# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj11471.fasta.huge -Q ../query/KIAA1695.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1695, 1199 aa vs ./tmplib.25089 library 1986306 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8247+/-0.0103; mu= -21.8390+/- 0.691 mean_var=460.0604+/-112.906, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.059795 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0381 ( 1114 res) ah04695 (1114) 506 59.0 4.9e-09 KIAA1727 ( 1130 res) pg00153 (1130) 415 51.1 1.1e-06 KIAA2014 ( 1032 res) ff00951s1 (1032) 375 47.6 1.2e-05 >>KIAA0381 ( 1114 res) ah04695 (1114 aa) initn: 151 init1: 151 opt: 506 Z-score: 254.1 bits: 59.0 E(): 4.9e-09 Smith-Waterman score: 506; 26.128% identity (55.639% similar) in 532 aa overlap (606-1120:587-1098) 580 590 600 610 620 630 KIAA16 RIQDMDFTDLGEEDDIDVLDVDLGHREAPGPPPPPPPTFLGLPPPPPPPLLDSIPPPPVP :::::: : :::::::: . :: : : KIAA03 LSELSTGPVSSPPPPGGPLTLSSSMTTNDLPPPPPPLPFACCPPPPPPPLPPGGPPTP-P 560 570 580 590 600 610 640 650 660 670 680 690 KIAA16 GNLLVPPPPVFNAPQGLGWSQVPRGQPTFTKKKKTIRLFWNEVRPFDWPCKNNRRCREFL : :: .. .:: : : . .:: . . .. :.: :..: . 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