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FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1739, 963 aa
 vs ./tmplib.25089 library

1986542 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7265+/-0.00706; mu= -3.4936+/- 0.474
 mean_var=228.0783+/-54.293, 0's: 0 Z-trim: 12  B-trim: 5 in 1/39
 Lambda= 0.084924

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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KIAA1869  ( 935 res)   hh01800                     ( 935)  686 97.8 6.8e-21
KIAA1479  ( 1022 res)   fh17949                    (1022)  649 93.3 1.7e-19
KIAA1368  ( 1049 res)   fj03125                    (1049)  648 93.2 1.9e-19
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>>KIAA1619  ( 869 res)   fj14720                          (869 aa)
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KIAA17 FQKCPLLPIRGFGWHLLVAWGAGSRGARLRAVEPQGSCPSAAMLTPAELATVVRRFSQTG
       .   :::        .:.: .. . . : :  .   . :   :  : :  . .:.:.  .
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                       40        50         60          70         

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KIAA17 IQDFLTLTLTEPTGLLYVGAREALFAFSMEALELQGA---ISWEAPVEKKTECIQKGKNN
        :.. :: : : .. : :::: :::..: . .  .::   : :::  : ...: ::::::
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KIAA17 QTECFNFIRFLQPYNASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKG
       :::::: .::::  :..:::.:::.:::: :. ..  .:::  . ::.:: :::::::.:
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KIAA17 HAGLLVDGELYSATLNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKTEYLAF-WLNEPHFVGSAYVPESV
        .::..:: ::.::  .: .  : : :.  :: :..::   . :::. .:: :. : :: 
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KIAA17 GSFTGDDDKVYFFFRERAVE------SDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFL
       .: .:::::::.:: :::.:      ..  . . :::::::::::.:: . ::.:::.::
KIAA16 ASAVGDDDKVYYFFTERATEEGSGSFTQSRSSHRVARVARVCKGDLGGKKILQKKWTSFL
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KIAA17 KARLACSAPNWQLYFNQLQAMHTLQDTSWHNTTFFGVF--QAQWGDMYLSAICEYQLEEI
       :::: :  :     .. :... .:.  .   : :...:  ..::  .  ::::.:.: ::
KIAA16 KARLICHIP----LYETLRGVCSLDAETSSRTHFYAAFTLSTQWKTLEASAICRYDLAEI
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KIAA17 QRVFEGPYKEYHEEAQKWDRYTDPVPSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKH
       : :: ::: ::.. ...: ::   :: :::::::..  : .::.:: .::. .:.::: :
KIAA16 QAVFAGPYMEYQDGSRRWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLRSQGYNSSQDLPSLVLDFVKLH
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       ::: . : :  .::::.:..  .:::..  ::   : :: .::.::.:::. ::: ::  
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       .:.::: :.: ... ...::.:  .. :..:. : ..:::...: .:::: ::.::::::
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KIAA17 CAWSVNTSRCVA---VGGHS-GS--LLIQHVMTSDTSGICNLRGSKKVRPTP--KNITVV
       :.:. .:  :.:   ....: ::   ::: .  .. .  :  ..:. . : :  :. .:.
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KIAA17 AGTDLVLPCHLSSNLAHARWTFGGR-DLPAEQPGSFLYDARLQALVVMAAQPRHAGAYHC
        : :..:::   ::::.: : ..:   :   : :   : . ...:.:  :::.:.: : :
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KIAA17 FSEEQGARLAAEGYLVAVV-AGPSVTLEARA-PLENLG-----LVWLAVVALGAVCLVL-
       ..::.: :    .: ..:  : :. . .: : :  .:.     :  ::..:::..::.: 
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KIAA17 --LLLVLSLR--RRLREELEKGAKATERTLVYPLELPKEPTSPPFRPCP-EPDEKLWDPV
         :: :  ::  :: :..  . ..:. :.    ..:  . .:     :: : ::   :  
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KIAA17 GYYYSDGS-LKIVPGHARCQPGGGPPSPPPG-IPGQPLPSPTRLHLGGGRNSNANGYVRL
       :    .:: :.:.::..   :   :: :::. . .  .  :.::     :  :.:.:: :
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KIAA17 QLGGEDRGGLGHPLPELADELRRKLQQRQPLPDSNPEESSV 
       .   .. .:.      .:.:: : :..:.             
