# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh23254.fasta.nr -Q ../query/KIAA1741.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1741, 1777 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7804452 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8191+/-0.00021; mu= 9.3413+/- 0.012 mean_var=161.6276+/-30.893, 0's: 35 Z-trim: 95 B-trim: 142 in 1/66 Lambda= 0.100883 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119594137|gb|EAW73731.1| tankyrase 1 binding pr (1729) 11842 1737.1 0 gi|116242814|sp|Q9C0C2.3|TB182_HUMAN RecName: Full (1729) 11839 1736.7 0 gi|20198487|gb|AAM15531.1|AF441771_1 182kDa tankyr (1729) 11800 1731.0 0 gi|109106257|ref|XP_001093186.1| PREDICTED: tankyr (1852) 11678 1713.3 0 gi|73982651|ref|XP_540615.2| PREDICTED: similar to (1748) 8791 1293.1 0 gi|150387848|sp|P58871.2|TB182_MOUSE RecName: Full (1720) 7552 1112.8 0 gi|193785436|dbj|BAG54589.1| unnamed protein produ (1075) 7368 1085.8 0 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gi|149022439|gb|EDL79333.1| rCG27170 [Rattus norve ( 111) 649 106.8 1.1e-20 gi|118091427|ref|XP_421067.2| PREDICTED: hypotheti (1194) 516 88.6 3.6e-14 gi|220977246|gb|EED95573.1| predicted protein [Tha (4505) 479 83.8 3.8e-12 gi|41400384|gb|AAS07044.1| plus agglutinin [Chlamy (3409) 443 78.4 1.2e-10 gi|158109452|gb|ABW11649.1| hypothetical protein F (1085) 404 72.2 2.8e-09 gi|70873262|gb|EAN87106.1| trans-sialidase, putati (1446) 398 71.5 6.1e-09 gi|222616370|gb|EEE52502.1| hypothetical protein O (1360) 395 71.0 8e-09 gi|113645619|dbj|BAF28760.1| Os11g0657400 [Oryza s (1399) 395 71.0 8.1e-09 gi|27372319|dbj|BAC53724.1| Piccolo [Mus musculus] (4969) 398 72.0 1.4e-08 gi|27372317|dbj|BAC53723.1| Piccolo [Mus musculus] (5165) 398 72.0 1.5e-08 gi|60678627|gb|AAX33674.1| plus agglutinin [Chlamy (2371) 391 70.7 1.8e-08 gi|31414574|dbj|BAC58076.2| large tegument protein (3326) 393 71.1 1.8e-08 gi|57472005|gb|AAW51128.1| minus agglutinin [Chlam (4027) 386 70.2 4.2e-08 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very large tegument pro (3288) 364 66.9 3.3e-07 gi|1572721|gb|AAB09089.1| megakaryocyte stimulatin (1404) 357 65.5 3.8e-07 gi|211591430|emb|CAP97660.1| Pc22g03720 [Penicilli (1373) 356 65.3 4.1e-07 gi|198131579|gb|EDY67890.1| GA27145 [Drosophila ps ( 875) 352 64.5 4.5e-07 >>gi|119594137|gb|EAW73731.1| tankyrase 1 binding protei (1729 aa) initn: 11842 init1: 11842 opt: 11842 Z-score: 9317.3 bits: 1737.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 11842; 100.000% identity (100.000% similar) in 1729 aa overlap (49-1777:1-1729) 20 30 40 50 60 70 KIAA17 AEPDPGRARLQPPQLIPLCLPALKEGLPHVMKVSTLRESSAMASPLPREMEEELVPTGSE :::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 MKVSTLRESSAMASPLPREMEEELVPTGSE 10 20 30 80 90 100 110 120 130 KIAA17 PGDTRAKPPVKPKPRALPAKPALPAKPSLLVPVGPRPPRGPLAELPSARKMNMLAGPQPY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 PGDTRAKPPVKPKPRALPAKPALPAKPSLLVPVGPRPPRGPLAELPSARKMNMLAGPQPY 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 KIAA17 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