# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh23697.fasta.huge -Q ../query/KIAA1681.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1681, 1236 aa vs ./tmplib.25089 library 1986269 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.7606+/-0.0149; mu= -44.1328+/- 1.010 mean_var=983.3703+/-231.852, 0's: 0 Z-trim: 44 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.040899 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 579 50.8 2e-06 KIAA0207 ( 605 res) ha02795 ( 605) 523 47.1 1e-05 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 523 47.3 1.5e-05 KIAA0304 ( 2415 res) af07172 (2415) 495 46.0 8.7e-05 KIAA1887 ( 967 res) fk02232 ( 967) 438 42.3 0.00046 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 452 43.4 0.00047 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 430 41.9 0.00084 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 422 41.4 0.001 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 394 39.6 0.0025 KIAA0618 ( 1052 res) hg03971 (1052) 386 39.2 0.0041 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 380 38.9 0.0056 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 370 38.3 0.0083 KIAA0346 ( 1682 res) hg01508s1 (1682) 373 38.6 0.0098 >>KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552 aa) initn: 381 init1: 235 opt: 579 Z-score: 207.1 bits: 50.8 E(): 2e-06 Smith-Waterman score: 610; 28.131% identity (49.546% similar) in 551 aa overlap (498-1019:608-1116) 470 480 490 500 510 520 KIAA16 IKYLCCDDVRTLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLSSSSIKSGSSSS : ..: .:: .:: .::.. . 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KIAA02 WTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQ--VESTMASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQM 220 230 240 250 260 270 360 370 380 390 400 410 KIAA16 ETAEMADRNKEVLLEECFCGSSVTVPEIEGVLWLKDDGKKSWKKRYFLLRASGIYYVPKG : . . .... : . : .:: . :::.: : .:. ::::::: : :: ::.: :: KIAA02 VTWCQQSNGSQTQLLQNFLNSS-SCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKG 280 290 300 310 320 330 420 430 440 450 460 470 KIAA16 KAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVLKHPQIQKKSQYIKYLCCDDVR .: : : . .:. :.. :..:.::::. : .: ....... .. :: .: . KIAA02 TSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQ 340 350 360 370 380 390 480 490 500 510 520 530 KIAA16 TLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLSSSSIKSGSSSSSIPESQSNHS : :....:. ::: ::.::. .: : :. ..: : .: . . :... 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KIAA15 VTSLRSPGASVSSSLTSLCSSSSDPAPSDRSGPQILTPLGDRFVIPPHPKVPAPFSPPPS 570 580 590 600 610 620 770 780 790 800 810 KIAA16 AP--PKPLV-------TIPAPTSTKTVAPVVTQAAPPTPTPPVPPAKKQPAFPASYIPPS : :.: . ..:.:.:: ..: .:::: . : ...:.. . :: KIAA15 KPRSPNPAAPALAAPAVVPGPVSTTDASP----QSPPTPQTTLTPLQESPVISKDQSPPP 630 640 650 660 670 680 820 830 840 850 860 870 KIAA16 PPTPPVPVPPPTLPKQQSFCAKPPPSPLSPVPSVVKQIASQFPPPPTPPAMESQPLKPVP : : ::: : . : : . : ... ..:::: ::: : : : KIAA15 SPPPSYHPPPPPTKKPEVVVEAPSASETAEEP--LQD--PNWPPPP-PPAPEEQDL---- 690 700 710 720 730 880 890 900 910 920 KIAA16 ANVAPQSPP--AVKAKPKWQPSSIPVPSPDFPPPPPESS------LVFPPPPPSPVPAPP ..: :: : . . .:.. : ::.. : :: . :: :.: :::: KIAA15 -SMADFPPPEEAFFSVASPEPAG-PSGSPELVSSPAASSSSATALQIQPPGSPDPPPAPP 740 750 760 770 780 790 930 940 950 960 970 980 KIAA16 PPPPPTASPTPDKSGSPGKKTSKTSSPGGKKPPPTPQRNSSIKSSSGAEHPEPKRPSVDS : : ...: . : :. :. :: :: . .. . . ::. . KIAA15 APAPASSAPG-HVAKLPQKEPVGCSKGGG---PPREDVGAPLVT-----------PSLLQ 800 810 820 830 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA16 