# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj06603.fasta.huge -Q ../query/KIAA1716.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1716, 804 aa vs ./tmplib.25089 library 1986701 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2813+/-0.00594; mu= 15.6263+/- 0.402 mean_var=154.7835+/-39.159, 0's: 0 Z-trim: 25 B-trim: 9 in 1/39 Lambda= 0.103089 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 ( 781) 2383 367.0 4.4e-102 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 1775 276.5 7.4e-75 KIAA1975 ( 597 res) aj01061 ( 597) 438 77.5 4.6e-15 KIAA1099 ( 864 res) hk07834 ( 864) 434 77.2 8.4e-15 KIAA0167 ( 844 res) ha01026 ( 844) 429 76.4 1.4e-14 KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022) 415 74.4 6.6e-14 KIAA1428 ( 709 res) fh02979s1 ( 709) 386 69.9 1.1e-12 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 346 64.1 7.7e-11 KIAA0621 ( 753 res) hg04539 ( 753) 317 59.7 1.4e-09 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 309 58.8 4.1e-09 KIAA0148 ( 704 res) fh23975 ( 704) 275 53.4 9.9e-08 KIAA0580 ( 1631 res) hj00601s1 (1631) 274 53.8 1.7e-07 KIAA1334 ( 989 res) fh15842 ( 989) 215 44.7 5.8e-05 KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416) 215 44.9 7e-05 KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089) 203 42.9 0.00021 KIAA0969 ( 1091 res) hj06525 (1091) 188 40.7 0.00099 KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644) 181 39.9 0.0025 KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059) 175 38.8 0.0037 KIAA1636 ( 1864 res) ff02660 (1864) 176 39.3 0.0046 KIAA1200 ( 1403 res) fg02656 (1403) 168 37.9 0.0089 KIAA1876 ( 803 res) pf01162s1 ( 803) 164 36.9 0.0099 >>KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 (781 aa) initn: 2945 init1: 986 opt: 2383 Z-score: 1924.6 bits: 367.0 E(): 4.4e-102 Smith-Waterman score: 2982; 60.468% identity (81.534% similar) in 769 aa overlap (14-778:18-749) 10 20 30 40 50 KIAA17 SPEGAEAAGDPSQPRSCFRATIDEVETDVVEIEAKLDKLVKLCSGMVEAGKAYVST :: :::...::: ::.:.: ::::::::: .:...:::. . 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KIAA00 HTLQQQIQTLVKEGLRGFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTA 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 KIAA17 RKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLSFMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAA : .: ::::.:::::.. :.::.:.. .: ...::.. ::::. : .:. : :.:.: KIAA00 RAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGA 220 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 KIAA17 ELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRAS .: :::..:: :::.::..:. ..:. : . .: . . ..:.:.::::.:::::: KIAA00 QLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKEL----GGEEPEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRAS 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 KIAA17 NAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKS ::::::.::::.::..::::::: :: .::::::::::.:: : : ::::::::.: .:: KIAA00 NAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKS 340 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 KIAA17 CMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRES--PDSCYS--ERLDRTASPSTSSIDSA--TD :.::::::.: : ::.:::.:::::. .. :: . . . : :.... :. . KIAA00 CLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMAR 400 410 420 430 440 450 400 410 420 430 440 450 KIAA17 TRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSK :: : :. : : :::: ::.:: :: .: :.:::::::: :::.::::::::::: :: KIAA00 GREPGGVGHVVAQ-VQSVDGNAQCCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSK 460 470 480 490 500 510 460 470 480 490 500 510 KIAA17 VRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVE :::::::::::::.:::::::: .::::::. :. . .:: : :::.:::::. :::: KIAA00 VRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVE 520 530 540 550 560 570 520 530 540 550 560 570 KIAA17 KKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDR :::: : : : : ::...: .: . ..: .: :.: KIAA00 KKFLTKLPEI-------RGRRGGRGRPRGQPPVPP-KPSIRPRP-----------GSLRS 580 590 600 610 580 590 600 610 620 630 KIAA17 KFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPRKGAESEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELH : :. .: :. :: KIAA00 K---------------------------PEPPSE--------------------DLGSLH 620 640 650 660 670 680 690 KIAA17 PGLLAHRAA-RARDLPALAAALAHGAEVNWADAEDEGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNG :: : ::. . .::..: ::::::.:::... ... :::.::. ..::..:::::::: KIAA00 PGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNG 630 640 650 660 670 680 700 710 720 730 740 750 KIAA17 ADVNQRDSRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKRGADQHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVT :.::: :: ::.::::::.::.:: .::::::::: : :.: ::::.::...::::::: KIAA00 ANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVT 690 700 710 720 730 740 760 770 780 790 800 KIAA17 LLRLARMAEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQFRRCIQEFISLHLEES :::::. ::::::: : : KIAA00 LLRLAK----MREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL 750 760 770 780 790 >>KIAA1975 ( 597 res) aj01061 (597 aa) initn: 478 init1: 348 opt: 438 Z-score: 362.4 bits: 77.5 E(): 4.6e-15 Smith-Waterman score: 501; 41.048% identity (65.939% similar) in 229 aa overlap (304-531:295-495) 280 290 300 310 320 330 KIAA17 MEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRF .:.:: : . : : :. :. :. KIAA19 GLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEEEE-EK-- 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 KIAA17 CFEVLSPT-KSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSI : ..: : ..: ..: . . :.:::::.:..: .. . :: : : : :.. KIAA19 -FMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQ----SCES-------SKSKSQL 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 KIAA17 DSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLG : ... .:: .:.. :::.: :: .:.:::.:::::.:::::::::::: KIAA19 TSQSEAM--------ALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLG 370 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 KIAA17 VHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIK .. :.:::: ::.: :: :.: .::. .:.:.:.. . :. ::. :.:..:: ::. KIAA19 TRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQ--GQTKPSIESTREEKERWIR 430 440 450 460 470 520 530 540 550 560 570 KIAA17 DKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSV .:: .: :: ::. : : KIAA19 SKYEHKLFL--APL-PCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGC 480 490 500 510 520 530 >>KIAA1099 ( 864 res) hk07834 (864 aa) initn: 430 init1: 341 opt: 434 Z-score: 357.6 bits: 77.2 E(): 8.4e-15 Smith-Waterman score: 472; 39.806% identity (66.505% similar) in 206 aa overlap (327-531:555-736) 300 310 320 330 340 350 KIAA17 QNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPT-KSCMLQADSEKLRQ :. :. : : ..: : .. ..: . . :. KIAA10 PPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERD 530 540 550 560 570 580 360 370 380 390 400 410 KIAA17 AWVQAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSV :::::....: .. . :: : : . : . : ... .:: .... KIAA10 AWVQAIESQILASLQ----SCES-------SKNKSRLTSQSEAM--------ALQSIRNM 590 600 610 620 420 430 440 450 460 470 KIAA17 AGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMC :::.: :: .: :::.:::.:.:::::::::.::.: :.:::: ::.: ::.:.: KIAA10 RGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPIELIKVMS 630 640 650 660 670 680 480 490 500 510 520 530 KIAA17 ELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRR .:: .:...: . .: ::...:.:..:: ::. :: .: :: ::. : : KIAA10 SIGNELANSVWEESSQG--RTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFL--APL-PCTELSLG 690 700 710 720 730 740 540 550 560 570 580 590 KIAA17 WRVQKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFS KIAA10 QHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGV 750 760 770 780 790 800 >>KIAA0167 ( 844 res) ha01026 (844 aa) initn: 520 init1: 330 opt: 429 Z-score: 353.7 bits: 76.4 E(): 1.4e-14 Smith-Waterman score: 469; 39.409% identity (68.473% similar) in 203 aa overlap (330-531:525-704) 300 310 320 330 340 350 KIAA17 QLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPT-KSCMLQADSEKLRQAWV :. : : ..: : .. ..: : . :.::: KIAA01 EPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWV 500 510 520 530 540 550 360 370 380 390 400 410 KIAA17 QAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGN ::....: . : . : : :.. ::.. ..: ..: .... :: KIAA01 QAIESQILA----SLQCCES-----------SKVKLRTDSQSEAV----AIQAIRNAKGN 560 570 580 590 420 430 440 450 460 470 KIAA17 SQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELG : : ::: :.: :::.:::.:.:::::::::.::.: :.:::: ::.: :: .. .: KIAA01 SICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIG 600 610 620 630 640 650 480 490 500 510 520 530 KIAA17 NSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRV :...:...:.. .: . ::. .:::...:.::. :: . :: ::.. . : KIAA01 NDTANRVWESDTRGRA--KPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFL--APLSTSEEPLGRQLW 660 670 680 690 700 710 540 550 560 570 580 590 KIAA17 QKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFD KIAA01 AAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAA 720 730 740 750 760 770 >>KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022 aa) initn: 569 init1: 362 opt: 415 Z-score: 341.6 bits: 74.4 E(): 6.6e-14 Smith-Waterman score: 661; 26.497% identity (59.165% similar) in 551 aa overlap (5-523:28-554) 10 20 30 KIAA17 SPEGAEAAGDPSQPR-SCFRATIDEVETDVVEIEAKL ::. : . : : : . . .. :. :: : KIAA04 GGGAPAAVRQRPRAEAMPDQISVSEFVAETHEDYKAPTASSFTTRTAQCRNTVAAIEEAL 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 KIAA17 D-------KLVKLCSGMVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQC--QGDTVISECLQRFADS : :. : ... .: :.: . . ...... .. .: . : .. . .:. KIAA04 DVDRMVLYKMKKSVKAINSSGLAHVENEEQYTQALEKFGGNCVCRDDPDLGSAFLKFSVF 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 KIAA17 LQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFK-ETKKQFDKVREDLELSLVRNAQAP .:.. :... . . :.:..: :.. : . :: :::. .: : .... . KIAA04 TKELTALFKNLIQNMNNIISFPLDSLLKGDLKGVKGDLKKPFDKAWKDYETKITKIEKEK 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 KIAA17 RHRP--HEV--EEATGA-----LTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLSFM ... : . : .:: . :. :. .:.:..: .. :: ..:....... KIAA04 KEHAKLHGMIRTEISGAEIAEEMEKERRFFQLQMCEYLLKVNEIKIKKGVDLLQNLIKYF 190 200 210 220 230 240 200 210 220 230 240 250 KIAA17 HAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSY ::: .:::.: . ...: : .. :...: . . :.:.. . . . .. :: . KIAA04 HAQCNFFQDGLKAVESLKPSIETLSTDLHTIKQAQDEERRQLIQLRDIL--KSALQVEQK 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 KIAA17 DESKVE----FDVDAPSG-----VVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLK ..:... ... :.: . .: :.:.... :.:..: :..:. :. .. KIAA04 EDSQIRQSTAYSLHQPQGNKEHGTERNGSLYKKSDGIRKVWQKRKCSVKNGFLTISHGTA 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 KIAA17 DALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASA . . .. : :.:: . :.. ::...: .. .::..:. : :....: : KIAA04 NRPPAKLN-LLTCQVKT--NPEEKKCFDLISHDRTYHFQAEDEQECQIWMSVLQNS---- 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 KIAA17 YRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGE---SVLQRVQSVAGNSQCGDCG .: : :. ... . .: : .. : ....:: ..::. : ::: KIAA04 -KE-------EALN-------NAFKGDDNTGENNIVQELTKEIISEVQRMTGNDVCCDCG 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 KIAA17 QPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQI ::: : : :::.: ::::::::: :::: :...::::: : : ..::.. :.: KIAA04 APDPTWLSTNLGILTCIECSGIHRELGVHYSRMQSLTLDVLGTSELLLAKNIGNAGFNEI 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 540 KIAA17 YEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPH .: . : ::. .:. . .. .: ::.:... :: KIAA04 MECCLPAEDSVKPNPGSDMNARKDYITAKYIERRYARKKHADNAAKLHSLCEAVKTRDIF 520 530 540 550 560 570 550 560 570 580 590 600 KIAA17 SSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAG KIAA04 GLLQAYADGVDLTEKIPLANGHEPDETALHLAVRSVDRTSLHIVDFLVQNSGNLDKQTGK 580 590 600 610 620 630 >>KIAA1428 ( 709 res) fh02979s1 (709 aa) initn: 210 init1: 118 opt: 386 Z-score: 319.8 bits: 69.9 E(): 1.1e-12 Smith-Waterman score: 386; 23.864% identity (58.182% similar) in 440 aa overlap (19-440:20-447) 10 20 30 40 50 KIAA17 SPEGAEAAGDPSQPRSCFRATIDEVETDVVEIEAKLDKLVKLCSGMVEAGKAYVSTSRL :. . : :.. : ...: . . .: . ....: KIAA14 MPGIDKLPIEETLEDSPQTRSLLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 KIAA17 