# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh23774.fasta.nr -Q ../query/KIAA1682.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1682, 775 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826479 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2690+/-0.000184; mu= 13.0516+/- 0.010 mean_var=75.6394+/-14.810, 0's: 38 Z-trim: 44 B-trim: 99 in 1/65 Lambda= 0.147469 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|109076873|ref|XP_001089010.1| PREDICTED: simila ( 840) 5285 1134.2 0 gi|166199459|sp|Q9C0I1.2|MTMRC_HUMAN RecName: Full ( 747) 5097 1094.2 0 gi|15192141|gb|AAK26171.1| phosphatidylinositol-3 ( 747) 5095 1093.8 0 gi|75041695|sp|Q5R989.1|MTMRC_PONAB RecName: Full= ( 747) 5031 1080.1 0 gi|73954361|ref|XP_855452.1| PREDICTED: similar to ( 790) 4640 997.0 0 gi|166199460|sp|Q80TA6.2|MTMRC_MOUSE RecName: Full ( 747) 4596 987.6 0 gi|166199454|sp|Q5FVM6.2|MTMRC_RAT RecName: Full=M ( 748) 4532 974.0 0 gi|148671323|gb|EDL03270.1| Vmyotubularin related ( 720) 4420 950.1 0 gi|148671321|gb|EDL03268.1| Vmyotubularin related ( 614) 3602 776.1 0 gi|34783714|gb|AAH57393.1| MTMR12 protein [Homo sa ( 693) 3459 745.7 1.4e-212 gi|58476507|gb|AAH89876.1| Myotubularin related pr ( 587) 3392 731.4 2.5e-208 gi|149027295|gb|EDL82962.1| rCG23675 [Rattus norve ( 544) 3386 730.1 5.6e-208 gi|74002680|ref|XP_849317.1| PREDICTED: similar to ( 736) 3204 691.4 3.2e-196 gi|119631192|gb|EAX10787.1| myotubularin related p ( 637) 3063 661.4 3.1e-187 gi|114600792|ref|XP_001155493.1| PREDICTED: hypoth ( 637) 3057 660.1 7.5e-187 gi|7020602|dbj|BAA91195.1| unnamed protein product ( 637) 3051 658.8 1.8e-186 gi|148671322|gb|EDL03269.1| Vmyotubularin related ( 499) 2966 640.7 4.2e-181 gi|119913292|ref|XP_614802.3| PREDICTED: similar t ( 470) 2854 616.8 5.9e-174 gi|50949510|emb|CAH10604.1| hypothetical protein [ ( 394) 2693 582.5 1.1e-163 gi|166199425|sp|A2BGG1.1|MTMRC_DANRE RecName: Full ( 736) 2609 564.8 4.1e-158 gi|67971600|dbj|BAE02142.1| unnamed protein produc ( 361) 2476 536.3 7.8e-150 gi|26345156|dbj|BAC36227.1| unnamed protein produc ( 475) 2436 527.9 3.5e-147 gi|82185479|sp|Q6NU08.1|MTRAB_XENLA RecName: Full= ( 764) 1461 320.6 1.4e-84 gi|189442305|gb|AAI67641.1| LOC100170581 protein [ ( 764) 1451 318.5 6.2e-84 gi|194676733|ref|XP_872338.3| PREDICTED: similar t ( 764) 1435 315.1 6.5e-83 gi|149410838|ref|XP_001509867.1| PREDICTED: simila ( 803) 1431 314.3 1.2e-82 gi|82180137|sp|Q5U581.1|MTRAA_XENLA RecName: Full= ( 765) 1400 307.6 1.1e-80 gi|54261517|gb|AAH84670.1| MGC81352 protein [Xenop ( 697) 1337 294.2 1.1e-76 gi|145566797|sp|A0JMF6.1|MTMRA_DANRE RecName: Full ( 752) 1288 283.8 1.7e-73 gi|126277242|ref|XP_001373756.1| PREDICTED: simila ( 767) 1254 276.6 2.6e-71 gi|126326393|ref|XP_001369054.1| PREDICTED: simila ( 769) 1252 276.2 3.4e-71 gi|126343568|ref|XP_001362399.1| PREDICTED: simila ( 769) 1251 275.9 4e-71 gi|149057063|gb|EDM08386.1| similar to BB128963 pr ( 771) 1229 271.3 1e-69 gi|109458864|ref|XP_219705.4| PREDICTED: similar t ( 861) 1229 271.3 1.1e-69 gi|73951013|ref|XP_536168.2| PREDICTED: similar to ( 767) 1225 270.4 1.8e-69 gi|73951015|ref|XP_856569.1| PREDICTED: similar to ( 781) 1225 270.4 1.9e-69 gi|32967638|gb|AAH55074.1| Mtmr10 protein [Mus mus ( 689) 1220 269.3 3.5e-69 gi|194034536|ref|XP_001927143.1| PREDICTED: simila ( 766) 1220 269.3 3.8e-69 gi|215274100|sp|Q7TPM9.2|MTMRA_MOUSE RecName: Full ( 771) 1220 269.4 3.9e-69 gi|194206364|ref|XP_001917120.1| PREDICTED: myotub ( 768) 1215 268.3 8.1e-69 gi|117644504|emb|CAL37747.1| hypothetical protein ( 777) 1200 265.1 7.4e-68 gi|215274131|sp|Q9NXD2.3|MTMRA_HUMAN RecName: Full ( 777) 1199 264.9 8.6e-68 gi|109080446|ref|XP_001109855.1| PREDICTED: simila ( 775) 1192 263.4 2.4e-67 gi|37194862|gb|AAH58196.1| Mtmr10 protein [Mus mus ( 509) 1093 242.2 3.8e-61 gi|198424041|ref|XP_002126300.1| PREDICTED: simila ( 908) 1077 239.0 6.3e-60 gi|91077084|ref|XP_969828.1| PREDICTED: similar to ( 639) 1071 237.6 1.2e-59 gi|156547615|ref|XP_001603556.1| PREDICTED: simila ( 665) 1056 234.4 1.1e-58 gi|47230401|emb|CAF99594.1| unnamed protein produc ( 500) 997 221.8 5.3e-55 gi|115647135|ref|XP_001199880.1| PREDICTED: simila ( 529) 950 211.8 5.7e-52 gi|210090065|gb|EEA38352.1| hypothetical protein B ( 679) 937 209.1 4.7e-51 >>gi|109076873|ref|XP_001089010.1| PREDICTED: similar to (840 aa) initn: 5285 init1: 5285 opt: 5285 Z-score: 6070.9 bits: 1134.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 5285; 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