# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh23184mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA1635.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1635, 1435 aa vs ./tmplib.25089 library 1986070 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1531+/-0.0101; mu= -0.2780+/- 0.688 mean_var=389.7330+/-90.941, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.064967 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0192 ( 2124 res) ha02370 (2124) 2175 219.7 4.6e-57 KIAA1048 ( 897 res) hh02560 ( 897) 244 38.2 0.0084 >>KIAA0192 ( 2124 res) ha02370 (2124 aa) initn: 5043 init1: 1845 opt: 2175 Z-score: 1116.4 bits: 219.7 E(): 4.6e-57 Smith-Waterman score: 5267; 58.462% identity (77.324% similar) in 1495 aa overlap (1-1430:685-2122) 10 20 30 KIAA16 FPIPLDESSSHECNQRTILLYGVGKERDEA :::: .:: ::::::: ..:.::::.::.: KIAA01 KEVKPPPKEKIEGTLGVLYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDA 660 670 680 690 700 710 40 50 60 70 KIAA16 RHQLKKITKDILKILNKKSTTETGV----------------GDEGQKARKNKQETFPTLE :: .:::::::::.::.:.:.:: :..::: :.:. :.::: : KIAA01 RHAIKKITKDILKVLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAE 720 730 740 750 760 770 80 90 100 110 120 130 KIAA16 TVFTKLQLLSYFDQHQVTSQISNNVLEQITSFASGTSYHLPLAHHIQLIFDLMEPALNIN .:.:.: ::..::::::.:.: :::::::::: : ::::::..:.:.:::::: .:.:. 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