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FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1713, 1652 aa
 vs ./tmplib.25089 library

1985853 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0815+/-0.0118; mu= -19.5240+/- 0.798
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 Lambda= 0.051524

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KIAA17 RNKTHKQGSTQSRLETSHTSKSSEPSKSPDGIRS---ESRDSEIS--KRKTAEQHSFGIC
       .  ..   :. ::.. .. .. .. : ::: : :   :. :.: .  :::. :: . .  
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        ::. :.:: :: ::   :   :: :: .:::.:::..::::.: ::...:.::. .   
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       :   .:  :    ::::::::::::: :.:. :  .      ::.. ..:. :.:: :: 
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         :              .  .:.               :: .:    :. . :: .   :
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       :           :.. .. :..:  .    :: ..  ...: .: ..  :..:       
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          :  .:.:    :... .: .    :   :  .. : . . :.    . . :..:...
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KIAA17 ACNISMLKTIQGTDTPCIAIIPKCIESTPISATTEGSSISSSMDDKQLLISSSSASNLVS
          . . .    . : :                 :... :   ::..             
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        :  .::.    .: :        ::             .. :..   :.  ::      
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KIAA17 SCSDSVAVTDSLVAHPTVAMFTGNMLTINSYDSPPKLSAESLDKNSGPRNRA--DNSGKP
                ..: .:::.     . ....  ..: .  .. :      .:::  :. :  
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           ::  :       : .                   ::.  . .:. . . ...:.. 
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       .  :. . :...:.: . : :      .  .....  :. :.        : .:  :.  
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KIAA17 EPTAPSHNFAEQARGPAPFKSEADTTCSNQYNPSNRICWNDDGMRSTGQPLVTHSGSSKQ
       :   :  ...     :.   :... .  .: .  ...  : :.   . .   : ..:. .
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        .  :.:  .:   : :   . :  . ..   : . :    : ...  .:. :.   :  
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KIAA17 LPPPAAEGASSVQQT--QNVKASTSSPMEEAISLATDALKRVPGAGSSGCRLSSVEANNP
        :   .  . .:.:   ...  ...  . .:. :.      .::        :::::.::
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       :.. :. .: ..:  :.   : .             :: :  :.. ..    :.:    .
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KIAA17 GTSHRQQFYQMPVAARGPIPTAALLQASSKTPVGCNAFAFNRHLEQKGLGEVSLSSAPHQ
       : :        :    : . :.   . ::  :   :...:. .   ..::. :       
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KIAA09 HSPLELVGHLEGMPF-VMDLPFWKLPREPGKGLSEPLEPSSLPSQLSIKQAFYGKLSKLQ
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       ..::::. ..:.     :. ::    :. :.  ....:.. .: :.:::... . :.:.:
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        :::::.:.:::::::::::::::::: :::::
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>>KIAA1685  ( 1505 res)   pf04287                         (1505 aa)
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KIAA16 RGEEGIFYKVPGRMGVYTLKKDVPDGVKELSEGSE--ESSDG-QSDSQSSENSSSSS---
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KIAA17 HSFGICKE-KRARIEDDQSTRNISSSSPPEKEQPPREEPRVPPLKI-----QLSKIGPPF
        . :  :: :..: .     :..:::::    :     : .:  :.     . :: .   
KIAA16 -DGGSNKEGKKSRWK-----RKVSSSSP----QSGCPSPTIPAGKVISPSQKHSKKALKQ
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KIAA17 IIKSQPVSKPESRASTSTSVSGGRNTGARTLADIKARAQQARAQREAAAAAAVAAAASIV
        .:.:  .: ...   : :.:.... . .:.          .:  ... :  ..  ..  
KIAA16 ALKQQQQKKQQQQCRPSISISSNQHLSLKTV----------KAASDSVPAKPATWEGKQS
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KIAA17 SGAMGSPGEGGKTRTLAHIKEQTKAKLFAKHQARAHLFQTSKETRLPPPLSSKEGPPNLE
       .:  ::: ..... . .   :.:   :  :   :.. ..: .  :      .: .  ..:
KIAA16 DGQTGSPQNSNSSFSSSVKVENTLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKR------TKCADIDVE
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          ::.. . ...   ..: .  :  :.. . .:      ......:. :      ....
KIAA16 ---TPDSILVNTNLRALINKHTFSVLPGDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGL------MKLN
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         610       620       630       640       650       660     
KIAA17 SSDENIPVSHLSEKIVSSTSSENSSVPMLFNKNSVPVSVCSTAISGAIKEHPFVSSVDKS
       .:  :      . .  .   ::.  .: .  .  .   . .       ::. : :   .:
KIAA16 GSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTPEM--QVRIRQEIEKEKKVEPWKEQFFESYYGQS
           400       410       420         430       440       450 

