# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/bf02656.fasta.nr -Q ../query/KIAA1731.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1731, 2056 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7820682 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3044+/-0.000194; mu= 10.6835+/- 0.011 mean_var=110.9191+/-21.225, 0's: 38 Z-trim: 76 B-trim: 102 in 2/66 Lambda= 0.121779 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119587313|gb|EAW66909.1| hCG2036584, isoform CR (2601) 12939 2285.8 0 gi|119587312|gb|EAW66908.1| hCG2036584, isoform CR (2602) 12939 2285.8 0 gi|160420295|ref|NP_203753.1| hypothetical protein (2601) 12932 2284.6 0 gi|119587311|gb|EAW66907.1| hCG2036584, isoform CR (1932) 8866 1570.2 0 gi|109483068|ref|XP_343352.3| PREDICTED: hypotheti (2443) 3635 651.2 3.6e-183 gi|119587314|gb|EAW66910.1| hCG2036584, isoform CR ( 662) 3550 635.8 4.2e-179 gi|109108331|ref|XP_001085979.1| PREDICTED: hypoth ( 667) 3481 623.7 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