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KIAA17 IQDFLTLTLTEPTGLLYVGAREALFAFSMEALELQGA----ISWEAPVEKKTECIQKGKN
       :... .: :..    :::::::::::.: .   : :.    . : : .::: .:  :::.
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        : .: :.:..: : ..:::..::: ::.: :::.:: .::: . :     .:::::.::
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       :.: :: :.  . :: :: . ::. .  .:..: :.::: .::  :    ::.: . ...
KIAA17 AQLLCSRPDDGFPFNVLQDVFTLSPSPQDWRDTLFYGVFTSQWHRGTTEGSAVCVFTMKD
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KIAA17 IQRVFEGPYKEYHEEAQKWDRYTDPVPSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKK
       .:::: : ::: ..:.:.:   : :::.::::.::.:  :..  .:::.::: .:::.: 
KIAA17 VQRVFSGLYKEVNRETQQWYTVTHPVPTPRPGACITNSARERKINSSLQLPDRVLNFLKD
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       : ::. ::  : :: ::..  . . .... :: ::   :: :::.::::: : ::::.::
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        ::.:::::.:.. .:...:.:.  . ::.:.:.: .::.:.:.:  ::::.::.:::::
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           .:  .: : : ::::   :  .:  . :      :  . :  :.: . :    : .
KIAA17 QFQPNTVNTLACPLLSNLATRLWLRNGAPVNASASCHVLPTGDL--LLVGTQQ---LGEF
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KIAA17 HCFSEEQGARLAAEGYLVAVVA---------GPSV-----TLEARAPL---ENLGL---V
       .:.: :.: .  . .:   ::          : ::     : .. ::     . :     
KIAA17 QCWSLEEGFQQLVASYCPEVVEDGVADQTDEGGSVPVIISTSRVSAPAGGKASWGADRSY
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KIAA17 W-----LAVVALGAVCLVLLLLVLSLRRRLREELEKGAKATERTLVYPLELPKEPTSPPF
       :     . .. . :: : .:.:.   :  ..  :..:  :. .  . :. ::  : . :.
KIAA17 WKEFLVMCTLFVLAVLLPVLFLLYRHRNSMKVFLKQGECASVHPKTCPVVLP--PETRPL
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KIAA17 RPCPEPDEKLWDPVGYYYSDGSLKIVPGHARCQPGGGPPSPPPGIPGQPLPSPTRLHLGG
            :.  : :  ::                                            
KIAA17 NGLGPPSTPL-DHRGYQSLSDSPPGSRVFTESEKRPLSIQDSFVEVSPVCPRPRVRLGSE
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KIAA17 ARLRAVEPQGSCPSAAMLTPAELATVVRRFSQTGIQDFLTLTLTEPTGLLYVGAREALFA
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KIAA03 TGGHTADTTHPRLRLSHKELLNLNRTSIFHSPFGFLDLHTMLLDEYQERLFVGGRDLVYS
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KIAA17 FSMEAL-ELQGAISWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIRFLQPYNASHLYVCGTYAFQ
       .:.: . .    : : . . :  :::.:::.   :: :..: :. :: .:: .::: ::.
KIAA03 LSLERISDGYKEIHWPSTALKMEECIMKGKDAG-ECANYVRVLHHYNRTHLLTCGTGAFD
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KIAA17 PKCTYVNML------TFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGELYSATLNNFLGTE
       : :... .        : ::  . : :.:.::.::...  . :. .::...  ... . .
KIAA03 PVCAFIRVGYHLEDPLFHLESPRSERGRGRCPFDPSSSFISTLIGSELFAGLYSDYWSRD
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KIAA17 PIILRNMGPHHSMKTEYL-AFWLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGDDDKVYFFFRERAVESD
         :.:.::    ..::.     :.::.:::: ..:..      ::.:::::: :.:.:..
KIAA03 AAIFRSMGRLAHIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDR---DDNKVYFFFTEKALEAE
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KIAA17 CYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLACSAPNWQ---LYFNQLQAMHTLQ
         :. . .::.:.: .:.:: : :  ::.:::::::.::.:. .    ::..:. .  : 
KIAA03 NNAHAIYTRVGRLCVNDVGGQRILVNKWSTFLKARLVCSVPGMNGIDTYFDELEDVFLLP
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KIAA17 DTSWHNTTFFGVFQAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFEGPYKEYHEEAQKWDRYTDPVPS
         . .: ..::.:..  . .   ::: :..  :. .:.::: . .    .:. :   :: 
KIAA03 TRDHKNPVIFGLFNTTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAHKEGPEYHWSVYEGKVPY
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KIAA17 PRPGSCINNWHR-RHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRPLLVKKGT--NFT
       :::::: .. .  :.: :.  . ::. . :...:::: . . :  ..:.:::     :. 
KIAA03 PRPGSCASKVNGGRYGTTK--DYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAHKKPILVKTDGKYNLK
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KIAA17 HLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVH------LIEELQLF-DQEPMRS
       ....::: . ::  : :::::: .: .::....           ..::::.: :  :. :
KIAA03 QIAVDRVEAEDGQ-YDVLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVILEELQIFKDPVPIIS
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KIAA17 LVLSQSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRS-CADCVLARDPYCAWS-VNTSRCVAVGGH
       . .:.... :. :: : ..:.    :  : : :::: :::::::::. .. ::   .: :
KIAA03 MEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDMYGSACADCCLARDPYCAWDGISCSRYYPTGTH
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KIAA17 SGSLLI-QHVMTSDTSGIC---NLRGSKKVRPTPKNITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARW
       .   .  : :  ....  :   .. :.   .   .    . ... .: :   :  :.. :
KIAA03 AKRRFRRQDVRHGNAAQQCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIENNSTLLECTPRSLQAKVIW
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KIAA17 TFG-GRDLPAEQPGSFLYDARLQ-ALVVMAAQPRHAGAYHCFSEEQGARLAAEGYLVAVV
           ::.   :.  .    .... .:. .  .   ::.: : . :.              
KIAA03 FVQKGRETRKEEVKTDDRVVKMDLGLLFLRLHKSDAGTYFCQTVEHSFVHTVRKITLEVV
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KIAA17 AGPSVTLEARAPLENLGLVWLAVVALGAVCLVLLLLVLSLRRRLREELEKGAKATERTLV
                                                                   
KIAA03 EEEKVEDMFNKDDEEDRHHRMPCPAQSSISQGAKPWYKEFLQLIGYSNFQRVEEYCEKVW
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KIAA17 VEPQGSCPSAAMLTPAELATVVRRFSQTGIQDFLTLTLTEPTGLLYVGAREALFAFSMEA
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KIAA18 LISDLQGTSPLSWFRGLEDDAVAAELGLDFQRFLTLNRT-----LLVAARDHVFSFDLQA
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KIAA17 LEL-QGAI-----SWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIRFLQPYNASHLYVCGTYAFQ
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KIAA18 EEEGEGLVPNKYLTWRS--QDVENCAVRGKLTD-ECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTNSFS
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KIAA17 PKCTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGELYSATLNNFLGTEPIILRN
       : :   .. ..  : ::  .:...::.: ..........: :::::  .: ... .. :.
KIAA18 PVCRSYGITSLQQE-GEELSGQARCPFDATQSNVAIFAEGSLYSATAADFQASDAVVYRS
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KIAA17 MGPHHSMKT-EYLAFWLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGDDDKVYFFFRERAVESDCYAEQV
       .::.  ... .: . :: ::::: .              :.::::::: .::.   ..  
KIAA18 LGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVQALE----------HGDHVYFFFREVSVEDARLGRVQ
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KIAA17 VARVARVCKGDMGGA-RTLQRKWTTFLKARLACSAP-NWQLYFNQLQAMHTLQDTSWHN-
        .::::::: ::::. :.:.:.::.::: :: ::.: .  .::. :::.     .. :. 
