# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/af00030.fasta.huge -Q ../query/KIAA1760.ptfa ./tmplib.25089 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1760, 2219 aa
 vs ./tmplib.25089 library

1985286 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.6374+/-0.0119; mu= -28.4903+/- 0.801
 mean_var=956.3918+/-226.824, 0's: 0 Z-trim: 45  B-trim: 5 in 1/39
 Lambda= 0.041472

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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KIAA1566  ( 1313 res)   fh21445                    (1313)  537 49.4 7.9e-06
KIAA0458  ( 1552 res)   ef01252                    (1552)  499 47.2 4.2e-05
KIAA1471  ( 1421 res)   fj02383s1                  (1421)  477 45.9  0.0001
KIAA0309  ( 3053 res)   hg00096s1                  (3053)  480 46.4 0.00014
KIAA1681  ( 1236 res)   fh23697                    (1236)  452 44.3 0.00026
KIAA1887  ( 967 res)   fk02232                     ( 967)  439 43.4 0.00038
KIAA1142  ( 467 res)   hh05864                     ( 467)  397 40.5  0.0013


>>KIAA0344  ( 2066 res)   hg01568                         (2066 aa)
 initn: 2880 init1: 1990 opt: 2163  Z-score: 720.0  bits: 146.9 E(): 5.5e-35
Smith-Waterman score: 2777;  34.023% identity (54.665% similar) in 2272 aa overlap (34-2217:9-2015)

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                                     .::.::::. .:.    : :::  .  : :
KIAA03                       AATTTTTEHRFFRRSVICDSNATALELPGLPLS-LPQP
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KIAA17 QPPQPLQRRVLLLCKTRRLIAERARGRPAAPAPAALVAQPGAPGAPADAGPEP--VGTQE
       . :  . . .    . .. ..  : .. :   :::     .:::  : ::: :  : .. 
KIAA03 SIPAAVPQSAPPEPHREETVTATATSQVAQQPPAA-----AAPGEQAVAGPAPSTVPSST
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KIAA17 PGPDPIAAAVETAPAPDGGPREEAAATVRKEDEGAAEAKPEPGRTRRDEPEEEEDDEDDL
           :.     . :.  :. .:   :   .   :.. :: ::    ..:  ...:: ..:
KIAA03 SKDRPV-----SQPSLVGSKEEPPPA---RSGSGGGSAK-EP----QEERSQQQDDIEEL
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KIAA17 --KAVATSLDGRFLKFDIELGRGSFKTVYKGLDTETWVEVAWCELQDRKLTKLERQRFKE
         :::. : ::::::::::.:::::::::::::::: ::::::::::::::: :::::::
KIAA03 ETKAVGMSNDGRFLKFDIEIGRGSFKTVYKGLDTETTVEVAWCELQDRKLTKSERQRFKE
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KIAA17 EAEMLKGLQHPNIVRFYDFWESSAKGKRCIVLVTELMTSGTLKTYLKRFKVMKPKVLRSW
       :::::::::::::::::: :::..:::.::::::::::::::::::::::::: ::::::
KIAA03 EAEMLKGLQHPNIVRFYDSWESTVKGKKCIVLVTELMTSGTLKTYLKRFKVMKIKVLRSW
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KIAA17 CRQILKGLLFLHTRTPPIIHRDLKCDNIFITGPTGSVKIGDLGLATLKRASFAKSVIGTP
       :::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA03 CRQILKGLQFLHTRTPPIIHRDLKCDNIFITGPTGSVKIGDLGLATLKRASFAKSVIGTP
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KIAA17 EFMAPEMYEEHYDESVDVYAFGMCMLEMATSEYPYSECQNAAQIYRKVTCGIKPASFEKV
       ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :.:::::.::
KIAA03 EFMAPEMYEEKYDESVDVYAFGMCMLEMATSEYPYSECQNAAQIYRRVTSGVKPASFDKV
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KIAA17 HDPEIKEIIGECICKNKEERYEIKDLLSHAFFAEDTGVRVELAEEDHGRKSTIALRLW--
         ::.::::  :: .::.::: :::::.:::: :.::::::::::: :.:  ::..::  
KIAA03 AIPEVKEIIEGCIRQNKDERYSIKDLLNHAFFQEETGVRVELAEEDDGEK--IAIKLWLR
     380       390       400       410       420         430       

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KIAA17 VEDPKKLKGKPKDNGAIEFTFDLEKETPDEVAQEMIESGFFHESDVKIVAKSIRDRVALI
       .:: :::::: ::: ::::.::::...:..:::::.:::.  :.: : .::.:.:::.::
KIAA03 IEDIKKLKGKYKDNEAIEFSFDLERDVPEDVAQEMVESGYVCEGDHKTMAKAIKDRVSLI
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KIAA17 QWRRER--IWPALQPKEQQDVGSPDKARGPPVPLQVQVTY--HAQAGQPGPP--------
       . .::.  .    : :..:. .:  .        :. .     :..: :           
KIAA03 KRKREQRQLVREEQEKKKQEESSLKQQVEQSSASQTGIKQLPSASTGIPTASTTSASVST
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KIAA17 --EPEEPEADQHL-LPPTLPTSATSLASDSTFDSGQGSTVYSDSQ-SSQQSVMLGSLADA
         ::::::::::  :    :.   :. ::.: ::::::.:...:. ::::.:  ::  . 
KIAA03 QVEPEEPEADQHQQLQYQQPS--ISVLSDGTVDSGQGSSVFTESRVSSQQTVSYGSQHEQ
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KIAA17 APSPAQCVCSPPVSEGPVLPQSLPSLGAYQQPTAAPGLPVGSVPAPACPPSLQQHFPDPA
       : : .      : .   :  :: :  :.:   ..: :   :.       ::      . .
KIAA03 AHSTGTVPGHIPST---VQAQSQPH-GVYPPSSVAQGQSQGQ-------PS------SSS
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KIAA17 MSFAPVLPPPSTPMPTGPGQPAPPGQQPP-PLAQPTPLPQVLAPQPVVPLQPVPPHLPPY
       .. .    : . :.  :  : ::: :     :.: .   .. . :::   ::  :.. : 
KIAA03 LTGVSSSQPIQHPQQQGIQQTAPPQQTVQYSLSQTSTSSEATTAQPVS--QPQAPQVLPQ
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KIAA17 LAPASQ-VGAPAQLKPLQMPQAPLQPLAQVPPQMPPIPVVPPITPLAGIDGLPPALPDLP
       .. ..: . . .:. : . : :  :: :  :  .    :    . .:.  :.  .  ..:
KIAA03 VSAGKQSTQGVSQVAPAE-PVAVAQPQATQPTTLAS-SVDSAHSDVAS--GMSDGNENVP
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KIAA17 TATV--PPVPPPQYFSPAVILPSLAAPLPPASPALPLQAV--KLPHPPGAPLAMPCRTIV
       ...         ...  .:   : .     . : : .  :  :  .     :    : .:
KIAA03 SSSGRHEGRTTKRHYRKSV--RSRSRHEKTSRPKLRILNVSNKGDRVVECQLETHNRKMV
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KIAA17 P-------NAPATIPLLAVAPPGVAALSIHSAVAQLPGQPVYPAAFPQMAPTDVPPSPH-
               . :  :  . :    . :.  .: : :.  . .   :  .:   ::   :. 
KIAA03 TFKFDLDGDNPEEIATIMVNNDFILAIERESFVDQV--REIIEKA-DEMLSEDVSVEPEG
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        . ......         :       ::.  :  ..: :  .: .     : :      .
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         .:: : .     .  : .      :. : .:: .  :.: :   ... : ...  . .
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         .   .::      :. : ..: : ::.: : ... ..    ::  :: .         
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          :   :  :.:.   .:    : . ::.:        : : .   :     :.: .  
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       : : .   . ...   ..  .   .. : : .  .:     :.  ....   .:.  :  
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        : . .   .: .:      :.  .   ..  .  ..   :. :    :. .:... . .
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KIAA17 TDADRGSDPGTSPPHLSTCGLGTGEESRQSQANA--PVYQQNVLHTGKRWFIICPVAEHP
        ..  :   . : :  :. . :.:  :  :: ..  :.   .:. .        :.   :
KIAA03 HSSTTGLAFSLSAPS-SSSSPGAGVSSYISQPGGLHPLVIPSVIAS-------TPIL--P
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          .: :.: :: . :.:: ..   ..:  .:  . :. ::..: .:       :     
KIAA03 QAAGPTSTPLLPQVPSIPPLVQPVANVPAVQQTLIHSQPQPALLPNQP--HTHCPEVDSD
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       . :   ::.   . .: .       : . : .:. :..:.  .   .:. :  ..  .  
KIAA03 TQPK--APGIDDIKTLEEK----LRSLFSEHSSSGAQHAS-VSLETSLVIESTVTPGIPT
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       :  ::  .  :.   . : : :       .. :  :.  :.   .: : :     :  : 
KIAA03 TAVAPSKL--LTSTTSTCLP-PTNLPLGTVALPVTPVVTPGQVSTPVSTTTSGVKPGTAP
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       ..:    ::.::  ::.  : .. :::  :    :: :  .: .... :          .
KIAA03 SKPPLTKAPVLP--VGT-ELPAGTLPSEQL----PPFPGPSL-TQSQQP----------L
       1440        1450       1460          1470                   

