# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh19225mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1757.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1757, 1409 aa vs ./tmplib.25089 library 1986096 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.5227+/-0.00763; mu= -26.7462+/- 0.515 mean_var=370.9122+/-90.531, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 24 in 1/39 Lambda= 0.066595 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 264 40.4 0.0057 KIAA1203 ( 727 res) fg03361 ( 727) 244 38.3 0.0064 >>KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800 aa) initn: 206 init1: 93 opt: 264 Z-score: 145.2 bits: 40.4 E(): 0.0057 Smith-Waterman score: 329; 21.886% identity (48.260% similar) in 1092 aa overlap (400-1409:103-1154) 370 380 390 400 410 420 KIAA17 ACHKGNRNCPIQKRNPNATELPLLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELEMEQQNEASEENN : : . :.:... . ::.: : ::.. 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