# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj13890.fasta.nr -Q ../query/KIAA1617.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1617, 904 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7823620 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4129+/-0.00019; mu= 12.9531+/- 0.011 mean_var=88.8656+/-16.847, 0's: 33 Z-trim: 46 B-trim: 74 in 1/64 Lambda= 0.136053 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|67461560|sp|Q5VUG0.1|SMBT2_HUMAN RecName: Full= ( 894) 6149 1217.6 0 gi|109088168|ref|XP_001118715.1| PREDICTED: Scm-li ( 881) 5826 1154.2 0 gi|73949162|ref|XP_850333.1| PREDICTED: similar to ( 894) 5659 1121.5 0 gi|149743590|ref|XP_001500014.1| PREDICTED: simila ( 894) 5655 1120.7 0 gi|119923717|ref|XP_607062.3| PREDICTED: similar t ( 891) 5593 1108.5 0 gi|67461554|sp|Q5DTW2.2|SMBT2_MOUSE RecName: Full= ( 938) 3956 787.2 0 gi|74188606|dbj|BAE28050.1| unnamed protein produc ( 942) 3952 786.4 0 gi|74184795|dbj|BAE27994.1| unnamed protein produc ( 975) 3805 757.6 6.1e-216 gi|189518188|ref|XP_683042.3| PREDICTED: Scm-like ( 858) 3690 735.0 3.4e-209 gi|55962228|emb|CAI11875.1| novel protein similar ( 860) 3690 735.0 3.5e-209 gi|50754123|ref|XP_414254.1| PREDICTED: similar to ( 867) 3375 673.1 1.4e-190 gi|109039126|ref|XP_001084404.1| PREDICTED: simila ( 863) 3351 668.4 3.7e-189 gi|126336618|ref|XP_001380240.1| PREDICTED: simila ( 917) 3287 655.9 2.3e-185 gi|109039108|ref|XP_001084525.1| PREDICTED: simila ( 866) 3270 652.5 2.3e-184 gi|6635353|gb|AAF19794.1|AF168132_1 RU1 [Homo sapi ( 866) 3268 652.1 3e-184 gi|67461585|sp|Q9UHJ3.2|SMBT1_HUMAN RecName: Full= ( 866) 3268 652.1 3e-184 gi|73985463|ref|XP_850085.1| PREDICTED: similar to ( 866) 3268 652.1 3e-184 gi|114587351|ref|XP_001172770.1| PREDICTED: Scm-li ( 866) 3267 651.9 3.4e-184 gi|76648990|ref|XP_589414.2| PREDICTED: Scm-like w ( 865) 3261 650.8 7.7e-184 gi|149728585|ref|XP_001492212.1| PREDICTED: Scm-li ( 866) 3248 648.2 4.5e-183 gi|67461213|sp|Q9JMD2.2|SMBT1_RAT RecName: Full=Sc ( 863) 3228 644.3 6.9e-182 gi|8100077|dbj|BAA96304.1| polycomb-group protein ( 863) 3227 644.1 7.9e-182 gi|67461581|sp|Q9JMD1.1|SMBT1_MOUSE RecName: Full= ( 863) 3188 636.4 1.6e-179 gi|109039123|ref|XP_001084282.1| PREDICTED: simila ( 823) 2835 567.1 1.1e-158 gi|114587359|ref|XP_516523.2| PREDICTED: Scm-like ( 823) 2833 566.7 1.5e-158 gi|119585675|gb|EAW65271.1| Scm-like with four mbt ( 823) 2833 566.7 1.5e-158 gi|210101401|gb|EEA49466.1| hypothetical protein B ( 841) 2589 518.8 3.9e-144 gi|110331867|gb|ABG67039.1| Scm-like with four mbt ( 639) 2575 516.0 2.1e-143 gi|116283581|gb|AAH18217.1| Sfmbt1 protein [Mus mu ( 644) 2520 505.2 3.8e-140 gi|74140645|dbj|BAE35882.1| unnamed protein produc ( 636) 2504 502.1 3.3e-139 gi|74191808|dbj|BAE32857.1| unnamed protein produc ( 637) 2503 501.9 3.8e-139 gi|27370691|gb|AAH36972.1| Sfmbt1 protein [Mus mus ( 591) 2343 470.4 1e-129 gi|5262586|emb|CAB45734.1| hypothetical protein [H ( 711) 2298 461.7 5.3e-127 gi|42490841|gb|AAH66188.1| Sfmbt1 protein [Mus mus ( 465) 1725 349.0 2.8e-93 gi|148676061|gb|EDL08008.1| mCG20492 [Mus musculus ( 836) 1693 343.0 3.4e-91 gi|149021009|gb|EDL78616.1| Scm-like with four mbt ( 696) 1665 337.4 1.3e-89 gi|215506897|gb|EEC16391.1| conserved hypothetical ( 635) 1502 305.4 5.3e-80 gi|29028244|gb|AAO61788.1| Scm-related protein [Mu ( 533) 1246 255.1 6.2e-65 gi|56204571|emb|CAI19140.1| Scm-like with four mbt ( 186) 1202 246.0 1.1e-62 gi|156213894|gb|EDO34899.1| predicted protein [Nem ( 556) 1126 231.5 7.9e-58 gi|210109552|gb|EEA57421.1| hypothetical protein B ( 382) 1085 223.3 1.6e-55 gi|189525155|ref|XP_001922723.1| PREDICTED: Scm-li ( 891) 1082 223.1 4.5e-55 gi|47218992|emb|CAG02030.1| unnamed protein produc ( 954) 1060 218.8 9.3e-54 gi|47218292|emb|CAG04124.1| unnamed protein produc ( 875) 1018 210.5 2.7e-51 gi|56204572|emb|CAI19141.1| Scm-like with four mbt ( 160) 1008 207.9 3e-51 gi|169642215|gb|AAI60499.1| LOC100145310 protein [ ( 310) 1008 208.1 4.8e-51 gi|210109551|gb|EEA57420.1| hypothetical protein B ( 583) 1009 208.6 6.7e-51 gi|149597039|ref|XP_001517938.1| PREDICTED: simila ( 288) 997 206.0 2e-50 gi|26333843|dbj|BAC30639.1| unnamed protein produc ( 183) 979 202.3 1.7e-49 gi|74214191|dbj|BAE40348.1| unnamed protein produc ( 216) 979 202.3 1.9e-49 >>gi|67461560|sp|Q5VUG0.1|SMBT2_HUMAN RecName: Full=Scm- (894 aa) initn: 6149 init1: 6149 opt: 6149 Z-score: 6520.1 bits: 1217.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 6149; 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