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KIAA17 KSLDEKLRTLLYQEHVPTSSASAGTPVEVGDRDFTLEPLRGDQPR--SEVCGGDLALPPV
       ..:: .::  :  : . ..:: .: :: ..      :   : ::.  :.:  :    : .
KIAA03 EDLDAQLRRTLSPEMITVTSA-VG-PVSMAAPTAITEA--GTQPQKVSQVKEG----PVL
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KIAA17 PKEAVSGRVQLPQPLVEKSELAPTRGAVMEQGTSSSMTAESSPRSMLGYDRDGRQVASDS
          . .:  .. .  :     . . :: ...: ..:  :.:     . .. .    .:.:
KIAA03 ATSSGAGVFKMGRFQVS----VAADGA-QKEGKNKSEDAKS-----VHFESS----TSES
             1540          1550       1560           1570          

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KIAA17 HVVPSVPQDVPAFVRPARVEPTDRDGGEAGESSAEPPPSDMGTVGGQASHPQTLGARALG
        :. :   .  ..:.:   ::   .:      :.. : :   :....:.          :
KIAA03 SVLSSSSPE-STLVKP---EP---NGITIPGISSDVPESAHKTTASEAKSDT-------G
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KIAA17 SPRKRPEQQDVSSPAKTVGRFSVVSTQDEWTLASPHSLRYSAPPDVYLDEAPSSPDVKLA
       .: :  . : :.. :. :::::: .:.:. : .. ..   ..::  ..:       .. :
KIAA03 QPTKVGRFQ-VTTTANKVGRFSVSKTEDKITDTKKEG-PVASPP--FMD-------LEQA
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KIAA17 VRRAQTASSIEVGVGEPVSSDSGDEGPRARPPVQKQASLPVSGSVAGDFVKKATAFLQRP
       :  :   .. .  ..::    :  .:: . : .                     :::.: 
KIAA03 VLPAVIPKKEKPELSEP----SHLNGPSSDPEA---------------------AFLSRD
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KIAA17 SRAGSLGPETPSRVGMK-VPTISVTSFHSQS---SYISSDNDSELEDADIKKELQSLREK
          :: .:..: ... : .:. ....  :.:   ::.::::.:..:: :.: ::. ::.:
KIAA03 VDDGSGSPHSPHQLSSKSLPSQNLSQSLSNSFNSSYMSSDNESDIEDEDLKLELRRLRDK
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KIAA17 HLKEISELQSQQKQEIEALYRRLGKPLPPNVGFFHTAPPTGRRRKTSKSK-LKAGKLLNP
       :::::..:::.::.:::.:: .::: .:: : .  .:: .::::. .:::  :...    
KIAA03 HLKEIQDLQSRQKHEIESLYTKLGK-VPPAVIIPPAAPLSGRRRRPTKSKGSKSSR----
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      1960      1970      1980      1990      2000      2010       
KIAA17 LVRQLKVVASSTGHLADSSRGPPAKDPAQASVGLTADSTGLSGKAVQTQQPCSVRASLSS
               .:: :.          :.: : : .:...:..   .  :: .:         
KIAA03 --------SSSLGN----------KSP-QLSGNLSGQSAASVLHPQQTLHP---------
                              1830       1840      1850            

      2020      2030      2040      2050       2060      2070      
KIAA17 DICSGLASDGGGARGQGWTVYHPTSERVTYKSSSKPRARFLS-GPVSVSIWSALKRLCLG
           :   ..:  ..:     .:.       ::..  . : : : .::   ::      :
KIAA03 ---PGNIPESG--QNQLLQPLKPSP------SSDNLYSAFTSDGAISVPSLSAP-----G
             1860        1870            1880      1890            

       2080      2090      2100      2110      2120      2130      
KIAA17 KEHSSRSSTSSLAPGPEPGPQPALHVQAQVNNSNNKKGTFTDDLHKLVDEWTSKTVGAAQ
       .  :: ..... . .     ::          ....:::::::::::::.:.  ..    
KIAA03 QGTSSTNTVGATVNSQAAQAQPPAM-------TSSRKGTFTDDLHKLVDNWARDAM----
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       2140      2150      2160      2170       2180      2190     
KIAA17 LKPTLNQLKQTQKLQDMEAQAGWAAPGEARAMTAP-RAGVGMPRLPPAPGPLSTTVIPGA
          .:.  . ..  ...:.      :: :: ..:: .  ..:     . .:.:..    .
KIAA03 ---NLSGRRGSKGHMNYEG------PGMARKFSAPGQLCISMTSNLGGSAPISAA----S
          1950      1960            1970      1980      1990       

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KIAA17 APTLSVPTPGSCGPRAVSTPTSYT                                    
       : .:.  : . : :.  . :..                                      
KIAA03 ATSLGHFTKSMCPPQQYGFPATPFGAQWSGTGGPAPQPLGQFQPVGTASLQNFNISNLQK
          2000      2010      2020      2030      2040      2050   