KIAA18 FSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPGDSTFYFDVLQAL--TGPVNLHGR
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KIAA17 TTFFGVFQAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFEGPYKEYHEEAQKWDRYT-DPVPSPRPGS
       ...:::: .: ...  ::.: . :.::.: ::: .:: .     :   . : ::::::::
KIAA18 SALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQRSLDGAWTPVSEDRVPSPRPGS
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KIAA17 CINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRPLLVKKGTNFTHLVADRVT
       : .       ..:: .:::..:.:.: :::..  : :   .:::.  .  .   ::  : 
KIAA18 CAGVGGAAL-FSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVTHQPLLTLTSRALLTQVA--VD
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KIAA17 GLDG--ATYTVLFIGTGDGWLLKAV-----SLGPWVHLIEELQLFD----------QEPM
       :. :  .. ::.:.:..:: .::..     : ::   :.::.. ..          :   
KIAA18 GMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSGGPEPILLEEIDAYSPARCSGKRTAQTAR
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       :  .: :.   . ::..  . .: ::.. : .. .:  .:. ..::::.:  ..:: :: 
KIAA18 RIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHGACQRSCLASQDPYCGW--HSSRGCVD
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KIAA17 VGGHSGSLLIQHVMTSDTSGICNLRGSKKVRPTPKNITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARW
       . : .:.                                                     
KIAA18 IRGSGGTDVDQAGNQESMEHGDCQDGATGSQSGPGDSAYGVRRDLPPASASRSVPIPLLL
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KIAA17 EPQGSCPSAAMLTPAELATVVRRFSQTGIQDFLTLTLTEPTGLLYVGAREALFAFSMEAL
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KIAA14 EPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDT--LYIAGRDQVYTVNLNEM
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KIAA17 ELQGAI-----SWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIRFLQPYNASHLYVCGTYAFQPK
           .:     .:..  . . .: .:::. . :: :::. . : :   ..:::: ::.: 
KIAA14 PKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKH-KDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPM
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KIAA17 CTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGELYSATLNNFLGTEPIILRNMG
       : :  . :.  . ::  .: ..::.:  . ...:..::.:::::. .::... .: :.::
KIAA14 CRYYRLSTLEYD-GEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMG
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KIAA17 PHHSMKT-EYLAFWLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGDDDKVYFFFRERAVESDCYAEQVVA
          ...: .: . :..::::. .       :..      ::::::: ::: .  .. : .
KIAA14 DGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAI----EYGNY------VYFFFREIAVEHNNLGKAVYS
          220       230           240             250       260    

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KIAA17 RVARVCKGDMGGA-RTLQRKWTTFLKARLACSAPNWQL-YFNQLQAMHTLQDTSWHNTTF
       ::::.::.::::. :.:...::.:::::: ::.:. .. ::. ::..  . . .    : 
KIAA14 RVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSITDIIQIN-GIPTV
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KIAA17 FGVFQAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFEGPYKEYHEEAQKWDRYT-DPVPSPRPGSCIN
        ::: .: ...  ::.: .....:..::.: .:: .   . :     : ::.:::: :  
KIAA14 VGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCCA-
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KIAA17 NWHRRHG----YTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRPLLVKKGTNF--THLVAD
           .::    : .:...::. :.:.:.::::.  : :  ..: ..:  . .  : . .:
KIAA14 ----KHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAISVD
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KIAA17 RVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAV------SLGPWVHLIEELQLFD--------QEPM
       . .:    .:::.:.:.  : .::..      ::.  : :.::.. ..        .:  
KIAA14 HSAG-PYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSV-LLEEIEAYNHAKCSAENEEDK
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KIAA17 R--SLVLSQSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCA-DCVLARDPYCAWSVNTSRCVAV
       .  :: :..... :...  : ....:.. : .: ::  .:. .:::::.: .. . :   
KIAA14 KVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGW-LSQGSCGRV
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KIAA17 GGHSGSLLIQHVMTSDTSGICNLRGSKKVRPTPKNITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARWT
                                                                   
KIAA14 TPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMNVLIT
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KIAA17 SWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIRFLQPYNASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTL
       .:..       : .:::. . :: :::. :   : . :.:::: ::.:.:   .: :.  
