# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj16891.fasta.huge -Q ../query/KIAA1703.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1703, 1165 aa vs ./tmplib.25089 library 1986340 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4698+/-0.00655; mu= 15.8899+/- 0.445 mean_var=173.5655+/-44.041, 0's: 0 Z-trim: 68 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.097351 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 665 106.5 1.2e-23 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 663 106.4 1.8e-23 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 639 102.8 1.5e-22 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 639 103.0 1.8e-22 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 631 102.0 4.2e-22 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 608 98.3 2.8e-21 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 605 98.2 4.7e-21 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 599 97.1 7.1e-21 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 587 95.7 2.7e-20 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 584 95.4 4.1e-20 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 573 93.6 9.6e-20 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 571 93.3 1.2e-19 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 570 93.2 1.3e-19 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 567 92.7 1.6e-19 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 566 92.5 1.8e-19 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 560 91.7 3.3e-19 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 558 91.3 3.7e-19 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 559 91.7 4e-19 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 558 91.4 4e-19 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 555 91.0 5.5e-19 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 555 91.3 7e-19 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 549 90.4 1.1e-18 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 527 87.1 8.1e-18 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 525 86.7 9.2e-18 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 515 85.4 2.8e-17 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 501 83.7 1.3e-16 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 498 83.0 1.4e-16 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 490 81.7 2.5e-16 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 490 82.6 5.4e-16 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 472 79.7 2.3e-15 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 457 77.2 7.4e-15 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 444 75.6 3.2e-14 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 441 75.0 3.7e-14 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 429 73.5 1.3e-13 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 423 72.6 2.3e-13 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 416 71.8 5e-13 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 411 70.7 6e-13 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 412 71.0 6.3e-13 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 412 71.1 6.9e-13 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 406 70.0 1e-12 