         670       680       690       700         710       720   
KIAA17 SVLMSVDSANTTISACNISMLKTIQGTDTPCIAIIPKC--IESTPISATTEGSSISSSMD
       : :   :: . : :  . .. ::   .. :    . .   :. .:. . .: .  . .:.
KIAA16 SGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKT--PAEQPKSMPVSEASLIRIVPVVSQSECKEEALQMS
             460       470         480       490       500         

           730       740       750       760       770       780   
KIAA17 DKQLLISSSSASNLVSTQYTSVPTPSIGNNLPNLSTSSVLIPPMGINNRFPSEKIAIPGS
       .        : .. :. ....   : ... : .   ::.:      .. .  .: .  . 
KIAA16 SPGRKEECESQGE-VQPNFSTSSEPLLSSALNTHELSSILPIKCPKDEDLLEQKPVTSAE
     510       520        530       540       550       560        

           790       800       810             820                 
KIAA17 EEQATVSMGTTVRAALSCSDSVAVTDSL------VAHPTVAMFTG------NM---LTIN
       .:.    . :.     : :.   ::.        : .: :   .:      ::   :.  
KIAA16 QESEKNHLTTASNYNKSESQESLVTSPSKPKSPGVEKPIVKPTAGAGPQETNMKEPLATL
      570       580       590       600       610       620        

      830       840             850       860               870    
KIAA17 SYDSPPKLSAES-LDKNSGP-----RNRADNSGKPQQP----PGGFAPAA----INRSIP
         .:: .:. .: : .. .:     : :. .. . :::    :  :   .    . .  :
KIAA16 VDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEKRPRVTENRQHQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPP
      630       640       650       660       670       680        

          880              890       900                 910       
KIAA17 CKVIVD-------HSTTLTSSLSLTVSVESSEAS-----LDLQGRPV-----RTEASVQP
        :. :.       : . ..    . ::. : . .      :....       :. :..  
KIAA16 LKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPNRTGARTLADIKAKAQLVKAQRAAAAAAA
      690       700       710       720       730       740        

       920          930       940       950       960              
KIAA17 VACPQVSV---ISRPEPVANEGIDHSSTFIAASAAKQDSKTLPATCTS------------
       .:   .::   :  : : ...:  ...   .: ...  :  .  :  .            
KIAA16 AAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTARGGSPGSDRVSETGKGPTLELAGTGSRG
      750       760       770       780       790       800        

              970          980              990      1000      1010
KIAA17 -LREL-PLVPD---KLNEPTAPSHNFAEQARG-------PAPFKSEADTTCSNQYNPSNR
         ::: :  :.   . .  :.::.   ... :       :.:    .. .:..  .:.. 
KIAA16 GTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSGAQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPAHI
      810       820       830       840       850       860        

                1020          1030      1040      1050      1060   
KIAA17 ICWNDDGM---RSTGQ-PLVTHS---GSSKQKEYLEQSCPKAIKTEHANYLNVSELHPRN
          ... .   :.:.    :.:    .: .:..    . :  :.     .  ..     .
KIAA16 EKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQGPSSCRQEKAPSPTGPALISGASPVHCAADGTVELK
      870       880       890       900       910       920        

          1070      1080      1090      1100      1110      1120   
KIAA17 LVTNVALPVKSELHEADKGFRMDTEDFPGPELPPPAAEGASSVQQTQNVKASTSSPMEEA
          .  .:  :   ..: .  . .   :   :   :.     : :.. . : ..:    .
KIAA16 AGPSKNIPNPSASSKTDASVPVAVTPSPLTSLLTTATLEKLPVPQVSATTAPAGSAPPSS
      930       940       950       960       970       980        