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KIAA17 EHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGELYSATLNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKT-EYL
          :: .: ..::::  .....:..::.:::::...::. . .: :..:   ...: .. 
KIAA13 FGDEF-SGMARCPYDAKHANVALFADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHD
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       . ::.::.:: ..    . :      : .:::::: ::: . ... :  :::.:::.:::
KIAA13 SKWLKEPYFVQAV----DYG------DYIYFFFREIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMG
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KIAA17 GA-RTLQRKWTTFLKARLACSAP-NWQLYFNQLQAMHTLQDTSWHNTTFFGVFQAQWGDM
       :. :.:...::.:::::: ::.: . ..::: :::.  .   . ..... ..:.. ....
KIAA13 GSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQAVTDVIRINGRDVVL-ATFSTPYNSI
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         ::.: :.. .:  :: : .:: .   . :    :  ::.:::: : ..   .. :..:
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KIAA17 LELPDNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRPLLVKKGTNF--THLVADRVTGLDGATYTVLFI
        :.::. :::.: ::::.: :   ..:: ...  . .  :....: ..:    ..::.:.
KIAA13 NEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVRYRLTKIAVDTAAG-PYQNHTVVFL
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KIAA17 GTGDGWLLKAVS-LGPWVHL-----IEELQLFDQEP----------MRSLVLSQSKKLLF
       :.  : .:: .. .:    :     .::......:           . .. :..... :.
KIAA13 GSEKGIILKFLARIGNSGFLNDSLFLEEMSVYNSEKCSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLY
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KIAA17 AGSRSQLVQLPVADCMKYRSCAD-CVLARDPYCAWSVNTSRCVAVGGHSGSLLIQHVMTS
       ..  . ....:.. : .. .:   :. .:::::.:  . . :  .. .:   . : .  .
KIAA13 VAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWIKEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERG
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KIAA17 DTSGICNLRGS-----KKVRPTPKN----ITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARWTFGGRDL
       .:.:. . ..:         : : :     :: . .. .::   .:.             
KIAA13 NTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGHSSSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGM
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KIAA17 PAEQPGSFLYDARLQALVVMAAQPRHAGAYHCFSEEQGARLAAEGYLVAVVAGPSVTLEA
                                                                   
KIAA13 LDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYLKGHDQLVPVTLLAIAVILAFVMGA
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KIAA14 PGPPDTPAQQLRCGWTVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMVLAGP--LAVSLLLP-
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KIAA17 RGFGWHLLVAWGAGSRGARLRAVEPQGSCPSAAMLTPA--ELATVVRRFSQTGIQDFLTL
          .  :::.  ..:. .  .    :  :  .   : :  .:   :  :.  : .::  :
KIAA14 ---SLTLLVSHLSSSQDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQL
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KIAA17 TLTEPTG-LLYVGAREALFAFSMEALELQGAISWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIR
       .: .:.:  : ::::. :: .:.  . :  :  : .  . .  : .:::... :: :..:
KIAA14 AL-DPSGNQLIVGARNYLFRLSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEE-ECQNYVR
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KIAA17 FLQPYNASHLYVCGTYAFQPKCT--YVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVD
        :    . ....::: ::.: ::   :. :. : :.    .: ..::::: .. .... .
KIAA14 VLI-VAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTTEKI---NGVARCPYDPRHNSTAVISS
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KIAA17 -GELYSATLNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKT-EYLAFWLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGD
        ::::.::. .: : .: : :..:    ..: .: . :::::.:: .::   ..: :.  
KIAA14 QGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLNEPNFV-AAY---DIGLFA--
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KIAA17 DDKVYFFFRERAVESDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLACSAPNW-
           :::.:: ::: :: .. : .:::::::.:.::   :.  ::::.:::: :: :.  
KIAA14 ----YFFLRENAVEHDC-GRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEV
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        .:.:.::.   : . .     ..::: .. ...  ::.: ..:  :...:.::..  ..
