# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh26207.fasta.nr -Q ../query/KIAA1688.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1688, 1094 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7811877 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7358+/-0.000199; mu= 12.3262+/- 0.011 mean_var=112.5648+/-21.203, 0's: 43 Z-trim: 91 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.120885 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|194382958|dbj|BAG59035.1| unnamed protein produ (1083) 7420 1305.9 0 gi|38148672|gb|AAH60637.1| DNA segment, Chr 15, Wa (1076) 6642 1170.2 0 gi|158508538|ref|NP_775145.2| hypothetical protein (1109) 5074 896.8 0 gi|149066065|gb|EDM15938.1| rCG59984 [Rattus norve (1203) 5074 896.8 0 gi|148697669|gb|EDL29616.1| DNA segment, Chr 15, W (1109) 5060 894.3 0 gi|26330688|dbj|BAC29074.1| unnamed protein produc (1097) 4987 881.6 0 gi|37994603|gb|AAH60065.1| D15Wsu169e protein [Mus ( 688) 4382 775.9 0 gi|194384040|dbj|BAG64793.1| unnamed protein produ ( 664) 2675 478.2 6.5e-132 gi|189541467|ref|XP_001919979.1| PREDICTED: simila ( 831) 2148 386.4 3.5e-104 gi|198435699|ref|XP_002125699.1| PREDICTED: simila ( 705) 1710 309.9 3.1e-81 gi|215499955|gb|EEC09449.1| RhoGAP protein, putati ( 500) 1644 298.2 7.1e-78 gi|193787356|dbj|BAG52562.1| unnamed protein produ ( 282) 1633 296.1 1.8e-77 gi|148725831|emb|CAN88013.1| novel protein (zgc:92 (1067) 1611 292.8 6.5e-76 gi|212506267|gb|EEB10527.1| hypothetical protein P (1210) 1608 292.4 1e-75 gi|55250376|gb|AAH85634.1| Zgc:92107 [Danio rerio] (1067) 1607 292.1 1.1e-75 gi|194035485|ref|XP_001925089.1| PREDICTED: simila ( 538) 1601 290.8 1.4e-75 gi|118100475|ref|XP_417317.2| PREDICTED: hypotheti (1381) 1416 258.9 1.3e-65 gi|210098190|gb|EEA46305.1| hypothetical protein B ( 292) 1366 249.5 1.9e-63 gi|47209028|emb|CAF91633.1| unnamed protein produc ( 474) 1340 245.2 6.2e-62 gi|167867888|gb|EDS31271.1| RhoGAP93B [Culex quinq (1283) 1288 236.6 6.7e-59 gi|163776055|gb|EDQ89677.1| predicted protein [Mon ( 747) 1200 221.0 1.9e-54 gi|118087474|ref|XP_001231603.1| PREDICTED: hypoth ( 233) 1192 219.1 2.2e-54 gi|47227307|emb|CAF96856.1| unnamed protein produc ( 909) 1141 210.8 2.7e-51 gi|158598344|gb|EDP36256.1| RhoGAP domain containi ( 670) 1091 201.9 9.4e-49 gi|187027501|emb|CAP33466.1| Hypothetical protein ( 646) 974 181.5 1.3e-42 gi|193610563|ref|XP_001947126.1| PREDICTED: simila (1093) 960 179.3 9.9e-42 gi|108878019|gb|EAT42244.1| hypothetical protein A (1250) 910 170.6 4.6e-39 gi|194129575|gb|EDW51618.1| GM15105 [Drosophila se ( 674) 902 169.0 7.9e-39 gi|157017376|gb|EDO64145.1| AGAP004526-PA [Anophel ( 198) 857 160.6 7.8e-37 gi|116508664|gb|EAU91559.1| hypothetical protein C ( 489) 839 157.8 1.3e-35 gi|110765869|ref|XP_392788.3| PREDICTED: similar t (1054) 830 156.6 6.5e-35 gi|210091994|gb|EEA40231.1| hypothetical protein B (1034) 817 154.3 3.1e-34 gi|190588669|gb|EDV28691.1| hypothetical protein T ( 231) 807 151.9 3.6e-34 gi|125847166|ref|XP_689026.2| PREDICTED: si:ch211- ( 122) 717 135.9 1.2e-29 gi|55962493|emb|CAI11976.1| novel protein [Danio r ( 120) 712 135.1 2.2e-29 gi|50260425|gb|EAL23082.1| hypothetical protein CN ( 810) 709 135.4 1.2e-28 gi|57223351|gb|AAW41395.1| conserved hypothetical ( 810) 709 135.4 1.2e-28 gi|190627972|gb|EDV43496.1| GF18519 [Drosophila an ( 164) 668 127.5 5.7e-27 gi|151302928|gb|AAK19005.5| Hypothetical protein Y ( 397) 656 125.8 4.5e-26 gi|115943091|ref|XP_798334.2| PREDICTED: similar t (1348) 652 125.7 1.7e-25 gi|210097778|gb|EEA45900.1| hypothetical protein B ( 127) 634 121.5 2.9e-25 gi|215459077|gb|EEB93607.1| hypothetical protein M ( 352) 607 117.2 1.5e-23 gi|156214806|gb|EDO35783.1| predicted protein [Nem ( 151) 556 108.0 4.1e-21 gi|194143065|gb|EDW59468.1| GJ10274 [Drosophila vi (1359) 566 110.7 5.6e-21 gi|121878067|gb|EAX84836.1| RhoGAP domain containi ( 576) 561 109.4 5.6e-21 gi|156214805|gb|EDO35782.1| predicted protein [Nem ( 254) 556 108.2 5.9e-21 gi|193915237|gb|EDW14104.1| GI23523 [Drosophila mo (1331) 561 109.8 1e-20 gi|190651045|gb|EDV48300.1| GG14905 [Drosophila er (1328) 556 108.9 1.8e-20 gi|33589556|gb|AAQ22545.1| LD10379p [Drosophila me ( 824) 548 107.3 3.5e-20 gi|194129574|gb|EDW51617.1| GM15103 [Drosophila se ( 654) 545 106.7 4.3e-20 >>gi|194382958|dbj|BAG59035.1| unnamed protein product [ (1083 aa) initn: 7420 init1: 7420 opt: 7420 Z-score: 6994.2 bits: 1305.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 7420; 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