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 378 66.0 1.5e-11 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 380 66.7 1.7e-11 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 375 65.7 2.1e-11 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 365 63.9 4.2e-11 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 354 62.7 1.5e-10 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 329 58.5 1e-09 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 333 59.9 1.4e-09 KIAA0198 ( 562 res) ha02521 ( 562) 294 54.3 5.8e-08 KIAA0352 ( 721 res) hg01642 ( 721) 293 54.4 7.3e-08 KIAA1782 ( 545 res) aj00273 ( 545) 277 51.9 3e-07 >>KIAA2007 ( 580 res) fj01689 (580 aa) initn: 1790 init1: 282 opt: 665 Z-score: 516.3 bits: 106.5 E(): 1.2e-23 Smith-Waterman score: 707; 28.649% identity (56.937% similar) in 555 aa overlap (252-766:26-550) 230 240 250 260 270 280 KIAA17 NKEILMNSQHETEFILEEDGPASDSTVESSDVYETIISIDDKGQAMYSFGRFDSSIIRIK ..:. .. . :. : .. : :.: KIAA20 DSVTFDDLAVDFTPEEWTLLDPTQRNLYRDVMLENYKNLATVGYQLFKPSLISWL 10 20 30 40 50 290 300 310 320 330 KIAA17 NPEDGELIDQSE--EGLIATGVRISELPLKD------CAQGVKKKKSEGSSIGESTRIRC . :... ..... . . .. .:: :.. ..:.. :... :: . .. 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KIAA20 GHLRIHTGE----KPFECLECGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVN 460 470 480 490 500 510 730 740 750 760 770 780 KIAA17 LHAGIVS--KSYECRLKGQGATFVETDSPFTAAALAEEPLVKEKPLRSSRRPAPPPEQVQ :: : . : :.: : : .: ..: : : :. . ::: KIAA20 LHMRIHTGEKPYKC--KQCGKSFSYSNS-FQ---LHERTHTGEKPYECKECGKAFSSSSS 520 530 540 550 560 790 800 810 820 830 840 KIAA17 QVIIFQGYDGEFALDPSVEETAAATLQTLAMAGQVARVVHITEDGQVIATSQSGAHVGSV KIAA20 FRNHERRHADERLSA 570 580 >>KIAA1611 ( 813 res) fj12627 (813 aa) initn: 2253 init1: 301 opt: 663 Z-score: 513.4 bits: 106.4 E(): 1.8e-23 Smith-Waterman score: 764; 32.104% identity (55.748% similar) in 461 aa overlap (263-710:263-692) 240 250 260 270 280 290 KIAA17 TEFILEEDGPASDSTVESSDVYETIISIDDKGQAMYSFGRFDSSIIRIKNPEDGELIDQS ... . : :. :. : : :. . KIAA16 LNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 KIAA17 EEGLIATGVRISELPLK--DCAQGVKKKKSEGSS----IGESTRIRCDDCGFLADGLSGL . : .. .: : : .:.. .... .. ::. .:..:: : :.: KIAA16 SNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPY-KCNECGKAFRGHSNL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 KIAA17 NVHIAMKHPTKEKHFHCLLCGKSFYTESNLHQHLASAGHMRNEQASVEELPEGGATFKCV ..: . : : :: :.: ::: : .: :: : : : . : .:: KIAA16 TTH-QLIH-TGEKPFKCNECGKLFTQNS----HLIS--HWR--------IHTGEKPYKCN 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 KIAA17 KCTEPFDSEQNLFLHIK---GQHEELLREVNKYIVEDTEQINREREENQGNV---CKYCG .: . :. ...: .: :.. : .: . . . ..:.:. . :. :. :: KIAA16 ECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGK-VFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECG 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 KIAA17 KMCRSSNSMAFLAHIRTHTGSKPFKCKICHFATAQLGDARNHVKRHLGMREYKCHVCGVA : ...: .: :::.:::::. : . .: .. :: . : : . :::. :: : KIAA16 KAFSMHSNLA--THQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKA 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 KIAA17 FVMKKHLNTHLLGKHGVGTPKERKFTCHLCDRSFTEKWALNNHMKLHTGEKPFKCTWPTC : ... :.:: . : :. . : : .:::.: : .: .:.::::.::. : KIAA16 