# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj05982s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1582.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1582, 1740 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7811118 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8302+/-0.000211; mu= 9.3344+/- 0.012 mean_var=155.4802+/-28.892, 0's: 34 Z-trim: 88 B-trim: 0 in 0/65 Lambda= 0.102858 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|126253813|sp|Q9HCJ0.3|TNR6C_HUMAN RecName: Full (1690) 11690 1748.1 0 gi|119609889|gb|EAW89483.1| trinucleotide repeat c (1687) 11653 1742.6 0 gi|220939215|emb|CAX15807.1| trinucleotide repeat (1732) 11037 1651.2 0 gi|74184652|dbj|BAE27937.1| unnamed protein produc (1900) 11011 1647.4 0 gi|123222448|emb|CAM27640.1| trinucleotide repeat (1900) 11011 1647.4 0 gi|118099617|ref|XP_415612.2| PREDICTED: hypotheti (1886) 10829 1620.4 0 gi|126253814|sp|Q3UHC0.2|TNR6C_MOUSE RecName: Full (1690) 10717 1603.7 0 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 AQRNVSGPMRQQEQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQALLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGK 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA15 SAMDSFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSPNTFAPYPLAGLNPNMNVNSMDMTGGLSVKDPSQ :.:.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::..::::::::: gi|123 SGMESFPPPPQAPGLPDLQTKEQQSSPNTFAPYPLAGLNPNMNVNSIDMSSGLSVKDPSQ 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA15 SQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNPSKHGAIPGGLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQN :::::::::::::: :: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 SQSRLPQWTHPNSMGNLSSAASPLDQNPSKHGAIPGGLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQN 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1410 1420 1430 1440 1450 1460 KIAA15 SESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPG :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: gi|123 SESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSSISWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPG 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1470 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA15 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:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::: : gi|118 KSAMDSFSPHPQAPGLPDLQTKEQQSSPNTFAPYPLAGLNPNMNVNNMDITGGLSVKDTS 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA15 QSQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNPSKHGAIPGGLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQ :::::::::::::::::: :::: :.:: ::::::::::::::::::::::::::::::: gi|118 QSQSRLPQWTHPNSMDNLSSAASSLDQNSSKHGAIPGGLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQ 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1410 1420 1430 1440 1450 1460 KIAA15 NSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTP ::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|118 NSESPASPPVAVPHSWSRAKTDSDKISNGSSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTP 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1470 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA15 GSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSDIKSTWSSGPTSHTQASLSHELWKVPRNSTAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::.::: gi|118 GSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSDIKSTWSSGPISHTQASLSHELWKVPRNTTAP 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1530 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA15 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: gi|126 SYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSSISWPPEFHPGVPWKGLQNID 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1460 1470 1480 1490 1500 1510 KIAA15 PENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSDIKSTWSSGPTSHTQASLSHELW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: gi|126 PENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSDIKSTWSSGPASHTQASLSHELW 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1520 1530 1540 1550 1560 1570 KIAA15 KVPRNSTAPTRPPPGLTNPKPSSTWGASPLGWTSSYSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLT :::::.::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 KVPRNTTAPTRPPPGLANPKPSSTWGTSPLGWTSSYSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLT 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1580 1590 1600 1610 1620 1630 KIAA15 PQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTILAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 PQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTILAE 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1640 1650 1660 1670 1680 1690 KIAA15 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