FVSGVRDLSQQ---CQGDT-VISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVK . ... .: :: :.: ::.:. ..:. . : .: : .. . .: . KIAA14 TSKLLKEYEKQRFPLGGDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPITQFKE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 KIAA17 EDVRKFKETKKQFDKVREDLELSLVRNAQAPRHRPHE-VE-EATGALTLTRKCFRHLALD .:.... :. :. . .: . .. : .. ..: .. :. :.: . .:: .. . KIAA14 RDLKEILTLKEVFQIASNDHDAAINRYSRLSKKRENDKVKYEVTEDVYTSRKKQHQTMMH 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 KIAA17 YVLQINVLQAKKKFEILDSMLSFMHAQSSFFQQGY-SLLHQLDPYMKKLAAELDQLV--I : .:.:: :::. .:. .:..:.:: :::..: .: .::. .. .... .... . KIAA14 YFCALNTLQYKKKIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLANIGTSVQNVRREM 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 KIAA17 DSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAF--KT :: .: .. . . . : . : . ..: :. . . ::: : .... .: KIAA14 DSDIETMQQTIEDLEVASDPL---YVPDPDPTKFPVNR-NLTRKAGYLNARNKTGLVSST 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 KIAA17 WNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKP--CEDIERRFCFEVLS--PTKSC :.:... :...:. : . :. .. :. ::: ::: ::.::.. : :: KIAA14 WDRQFYFTQGGNLMSQAR-GDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCED--RRYCFQITSFDGKKSS 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 KIAA17 MLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAY-RESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRE--R .:::.:.: .. :. ... . : :.:. . :....: ... : . .: : KIAA14 ILQAESKKDHEEWICTINNISKQIYLSENPEET-AARVNQSALEAVTPSPSFQQRHESLR 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 KIAA17 GVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSL . :.: .: .:. :. :. . :...: :. KIAA14 PAAGQSR----PPTARTSSSGSLGSESTNLAALSLDSLVAPDTPIQFDIISPVCEDQPGQ 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 KIAA17 TLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFL KIAA14 AKAFGQGGRRTNPFGESGGSTKSETEDSILHQLFIVRFLGSMEVKSDDHPDVVYETMRQI 470 480 490 500 510 520 >>KIAA1249 ( 949 res) hh04184 (949 aa) initn: 530 init1: 293 opt: 346 Z-score: 286.4 bits: 64.1 E(): 7.7e-11 Smith-Waterman score: 582; 30.287% identity (61.097% similar) in 383 aa overlap (155-523:14-375) 130 140 150 160 170 KIAA17 KKQFDKVREDLELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGA-----LTLTRKCFRHLALDYVLQIN : ::: . :. :. .:....: KIAA12 KREHAKQHGMIRTEITGAEIAEEMEKERRLFQLQMCEYLIKVN 10 20 30 40 180 190 200 210 220 230 KIAA17 VLQAKKKFEILDSMLSFMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREM ...:: ..:.......::: .:::.: . .: :..::::.: .. . ::... KIAA12 EIKTKKGVDLLQNLIKYYHAQCNFFQDGLKTADKLKQYIEKLAADLYNIKQTQDEEKKQL 50 60 70 80 90 100 240 250 260 270 280 290 KIAA17 ERKHAAIQQRTLL-QDFSYDESKV--------EFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWN . :.. : : : .:. ... . : .:::.:.... :.:. KIAA12 TALRDLIKSSLQLDQKESRRDSQSRQGGYSMHQLQGNKEYGSEKKGYLLKKSDGIRKVWQ 110 120 130 140 150 160 300 310 320 330 340 350 KIAA17 RRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADS :: :..:. :. .. .. . .. : :.::: . : . :...: ... .::.. KIAA12 RRKCSVKNGILTISHATSNRQPAKLN-LLTCQVKP--NAEDKKSFDLISHNRTYHFQAED 170 180 190 200 210 220 360 370 380 390 400 410 KIAA17 EKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQ :. ::.... : : .. : ...:. .:... : ..... KIAA12 EQDYVAWISVLTNSKEEALT------MAFRGEQSAGE--NSLEDLT---------KAIIE 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 KIAA17 RVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPEL :: . ::. : :::. .: : : :::.: ::::::::: .::: :...:: ::. KIAA12 DVQRLPGNDICCDCGSSEPTWLSTNLGILTCIECSGIHREMGVHISRIQSLELDKLGTSE 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 KIAA17 LKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPAL : : ..::.. :.:.::. . : ::: ::. .. .: :::...: :: KIAA12 LLLAKNVGNNSFNDIMEANLPSP-SPKPTPSSDMTVRKEYITAKYVDHRFSRKTCSTSSA 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 KIAA17 EAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDEL KIAA12 KLNELLEAIKSRDLLALIQVYAEGVELMEPLLEPGQELGETALHLAVRTADQTSLHLVDF 390 400 410 420 430 440 >>KIAA0621 ( 753 res) hg04539 (753 aa) initn: 307 init1: 140 opt: 317 Z-score: 264.1 bits: 59.7 E(): 1.4e-09 Smith-Waterman score: 362; 