          1130        1140         1150      1160       1170       
KIAA17 ISLATDALKRVPGAG--SSGCRL---SSVEANNPLVTQLLQG-NLPLEKVLPQPRLGAKL
          :...:: .::..   .:  :   ::. :::::::::::: ..:.:..::.:   .:.
KIAA16 TLPAASSLK-TPGTSLNMNGPTLRPTSSIPANNPLVTQLLQGKDVPMEQILPKPL--TKV
      990       1000      1010      1020      1030      1040       

      1180      1190      1200      1210      1220      1230       
KIAA17 EINRLPLPLQTTSVGKTAPERNVEIPPSSPNPDGKGYLAGTLAPLQMRKRENHPKKRVAR
       :.. .::         :: :.            : : : .:         ::  ...: .
KIAA16 EMKTVPL---------TAKEER-----------GMGALIAT------NTTENSTREEVNE
        1050                          1060            1070         

      1240      1250      1260      1270      1280      1290       
KIAA17 TVGEHTQVKCEPGKLLVEPDVKGVPCVISSGISQLGHSQPFKQEWLNKHSMQNRIVHSPE
           :  .. . :: :   ..  ::  .     ::  .. ...  .. :.... . .. .
KIAA16 R-QSHPATQQQLGKTLQSKQLPQVPRPL-----QLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQ
    1080       1090      1100           1110      1120      1130   

      1300      1310             1320       1330      1340         
KIAA17 VKQQKRLLPSCSFQQNLFHVDK-------NGGFHT-DAGTSHRQQFYQMPVAARGPIPTA
        .  . :.     .:::. :         ..::.  : .::.:  :.   .. :   :. 
KIAA16 DQILQTLIQRVR-RQNLLSVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQR--FMLGFAGRRTSKPAM
          1140       1150      1160      1170        1180      1190

    1350      1360      1370      1380      1390           1400    
KIAA17 ALLQASSKTPVGCNAFAFNRHLEQKGLGEVSLSSAPHQLRLA-----NMLSPNMPMKEGD
       :     . .  : .. .: :    .   .  :::  . :...     :  . .   :: :
KIAA16 AGHYLLNISTYGRGSESFRRTHSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKNATGESSSSKEDD
             1200      1210      1220      1230      1240      1250

         1410      1420      1430      1440      1450      1460    
KIAA17 EVGGTAHTMPNKALVHPPPPPPPPPPPPLALPPPPPPPPPLPPPLPNAEVPSDQKQPPVT
           ..    ... :.  :                         . ..   .: .. : .
KIAA16 TDEESTGDEQESVTVKEEP------------------------QVSQSAGKGDTSSGPHS
             1260                              1270      1280      

         1470      1480          1490      1500                    
KIAA17 METTKRLSWPQSTGIC---SNIKSE-PLSFEEGLSSSCELGMKQVSYD------------
        ::        ::. :   .:.:.: ::. .  ::.   :  .  ..:            
KIAA16 RETL-------STSDCLASKNVKAEIPLNEQTTLSKENYLFTRGQTFDEKTLARDLIQAA
       1290             1300      1310      1320      1330         

     1510      1520        1530       1540       1550              
KIAA17 QNEMKEQLKAFALKSAD--FSSYLLSEP-QKPFTQ-LAAQKMQVQQ----QQQLCGNY-P
       :..: . ... :..:.   ::: .:  : ..:  : :    .:. .      :.  .:  
KIAA16 QKQMAHAVRGKAIRSSPELFSSTVLPLPADSPTHQPLLLPPLQTPKLYGSPTQIGPSYRG
    1340      1350      1360      1370      1380      1390         

    1560      1570           1580      1590              1600      
KIAA17 TIHFGSTSFKRAASAIEKS-----IGILGSGSNPATGLSGQNAQ--------MPVQNFAD
        :. ...:     ::.  :     .: . : :  .: . ...:.        .::: :..
KIAA16 MINVSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVTVTTIPASQAMNPSSHGQTIPVQAFSE
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KIAA17 SSNADELELKCSCRLKAMIVCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVACLVVR
        .. .    :: :::::::.::::::::::::::::::::.:::::
KIAA16 ENSIEGTPSKCYCRLKAMIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR
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