FSVRSSLTTHQAIHSG-----EKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCN--EC 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 KIAA17 HYSFLTASAMKDHYRTHTGEKSFLCDLCGFAGGTRHALTKHRRQHTGEKPFKCDECNFAS : .: . :.:.::::: . :. :: : . : .:: :. ::::::.:: ::. . KIAA16 GKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVF 570 580 590 600 610 620 650 660 670 680 690 KIAA17 TTQSHLTRHKRVHTGEKPYRCPWCDYRSNCAENIRKH-ILHTGKHEGVKMYNCPKCDYGT .:.:. :.:.:::::::.: : . :. : ..:::. : :.: .: KIAA16 RHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGE----KPYKCNQCGKVF 630 640 650 660 670 680 700 710 720 730 740 750 KIAA17 NVPVEFRNHLKEQHPDIENPDLAYLHAGIVSKSYECRLKGQGATFVETDSPFTAAALAEE . .. :: . KIAA16 TQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNA 690 700 710 720 730 740 >>KIAA1473 ( 574 res) fj03262 (574 aa) initn: 2232 init1: 316 opt: 639 Z-score: 496.6 bits: 102.8 E(): 1.5e-22 Smith-Waterman score: 705; 30.787% identity (56.944% similar) in 432 aa overlap (309-731:138-537) 280 290 300 310 320 330 KIAA17 RIKNPEDGELIDQSEEGLIATGVRISELPLKDCAQGVKKKKSEGSSIGESTRIRCDDCGF :.: .:. .. . .. ..:: KIAA14 KVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGL----NQCLTTTQNKIFQCDKYVK 110 120 130 140 150 160 340 350 360 370 380 390 KIAA17 LADGLSGLNVHIAMKHPTKEKHFHCLLCGKSFYTESNLHQHLASAGHMRNEQASVEELPE . .:. : : ...: : .: :.: : ::: :.: :: ... KIAA14 VFHKFSNSNRH-TIRH-TGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQH--------------KRIHS 170 180 190 200 400 410 420 430 440 450 KIAA17 GGATFKCVKCTEPFDSEQNLFLHIK---GQH----EELLREVNKYIVEDTEQINREREEN : .:: .: . .. .:: : . :.. :: . :. :..: . .. KIAA14 GEKPYKCKECGKAYNETSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKP 210 220 230 240 250 260 460 470 480 490 500 510 KIAA17 QGNVCKYCGKMCRSSNSMAFLAHIRTHTGSKPFKCKICHFATAQLGDARNHVKRHLGMRE :. ::: .: ... .: : ::: ::.::. : : .: . : : : . KIAA14 YK--CEECGKAFNQSANLT--THKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKP 270 280 290 300 310 320 520 530 540 550 560 570 KIAA17 YKCHVCGVAFVMKKHLNTHLLGKHGVGTPKERKFTCHLCDRSFTEKWALNNHMKLHTGEK :::. :: :: ... :.:: . . : :. . :. : ..:.. :..: ..:.::: KIAA14 YKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTG-----EKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRIHSGEK 330 340 350 360 370 580 590 600 610 620 630 KIAA17 PFKCTWPTCHYSFLTASAMKDHYRTHTGEKSFLCDLCGFAGGTRHALTKHRRQHTGEKPF :.:: : .: .:.. : : :.::: . :..:. : . :: :.: ::::::. KIAA14 PYKCE--ECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPY 380 390 400 410 420 430 640 650 660 670 680 690 KIAA17 KCDECNFASTTQSHLTRHKRVHTGEKPYRCPWCDYRSNCAENIRKH-ILHTGKHEGVKMY ::.::. : . .:.:: :: .:::::::.: : : . .. :: ..:::. . :. KIAA14 KCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGE-KPYKYE 440 450 460 470 480 490 700 710 720 730 740 KIAA17 NCPKC-DYGTNVPVEFRNHLKEQHPDIENPDLAYLHAGIVSKSYECRLKGQGATFVETDS .: : . .... .. : :. :. :. ...:... KIAA14 ECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNN 500 510 520 530 540 550 750 760 770 780 790 800 KIAA17 PFTAAALAEEPLVKEKPLRSSRRPAPPPEQVQQVIIFQGYDGEFALDPSVEETAAATLQT KIAA14 ACDNIAKISKYKRNCAGEK 560 570 >>KIAA1349 ( 752 res) fj00940 (752 aa) initn: 2275 init1: 285 opt: 639 Z-score: 495.5 bits: 103.0 E(): 1.8e-22 Smith-Waterman score: 777; 32.326% identity (57.907% similar) in 430 aa overlap (305-710:300-715) 280 290 300 310 320 KIAA17 SSIIRIKNPEDGELIDQSEEGLIATGVRISELPLK--DCAQGVKKKKS---EGSSIGEST : : : ::... ..:. . .. : KIAA13 TGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEK 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 KIAA17 RIRCDDCGFLADGLSGLNVHIAMKHPTKEKHFHCLLCGKSFYTESNLHQHLAS------- .:..:: . . .::: . : : :: :.: :::.. ..:.: :. . KIAA13 PYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRI-H-TGEKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPY 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 KIAA17 ----AGHMRNEQASVEE---LPEGGATFKCVKCTEPFDSEQNLFLHIK---GQHEELLRE :. :. :. : . : .:: .: . : . . : .: . :.. : KIAA13 ECNECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTE 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 490 KIAA17 VNKYIVEDTEQINRER--EENQGNVCKYCGKMCRSSNSMAFLAHIRTHTGSKPFKCKICH .: ..... : ..: :.. .:. ::. : .. .. .: : ::: ::.:: :. KIAA13 CGKAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLT--VHQRIHTGEKPYKCTDCE 450 460 470 480 490 500 500 510 520 530 540 550 KIAA17 FATAQLGDARNHVKRHLGMREYKCHVCGVAFVMKKHLNTHLLGKHGVGTPKERKFTCHLC : ... . ..: : : :.. :::. :: .: :..: .: . : :. . :. : KIAA13 RAFTKMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTG-----EKPYKCNEC 510 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 610 KIAA17 DRSFTEKWALNNHMKLHTGEKPFKCTWPTCHYSFLTASAMKDHYRTHTGEKSFLCDLCGF ...::. :. :.. ::::::.::. : : . :... : ::::::: : :. :: KIAA13 EKAFTNTSQLTVHQRRHTGEKPYKCN--ECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGK 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 KIAA17 AGGTRHALTKHRRQHTGEKPFKCDECNFASTTQSHLTRHKRVHTGEKPYRCPWCDYRSNC : . .:.:.. :.::::.::: :. : :.:: : :.::::::: : : ..: KIAA13 AFSQMVHVTEHQKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECG--KGC 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 KIAA17 AENIRKHILHTGKHEGVKMYNCPKCDYGTNVPVEFRNHLKEQHPDIENPDLAYLHAGIVS .. . :: : : . :.: .: . . .: ::. KIAA13 I-TLSQLTLHQRIHTGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSS 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 KIAA17 KSYECRLKGQGATFVETDSPFTAAALAEEPLVKEKPLRSSRRPAPPPEQVQQVIIFQGYD KIAA13 SSLTVHQRIHQRETQLI 740 750 >>KIAA1431 ( 891 res) fj00022 (891 aa) initn: 1774 init1: 319 opt: 631 Z-score: 488.7 bits: 102.0 E(): 4.2e-22 Smith-Waterman score: 705; 27.955% identity (54.784% similar) in 533 aa overlap (191-695:282-785) 170 180 190 200 210 220 KIAA17 VPHRHLCPVTLDGERSAESPVLVVTRITREQGNLESGGQNRVARGHGLEDLKGVQEDPVL ..: . :. .. . : .: ...: . KIAA14 PGLVTIKNLAVDFRQQLHPAQKNFCKNGIWENNSDLGSAGHCVAKPDLVSLLEQEKEPWM 260 270 280 290 300 310 230 240 250 260 270 KIAA17 GNKEI---LMNSQ---HET-EFILEEDGPASDSTVESSDVYETIISIDDKGQAMYSFGRF ..:. :...: ::: :.. ..:. : : ..:.. :. .. .. : ::: KIAA14 VKRELTGSLFSGQRSVHETQELFPKQDSYAEGVTDRTSNTKLDCSSFRENWDSDYVFGRK 320 330 340 350 360 370 280 290 300 310 KIAA17 ----DSSIIRIKNPEDGELIDQSEEGLIATGVRISELPL-------KDCAQGVKKK---- . . .: . .. ... .: . : : : .: .. .:. KIAA14 LAVGQETQFRQEPITHNKTLSKERERTYNKSGRWSYLDDSEEKVHNRDSIKNFQKSSVVI 380 390 400 410 420 430 320 330 340 350 360 370 KIAA17 KSEGSSIGESTRIRCDDCGFLADGLSGLNVHIAMKHPTKEKHFHCLLCGKSFYTESNLHQ :. : :.. ..:..: :.:.:: .. : :: ..: :::.: :.. . KIAA14 