>>KIAA1566  ( 1313 res)   fh21445                         (1313 aa)
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KIAA15 TPIKKTREKKPAGCLEERRDSQCKSMGNVFPQPQNTTLPLAPAQQT--GAECEETEVDQH
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KIAA17 VRPEPLQPHLPEQAAPAATPGSQILLGHPAPYAVDVAAQVPTVPVPPAAVLSPPLPEVLL
       :: . :: . :.:   ..:  .    :  .    :...: :.:      ...  .   . 
KIAA15 VRQQLLQRK-PQQHCSSVTGDNLSEAGAASVIHSDTSSQ-PSVAYSSNQTMGSQMVSNI-
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KIAA17 PAAPELLP-QFPSSLATVSASVQSVPTQTAT-LLPPANPPLPGGPGIASPC----PTV--
       : :   .: :. ::   :.   :    :  . :  :   ::  : . . :     :::  
KIAA15 PQAEVNVPGQIYSSQQLVGHYQQVSGLQKHSKLTQPQILPLVQGQSTVLPVHVLGPTVVS
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KIAA17 QLTVEPVQEEQASQDKPPGLPQSCESYGG-----------SDVTSGKELSDSCEGAFGGG
       :  : :.  ... : :: . : . :. ..           .::.. ::  .: ..  :.:
KIAA15 QPQVSPLTVQKVPQIKPVSQPVGAEQQAALLKPDLVRSLNQDVATTKENVSSPDNPSGNG
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KIAA17 RLEGRAARKHHRRSTRARSRQERASRPRLTILNVCNTGDKMVECQLETHNHKMVTFKFDL
       . .    : ..::..  :   :.... .::.:.: ..::.::::::::::.::::::::.
KIAA15 KQD----RIKQRRASCPR--PEKGTKFQLTVLQVSTSGDNMVECQLETHNNKMVTFKFDV
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KIAA17 DGDAPDEIATYMVEHDFILQAERETFIEQMKDVMDKAEDMLSEDTDADRGSDPGTSPPHL
       :::::..:: :::: .:.:..:.: :.:... .. .:...:     ..:..   .     
KIAA15 DGDAPEDIADYMVEDNFVLESEKEKFVEELRAIVGQAQEILHVHFATERATGVDSITVDS
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KIAA17 STCGLGTGEESRQSQANAPVYQQNVLHTGK--RW-FIICPVAEHPAPEAPESSPPLPLSS
       ..   :..:. . ..... . .... ...   :: : :  . ..   ..: :     .:.
KIAA15 NSSQTGSSEQVQINSTSTQTSNESAPQSSPVGRWRFCINQTIRNRETQSPPSLQH-SMSA
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KIAA17 LP-------PEASQDSAPYKDQLSSKEQ-PSFLASQQLLSQAGPS-NPPGAPPAPLAPSS
       .:       :. ....   .: : . :. :   :     :.     .   .  : .  ..
KIAA15 VPGRHPLPSPKNTSNKEISRDTLLTIENNPCHRALFTSKSEHKDVVDGKISECASVETKQ
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KIAA17 PPVTALPQDG---AAPATSTMPEPASGTASQAGGPGTPQGLTSELETSQPLAETHEAPLA
       : .    .:.    ::.:..    . .:.:  . :.  .:::..     :.   :..   
KIAA15 PAILYQVEDNRQIMAPVTNS---SSYSTTSVRAVPAECEGLTKQASIFIPVYPCHQTASQ
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KIAA17 VQPLVVGLAPCTPAPEAASTRDASAPREPLPPPAPEPSPHS-GTPQPALGQPAPLLPAAV
       .. :.      .   :...:   :     :   : . .:.. .. :::.        . .
KIAA15 ADALM------SHPGESTQTSGNS-----LTTLAFDQKPQTLSVQQPAMDAEFISQEGET
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KIAA17 GAVSLATSQ---LPS--PPLGPTVPPQPPSALESDGEGPPPRVGFVDSTIKSLDEKLRTL
        . . :.:    .:.  : : ::.  :: ..:::::: :: .. :.:. ::.::::::.:
KIAA15 TVNTEASSPKTVIPTQTPGLEPTTL-QPTTVLESDGERPP-KLEFADNRIKTLDEKLRNL
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KIAA17 LYQEHVPTSSASAGTPVEVGDRDFTLEPLRGDQPRSEVCGGDLALPPVPKEAVSGRVQLP
       :::::    : :.  :    : .    :. ..   .  :       :: .  . ..  . 
KIAA15 LYQEH----SISSIYPESQKDTQSIDSPFSSSAEDTLSC-------PVTEVIAISHCGIK
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KIAA17 QPLVEKSELAPTRGAVMEQGTSSSMTAESSPRSMLGYDRDGRQVASDS-----HVVPS--
       .  :.. ..  : . ..      : .: :.: ..  . ::   ..: :     : . :  
KIAA15 DSPVQSPNFQQTGSKLL------SNVAASQPANISVFKRDLNVITSVSSELCLHEMSSDA
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KIAA17 -VPQDVPAFVRPARVEPTD----RDGGEAGESSAEPPPSDMGTVGGQASHPQTLG-ARAL
        .: :  :.  :: :        . : :. :  .   :. .  .  ...  ..:.  .:.
KIAA15 SLPGDPEAY--PAAVSSGGAIHLQTGVETEEMRSAIAPDPIPLTRESTADTRALNRCKAM
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KIAA17 GSPRKRPEQQDVSSPAKTVGR---FSV--VSTQDEWTLASPHSLRYSAPPD-VYLDEAPS
       ..  .: . : .. : .  ..   :..  .:. .: . .: ...  .:  . : .. : .
KIAA15 SGSFQRGRFQVITIPQQQSAKMTSFGIEHISVFSETNHSSEEAFIKTAKSQLVEIEPATQ
             860       870       880       890       900       910 

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KIAA17 SPDVKLAVRRAQTAS-SIEVGVGEPVSSDS-------GDEGPRARPPVQKQASLPVSGSV
       .: .... .. :. . . . . : : ..:.        .    .  : ..     ..:: 
KIAA15 NPKTSFSYEKLQALQETCKENKGVPKQGDNFLSFSAACETDVSSVTPEKEFEETSATGSS
             920       930       940       950       960       970 

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KIAA17 ---AGDFVKKATAFL---QRPSR--------AGS------LGPET----PSRVGMKVPTI
          ..... :   .:   ..::         :::       :::.    : .  .     
KIAA15 MQSGSELLLKEREILTAGKQPSSDSEFSASLAGSGKSVAKTGPESNQCLPHHEEQAYAQT
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KIAA17 SVTSFHSQSSYISSDNDSELEDADIKKELQSLREKHLKEISELQSQQKQEIEALYRRLG-
       . . :.: :: .:::..::.:: :.: ::: :::::..:. .::.::..:.. ::.::  
KIAA15 QSSLFYSPSSPMSSDDESEIEDEDLKVELQRLREKHIQEVVNLQTQQNKELQELYERLRS
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KIAA17 -KPLPPNVGFFHTAPPTGRRRKTSKSKLKAGKLLNPLVRQLKVVASSTGHLADSSRGPPA
        :    .   .   : . :: .. ::::..                              
KIAA15 IKDSKTQSTEIPLPPASPRRPRSFKSKLRSRPQSLTHVDNGIVATDPLCVESNAASCQQS
            1100      1110      1120      1130      1140      1150 

