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FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA1603, 1659 aa
 vs ./tmplib.25089 library

1985846 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1308+/-0.00579; mu= 16.7555+/- 0.392
 mean_var=127.6520+/-31.748, 0's: 0 Z-trim: 11  B-trim: 78 in 1/38
 Lambda= 0.113517

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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KIAA1503  ( 4464 res)   hk03643y1                  (4464) 3041 511.9 1.2e-144
KIAA2017  ( 3051 res)   fk13965y1                  (3051) 2377 402.9 5.3e-112
KIAA0357  ( 2992 res)   hh00016y2                  (2992) 2031 346.2   6e-95
KIAA1997  ( 1685 res)   bj00195y1                  (1685) 1502 259.2 5.2e-69
KIAA0325  ( 4658 res)   hg00575y2                  (4658) 1475 255.4   2e-67
KIAA1697  ( 2182 res)   fj14406y2                  (2182) 1434 248.3 1.4e-65


>>KIAA1410  ( 4293 res)   pg00933y4                       (4293 aa)
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Smith-Waterman score: 3641;  34.932% identity (69.213% similar) in 1689 aa overlap (1-1656:2624-4289)

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       : .   :: :.  :::.:.:..::.::::: .::::.::.. ::.. :: :.: : .   
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       ....     ::. ::   . .:::.:.:.:::.::.:: :: :  .::.:.. ::::::.
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       .:: .:: .:.  ::.   ... : :  . ..:    ....:..::..:. .. : ..::
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       ::::: ... .... :.:..:..:  :::..::.:: ..::.:: ....::         
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       ::.  : . . :.: .. : : ..  .:..::. .:.: .::::.:. .::       :.
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        : :::. : :.:...  .:.. ::.. :::  .  ... : ..  . ..  :.  ::  
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       :  .  :. .  :.   :.::..: .: ::.:.. ::. ..::..  ...  :  .:   
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       :.:.. .:.:. :    :.:....  :. ::.::. :: :: :  ...  . . . ::::
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       .:..:..: :::. ..: .: ..: :.......:  .. .:   : .   :  :.. :::
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       ::::::.. ..:.::.. .::::::::.:.  :. .::. ...:. . .  ....:..::
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       ..::::.:..:. :.:  :: ::  .:  : :.  :..:. .:: .:. .: :: ::: :
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KIAA15 HITRIVRVIGQPRGNMLLVGIGGSGRQSLARLASSICDYTTFQIEVTKHYRKQEFRDDIK
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KIAA16 KKE-FPRCLPTNENLHDYFMSRVRQNLHIVLCFSPVGEKFRNRALKFPALISGCTIDWFS
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       ::::::  ::...  .::. ... ::::  .  .:. :..:   .              :
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       ::.::.::. :. .  ::     .  .:.. ::.:::::. ..  :...:  ..  :   
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       .   . .:.:..... .::. :  :: . .. . :  :  :. .:: ::  :  . : ::
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        :.  :: .  ::.. .:....::. .. . .:.:..   :      .:       .:. 
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       .  .:.  :::..:...  :.:..  .. ..  ..  . . :  . :     :. ....:
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       . .. .. .:. : . ...  :    :. ..:.. : ::   : ::... :.:: :. ::
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       : : :.::  .... .:. :::::..:. :: .. .:.  .  .:.:: :: .::::: :
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        :. :::: ..:  :....  :.::... . :  .: :   ::.:. :::: :.::.:::
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       :..:.:::.:: :::: :.  ::: :: .:.:...:.:   : ..:: :.. : :.:..:
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       : : .::..:::::.:. .. :  : . .::::::  ..::::..::: :: :.: . ..
KIAA20 VDEYIDPVIDNVLEKNIKVSQGRQF-IILGDKEVDYDSNFRLYLNTKLANPRYSPSVFGK
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       . .:..:::.::::::::. ..  :..:::..: ::..... ::  .:.:::.:: .:..
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       . :..... .:. .: .::  : ::..::... .: ..:.  :. :::.: ::.::.:..
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       .:: ::: ::: ::  :: .: ::: .:. . :  ::. ::.. .:. .:...  ::.:.
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       .:..    . . ::   .:..:.:..:...:::::::.:.: :. ::::...  .: :: 
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KIAA16 KLMTAGNFLQNLQQFPKDTINEEVIEFLSPYFEMPDYNIETAKRVCGNVAGLCSWTKAMA
        .  . .::..: .: :..:.:. .. . ::.. :..: : .      .::::::.  ..
