# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj12627.fasta.nr -Q ../query/KIAA1611.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1611, 813 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7797353 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9063+/-0.000187; mu= 11.2449+/- 0.010 mean_var=78.6017+/-15.080, 0's: 41 Z-trim: 232 B-trim: 82 in 1/65 Lambda= 0.144663 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|20138732|sp|Q9HCG1.2|ZN160_HUMAN RecName: Full= ( 818) 5780 1217.3 0 gi|63102294|gb|AAH94880.1| Zinc finger protein 160 ( 818) 5770 1215.2 0 gi|109125901|ref|XP_001116710.1| PREDICTED: zinc f ( 818) 5691 1198.7 0 gi|119592517|gb|EAW72111.1| zinc finger protein 16 ( 782) 5558 1170.9 0 gi|109125905|ref|XP_001116703.1| PREDICTED: zinc f ( 782) 5486 1155.9 0 gi|10440398|dbj|BAB15732.1| FLJ00032 protein [Homo ( 705) 5040 1062.8 0 gi|14348588|gb|AAK61306.1|AF277623_1 KRAB zinc fin ( 556) 3885 821.6 0 gi|51476882|emb|CAH18407.1| hypothetical protein [ ( 510) 3675 777.8 0 gi|211057416|ref|NP_001129971.1| zinc finger prote ( 924) 3508 743.1 1.1e-211 gi|74761506|sp|Q9H7R5.1|ZN665_HUMAN RecName: Full= ( 613) 3220 682.9 1.1e-193 gi|75070653|sp|Q5R8X1.1|ZN665_PONAB RecName: Full= ( 613) 3215 681.8 2.2e-193 gi|158256242|dbj|BAF84092.1| unnamed protein produ ( 678) 3214 681.7 2.7e-193 gi|134254457|ref|NP_079009.3| zinc finger protein ( 678) 3212 681.2 3.6e-193 gi|112180405|gb|AAH33199.1| Zinc finger protein 61 ( 781) 3090 655.8 1.9e-185 gi|121940044|sp|Q08AN1.1|ZN616_HUMAN RecName: Full ( 781) 3079 653.5 9.1e-185 gi|109125970|ref|XP_001115785.1| PREDICTED: simila ( 738) 3078 653.3 1e-184 gi|109125942|ref|XP_001116792.1| PREDICTED: simila ( 775) 3055 648.5 2.9e-183 gi|114678842|ref|XP_512866.2| PREDICTED: zinc fing ( 781) 3052 647.9 4.5e-183 gi|114678844|ref|XP_001174436.1| PREDICTED: zinc f ( 755) 3046 646.6 1.1e-182 gi|74758703|sp|Q6ZN19.1|ZN841_HUMAN RecName: Full= ( 808) 3004 637.9 4.8e-180 gi|194674865|ref|XP_584865.4| PREDICTED: hypotheti (1022) 2981 633.2 1.6e-178 gi|23396996|sp|Q96SE7.1|ZN347_HUMAN RecName: Full= ( 839) 2970 630.8 6.8e-178 gi|119592527|gb|EAW72121.1| zinc finger protein 34 ( 839) 2970 630.8 6.8e-178 gi|189054400|dbj|BAG37173.1| unnamed protein produ ( 839) 2970 630.8 6.8e-178 gi|193788445|dbj|BAG53339.1| unnamed protein produ ( 840) 2970 630.8 6.8e-178 gi|158261011|dbj|BAF82683.1| unnamed protein produ ( 840) 2970 630.8 6.8e-178 gi|119592525|gb|EAW72119.1| zinc finger protein 34 ( 840) 2970 630.8 6.8e-178 gi|12585543|sp|O43345.1|ZN208_HUMAN RecName: Full= (1167) 2962 629.3 2.7e-177 gi|162135948|ref|NP_663458.2| zinc finger protein ( 650) 2952 627.0 7.6e-177 gi|15929737|gb|AAH15291.1| Zinc finger protein 160 ( 650) 2952 627.0 7.6e-177 gi|74228441|dbj|BAE25340.1| unnamed protein produc ( 650) 2952 627.0 7.6e-177 gi|109125918|ref|XP_001116755.1| PREDICTED: simila ( 803) 2933 623.1 1.4e-175 gi|109125914|ref|XP_001116762.1| PREDICTED: simila ( 839) 2933 623.1 1.4e-175 gi|109125916|ref|XP_001116744.1| PREDICTED: simila ( 840) 2933 623.1 1.4e-175 gi|149047059|gb|EDL99779.1| rCG22999, isoform CRA_ ( 557) 2926 621.5 2.9e-175 gi|109124151|ref|XP_001087503.1| PREDICTED: simila (1063) 2912 618.8 3.5e-174 gi|194215235|ref|XP_001495155.2| PREDICTED: simila ( 882) 2885 613.1 1.5e-172 gi|19584399|emb|CAD28491.1| hypothetical protein [ ( 535) 2860 607.7 4e-171 gi|148706079|gb|EDL38026.1| zinc finger protein 16 (1454) 2847 605.4 5.3e-170 gi|114671709|ref|XP_511785.2| PREDICTED: zinc fing (1323) 2843 604.5 8.9e-170 gi|126323913|ref|XP_001377951.1| PREDICTED: simila ( 931) 2832 602.1 3.4e-169 gi|114676315|ref|XP_512535.2| PREDICTED: zinc fing (1226) 2822 600.1 1.8e-168 gi|194217724|ref|XP_001503488.2| PREDICTED: simila ( 984) 2820 599.6 2e-168 gi|73970472|ref|XP_531878.2| PREDICTED: similar to (1216) 2804 596.3 2.4e-167 gi|114678889|ref|XP_001174611.1| PREDICTED: zinc f ( 721) 2750 584.8 4e-164 gi|109087797|ref|XP_001096362.1| PREDICTED: zinc f ( 782) 2746 584.0 7.6e-164 gi|119592538|gb|EAW72132.1| hCG2041454 [Homo sapie ( 927) 2746 584.1 8.6e-164 gi|210031219|ref|NP_612383.1| zinc finger protein ( 970) 2746 584.1 8.9e-164 gi|205831221|sp|Q96IR2.2|ZN845_HUMAN RecName: Full ( 970) 2746 584.1 8.9e-164 gi|119592502|gb|EAW72096.1| zinc finger protein 60 ( 791) 2742 583.2 1.4e-163 >>gi|20138732|sp|Q9HCG1.2|ZN160_HUMAN RecName: Full=Zinc (818 aa) initn: 5780 init1: 5780 opt: 5780 Z-score: 6519.7 bits: 1217.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 5780; 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