERPSGRKPRPMGIIAANVEKHYETGRVI .:..: : : . :....:: ... 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KIAA05 PDRRATIEDIANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESPLLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMK 330 340 350 360 370 380 >>KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100 aa) initn: 381 init1: 243 opt: 509 Z-score: 378.6 bits: 81.0 E(): 5.7e-16 Smith-Waterman score: 509; 32.095% identity (62.162% similar) in 296 aa overlap (289-574:47-336) 260 270 280 290 300 310 KIAA17 KEKKPCMSGGRRMTLRDDQPAKLEKEPKTRPEENKPERPSGRKPRPMGIIAANVEKHYET : . :::. : : : .: .: KIAA06 HESPPGPGAAAAPDPPHAGALRARGAAVLIPAPHCAARPSAVCP---GGAAMEVVGDFEY 20 30 40 50 60 70 320 330 340 350 360 370 KIAA17 GR--VIGDGNFAVVKECRHRE-TRQAYAMKIIDKSRLKGKEDMVDSEILIIQSLSHPNIV .. ..: : :::: . :::. : :.: :.:. :. .. .. .:: :.. :.: ::: KIAA06 SKRDLVGHGAFAVVFRGRHRQKTDWEVAIKSINKKNLSKSQILLGKEIKILKELQHENIV 80 90 100 110 120 130 380 390 400 410 420 430 KIAA17 KLHEVYETDMEIYLILEYVQGGDLFDAIIESVKFPEPDAALMIMDLCKALVHMHDKSIVH :..: : ..:..:: .:::: : . . . : ... .. :. .:.:.:.: KIAA06 ALYDVQELPNSVFLVMEYCNGGDLADYLQAKGTLSEDTIRVFLHQIAAAMRILHSKGIIH 140 150 160 170 180 190 440 450 460 470 480 KIAA17 RDLKPENLLVQR-NEDKSTT----LKLADFGLAKHVVRPIF--TVCGTPTYVAPEILSEK :::::.:.:.. :. ::.. .:.::::.:... .. :.::.: :.:::.. . 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