>>KIAA0458  ( 1552 res)   ef01252                         (1552 aa)
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Smith-Waterman score: 559;  25.026% identity (44.317% similar) in 959 aa overlap (591-1509:658-1503)

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KIAA17 GPPVPLQVQVTYHAQAGQPGPPEPEEPEADQHLLPPTLPTSATSLASDSTFDSGQGSTVY
                                     :..  :. :. . . .:::   . .::   
KIAA04 SPLKSNKRQREKVASDTEEADRTSSKKTKTQEISRPNSPSEGEGESSDSRSVNDEGS---
       630       640       650       660       670       680       

              630       640       650       660       670       680
KIAA17 SDSQSSQQSVMLGSLADAAPSPAQCVCSPPVSEGPVLPQSLPSLGAYQQPTAAPGLPVGS
       :: .. .:.    : . . ::: .   .   :    . :. :   : : ::       : 
KIAA04 SDPKDIDQDNR--STSPSIPSPQDNESDSDSSAQQQMLQAQPP--ALQAPT-------GV
          690         700       710       720         730          

              690       700        710         720       730       
KIAA17 VPAPACPPSLQQHFPDPAMS-FAPVLPPPSTPMPT-GPGQP-APPGQQPPPLAQPTPL--
       .:::.  :    ..: :. .  : ..:: ..:  . .:.:: :: .  :    : .:   
KIAA04 TPAPSSAPPGTPQLPTPGPTPSATAVPPQGSPTASQAPNQPQAPTAPVPHTHIQQAPALH
           740       750       760       770       780       790   

         740       750        760       770       780          790 
KIAA17 PQVLAPQPVVPLQPVP-PHLPPYLAPASQVGAPAQLKPLQMPQAPLQPLA-QVPP--QMP
       ::   :.:  : .: : : : :  . :.: .::.. .:    :.:  : . :. :  : :
KIAA04 PQR-PPSPHPPPHPSPHPPLQPLTGSAGQPSAPSHAQPPLHGQGPPGPHSLQAGPLLQHP
            800       810       820       830       840       850  

             800       810       820       830       840       850 
KIAA17 PIPVVPPITPLAGIDGLPPALPDLPTATVPPVPPPQYFSPAVILPSLAAPLPPASPALPL
            ::  :.    ::::         .     :   :::.  :  .  :: .. ::  
KIAA04 G----PP-QPF----GLPPQ--------ASQGQAPLGTSPAAAYPHTSLQLPASQSALQS
                     860               870       880       890     

              860            870       880       890       900     
KIAA17 QAVKLPHP-PGAPLAMPC-----RTIVPNAPATIPLLAVAPPGVAALSIHSAVAQLPGQP
       :     .: : ::::::       : .:. ::  :     :: ... :  :  :.::  :
KIAA04 QQPPREQPLPPAPLAMPHIKPPPTTPIPQLPA--PQAHKHPPHLSGPSPFSMNANLP-PP
         900       910       920         930       940       950   

         910        920       930       940       950       960    
KIAA17 VYPAAFPQMA-PTDVPPSPHHTVQNMRATPPQPALPPQPTLPPQPVLPPQPTLPPQPVLP
         ::  :  .  :  ::: :         ::   .: .  :: .:. ::   :  .  ::
KIAA04 --PALKPLSSLSTHHPPSAH--------PPPLQLMPQSQPLPSSPAQPP--GLTQSQNLP
              960       970               980       990        1000

           970         980       990      1000      1010      1020 
KIAA17 PQP-TRPPQPV--LPPQPMLPPQPVLPPQPALPVRPEPLQPHLPEQAAPAATPGSQILLG
       : : ..::  .  . ::: .  .: .:  :  :. :    :  :  ..: : ::..    
KIAA04 PPPASHPPTGLHQVAPQPPFAQHPFVPGGPP-PITP----PTCPSTSTPPAGPGTSA--Q
             1010      1020      1030           1040      1050     

            1030         1040      1050      1060      1070        
KIAA17 HPAPYAVDVAAQVP---TVPVPPAAVLSPPLPEVLLPAAPELLPQFPSSLATVSASVQSV
        :   :.  ....    . :.: . .    : ..  : .:   :. ::   :: ... : 
KIAA04 PPCSGAAASGGSIAGGSSCPLPTVQIKEEALDDAEEPESPPPPPRSPSPEPTV-VDTPSH
          1060      1070      1080      1090      1100       1110  

     1080      1090      1100      1110      1120      1130        
KIAA17 PTQTATLLPPANPPLPGGPGIASPCPTVQLTVEPVQEEQASQDKPPGLPQSCESYGGSDV
        .:.: .    .       :  : :  ..:   :.   . .. .  .. .. .  . . .
KIAA04 ASQSARFYKHLDR------GYNS-CARTDLYFMPLAGSKLAKKREEAIEKA-KREAEQKA
           1120             1130      1140      1150       1160    

     1140      1150      1160      1170      1180      1190        
KIAA17 TSGKELSDSCEGAFGGGRLEGRAARKHHRRSTRARSRQERASRPRLTILNVCNTGDKMVE
          .:     :      : . : :..  . :. :.  . : : :.:       .:   ..
KIAA04 REEREREKEKEKEREREREREREAERAAKASSSAH--EGRLSDPQL-------SGPGHMR
         1170      1180      1190        1200             1210     

     1200      1210      1220        1230      1240      1250      
KIAA17 CQLETHNHKMVTFKFDLDGDAPD--EIATYMVEHDFILQAERETFIEQMKDVMDKAEDML
        ..:     ...    .  :.:    .. :   :  ...   ..    :   .. .. .:
KIAA04 PSFEPPPTTIAAVPPYIGPDTPALRTLSEYARPH--VMSPTNRNHPFYMP--LNPTDPLL
        1220      1230      1240        1250      1260        1270 

       1260      1270      1280      1290      1300      1310      
KIAA17 SEDTDADRGSDPGTSPPHLSTCGLGTGEESRQSQANAPVYQQNVLHTGKRWFIICPVAE-
       .    .  . ::     .:        .: :. .    . .... .  :  : . :    
KIAA04 AYHMPGLYNVDPTIRERELRE------REIRERE----IRERELRERMKPGFEVKPPELD
            1280      1290                1300      1310      1320 

          1320      1330      1340       1350      1360      1370  
KIAA17 --HPAPEAPESSPPLPLSSLPPEASQDS-APYKDQLSSKEQPSFLASQQLLSQAGPSNPP
         ::: .  :        ..:: :.    : ..  :.  :.       . :. :::.  :
KIAA04 PLHPAANPMEHFARHSALTIPPTAGPHPFASFHPGLNPLER-------ERLALAGPQLRP
            1330      1340      1350      1360             1370    

           1380      1390      1400      1410      1420            
KIAA17 GAPPAPLAPSSPPVTALPQDGAAPATSTMPEPASGTASQAGGPGTPQG--LTSELETSQ-
                : :   :  .  :   .:   .: .        :   :   . :.:.  : 
KIAA04 -------EMSYPDRLAAERIHAERMASLTSDPLARLQMFNVTPHHHQHSHIHSHLHLHQQ
                1380      1390      1400      1410      1420       

