# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pg00153.fasta.nr -Q ../query/KIAA1727.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1727, 1130 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7797202 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4616+/-0.000213; mu= 9.9100+/- 0.012 mean_var=174.5371+/-33.216, 0's: 33 Z-trim: 108 B-trim: 65 in 1/66 Lambda= 0.097080 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|109075912|ref|XP_001085372.1| PREDICTED: simila (1149) 7197 1021.4 0 gi|149048246|gb|EDM00822.1| similar to CG32384-PA (1148) 5343 761.7 0 gi|166977314|sp|Q3ULZ2.2|FHDC1_MOUSE RecName: Full (1149) 5321 758.6 4.4e-216 gi|148683458|gb|EDL15405.1| RIKEN cDNA 6330505N24 (1149) 5317 758.1 6.4e-216 gi|74208172|dbj|BAE26306.1| unnamed protein produc (1149) 5315 757.8 7.8e-216 gi|170172542|ref|NP_001028473.2| FH2 domain contai (1149) 5310 757.1 1.3e-215 gi|26327745|dbj|BAC27616.1| unnamed protein produc (1043) 4782 683.1 2.2e-193 gi|194208392|ref|XP_001501303.2| PREDICTED: simila (1911) 4645 664.2 1.9e-187 gi|73978311|ref|XP_539768.2| PREDICTED: similar to (1132) 4289 614.1 1.4e-172 gi|89273377|emb|CAJ82216.1| novel protein [Xenopus ( 823) 2362 344.0 2e-91 gi|189514679|ref|XP_001920056.1| PREDICTED: simila (1162) 2041 299.2 8.6e-78 gi|47216282|emb|CAF96578.1| unnamed protein produc (1508) 1644 243.8 5.5e-61 gi|115676707|ref|XP_793426.2| PREDICTED: similar t (2383) 1244 188.0 5.4e-44 gi|210113469|gb|EEA61237.1| hypothetical protein B (2637) 1239 187.4 9.3e-44 gi|189241799|ref|XP_970228.2| PREDICTED: similar t (1361) 1167 176.9 6.7e-41 gi|189238218|ref|XP_970252.2| PREDICTED: similar t (2139) 1163 176.6 1.3e-40 gi|116487939|gb|AAI25856.1| Zgc:153126 [Danio reri ( 755) 1155 174.9 1.5e-40 gi|47227862|emb|CAG09025.1| unnamed protein produc ( 408) 1142 172.8 3.5e-40 gi|156552846|ref|XP_001600053.1| PREDICTED: simila (1774) 1123 170.9 5.6e-39 gi|68378725|ref|XP_694558.1| PREDICTED: hypothetic ( 712) 1098 166.9 3.6e-38 gi|108873783|gb|EAT38008.1| conserved hypothetical (1808) 1098 167.4 6.5e-38 gi|167865485|gb|EDS28868.1| formin 3 [Culex quinqu (1661) 1086 165.7 2e-37 gi|198416127|ref|XP_002127689.1| PREDICTED: simila (1340) 1067 162.9 1.1e-36 gi|193898893|gb|EDV97759.1| GH14513 [Drosophila gr (1683) 1055 161.3 4e-36 gi|47222946|emb|CAF99102.1| unnamed protein produc ( 853) 1046 159.7 6.3e-36 gi|210098986|gb|EEA47087.1| hypothetical protein B ( 763) 1042 159.1 8.6e-36 gi|212515782|gb|EEB17872.1| conserved hypothetical (1630) 1040 159.2 1.7e-35 gi|190653283|gb|EDV50526.1| GG14402 [Drosophila er (1728) 1008 154.8 3.9e-34 gi|194180093|gb|EDW93704.1| GE21592 [Drosophila ya (1735) 1006 154.5 4.8e-34 gi|30578122|dbj|BAC76439.1| ah1644 [Drosophila mel (1644) 1002 153.9 6.8e-34 gi|158028457|gb|ABW08480.1| formin 3, isoform B [D (1717) 1002 153.9 7e-34 gi|190623326|gb|EDV38850.1| GF25007 [Drosophila an (1719) 984 151.4 4e-33 gi|194118186|gb|EDW40229.1| GL25024 [Drosophila pe (1602) 982 151.1 4.7e-33 gi|198149843|gb|EDY73451.1| GA23590 [Drosophila ps (1640) 982 151.1 4.7e-33 gi|115751565|ref|XP_785094.2| PREDICTED: similar t (1472) 975 150.1 8.7e-33 gi|193631949|ref|XP_001948092.1| PREDICTED: simila (1595) 966 148.8 2.2e-32 gi|194154375|gb|EDW69559.1| GJ12058 [Drosophila vi (1781) 963 148.5 3.2e-32 gi|157012480|gb|EAA01017.4| AGAP001916-PA [Anophel (1654) 961 148.2 3.7e-32 gi|193919657|gb|EDW18524.1| GI13292 [Drosophila mo (1702) 945 145.9 1.8e-31 gi|189527639|ref|XP_697667.2| PREDICTED: similar t ( 776) 936 144.3 2.6e-31 gi|194158530|gb|EDW73431.1| GK16650 [Drosophila wi (1691) 941 145.4 2.6e-31 gi|198430951|ref|XP_002124018.1| PREDICTED: simila (1334) 920 142.3 1.7e-30 gi|194128747|gb|EDW50790.1| GM14818 [Drosophila se (1293) 907 140.5 5.9e-30 gi|82185440|sp|Q6NTV6.1|INF2_XENLA RecName: Full=I (1099) 890 138.0 2.8e-29 gi|117940162|sp|Q0IHV1.1|INF2_XENTR RecName: Full= (1380) 866 134.8 3.3e-28 gi|116283912|gb|AAH42779.1| Fhdc1 protein [Mus mus ( 235) 851 131.7 4.7e-28 gi|118092235|ref|XP_421396.2| PREDICTED: similar t (1208) 843 131.5 2.8e-27 gi|47230277|emb|CAG10691.1| unnamed protein produc ( 826) 840 130.8 3e-27 gi|189530561|ref|XP_001922040.1| PREDICTED: simila (1680) 835 130.5 7.6e-27 gi|126290361|ref|XP_001372702.1| PREDICTED: simila (1268) 819 128.1 3e-26 >>gi|109075912|ref|XP_001085372.1| PREDICTED: similar to (1149 aa) initn: 6148 init1: 4913 opt: 7197 Z-score: 5455.7 bits: 1021.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 7197; 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