# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj05607.fasta.nr -Q ../query/KIAA1692.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1692, 855 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826506 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0617+/-0.000182; mu= 13.4437+/- 0.010 mean_var=72.8990+/-14.224, 0's: 42 Z-trim: 47 B-trim: 174 in 1/66 Lambda= 0.150215 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|121946695|sp|Q14D04.1|MELT_HUMAN RecName: Full= ( 833) 5433 1187.4 0 gi|75517805|gb|AAI01661.1| Ventricular zone expres ( 833) 5427 1186.1 0 gi|57997102|emb|CAD28465.2| hypothetical protein [ ( 833) 5424 1185.4 0 gi|14042432|dbj|BAB55243.1| unnamed protein produc ( 833) 5423 1185.2 0 gi|114590032|ref|XP_001152820.1| PREDICTED: hypoth ( 833) 5392 1178.5 0 gi|109048564|ref|XP_001103348.1| PREDICTED: simila ( 833) 5311 1161.0 0 gi|149731066|ref|XP_001490074.1| PREDICTED: simila ( 833) 4846 1060.2 0 gi|73990750|ref|XP_542853.2| PREDICTED: similar to ( 895) 4767 1043.1 0 gi|81889310|sp|Q5PQS3.1|MELT_RAT RecName: Full=Ven ( 832) 4710 1030.7 0 gi|148683584|gb|EDL15531.1| ventricular zone expre ( 867) 4699 1028.3 0 gi|156632530|sp|A1A535.1|MELT_MOUSE RecName: Full= ( 833) 4684 1025.1 0 gi|21715976|dbj|BAC02920.1| Veph-A [Mus musculus] ( 833) 4676 1023.3 0 gi|126338443|ref|XP_001363324.1| PREDICTED: simila ( 835) 4184 916.7 0 gi|83405782|gb|AAI11018.1| VEPH1 protein [Homo sap ( 788) 4048 887.2 0 gi|114590042|ref|XP_516839.2| PREDICTED: ventricul ( 788) 4013 879.6 0 gi|109048570|ref|XP_001103203.1| PREDICTED: simila ( 788) 3946 865.1 0 gi|27769391|gb|AAH42159.1| VEPH1 protein [Homo sap ( 459) 3035 667.5 3.5e-189 gi|149048357|gb|EDM00933.1| rCG62520 [Rattus norve ( 763) 2962 651.9 3e-184 gi|119884937|ref|XP_618021.3| PREDICTED: similar t ( 446) 2115 468.1 3.6e-129 gi|134024922|gb|AAI34891.1| Veph protein [Danio re ( 451) 1717 381.9 3.4e-103 gi|193661967|ref|XP_001944371.1| PREDICTED: simila ( 837) 1628 362.8 3.4e-97 gi|21715980|dbj|BAC02922.1| Veph-B [Mus musculus] ( 253) 1610 358.5 2.1e-96 gi|12850732|dbj|BAB28831.1| unnamed protein produc ( 253) 1606 357.6 3.8e-96 gi|21715978|dbj|BAC02921.1| zVeph-A [Danio rerio] ( 813) 1426 319.0 5.1e-84 gi|156632529|sp|A2BID5.1|MELT_DANRE RecName: Full= ( 813) 1424 318.6 6.8e-84 gi|10434192|dbj|BAB14165.1| unnamed protein produc ( 173) 1169 262.8 9.1e-68 gi|210127845|gb|EEA75525.1| hypothetical protein B ( 722) 1168 263.1 3.1e-67 gi|210113769|gb|EEA61534.1| hypothetical protein B (2080) 1170 263.9 5.2e-67 gi|34783693|gb|AAH57999.1| VEPH1 protein [Homo sap ( 213) 1138 256.1 1.1e-65 gi|215508021|gb|EEC17475.1| conserved hypothetical ( 958) 1050 237.6 1.9e-59 gi|212510639|gb|EEB13775.1| conserved hypothetical ( 934) 881 200.9 2e-48 gi|108874713|gb|EAT38938.1| conserved hypothetical ( 990) 858 196.0 6.7e-47 gi|6513834|gb|AAF14808.1|AF205831_1 Melted [Drosop ( 717) 831 190.0 3e-45 gi|61678479|gb|AAX52758.1| melted, isoform B [Dros ( 988) 831 190.1 3.8e-45 gi|74948445|sp|Q9VS24.1|MELT_DROME RecName: Full=P ( 992) 831 190.1 3.9e-45 gi|115646451|gb|ABJ17062.1| IP16092p [Drosophila m ( 994) 831 190.1 3.9e-45 gi|194128754|gb|EDW50797.1| GM14823 [Drosophila se ( 986) 827 189.3 7e-45 gi|194195946|gb|EDX09522.1| GD13996 [Drosophila si ( 968) 825 188.8 9.3e-45 gi|194180100|gb|EDW93711.1| GE21597 [Drosophila ya ( 988) 825 188.8 9.5e-45 gi|157020079|gb|EAA04616.4| AGAP007472-PA [Anophel ( 985) 824 188.6 1.1e-44 gi|190653276|gb|EDV50519.1| GG14408 [Drosophila er ( 990) 823 188.4 1.3e-44 gi|194158524|gb|EDW73425.1| GK16654 [Drosophila wi (1023) 818 187.3 2.8e-44 gi|194118178|gb|EDW40221.1| GL25030 [Drosophila pe ( 991) 817 187.1 3.2e-44 gi|198149839|gb|EAL30838.2| GA21215 [Drosophila ps ( 991) 817 187.1 3.2e-44 gi|190623333|gb|EDV38857.1| GF25012 [Drosophila an ( 984) 810 185.6 9e-44 gi|109469392|ref|XP_578205.2| PREDICTED: similar t ( 173) 797 182.2 1.7e-43 gi|193919663|gb|EDW18530.1| GI13296 [Drosophila mo (1009) 802 183.9 3e-43 gi|194663641|ref|XP_001787261.1| PREDICTED: simila ( 123) 790 180.5 3.7e-43 gi|149629131|ref|XP_001515453.1| PREDICTED: simila ( 175) 791 180.9 4.2e-43 gi|193898886|gb|EDV97752.1| GH14519 [Drosophila gr (1013) 795 182.3 8.7e-43 >>gi|121946695|sp|Q14D04.1|MELT_HUMAN RecName: Full=Vent (833 aa) initn: 5433 init1: 5433 opt: 5433 Z-score: 6357.6 bits: 1187.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 5433; 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