     1430      1440      1450      1460      1470             1480 
KIAA17 -PLAETHEAPLAVQPLVVGLAPCTPAPEAASTRDASAPREPLPP---PAP----EPSPHS
        :: .   .:  :.:::    : : .:. :        : : ::   : :     :  : 
KIAA04 DPLHQGSAGP--VHPLV---DPLTAGPHLA--------RFPYPPGTLPNPLLGQPPHEHE
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            1490       1500      1510      1520      1530      1540
KIAA17 GTPQPALGQPAPL-LPAAVGAVSLATSQLPSPPLGPTVPPQPPSALESDGEGPPPRVGFV
          .:..: : :  ::.:.     :. ::                               
KIAA04 MLRHPVFGTPYPRDLPGAIPPPMSAAHQLQAMHAQSAELQRLAMEQQWLHGHPHMHGGHL
         1480      1490      1500      1510      1520      1530    

>>KIAA1471  ( 1421 res)   fj02383s1                       (1421 aa)
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Smith-Waterman score: 541;  29.175% identity (46.833% similar) in 521 aa overlap (677-1184:756-1223)

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KIAA17 CSPPVSEGPVLPQSLPSLGAYQQPTAAPGLPVGSVPAPACP---PSLQQHFPDPAMSFAP
                                     :  ..: :  :    :   .  ::   .  
KIAA14 ALLERTQSTCQAREAARQQLLDRELKKKPPPRPTAPKPLLPRREESEAVEAGDPPEELRS
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KIAA17 VLPPPSTPMPTGPGQPAPP-GQQPPPLAQPTPLPQVLAPQPVVPLQPVPPHLPPYLAPAS
        :::    : .::  :    :.  :    :.:.:.  .: :     :.::    : .: .
KIAA14 -LPPD---MVAGPRLPDTFLGSATPLHFPPSPFPSSTGPGPHYLSGPLPPG--TYSGP-T
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       :.  :    :  :: ::   :  .:   : . .::  .:  :. . :   . :  :.: .
KIAA14 QLIQPRAPGPHAMPVAPGPALYPAPAYTPELGLVPRSSPQHGVVSSPYVGVGPAPPVAGL
      840       850       860       870       880       890        

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KIAA17 PPVPPPQYFSPAVILPSLAAPLPPASPALPLQAVKLPHPPG-APLAMPCRTIVPNAPATI
       : .::::. .:      ::  . ::. .  ..... : :   ::   :    .:  :   
KIAA14 PSAPPPQFSGPE-----LAMAVRPATTT--VDSIQAPIPSHTAPRPNP----TPAPPP--
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KIAA17 PLLAVAPPGVAALSIHSAVAQLPGQPVYPAAFPQMAPTDVPPSPHHTVQNMRATPPQPAL
       : . : ::             ::   .:::.  :  :    :. ::  ... .  : : .
KIAA14 PCFPVPPP-----------QPLPTPYTYPAGAKQ--PI---PAQHHFSSGIPTGFPAPRI
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KIAA17 PPQPTLPPQPVLPPQPTLPPQPVLPPQPTRPPQPVLPPQ-P-MLPPQPVLP--PQPA-LP
        :::   :::   :. .. :::   : : . :. ..::: : .::::   :  :::. : 
KIAA14 GPQPQPHPQP--HPSQAFGPQPPQQPLPLQHPH-LFPPQAPGLLPPQSPYPYAPQPGVLG
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         1000      1010      1020      1030      1040      1050    
KIAA17 VRPEPLQPHLPEQAAPAATPGSQILLGHPAPYAVDVAAQVPTVPVPPAAVLSPPLPEVLL
         : ::. .:    :    :. .  :  :.:         :  : :: :    :  . . 
KIAA14 QPPPPLHTQLYPGPAQDPLPAHSGALPFPSPGP-------PQPPHPPLAYGPAPSTRPMG
       1050      1060      1070             1080      1090         

         1060      1070      1080      1090      1100      1110    
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       : :  :  . ::: .  . : . ::. . .   :.  :.:  :  : : : ..  .  ..
KIAA14 PQAAPLTIRGPSSAGQSTPSPHLVPSPAPS---PGPGPVPPRPPAAEPPPCLRRGAAAAD
    1100      1110      1120         1130      1140      1150      

         1120      1130      1140      1150       1160      1170   
KIAA17 EEQASQDKPPGLPQSCESYGGSDVTSGKELSDSCEGAFGGG-RLEGRAARKHHRRSTRAR
         ..: ..  :  ::    ::. . .  .. :. ::    . ::  :   .: .:  :  
KIAA14 LLSSSPESQHGGTQS--PGGGQPLLQPTKV-DAAEGRRPQALRLIERDPYEHPER-LRQL
       1160      1170        1180       1190      1200       1210  

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KIAA17 SRQERASRPRLTILNVCNTGDKMVECQLETHNHKMVTFKFDLDGDAPDEIATYMVEHDFI
       ... .: : .:                                                 
KIAA14 QQELEAFRGQLGDVGALDTVWRELQDAQEHDARGRSIAIARCYSLKNRHQDVMPYDSNRV
           1220      1230      1240      1250      1260      1270  

>>KIAA0309  ( 3053 res)   hg00096s1                       (3053 aa)
 initn: 270 init1: 128 opt: 480  Z-score: 173.9  bits: 46.4 E(): 0.00014
Smith-Waterman score: 582;  23.532% identity (45.922% similar) in 1925 aa overlap (555-2213:1205-3045)

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KIAA17 KSIRDRVALIQWRRERIWPALQPKEQQDVGSPDKARGPP--VPLQVQVTYHAQAGQPGP-
                                     ::. . . :  .:: ..   :. .. ::: 
KIAA03 RLPTPTLGTARAPMPTPTLVRPLLKLVHSPSPEVSASAPGAAPLTISSPLHVPSSLPGPA
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KIAA17 --PEP---EEPEAD----------QHLLPPTLPTSATSLASDS-TFDSGQGSTVYSDSQS
         : :     : :.          .  :: ..::.  . ::   :.  .   :: ... .
KIAA03 SSPMPIPNSSPLASPVSSTVSVPLSSSLPISVPTTLPAPASAPLTIPISAPLTVSASGPA
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KIAA17 SQQSVM--LGSLADAAPSP---AQCVCSPPVSEGPVLPQSLPSLGAYQQP----------
          ::   :. .. :::.:   :    :: .:   .   . :::.. : :          
KIAA03 LLTSVTPPLAPVVPAAPGPPSLAPSGASPSASALTLGLATAPSLSSSQTPGHPLLLAPTS
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KIAA17 TAAPGLPVGSVPAPACPPSLQQHFPDPAMSFAPVLPPPSTPMPTGPGQPAPPGQQPPPLA
       . .:::  .:. :::: : :      :: ..:  .:   .: :.  .  :: ..    ::
KIAA03 SHVPGL--NSTVAPACSPVLV-----PASALASPFPSAPNPAPAQASLLAPASSASQALA
         1360        1370           1380      1390      1400       

                   740       750        760          770       780 
KIAA17 QP-TPL--PQ--VLAPQPVVPLQPVPPHLP-PYLAP---ASQVGAPAQLKPLQMPQAPLQ
        : .:.  ::  .:::.:. :: :.:   : :  ::   .::. .:. . : . : . : 
KIAA03 TPLAPMAAPQTAILAPSPAPPLAPLPVLAPSPGAAPVLASSQTPVPV-MAPSSTPGTSLA
      1410      1420      1430      1440      1450       1460      