LVSKFTPPAESGSPSKETLPPPAAPPKPGKLNLSG----VNLPGVLQQGCVSAKAPVLSG .: . : .:.:. :.:: :: . ::: : :. .. : :: :.. KIAA15 MVRLRSVGAPGGAPTPAL--GPSAPQKPLRRALSGRASPVPAPSSGLHAAVRLKACSLAA 840 850 860 870 880 890 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA16 RGKDSVVEFPSPPSDSDFPPPPPETDLPLPPIEIPAVFSGNTSPKVAVVNP-QPQQWSKM : .. :. : ... : ::.. : .:: . : :. . : .:. . . KIAA15 SEGLSSAQ-PNGPPEAE--PRPPQS----PASTASFIFS-KGSRKLQLERPVSPETQADL 900 910 920 930 940 1110 1120 1130 1140 KIAA16 ---------SVKKAPPPTRPKRNDSTRLTQAEISEQPTMATVVPQVPTSPKSS-LSVQP- :... :: ::.. .. ....:.... : :. :.. :.. : KIAA15 QRNLVAELRSISEQRPPQAPKKSPKA---PPPVARKPSVGVPPPASPSYPRAEPLTAPPT 950 960 970 980 990 1000 1150 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA16 -GFLADLNRTLQRKSITRHGSLSSRMSRAEPTATMDDMALPPPPPELLSDQQKAGYGGSH :. .:: .. ....:.. 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KIAA03 SWQDVPQRRVGSGQGGSPCWKKQ-------EQKLDDEEEEKKEEEEK--DKEGEEKEERA 40 50 60 70 80 580 590 600 610 620 630 KIAA16 TQLEESSKARMESMNRPYTSLVPPLSPQPKIVTPYTASQPSPPLPPPPPPPPPPPPPPPP . : :. : . : :.:: .:.: : ...: ::: :::::: ::: : : KIAA03 VAEEMMPAAEKEEAKLPPPPLTPP-APSPPPPLPPPSTSPPPPLCPPPPPPVSPPPLPSP 90 100 110 120 130 140 640 650 660 670 680 690 KIAA16 PPPPLPSQSAPSAGSAAPMFVKYSTITRLQNASQHSGALFKPPTPPVMQSQSVKPQILVP :::: .. : ..: . :.. : .:: : .... . . KIAA03 PPPPAQEEQEESPPPVVPA-----------TCSRKRG---RPPLTPSQRAE--REAARAG 150 160 170 180 700 710 720 KIAA16 PNGVVPPPPPP------PPPPTPGSAMAQ---LK-------PAPCAPS-----LPQ-F-- :.:. :: : : :: .: : . :: :. : : :. : KIAA03 PEGTSPPTPTPSTATGGPPEDSPTVAPKSTTFLKNIRQFIMPVVSARSSRVIKTPRRFMD 190 200 210 220 230 240 730 740 750 760 770 780 KIAA16 SAPPPPLKIHQVQHITQVAPP--TPPPPP--PIPAPLPPQAPPKPLVTIPAPTSTKTV-- :: : :. .:. . . :: : :: : : :.: ::.:: : . .: : . ... KIAA03 EDPPKPPKV-EVSPVLR--PPITTSPPVPQEPAPVPSPPRAPTPPSTPVPLPEKRRSILR 250 260 270 280 290 300 790 800 810 KIAA16 AP------VVTQAAPPTPTPPVPPAKKQPAFPAS--------YIPPSPPTPP-------V : .. . :: :.:: ::: . : ::. : :. : KIAA03 EPTFRWTSLTRELPPPPPAPPPPPAPSPPPAPATSSRRPLLLRAPQFTPSEAHLKIYESV 310 320 330 340 350 360 820 830 840 850 860 870 KIAA16 PVPPPTLPKQQSFCAKPPP---SPLSPVPSVVKQIASQFPPPPTPPAMESQPLKPVPANV .::: : .. .::: :: : : .: . .... : :.. . :: :.: KIAA03 LTPPP-LGAPEAPEPEPPPADDSPAEPEPRAVGR-TNHLSLPRFAPVVTT----PVKAEV 370 380 390 400 410 880 890 900 910 920 930 KIAA16 APQSPPAVKAKPKWQPSSI-PVPS--PDFPP---PPPESSLVFPPPPPSPVPAPPPPPPP .:.. ::.. :. : . . :. . .. : :::. .: ::::: :: KIAA03 SPHGAPALSNGPQTQAQLLQPLQALQTQLLPQALPPPQPQL---QPPPSPQQMPPLEKAR 420 430 440 450 460 470 940 950 960 970 980 990 KIAA16 TASPTPDKSGSPGKKTSKTSSPGGKKPPPTPQRNSSIKSSSGAEHPEPKRPSVDSLVSKF KIAA03 IAGVGSLPLSGVEEKMFSLLKRAKVQLFKIDQQQQQKVAASMPLSPGGQMEEVAGAVKQI 480 490 500 510 520 530 >>KIAA1887 ( 967 res) fk02232 (967 aa) initn: 140 init1: 140 opt: 438 Z-score: 164.8 bits: 42.3 E(): 0.00046 Smith-Waterman score: 563; 26.569% identity (46.715% similar) in 685 aa overlap (583-1194:134-773) 560 570 580 590 600 610 KIAA16 VRSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEESSKARMESMNRPYTSLVPP--LSPQPKIVTPYTASQP :... . .:. : : : :... : : KIAA18 PGPPSARPPCRVPPTTPLNGGPGSLPPEPPSVSQAFPTLAGPGGLFP-PRLADPV----P 110 120 130 140 150 620 630 640 650 660 670 KIAA16 SPPLPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPLPSQSAPSAGSAAPMFVKYSTITRLQNASQHSGALF : : : : : ::::: : .::: . .: . . : . .. : KIAA18 SGGSSSPRFLPRGNAPSPAPPPPPAISLNAPSYNWGAAL--RSSLVPSDLGSPPAPHASS 160 170 180 190 200 210 680 690 700 710 720 KIAA16 KPPT-PPVMQ-SQSVKPQILVPPNGVVPPPPPPPPPPTPGSAMAQ---LKPAPCAPSLPQ .::. ::... :... : : : :.. : : ::. ...: : : ::.. 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