# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pj01380s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1743.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1743, 1036 aa vs ./tmplib.25089 library 1986469 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.8069+/-0.0119; mu= -32.4981+/- 0.806 mean_var=599.5693+/-145.156, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 12 in 2/38 Lambda= 0.052379 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1938 ( 1376 res) hg00912s1 (1376) 1727 146.1 2.9e-35 >>KIAA1938 ( 1376 res) hg00912s1 (1376 aa) initn: 2969 init1: 1706 opt: 1727 Z-score: 724.9 bits: 146.1 E(): 2.9e-35 Smith-Waterman score: 3378; 49.957% identity (72.246% similar) in 1153 aa overlap (1-1027:207-1345) 10 20 30 KIAA17 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEE : .:::.:::::::::::.:::.:...:. 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