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KIAA17 PLAQVPPQMP-----------PIPVVPPITPLAGID--GLPPAL-PDL----PTATV---
         . ::   :           : ::  :.   :. .  .: ::: : :    :. :.   
KIAA03 SASPVPAPTPVLAPSSTQTMLPAPVPSPLPSPASTQTLALAPALAPTLGGSSPSQTLSLG
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KIAA17 ---PPVP-PPQYFS--PA---VILPSLAAPLPPASPALPLQAVKL-PHPPGAPLA----M
          :  : : : .:  ::   :  :. .  : :. :  : :...: : :: :: .     
KIAA03 TGNPQGPFPTQTLSLTPASSLVPTPAQTLSLAPGPPLGPTQTLSLAPAPPLAPASPVGPA
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KIAA17 PCRTIVPNAPATIPLLAVAPPGVAALSIHSAVAQLPGQPVYPAAFPQMA--PTDVPPSPH
       : .:..  :::.     .:: .: .:..  :    :   . :::   .:  :...  :: 
KIAA03 PAHTLTL-APASSSASLLAPASVQTLTLSPA----PVPTLGPAAAQTLALAPASTQ-SPA
       1590       1600      1610          1620      1630       1640

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KIAA17 HTVQNMRATPPQPALPPQPTLPPQPVLPPQPTLPPQPVLPPQPTRPPQPVLPPQPMLPPQ
         .... ..    :  :   .   ::   .:        ::.:         :.:   : 
KIAA03 SQASSLVVSASGAAPLPVTMVSRLPVSKDEPDTLTLRSGPPSPPSTATSFGGPRPRRQP-
             1650      1660      1670      1680      1690          

          990      1000      1010      1020         1030      1040 
KIAA17 PVLPPQPALPVRPEPLQPHLPEQAAPAATPGSQILLGHPA--P-YAVDVAAQVPTVPVPP
          :: :  :   . :. .  .: .       :.  .: :  : :...:  .  :.: : 
KIAA03 ---PPPPRSPFYLDSLEEKRKRQRSERLERIFQLSEAHGALAPVYGTEVL-DFCTLPQPV
       1700      1710      1720      1730      1740       1750     

            1050      1060      1070      1080            1090     
KIAA17 AAVLSPPLPEVLLPAAPELLPQFPSSLATVSASVQSVPTQTATL------LPPANPPLPG
       :. ..:  :    :. : .     ..  .:    : .   .  .      .::.. : : 
KIAA03 ASPIGPRSPG---PSHPTFWTYTEAAHRAVLFPQQRLDQLSEIIERFIFVMPPVEAP-PP
        1760         1770      1780      1790      1800       1810 

        1100      1110      1120         1130      1140      1150  
KIAA17 GPGIASPCPTVQLTVEPVQEEQASQDKPPGLPQS---CESYGGSDVTSGKELSDSCEGAF
       .     : : .       ::. ::.  : . :     :.    ..  . . .. .: : .
KIAA03 SLHACHPPPWLAPRQAAFQEQLASELWPRARPLHRIVCNMR--TQFPDLRLIQYDC-GKL
            1820      1830      1840      1850        1860         

                                    1160           1170            
KIAA17 G------------GGR-------------LEGRAARKHHRR-----STRARSRQ---ERA
                    : :             ::   . . :       :::...::   :: 
KIAA03 QTLAVLLRQLKAEGHRVLIFTQMTRMLDVLEQFLTYHGHLYLRLDGSTRVEQRQALMERF
     1870      1880      1890      1900      1910      1920        

    1180      1190      1200      1210          1220               
KIAA17 SRPRLTILNVCNTGDKMVECQLETHNHKMVTFKFD----LDGDAPDE-------------
       .  .  .  . .: .  :  .: :    .: .  :    .:..: :.             
KIAA03 NADKRIFCFILSTRSGGVGVNL-TGADTVVFYDSDWNPTMDAQAQDRCHRIGQTRDVHIY
     1930      1940      1950       1960      1970      1980       

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KIAA17 --IATYMVEHDFILQAERETFIEQM-------------KDVMDKAEDM-LSEDTDADRGS
         :.   ::.... .:... .. .:             .... .  :: : : ....  :
KIAA03 RLISERTVEENILKKANQKRMLGDMAIEGGNFTTAYFKQQTIRELFDMPLEEPSSSSVPS
      1990      2000      2010      2020      2030      2040       

              1270      1280      1290      1300      1310         
KIAA17 DP-------GTSPPHLSTCGLGTGEESRQSQANAPVYQQNVLHTGKRWFIICPVAEHPAP
        :       ...  :.   .:  .:. .. .: . .  ..: . ..    .      :: 
KIAA03 APEEEEETVASKQTHILEQALCRAEDEEDIRAATQAKAEQVAELAE----FNENDGFPAG
      2050      2060      2070      2080      2090          2100   