KQTGIYAGKKL-FKCNECKKTFTQSSSLTVH--QRIHTGEKPYKCNECGKAFSDGSSFAR 440 450 460 470 480 380 390 400 410 420 430 KIAA17 HLASAGHMRNEQASVEELPEGGATFKCVKCTEPFDSEQNLFLHIKGQH--EELLREVN-K : .. : ..:..: . : .. .:. : . : :. . .. KIAA14 H--------------QRCHTGKKPYECIECGKAFIQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCIDCG 490 500 510 520 530 440 450 460 470 480 490 KIAA17 YIVEDTEQINREREENQGNV---CKYCGKMCRSSNSMAFLAHIRTHTGSKPFKCKICHFA : .:..:. . :. : : : : ..:.. .: : ::: ::..: .:. : KIAA14 KAFSDHIGLNQHRRIHTGEKPYKCDVCHKSFRYGSSLT--VHQRIHTGEKPYECDVCRKA 540 550 560 570 580 590 500 510 520 530 540 550 KIAA17 TAQLGDARNHVKRHLGMREYKCHVCGVAFVMKKHLNTHLLGKHGVGTPKERKFTCHLCDR .. .. .: . : : . .::. :: :: .. :: .:: . : :. : : : . KIAA14 FSHHASLTQHQRVHSGEKPFKCKECGKAFRQNIHLASHLRIHTG-----EKPFECAECGK 600 610 620 630 640 560 570 580 590 600 610 KIAA17 SFTEKWALNNHMKLHTGEKPFKCTWPTCHYSFLTASAMKDHYRTHTGEKSFLCDLCGFAG ::. . : .:...::::::..: .: .: . . .: .:::::: . : :: : KIAA14 SFSISSQLATHQRIHTGEKPYEC--KVCSKAFTQKAHLAQHQKTHTGEKPYECKECGKAF 650 660 670 680 690 700 620 630 640 650 660 670 KIAA17 GTRHALTKHRRQHTGEKPFKCDECNFASTTQSHLTRHKRVHTGEKPYRCPWCDYRSNCAE . : .:.: ::::::.:: ::. : .: :.:.:.:::..::.: : . KIAA14 SQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCMECGKAFGDNSSCTQHQRLHTGQRPYECIECGKAFKTKS 710 720 730 740 750 760 680 690 700 710 720 730 KIAA17 NIRKHILHTGKHEGVKMYNCPKCDYGTNVPVEFRNHLKEQHPDIENPDLAYLHAGIVSKS .. : : .: : : :.: : KIAA14 SL---ICHRRSHTGEKPYECSVCGKAFSHRQSLSVHQRIHSGKKPYECKECRKTFIQIGH 770 780 790 800 810 820 >>KIAA1806 ( 481 res) fk00438 (481 aa) initn: 286 init1: 286 opt: 608 Z-score: 473.8 bits: 98.3 E(): 2.8e-21 Smith-Waterman score: 621; 32.573% identity (59.935% similar) in 307 aa overlap (394-693:173-468) 370 380 390 400 410 420 KIAA17 LLCGKSFYTESNLHQHLASAGHMRNEQASVEELPEGGATFKCVKCTEPFDSEQNLFLHIK :.. : .. : :: . : ..:. : : KIAA18 QYQRIHAGEASCECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEK 150 160 170 180 190 200 430 440 450 460 470 KIAA17 GQHEELLREVNK--YIVEDTEQINREREENQGNV---CKYCGKMCRSSNSMAFLAHIRTH . : . .. . . .. :. . . :. :. ::: . .. .. : :.: KIAA18 THTAEKCFDCQECGQAFKYSSNLRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTF--TRNFNLILHQRNH 210 220 230 240 250 260 480 490 500 510 520 530 KIAA17 TGSKPFKCKICHFATAQLGDARNHVKRHLGMREYKCHVCGVAFVMKKHLNTHLLGKHGVG :: ::..:: : : : .. :.::. : : . ..: :: :: .. :.::: : KIAA18 TGEKPYECKDCGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHLR-TH--- 270 280 290 300 310 540 550 560 570 580 590 KIAA17 TPKERKFTCHLCDRSFTEKWALNNHMKLHTGEKPFKCTWPTCHYSFLTASAMKDHYRTHT .:. . :. : . : . :: : ..::::: ..:. :: . :..:.:.:::: KIAA18 -TREKPYECNQCGKPFRTSTHLNVHKRIHTGEKLYECA--TCGQVLSRLSTLKSHMRTHT 320 330 340 350 360 370 600 610 620 630 640 650 KIAA17 GEKSFLCDLCGFAGGTRHALTKHRRQHTGEKPFKCDECNFASTTQSHLTRHKRVHTGEKP ::: ..:. :: : . .: :: : :.:.::. :.::. : .::: : :.:.. .: KIAA18 GEKPYVCQECGRAFSEPSSLRKHARTHSGKKPYACQECGRAFGQSSHLIVHVRTHSAGRP 380 390 400 410 420 430 660 670 680 690 700 710 KIAA17 YRCPWCD--YRSNCAENIRKHILHTGKHEGVKMYNCPKCDYGTNVPVEFRNHLKEQHPDI :.: :. .: . . ...:. :.:. : .. . : KIAA18 YQCNQCEKAFRHSSSLTVHKRT-HVGR-ETIRNGSLPLSMSHPYCGPLAN 440 450 460 470 480 720 730 740 750 760 770 KIAA17 ENPDLAYLHAGIVSKSYECRLKGQGATFVETDSPFTAAALAEEPLVKEKPLRSSRRPAPP >>KIAA0412 ( 720 res) hg03242 (720 aa) initn: 1821 init1: 296 opt: 605 Z-score: 469.8 bits: 98.2 E(): 4.7e-21 Smith-Waterman score: 719; 28.235% identity (54.790% similar) in 595 aa overlap (206-770:161-719) 180 190 200 210 220 230 KIAA17 SAESPVLVVTRITREQGNLESGGQNRVARGHGLEDL---KGVQEDPVLGNKEILMNSQHE :: : . ...: :.: ... KIAA04 LYQEVMLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPT 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 KIAA17 T-EFILEEDGPASDSTVESSDVYETIISIDDK-GQAMYSFGRFDSSI-IRIKNPEDGELI : : : : . .......: . . .:. : . .. :.: .: . :.: :.. KIAA04 TCEPALSEGISLQGQVTQGNSVDSQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSP--GKMS 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 340 KIAA17 DQSEEGL-IATGVRISELPLKDCAQGVKKKKSEGSSIG-------ESTRIRCDDCGFLAD . . :: : :: :.. .. . : . .. .. : : . ..:..:: . . KIAA04 PECD-GLGTADGV-CSRIGQEQVSPGDRVRSHNSCESGKDPMIQEEENNFKCSECGKVFN 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 400 KIAA17 GLSGLNVHIAMKHPTKEKHFHCLLCGKSFYTESNLHQHLASAGHMRNEQASVEELPEGGA : : : . : ..: :::.: ..: :: :: . : KIAA04 KKHLLAGH--EKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQH-----HM---------IHTGER 310 320 330 340 350 410 420 430 440 450 KIAA17 TFKCVKCTEPFDSEQNLFLHIK---GQHEELLREVNKYIVEDTEQI--NREREENQGNVC ..:..: . :. .. : : . :.. : .: ... .. . ::.. ... :: KIAA04 PYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVC 360 370 380 390 400 410 460 470 480 490 500 510 KIAA17 KYCGKMCRSSNSMAFLAHIRTHTGSKPFKCKICHFATAQLGDARNHVKRHLGMREYKCHV ::.. : . .:: : .:.: .:..: : . . . : . : : . :.: KIAA04 TECGQVFR--HRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSE 420 430 440 450 460 520 530 540 550 560 570 KIAA17 CGVAFVMKKHLNTHLLGKHGVGTPKERKFTCHLCDRSFTEKWALNNHMKLHTGEKPFKCT :: .:. . : : . . : :. : : : ..:... :. :...::::::: :. KIAA04 CGKVFLESAALIHHYVIHTG-----EKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCS 470 480 490 500 510 520 580 590 600 610 620 630 KIAA17 WPTCHYSFLTASAMKDHYRTHTGEKSFLCDLCGFAGGTRHALTKHRRQHTGEKPFKCDEC : .: :.. : :.::::: : : :: : ..:. : .: ::::::..: :: KIAA04 --ECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVEC 530 540 550 560 570 580 640 650 660 670 680 690 KIAA17 NFASTTQSHLTRHKRVHTGEKPYRCPWCDYRSNC-AENIRKH-ILHTGKHEGVKMYNCPK . : : .: ::::::.:.:::::.: : .: : . :. .: :.:::. : :.: . KIAA04 GKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECG-KSFCWSTNLIRHAIIHTGE----KPYKCSE 590 600 610 620 630 700 710 720 730 740 KIAA17 CDYGTNVPVEFRNHLKEQHPDIENP----DLAY-LHAGIVSKSYECRLKGQGATFVETDS : . . . .: ...: .:: :.. . .: .: . . : :. : :.. KIAA04 CGKAFSRSSSLTQH-QRMHTG-KNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEA 640 650 660 670 680 690 750 760 770 780 790 800 KIAA17 PF----TAAALAEEPLVKEKPLRSSRRPAPPPEQVQQVIIFQGYDGEFALDPSVEETAAA . :... ...: .: : :: KIAA04 NILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL 700 710 720 >>KIAA1710 ( 515 res) fj18457 (515 aa) initn: 1311 init1: 310 opt: 599 Z-score: 466.7 bits: 97.1 E(): 7.1e-21 Smith-Waterman score: 680; 33.239% identity (57.465% similar) in 355 aa overlap (333-681:185-514) 310 320 330 340 350 360 KIAA17 ISELPLKDCAQGVKKKKSEGSSIGESTRIRCDDCGFLADGLSGLNVHIAMKHPTKEKHFH :. :: . .: :: : .: : .. .. KIAA17 TAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRH--QKTHTGDRPYK 160 170 