# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh23774.fasta.huge -Q ../query/KIAA1682.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1682, 775 aa vs ./tmplib.25089 library 1986730 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3119+/-0.00572; mu= 15.6773+/- 0.390 mean_var=110.3317+/-25.575, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.122102 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1073 ( 675 res) hj06550 ( 675) 392 80.0 8.7e-16 KIAA0371 ( 1203 res) hh00252 (1203) 374 77.1 1.1e-14 KIAA0647 ( 1195 res) hj03819s1 (1195) 352 73.3 1.7e-13 >>KIAA1073 ( 675 res) hj06550 (675 aa) initn: 463 init1: 204 opt: 392 Z-score: 375.3 bits: 80.0 E(): 8.7e-16 Smith-Waterman score: 536; 27.580% identity (56.473% similar) in 533 aa overlap (73-569:110-588) 50 60 70 80 90 100 KIAA16 APKPSFVSYVRPEEIHTNEKEVTEKEVTLHLLPGEQLLCEASTVLKYVQEDSCQH--GVY :::::.. :. : :. : .: KIAA10 DSISTSADNFSPDLRVLRESNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVT-YI----CPFTGAVR 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 KIAA16 GRLVCTDFKIAFLGDDESALDNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQIYGVFDEKKKTLFGQL : :. :.... : .... : . .: ... :..: :. . . .. .: KIAA10 GTLTVTNYRLYF-----KSMERDPPFVLDASLG----VINRVEKIGGA-SSRGENSYG-- 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 KIAA16 KKYPEKLIIHCKDLRVFQFCLRYTKEEEVKRIVSGIIHHTQAPKLLKRLFLFSYATAAQN : :::.: ..: . : ...: . . . : . . : ::.. . 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