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KIAA17 EAPESSPPLPLSSLPPEASQDSAPYKDQLSSKEQPS--FL------ASQQLLSQAGPSNP
       :. :.. :   .    .: :. :   .::.  :. .  ::      .:.. :.::   . 
KIAA03 EGEEAGRPGAEDEEMSRAEQEIAALVEQLTPIERYAMKFLEASLEEVSREELKQA--EEQ
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KIAA17 PGAPPAPLAPSSPPVTALPQDGAAPATSTMPEPASGTASQAG-GPGTPQGLTSELETSQP
         :    :  ..  :  :::.           :..:  :. : : :: .   .     .:
KIAA03 VEAARKDLDQAKEEVFRLPQEEEEG-------PGAGDESSCGTGGGTHRRSKKAKAPERP
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KIAA17 LAETHEAPLAVQPLVVGLAPCTPAPEAASTRDASAP------REPLPPPAPEPSPHSGT-
        ... :   ...  . : :  ::.  : .::....:      :: .: :::.: :  .. 
KIAA03 GTRVSERLRGARAETQG-ANHTPVISAHQTRSTTTPPRCSPARERVPRPAPRPRPTPASA
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KIAA17 PQ--PALGQPAPL-LPAAVGAVS----LATSQLPSPPLGPTVPP-------QPPSALESD
       :   :::  :.:.  :. ..: .    : .  :::::    .::        ::.     
KIAA03 PAAIPAL-VPVPVSAPVPISAPNPITILPVHILPSPPPPSQIPPCSSPACTPPPACTPPP
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KIAA17 GEGPPPRVGFVDSTIKSLDEKLRTLLYQEHVPTSSASAGTPVEVGDR-DFTLEPLRGDQP
       .. :::    ... . . .  :  ::    :: :.. .. :.  : : .  :      .:
KIAA03 AHTPPP----AQTCLVTPSSPL--LLGPPSVPISASVTNLPL--GLRPEAELCAQALASP
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       .: :. .      ..:.: : ::. .   :..  :. ::.  :.:.  .. .: :.  . 
KIAA03 ESLELASVASSETSSLSLVP-PKDLLPVAVEI-LPVSEKNLSLTPSAPSLTLEAGSIPNG
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         . .: :  :       .:...   .:.:.   . ::. .: : . .: ... :...  
KIAA03 QEQEAPDSAEGTTLTVLPEGEELPLCVSESNGLELPPSAASDEP-LQEPLEADRTSEELT
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KIAA17 EAGESSAEPP-PSDMGTVGGQASHPQTLGARALGSPR----KRPEQQDVSSPAKTVGRFS
       ::   .. :  :...  : .... :.: .. : .::.     :: .. .:. ..  :. .
KIAA03 EAKTPTSSPEKPQEL--VTAEVAAPST-SSSATSSPEGPSPARPPRRRTSADVEIRGQGT
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           :      .:. ::      : . :     . .:. :: :   .::..  ::.:  .
KIAA03 GRPGQPP----GPKVLRKLPGRLVTVVE-----EKELVRRRRQQRGAASTLVPGVSETSA
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KIAA03 SPGSPSVRSMSGPESSPPIGGPCEAAPSSSLPTPPQQPFIA--RRHIELGVTGGGSPENG
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KIAA17 GMKVPTISVTSFHSQSSYISSDNDSELEDADIKKELQSLREKHLKEISELQSQQKQEIEA
          . .:.  . . . .   . : :    ::  . ..    . ::  ..  ..     :.
KIAA03 DGALLAITPPAVKRRRGRPPKKNRS---PADAGRGVDEAPSSTLKGKTN-GADPVPGPET
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       :   .. : : :..  :    .: :. :     .   :  .   : .:.: .  . ::.:
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KIAA03 DGNSESRTQPPPHPSPLTPLPPLLVCPTATVANTVTTVTISTSPPKRKRGRPPKNPPSPR
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        :    :. :  : : : : : :    ::: .    ..:     ..:.: .:.    . .
KIAA03 PSQLPVLDRDSTSVLESCGLGRRRQPQGQGESEGSSSDE-----DGSRPLTRLARLRLEA
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KIAA17 SIWSALKR---LCLGKEHSSRSSTSSLAPGPEPGPQPALHVQAQVNNSNNKKGTFTDDLH
           . :    . ..  ... . ..:   : :  : :.. .  .. ..  . :...  :.
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KIAA17 --KLVDEWTSKTVGAAQLKPTLNQLKQTQKLQDMEAQAGWAAPGEARAMTAPRAGVGMPR
         ::  . ..  ::..   : : .  . :  . . .  : .  .::.:    . : : ::
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         :.:  :  :.  :    :   .: :  :: :::        
KIAA03 RRPGPRRLVGTTNQGDQRILRSSAPPSLAGP-AVSHRGRKAKT
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       ....:. :.    .: . :   ::    :  : .:  . . ....: ..   :..  :  
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KIAA17 ACPPSLQQHFPDPAMSFAPVLPPPSTPMPTGPGQPAPPGQQPPPL-AQPTPLPQVLAPQ-
       . : . .:  :.:     : ::::  : :  :  : ::   :::: .: .:     ::. 
KIAA16 VTPYTASQ--PSP-----P-LPPPPPPPPPPPPPPPPP---PPPLPSQSAPSAGSAAPMF
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KIAA17 ----PVVPLQPVPPHLPPYLAPASQVGAPAQLKPLQMPQAPLQPLAQVPPQMPPIPVVPP
            .. :: .  :    . : .    :.. .    ::  . : . :::  :: :  ::
KIAA16 VKYSTITRLQNASQHSGALFKPPTP---PVMQSQSVKPQILVPPNGVVPPP-PPPP--PP
              660       670          680       690        700      

      800       810         820       830       840       850      
KIAA17 ITPLAGIDGLPPA--LPDLPTATVPPVPPPQYFSPAVILPSLAAPLPPASPALPLQAVKL
        :: ...  : ::   :.::  ..::  ::  .  .  . ..: : ::  : .:      
KIAA16 PTPGSAMAQLKPAPCAPSLPQFSAPP--PPLKIHQVQHITQVAPPTPPPPPPIP-----A
          710       720       730         740       750            

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KIAA17 PHPPGAPLAMPCRTI-VPNAPATI-PLLAVAPPGVAALSIHSAVAQLPGQPVYPAAF---
       : :: ::   :  :: .:..  :. :... : : . .  .  :      ::..::..   
KIAA16 PLPPQAP-PKPLVTIPAPTSTKTVAPVVTQAAPPTPTPPVPPA----KKQPAFPASYIPP
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KIAA17 -PQMAPTDVPPSPHHTVQNMRATPPQPALPPQPTLPPQPV--LPPQPTLPP----QPVLP
        :   :. :::      :.. : ::   : : :..  : .  .:: :: ::    ::. :
KIAA16 SPPTPPVPVPPPTLPKQQSFCAKPPPSPLSPVPSVVKQIASQFPPPPT-PPAMESQPLKP
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KIAA17 -PQ---PTRPP--------QPV-LP-PQPMLPPQP-----VLPPQPALPVRPEPLQPHLP
        :    :  ::        ::  .: :.: .:: :     :.:: :  :: : :  :  :
KIAA16 VPANVAPQSPPAVKAKPKWQPSSIPVPSPDFPPPPPESSLVFPPPPPSPV-PAP-PPPPP
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KIAA17 EQAAPAATPGSQILLGHPAPYAVDVAAQVPTVPVPPAAVLSPPLPEVLLPAAPELLPQFP
         :.:  :: ..   : :.  .  ...     : ::.   .  .        ::  :. :
KIAA16 PTASP--TPDKS---GSPGKKTSKTSSPGGKKP-PPTPQRNSSIKSSSGAEHPE--PKRP
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KIAA17 SSLATVSA---SVQSVPTQTATLLPPANPPLPGGPGIASPCPTVQLTVEPVQEEQASQDK
       :  . ::     ..:   .  :: ::: :: ::                           
KIAA16 SVDSLVSKFTPPAESGSPSKETLPPPAAPPKPGKLNLSGVNLPGVLQQGCVSAKAPVLSG
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KIAA17 PPGLPQSCESYGGSDVTSGKELSDSCEGAFGGGRLEGRAARKHHRRSTRARSRQERASRP
                                                                   
KIAA16 RGKDSVVEFPSPPSDSDFPPPPPETDLPLPPIEIPAVFSGNTSPKVAVVNPQPQQWSKMS
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KIAA17 VALIQWRRERIWPALQPKEQQDVGSPDKARGPPV---PLQVQVTYHAQAGQPGPPEPEEP
                                     :::    : .:  :   ..: ::   :: :
KIAA18 ATLYRSMETTCSHSSPGEGASPQMFHTVSPGPPSARPPCRVPPTTPLNGG-PGSLPPEPP
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KIAA17 EADQHLLPPTLPTSATSLASDSTFDSGQGSTVYSDSQSSQQSVMLGSLADAAPSPAQCVC
        ..: .  :::       .  . :    .. : : ..:: . .  :.    :::::    
KIAA18 SVSQAF--PTLA------GPGGLFPPRLADPVPSGGSSSPRFLPRGN----APSPAP---
             140             150       160       170               