180 190 200 210 370 380 390 400 410 420 KIAA17 CLLCGKSFYTESNLHQHLASAGHMRNEQASVEELPEGGATFKCVKCTEPFDSEQNLFLHI : :::.: :.: :: ... . : : . : .: . : ..:. : KIAA17 CYECGKGFSRSSHLIQH---------QRTHTGERP-----YDCNECGKSFGRSSHLIQHQ 220 230 240 250 430 440 450 460 470 KIAA17 K---GQHEELLREVNKYIVEDTEQINREREEN--QGNVCKYCGKMCRSSNSMAFLAHIRT :.. . : .: . . .. :...: .. . :. ::: :. .: : :: KIAA17 TIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLA--QHQRT 260 270 280 290 300 310 480 490 500 510 520 530 KIAA17 HTGSKPFKCKICHFATAQLGDARNHVKRHLGMREYKCHVCGVAFVMKKHLNTHLLGKHGV ::: ::..:. : . .. .: .: . : : : ::: :: : ... : : .. : KIAA17 HTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTG- 320 330 340 350 360 370 540 550 560 570 580 590 KIAA17 GTPKERKFTCHLCDRSFTEKWALNNHMKLHTGEKPFKCTWPTCHYSFLTASAMKDHYRTH :. . :. : ..:.. : .:.. ::::::..:. .: :: .: . : . : KIAA17 ----EKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECN--ACGKSFSRSSHLITHQKIH 380 390 400 410 420 600 610 620 630 640 650 KIAA17 TGEKSFLCDLCGFAGGTRHALTKHRRQHTGEKPFKCDECNFASTTQSHLTRHKRVHTGEK :::: . :. : . : : : ::.: ::::::..: .:. . : .:.: :.::::::: KIAA17 TGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEK 430 440 450 460 470 480 660 670 680 690 700 710 KIAA17 PYRCPWCDYRSNCAENIRKHI-LHTGKHEGVKMYNCPKCDYGTNVPVEFRNHLKEQHPDI ::.: :. . . . :: .:: KIAA17 PYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD 490 500 510 >>KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 (702 aa) initn: 443 init1: 313 opt: 587 Z-score: 456.3 bits: 95.7 E(): 2.7e-20 Smith-Waterman score: 610; 28.675% identity (56.867% similar) in 415 aa overlap (446-848:291-687) 420 430 440 450 460 470 KIAA17 QNLFLHIKGQHEELLREVNKYIVEDTEQINREREENQGNVCKYCGKMCRSSNSMAFLAHI :.: . :: :::. . .. .:. : KIAA04 RRIWRSVKLKDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCGKVFKYNHFLAI--HQ 270 280 290 300 310 480 490 500 510 520 530 KIAA17 RTHTGSKPFKCKICHFATAQLGDARNHVKRHLGMREYKCHVCGVAFVMKKHLNTHLLGKH :.::: .::::. : . :: . . :.. : : : : : ::. :.. :. : :. . KIAA04 RSHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLHS 320 330 340 350 360 370 540 550 560 570 580 590 KIAA17 GVGTPKERKFTCHLCDRSFTEKWALNNHMKLHTGEKPFKCTWPTCHYSFLTASAMKDHYR : ...::: : . :... :..:...:::.. .: :: .:. .: .: : : KIAA04 G-----QKSFTCDQCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECK--DCHRKFMDVSQLKKHLR 380 390 400 410 420 430 600 610 620 630 640 650 KIAA17 THTGEKSFLCDLCGFAGGTRHALTKHRRQHTGEKPFKCDECNFASTTQSHLTRHKRVHTG :::::: : :..:: . .. .: : : : ::::..: :. . . .: :: .::: KIAA04 THTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTG 440 450 460 470 480 490 660 670 680 690 700 710 KIAA17 EKPYRCPWCDYRSNCAENIRKHI-LHTGKHEGVKMYNCPKCDYGTNVPVEFRNHLKEQHP .::. :: :. . .:.. :. .:. . : . . :.. : :: :. : KIAA04 KKPFSCPECNLQFARLDNLKAHLKIHSKE----KHASDASSISGSSNTEEVRNILQLQPY 500 510 520 530 540 720 730 740 750 760 KIAA17 DIENPDLAYLHAGIVSKSYECRL---KGQGATFV--ETDSPFTAAALAEEPLVKEKP--L .. . .. .... .. . .:: ..: :... .:: :. :. ..: : KIAA04 QLSTSGEQEIQLLVTDSVHNINFMPGPSQGISIVTAESSQNMTADQAANLTLLTQQPEQL 550 560 570 580 590 600 770 780 790 800 810 820 KIAA17 RSSRRPAPPP--EQVQQVIIFQGYDGEFALDP-SVEETAAATLQTLAMAGQVARVVHITE .. : :..:.. .... : .: : . ::. : . .. .:.. 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