KIAA14 PFYYNELQSAFHLPEQD----LIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQEN
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           :   ..:.:. . :.  ..   ..    ::.  . ..       :: : : :   .
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       : ... .. :.:::.: : . : . : ::.::: .: .:::.: .   .:   .:::...
KIAA14 PCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKD-TLYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVL
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           .::.::: . .: . ::.: :. ....:.  :  ::: . :. ::::::.:. . .
KIAA14 PPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQ
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       :: ..   :. ::  :..                         . .:.:: :  :. .  
KIAA14 RCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCD
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        : :.     .: : . :  :...   .. :: ...  : . . : . ...: ..    :
KIAA14 SPRPR----CGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCG-IGFQVRQRSCSNPA
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KIAA17 AQPRHAGAYHCFSEEQGARLAAEGYLVAVVAGPSVTLEARAPLENLGLVWLAVVALGAVC
         :::.:   : .. .  :.  :                                     
KIAA14 --PRHGGRI-CVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACENG
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>>KIAA0407  ( 2143 res)   hg01339                         (2143 aa)
 initn: 288 init1: 163 opt: 237  Z-score: 164.9  bits: 43.1 E(): 0.00045
Smith-Waterman score: 315;  24.472% identity (47.950% similar) in 805 aa overlap (175-904:36-784)

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KIAA17 GARLRAVEPQGSCPSAAMLTPAELATVVRRFSQTGIQDFLTLTLTEPT-GLLYVGAREAL
                                     :. .:   .:     .:: : ::.:: . :
KIAA04 QVTMPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTPNGT--YLQHLARDPTSGTLYLGATNFL
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KIAA17 FAFSMEALELQGAISWEAPVEKKTEC---IQKGKNNQTECFNFIRFLQPYNASHLYVCGT
       : .:  .:.:....:  .::  . .:   ..  .  :..  :    :   . . : :::.
KIAA04 FQLS-PGLQLEATVS-TGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQPTNNPNQLLLVSPGALVVCGS
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KIAA17 YAFQPKCTY--VNMLTFTLEHGEFE-DGKGKCPYDPA--------KGHAG--LLVDGELY
        . :  :    ...:   : . :   : .     :::        .: ::  ::  :. :
KIAA04 -VHQGVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQGLAGEPLLFVGRGY
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KIAA17 SATLNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKTEYLAFWLNEPHFVG--SAYVPESVGSFTGDDDKV
       ..  .   :  ::  : . :   . .  ...  .    ::  : :  . :..:.    ..
KIAA04 TSR-GVGGGIPPITTRALWPPDPQAA--FSYEETAKLAVGRLSEYSHHFVSAFA-RGASA
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KIAA17 YFFFRERAVESDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLACSAPNWQLYFN
       ::.: .: ....  : .  : :.:::  :        ... ....  ::: .  . :   
KIAA04 YFLFLRRDLQAQSRAFR--AYVSRVCLRD--------QHYYSYVELPLACEGGRYGLI--
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KIAA17 QLQAMHTLQDTSWHNTTFFGVFQ------------AQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFEG
       :  :. : .... :. ..:..:.            :  :    ::.: . :.:..:. . 
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         .       .  :  : .        .:        ..  .:: . :.    .:   ..
