# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pg00954.fasta.nr -Q ../query/KIAA1729.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1729, 1020 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7809584 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2527+/-0.000188; mu= 13.6839+/- 0.011 mean_var=83.8924+/-16.197, 0's: 29 Z-trim: 126 B-trim: 100 in 1/66 Lambda= 0.140027 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119613097|gb|EAW92691.1| hCG2026767 [Homo sapie (1020) 6773 1379.0 0 gi|166979949|sp|Q9C0D4.2|Z518B_HUMAN RecName: Full (1074) 6767 1377.8 0 gi|109073754|ref|XP_001098027.1| PREDICTED: simila (1072) 6518 1327.5 0 gi|149702892|ref|XP_001501034.1| PREDICTED: zinc f (1074) 5539 1129.7 0 gi|195546922|ref|NP_001124305.1| zinc finger prote (1081) 5501 1122.0 0 gi|119924208|ref|XP_584181.3| PREDICTED: similar t (1078) 5198 1060.8 0 gi|212288560|sp|B2RRE4.1|Z518B_MOUSE RecName: Full (1077) 4780 976.4 0 gi|148705613|gb|EDL37560.1| mCG141317 [Mus musculu (1082) 4780 976.4 0 gi|109499843|ref|XP_573627.2| PREDICTED: similar t (1072) 4720 964.2 0 gi|149047323|gb|EDL99992.1| rCG36096 [Rattus norve (1077) 4720 964.2 0 gi|194668138|ref|XP_001788474.1| PREDICTED: simila ( 937) 4601 940.2 0 gi|77681327|dbj|BAB71650.2| unnamed protein produc ( 633) 4162 851.3 0 gi|126332012|ref|XP_001370820.1| PREDICTED: hypoth (1077) 2601 536.2 3.4e-149 gi|50747212|ref|XP_420787.1| PREDICTED: hypothetic (1074) 2173 449.7 3.6e-123 gi|149642484|ref|XP_001512216.1| PREDICTED: simila (1150) 1187 250.5 3.5e-63 gi|56789766|gb|AAH88611.1| Kiaa1729 protein [Xenop ( 598) 480 107.5 2.1e-20 gi|47221678|emb|CAG10150.1| unnamed protein produc ( 145) 408 92.4 1.8e-16 gi|189542611|ref|XP_001922874.1| PREDICTED: simila ( 884) 361 83.6 4.9e-13 gi|109896331|sp|Q6AHZ1.2|Z518A_HUMAN RecName: Full (1483) 353 82.2 2.2e-12 gi|50949959|emb|CAH10523.1| hypothetical protein [ (1483) 353 82.2 2.2e-12 gi|125831442|ref|XP_001339026.1| PREDICTED: im:691 (1413) 343 80.1 8.6e-12 gi|149689802|ref|XP_001501837.1| PREDICTED: simila (1489) 340 79.5 1.4e-11 gi|109090081|ref|XP_001100415.1| PREDICTED: simila (1481) 338 79.1 1.8e-11 gi|149642509|ref|XP_001505825.1| PREDICTED: simila (1539) 337 78.9 2.1e-11 gi|194041773|ref|XP_001928172.1| PREDICTED: simila (1491) 331 77.7 4.8e-11 gi|119917516|ref|XP_603021.3| PREDICTED: similar t (1482) 330 77.5 5.5e-11 gi|118599853|gb|AAH30967.1| ZNF518A protein [Homo ( 348) 321 75.1 6.7e-11 gi|74204493|dbj|BAB28569.3| unnamed protein produc ( 370) 304 71.7 7.5e-10 gi|205831216|sp|B2RRF6.1|ZF518_MOUSE RecName: Full (1478) 304 72.3 2.1e-09 gi|80478067|gb|AAI09046.1| ZNF518A protein [Homo s ( 953) 292 69.7 8.1e-09 gi|109090087|ref|XP_001100329.1| PREDICTED: simila ( 954) 292 69.7 8.1e-09 gi|210108515|gb|EEA56411.1| hypothetical protein B ( 847) 281 67.4 3.5e-08 gi|210124085|gb|EEA71783.1| hypothetical protein B ( 235) 271 64.9 5.5e-08 gi|210080447|gb|EEA29795.1| hypothetical protein B ( 790) 273 65.8 1e-07 gi|210085375|gb|EEA33846.1| hypothetical protein B ( 587) 271 65.2 1.1e-07 gi|210122083|gb|EEA69792.1| hypothetical protein B ( 632) 269 64.9 1.5e-07 gi|210124096|gb|EEA71794.1| hypothetical protein B (1077) 269 65.1 2.2e-07 gi|210123739|gb|EEA71439.1| hypothetical protein B ( 360) 263 63.4 2.3e-07 gi|210081738|gb|EEA30568.1| hypothetical protein B ( 343) 262 63.2 2.6e-07 gi|210128729|gb|EEA76406.1| hypothetical protein B ( 684) 265 64.1 2.8e-07 gi|210086461|gb|EEA34878.1| hypothetical protein B ( 670) 263 63.7 3.6e-07 gi|210122080|gb|EEA69789.1| hypothetical protein B ( 422) 259 62.7 4.5e-07 gi|210078913|gb|EEA29250.1| hypothetical protein B ( 591) 258 62.6 6.7e-07 gi|210085352|gb|EEA33824.1| hypothetical protein B ( 254) 252 61.1 8.3e-07 gi|210108519|gb|EEA56415.1| hypothetical protein B ( 398) 254 61.7 8.7e-07 gi|210092532|gb|EEA40756.1| hypothetical protein B ( 584) 255 62.0 1e-06 gi|210124801|gb|EEA72496.1| hypothetical protein B ( 244) 250 60.7 1.1e-06 gi|210124196|gb|EEA71894.1| hypothetical protein B ( 224) 249 60.4 1.2e-06 gi|210092255|gb|EEA40486.1| hypothetical protein B ( 435) 251 61.1 1.4e-06 gi|210112682|gb|EEA60457.1| hypothetical protein B ( 272) 248 60.3 1.5e-06 >>gi|119613097|gb|EAW92691.1| hCG2026767 [Homo sapiens] (1020 aa) initn: 6773 init1: 6773 opt: 6773 Z-score: 7390.0 bits: 1379.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 6773; 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