KIAA03 TMAKVDGFLDSLINFNKENIHENCLKAIRPYLQDPEFNPEFVATKSYAAAGLCSWVINIV
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KIAA16 SFFSINKEVLPLKANLVVQENRHLLAMQDLQKAQAELDDKQAELDVVQAEYEQAMTEKQT
        :. .  .: : .  :         :.. :   .:..   . .:  . :..:.: ..:  
KIAA03 RFYEVFCDVEPKRQALNKATADLTAAQEKLAAIKAKIAHLNENLAKLTARFEKATADKLK
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KIAA16 LLEDAERCRHKMQTASTLISGLAGEKERWTEQSQEFAAQTKRLVGDVLLATAFLSYSGPF
         ..::     .. :. :..:::.:. ::..  :.:  : . : ::.:: :::.:: : :
KIAA03 CQQEAEVTAVTISLANRLVGGLASENVRWADAVQNFKQQERTLCGDILLITAFISYLGFF
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KIAA16 NQEFRDLLLN-DWRKEMKARK--IPFGKNLNLSEMLIDAPTISEWNLQGLPNDDLSIQNG
       ....:. ::.  ::  ..  :  ::    :.  .::.:   .. :. .::: : .:..:.
KIAA03 TKKYRQSLLDRTWRPYLSQLKTPIPVTPALDPLRMLMDDADVAAWQNEGLPADRMSVENA
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KIAA16 IIVTKASRYPLLIDPQTQGKIWIKNKESRNELQITSLNHKYFRNHLEDSLSLGRPLLIED
        :. .  :.::..::: ::  ::::: ... :..:....: . . .:..:  :  .:::.
KIAA03 TILINCERWPLMVDPQLQGIKWIKNKYGED-LRVTQIGQKGYLQIIEQALEAGAVVLIEN
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       . : .::.:  .: :. :: :  : .:.:::: .    ::: . ::: :: : ::..:..
KIAA03 LEESIDPVLGPLLGREVIKKGR-F-IKIGDKECEYNPKFRLILHTKLANPHYQPELQAQA
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KIAA16 SIIDFTVTMKGLEDQLLGRVILTEKQELEKERTHLMEDVTANKRRMKELEDNLLYRLTST
       ..:.::::  :::::::. :.  :. .::. .. : .. .. :  .: :::.:: ::.:.
KIAA03 TLINFTVTRDGLEDQLLAAVVSMERPDLEQLKSDLTKQQNGFKITLKTLEDSLLSRLSSA
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       .:... .  :.  :  ::.:: :: .:.. .  :::.:: :::.:::.:.:.:.:::...
KIAA03 SGNFLGETVLVENLEITKQTAAEVEKKVQEAKVTEVKINEAREHYRPAAARASLLYFIMN
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       ..  .. ::: ::. :  .:. .. :.. .    .:.::.:. .:. ::.:. :::.:  
KIAA03 DLSKIHPMYQFSLKAFSIVFQKAVERAAPDESLRERVANLIDSITFSVYQYTIRGLFECD
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       :. .   ::..: ..  .:.  :.  :...     ...   .: ...   .:  .  ::.
KIAA03 KLTYLAQLTFQILLMNREVNAVELDFLLRS----PVQTGTASPVEFLSHQAWGAVKVLSS
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       ...::..  .:  . : :: . ..: ::.: ::. . :.   ..:: ..:.  :::    
KIAA03 MEEFSNLDRDIEGSAKSWKKFVESECPEKEKLPQEW-KNKTALQRLCMLRAMRPDRMTYA
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         . . ::.:::::: :.  :. .  .: :..:::                         
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KIAA16 RLWMTTEVHKQFPITLLQMSIKFANDPPQGLRAGLKRTYSGVSQDLLDVSSGSQWKPMLY
                       :.:                              :  ...: .:.
KIAA03 ----------------LEMC-----------------------------SRETEFKSILF
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       :. ..:..: ::::::  :::  : :: .:.. .:. . : :.   ..  : .  .::..
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KIAA16 GEIQYGGRVTDDYDKRLLNTFAKVWFSENMFGPDFSFYQGYNIPKCSTVDNYLQYIQS-L
       :::.:::..:::.:.::  :.   ..  .:.  ..:.  :. .:     ..: :::.. :
KIAA03 GEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLGEFIRPEMLEGELSLAPGFPLPGNMDYNGYHQYIDAEL
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KIAA03 PP-ESPYLYGLHPNAEIGFLTQTSEKLFRTVLELQPRDSQARDGAGATREEKVKALLEEI
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       ::..  .   :.. : . :.    :. .   ::  ::. .   .. .: ::.:.. : . 
KIAA03 LERVTDE---FNIPELMAKVEERTPYIVVAFQECGRMNILTREIQRSLRELELGLKGELT
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       :.   :::..::  .::    .: ..:   .. :. :: .:..: ... .:. .   :  
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        :.:::::::.::::. :  .: :. : ::.:.:  ..::  .... .:: ::.:..::.
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       .::: :: .   . :.: : :   :::. : :     .: :  ::::.::   :   .:.
KIAA03 MEGACWDTQAGIITEAKLKDLTPPMPVMFIKAIPADKQDCRSVYSCPVYKTSQRGP-TYV
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        . .:.: ..: .::: ::::: .. 