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KIAA17 V-GPRWSR-PLLVKKGTNFT--HLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWV-
       . .:  :: :: .    ..   .:.:  ::  ::  .:. :.: ..: : . : :::   
KIAA04 TPSPMASRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDG--HTIAFLGDSQGQLHR-VYLGPGSD
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KIAA17 -HLIEELQLFDQEPM-RSLVLSQSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPY
        :     .. .   . :.:... . . :.. ..: :...:::.: .. .::.:.  ::::
KIAA04 GHPYSTQSIQQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCAQHLDCASCLAHRDPY
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KIAA17 CAWSVNTSRCVAVGGHS-GSLLIQHVMTSDTSGIC----NLRGSKKVRPTPKNITV-VAG
       :.: :  .::   .  : :.   : . . .    :     .  ..  :   ... . :  
KIAA04 CGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMSPANISREETREVFLSVPD
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KIAA17 TDLVLP-----CHLSSNLAHARWTFGGRDLPAEQPGSFLYDARLQALVVMAAQPRHAGAY
          . :     ::.. . . :  : .:   :. .:.        .: :.    :: :  :
KIAA04 LPPLWPGESYSCHFGEHQSPALLTGSGVMCPSPDPS--------EAPVL----PRGAD-Y
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KIAA17 HCFSEEQ--GARLAAEGYL-----VAVVA-GPSVTLEARAPLENLGL---VWLAVVALGA
          : :   :: . :.  :     :::.   ::.  .: .     :    ::  . .  :
KIAA04 VSVSVELRFGAVVIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVS-SRWGCNWCVWQHLCTHKA
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KIAA17 VCLVLLLLVLSLRRRLR--EELEKGAKA-----TERTLVYPLE--LPKEPTSPPFRPC--
        : .  . : : .  :   .   .:. .     . ..:. :    :: :: .:       
KIAA04 SCDAGPM-VASHQSPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTATASD
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KIAA17 --PEPDEKLWDPVGYYYSDGSLKIVPGHARC--QPGGGPPSPPPGIPGQPLPSPTRLHLG
         :  . .: .: : . ..::..  :: .    .   .::::  : ::  .:.::     
KIAA04 ISPGASPSLLSPWGPWAGSGSIS-SPGSTGSPLHEEPSPPSPQNG-PGTAVPAPTDFRPS
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KIAA17 GGRNSNANGYVRLQLGGEDRGGLGHPLPELADELRRKLQQRQPLPDSNPEESSV      
                                                                   
KIAA04 ATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALDW
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>>KIAA1550  ( 1462 res)   ff03434                         (1462 aa)
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KIAA17 PRWSRPLLVKKGTNFTHLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVHLI--EE
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KIAA15                     TSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLKKIRVDGPRGNALQYET
                                   10        20        30        40

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KIAA17 LQLFDQEP-MRSLVLSQSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPYCAWSVN
       .:. :  : .:....:.... :.  :. ::...:: .: .:.::..:. . ::.:.: : 
KIAA15 VQVVDPGPVLRDMAFSKDHEQLYIMSERQLTRVPVESCGQYQSCGECLGSGDPHCGWCVL
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KIAA17 TSRCVAVGGHSGSLLIQHVMTSDTSGICNLRGSKKVRPTPKNITVVAGTDLVLPCHLSSN
        . :                                                        
KIAA15 HNTCTRKERCERSKEPRRFASEMKQCVRLTVHPNNISVSQYNVLLVLETYNVPELSAGVN
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>>KIAA0315  ( 1841 res)   hg00246                         (1841 aa)
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KIAA17 SCPSAAMLTPAELATVVRRFSQTGIQDFLTLTLTEPTGLLYVGAREALFAFSMEALELQG
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KIAA03 ALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLDAK-LQLEQ
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KIAA17 AISWEAPVEKKTECIQKGKNNQ------TECFNFIRFLQPYNASHLYVCGTYAFQPKCTY
        ..  .:.  . .:    . .:      :.  : . .:.:   ..:  ::.  :.  :. 
KIAA03 QVA-TGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDP-PRKRLVECGSL-FKGICAL
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         . ...:.   .:::.:.  .  :..  :. . : : :.:     : . ...  .. ::
KIAA03 RALSNISLRL-FYEDGSGEKSF-VASNDEGVATVG-LVSSTGP---GGDRVLFVGKGNGP
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KIAA03 HDNGIIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQ-
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          : .  .  . .::.:. : .        . ..:.  : :  :. .   :.   :  .
KIAA03 ---DKHPARNRTLLARMCREDPN--------YYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASV
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KIAA03 AAPGS--GRVLYAVFSRDSRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTRE---ARD
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          .:  :.   . :   : ..:.   .. : .    ::  .. : : .  .: . : :.
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KIAA03 TA-----VTVAAENNHTVAFLGTSDGRILK-VYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVL
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KIAA03 ASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPAR
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1986542 residues in 2037 library sequences
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]