25.781% identity (59.375% similar) in 384 aa overlap (70-433:9-373) 40 50 60 70 80 90 KIAA17 VKLCSGMVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT------VISECLQRFADSLQEVVN :: ::. :.. ::.:: :... . KIAA06 DSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLED 10 20 30 100 110 120 130 140 150 KIAA17 YHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDLELSLVRNAQ-APRHRPHE .. ....:.. . :..: ::.. ::.::..:: : : .. . . ... . KIAA06 ERIRMIENASEVLITPLEKFRKEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQ 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 KIAA17 VEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLSFMHAQSSFFQQGYSLLH ..:: . . :.:. : ...:.::.... .: .: ::... .:.:... .:...:: : . KIAA06 LQEADSQVDLVRQHFYEVSLEYVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAK 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 KIAA17 QLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSYDESKVEFDVDAPSGV .. . ::.:. . ..: .. .. .:.. .. :. .: . .: KIAA06 DFGDFKT-------QLTISIQNTRNRFEGTRSEVE--SLMKKMK--ENPLEHKTISP--Y 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 KIAA17 VMEGYLFKRASNAFKT-WNRRWFSIQ--NSQLVY----QK---KLKDALTVVVDDLRLCS .:::::. . . : : : ... . : ..:... :: : . .:. :. :. KIAA06 TMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITMVPFDQKSGGKGGEDESVI---LKSCT 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 KIAA17 VKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCM--LQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDSCYSER . ..::.::::.: . . . .:: ::. :. :..:... .: . :: :: KIAA06 RRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGR-EPVYNSNKDS-QSEG 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 KIAA17 LDRTASPSTSSIDSATDTRE-RGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVL . : . : : . . : ::.. :. : :. .: . : ::. :: KIAA06 TAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGIN-EQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTASETETDI 330 340 350 360 370 440 450 460 470 480 490 KIAA17 LCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPT KIAA06 CAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKN 380 390 400 410 420 430 >>KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281 aa) initn: 271 init1: 204 opt: 309 Z-score: 255.4 bits: 58.8 E(): 4.1e-09 Smith-Waterman score: 337; 29.752% identity (57.438% similar) in 242 aa overlap (290-526:285-486) 260 270 280 290 300 310 KIAA17 SKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKD---ALTVVVD :. . .. .... :.:.. .. .. KIAA07 RARLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNKLYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGIGITFI 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 KIAA17 DLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDSC :. . .:: ...:: :.. .: . ..:::: .. :..:.:..:: : KIAA07 DMSVGNVK---EVDRR-SFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMQGAIAEAL------- 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 KIAA17 YSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINL ::: : .:. ..: : :.::: :.: :::::: KIAA07 -----------STSE----------------VAERIWAAAPNRFCADCGAPQPDWASINL 370 380 390 440 450 460 470 480 490 KIAA17 GVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDS--WEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAG :..: .:.: ::.::. :::::: .: : :..:. .:::.: :... :. . KIAA07 CVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRKVWTETLIELFLQLGNGAGNRFWAANVPPSE 400 410 420 430 440 450 500 510 520 530 540 550 KIAA17 SRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTAR . .:..: : .. .. :: : :. : :. KIAA07 ALQPSSSPS--TRRCHLEAKYREGKYRRYHPLFGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLG 460 470 480 490 500 510 560 570 580 590 600 610 KIAA17 RKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPRKGAESEE KIAA07 CGAGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNRTTEVPRLDSMKPLEKHYSVVLPT 520 530 540 550 560 570 804 residues in 1 query sequences 1986701 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:14:07 2008 done: Thu Dec 18 15:14:08 2008 Total Scan time: 0.590 Total Display time: 0.220 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]