KIAA03 WTFNLKTKENPSKWVLAGVALLLQI 
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>>KIAA1997  ( 1685 res)   bj00195y1                       (1685 aa)
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KIAA16                               TRLASFIAGYVSFQITLTRSYNTSNLMEDL
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        ...     :    . .::  :..::::::: .. .. .:     . ::: . : . :. 
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KIAA19 GWSNSSMKKIPEMLFSETGGGEKYNDKKRKEEKKKNSVDPDFLKSFLLIHESCKAYGATP
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       ..:..:.. :. : . :. :.    .....:. ::.::.  :  :...   .   :.. .
KIAA19 SQYMTFLHVYSAISSSKKKELLKRQSHLQAGVSKLNEAKALVDELNRKAGEQSVLLKTKQ
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       :.:: .:. .:.. : : . :.:....: :    : .: . :   ...:. ..: ..::.
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        :. .:.: ... .:.:  :: .:  :.. :: :.        .:        ::    .
KIAA19 LAVGNIKPESLSEIRSLRMPPDVIRDILEGVLRLMG------IFDT-------SWVSMKS
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        ..  . ... ::... .  :. .:   .: ..   :: .. .. .. .. ....  .: 
KIAA19 IQYSHVLERIHPLETEQAGLES-NLKKTEDRKRKLEELLNSVGQKVSELKEKFQSRTSEA
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KIAA19 AKLEAEVSKAQETIKAAEVLINQLDREHKRWNAQVVEITEELATLPKRAQLAAAFITYLS
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KIAA16 PFNQEFRDLLLNDWRKEMKARKIPFGKNLNL-SEMLIDAPTISEWNLQGLPNDDLSIQNG
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KIAA16 IIVTKASRYPLLIDPQTQGKIWIKNKESRNELQITSLNHKYFRNHLEDSLSLGRPLLIED
       ... ..   :.::::..:.  :.:.. . ..:.. . . . : . :: .. .:. :.:..
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KIAA16 VGEELDPALDNVLERNFIKTGSTFKVKVGDKEVDVLDGFRLYITTKLPNPAYTPEISART
       . . ..:.:  .:.:...  :  . :..::: .:  . :::...:. :::   :. .. .
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       . ..::.: .::. :::. .:  :: .::...:.:...   .: .. .::..::  :...
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KIAA16 QGSLVEDESLIVVLSNTKRTAEEVTQKLEISAETEVQINSAREEYRPVATRGSILYFLIT
       ::...:...::  :..:: ..  . ..:. : . ...... :. : :.:  .: .::.:.
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       ..  .:.::. ::  :: ::. .:  .  :  : .:: ..:  . . ::.:  : :..  
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       ...:.: ..  .    .:.:  . . :  .. :     :. . :     :: ::  . .:
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          :   :.   :       ..  .:. ....   :.: .:.   :... :...:...  
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        :::  .    .   ..: : .  . :.:.. ..:.    :.. ..: :.::.. .  :.
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       .  .    :  :.:::::   : ..:..   :: :  :.: :: ....  ...  ..:  
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        .:.::::.:.::: .:   ::: :.:.. . : ::. .: ::: . . . .. ..... 
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       ... : .: ... :.::. .... : .::: ::..:..::: .::  ::   . ..    
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        .::    : ..:.:. .: :.: .:::.:. ..: .: ...::   :::.. :...::.
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                  :.  .::. ::.::. :  .. ::. :..    ..:.::.:.::. ..:
KIAA03 QANARLAKRGGRTMAITPRHYLDFINHYANLFHEKRSELEEQQMHLNVGLRKIKETVDQV
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       . :.  . :.. .:.....:::: ..:..: :..:. .:. .....:. :..     . :
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KIAA16 MKELEDNLLYRLTSTQGSLVEDESLIVVLSNTKRTAEEVTQKLEISAETEVQINSAREEY
       ...:: .::  :. ..: ...:...:..: : :: : :::.:.: .  .  ..... ..:
KIAA03 LRQLEKSLLQALNEVKGRILDDDTIITTLENLKREAAEVTRKVEETDIVMQEVETVSQQY
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        :..:  : .:: .  .. .. .:: ::. :: ..   : .. . . .:  ..:.. : .
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        .   ... .:::. .. .. :..::. .:.    ..  .. ::  ...:.  .   .  
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       :. .   .. .   .:.:: :  :.:.. ... .:. . ::.:. .::.  .:  ...  
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       : ::.  .. .: .  ...   :  :::..: :.. . :..::. .  :. .:: :..:.
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       . ::.:..  . .  .: ..   . . .:..:. .::: ... :::.  :::...:. ..
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KIAA03 TQGVDMISKMLKMQMLEDEDDLAYAETEKKTRTDSTSDGRPAWMRTLHTTASNWLHLIPQ
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