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KIAA17 SPPVSEGPVLPQSLPSL--GAYQQPTAAPGLPVGSVPAP---ACPPSLQQHFP-DPAMSF
        ::    :..  . ::   ::  . . .:.  .:: :::   . :::    :  . :.. 
KIAA18 PPP----PAISLNAPSYNWGAALRSSLVPS-DLGSPPAPHASSSPPSDPPLFHCSDALTP
      180           190       200        210       220       230   

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KIAA17 APVLPPPSTPMPTGPGQPAPPGQQPPPLAQPTPLPQVLAPQPVVPLQPVPPHLPPYLAPA
        :.  :::. .:. ::    :..:::  .    :: ::.:   .:     :  ::.:: .
KIAA18 PPL--PPSNNLPAHPG----PASQPPVSSATMHLPLVLGPLGGAPTVE-GPGAPPFLASS
             240           250       260       270        280      

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KIAA17 S-QVGAPAQLKPLQMPQAPLQ---PLAQVPPQMPPIPVVP----PITPLAGIDGLPPALP
         ...: ::  ::  : . ::   : ::.:       . :    :  : . .  :    :
KIAA18 LLSAAAKAQHPPLP-PPSTLQGRRPRAQAPSASHSSSLRPSQRRPRRPPTVFRLLEGRGP
        290       300        310       320       330       340     

           820         830               840            850        
KIAA17 DLPTATVP--PVPPPQYFS---PAV-ILPS----LAAPLPPASPA-----LPLQAVKLPH
       . :  . :  :.: :: ::   :.  ::::    :. : :  : .     :  . ..:: 
KIAA18 QTPRRSRPRAPAPVPQPFSLPEPSQPILPSVLSLLGLPTPGPSHSDGSFNLLGSDAHLPP
         350       360       370       380       390       400     

      860           870              880       890        900      
KIAA17 PP----GAPLAMPCRTIVPNAPAT-------IPLLAVAPPGVA-ALSIHSAVAQLP----
       ::    :.:  .: . : :. :.:       .:  : :::... :  . : : : :    
KIAA18 PPTLSSGSP-PQPRHPIQPSLPGTTSGSLSSVPG-APAPPAASKAPVVPSPVLQSPSEGL
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            910         920               930       940       950  
KIAA17 GQPVYPAA-FPQMAPTDV-P-PSPHHTVQ-------NMRATPPQPALPPQPTLPPQPVL-
       :. . ::  .: .:  .. : :::.. .        .: .. : :    ::  ::.:.: 
KIAA18 GMGAGPACPLPPLAGGEAFPFPSPEQGLALSGAGFPGMLGALPLPLSLGQP--PPSPLLN
           470       480       490       500       510         520 

                           960         970       980         990   
KIAA17 --------------PPQPTLPPQ--PVLPPQPTRPPQPVLPPQPMLPPQP--VLPPQPAL
                     ::.: :::   :  :  : .:  : :    .::: :  .:::  : 
KIAA18 HSLFGVLTGGGGQPPPEPLLPPPGGPGPPLAPGEPEGPSLLVASLLPPPPSDLLPPPSAP
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          1000       1010      1020      1030      1040      1050  
KIAA17 PVRPEPLQPHLPEQA-APAATPGSQILLGHPAPYAVDVAAQVPTVPVPPAAVLSPPLPEV
       :   . :   ::  : .:.:  :     :  .: .   ..     :.     : :::   
KIAA18 P--SNLLASFLPLLALGPTAGDGEGSAEGAGGPSGEPFSGLGDLSPL-----LFPPL---
               590       600       610       620            630    

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KIAA17 LLPAAPELLPQFPSSLATVSASVQS-VPTQTATLLPPANPPLPGGPGIASPCPTVQLTVE
          .::  :  . :.: ... .  : .: :  .:    . : :: :  .    :..  . 
KIAA18 ---SAPPTLIALNSALLAATLDPPSGTPPQPCVL----SAPQPGPPTSSVTTATTDPGAS
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KIAA17 PVQEEQASQDKPPGLPQSCESYGGSDVTSGKELSDSCEGAFGGGRLEGRAARKHHRRSTR
        . .  ... .:: :                                             
KIAA18 SLGKAPSNSGRPPQLLSPLLGASLLGDLSSLTSSPGALPSLLQPPGPLLSGQLGLQLLPG
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>>KIAA1142  ( 467 res)   hh05864                          (467 aa)
 initn: 106 init1:  69 opt: 397  Z-score: 156.5  bits: 40.5 E(): 0.0013
Smith-Waterman score: 397;  28.118% identity (55.556% similar) in 441 aa overlap (31-450:27-450)

               10        20        30        40        50        60
KIAA17 GRRDVPGTLMEPGRGAGPAGMAEPRAKAARPGPQRFLRRSVVESDQEEPPGLEAAEAPGP
                                     :: .   :.. :: .   : ..:     : 
KIAA11     PEAPRGVVTCLRALLSHQHQTRPHRVPGTMFGKRKKRVEISA--PSNFEHRVHTGF
                   10        20        30        40          50    

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KIAA17 QPPQPLQRRVLLLCKTRRLIAERARGRPAAPA-PAALVA-QPGAP-GAPADA---GPEPV
       .  :  :. . :  . . :: : :: ::   . :: ... ::::: : : :.   ::   
KIAA11 D--QHEQKFTGLPRQWQSLIEESAR-RPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAG
             60        70         80        90       100       110 

          120       130            140       150        160        
KIAA17 GTQEPGPDPIAAAVET----APAPDG-GPREEAAATVRKEDEGAAEAKP-EPG-RTRRDE
       :   :  .  ..   :    ::.:   ::.      .      :: : :  :: :. . :
KIAA11 GLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQLAPPACTPAAPAVPGPPGPRSPQRE
             120       130       140       150       160       170 

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KIAA17 PEE--EEDDEDDLKAVATSLDGR-FLKFDIELGRGSFKTVYKGLDTETWVEVAWCELQDR
       :..  .:. .  :. :.   : : .:   :..:.::   :  .    .   ::  ... :
KIAA11 PQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLR
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       :  .  :. . .:. ...  :: :.:..:.   :   : . . .: :.. .:.:   . .
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KIAA17 FKVMKPKVLRSWCRQILKGLLFLHTRTPPIIHRDLKCDNIFITGPTGSVKIGDLGLATL-
        . :. . . . :  .:..:  ::..   .::::.: :.:..:   : ::..:.:. .  
KIAA11 TR-MNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQG--VIHRDIKSDSILLTHD-GRVKLSDFGFCAQV
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KIAA17 -KRASFAKSVIGTPEFMAPEMYEE-HYDESVDVYAFGMCMLEMATSEYPYSECQNAAQIY
        :..   ::..::: .::::.  .  :   ::....:. ..::. .: :: . .   . .
KIAA11 SKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFN-EPPLKAM
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KIAA17 RKVTCGIKP--ASFEKVHDPEIKEIIGECICKNKEERYEIKDLLSHAFFAEDTGVRVELA
       . .  .. :   ...:: .: .: .. . . ..  .:    .::.: :.:.         
KIAA11 KMIRDNLPPRLKNLHKV-SPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVP
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KIAA17 EEDHGRKSTIALRLWVEDPKKLKGKPKDNGAIEFTFDLEKETPDEVAQEMIESGFFHESD
                                                                   
KIAA11 LMRQNRTR                                                    
     460                                                           




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 Scomplib [34.26]
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