# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh23424.fasta.huge -Q ../query/KIAA1572.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1572, 492 aa vs ./tmplib.25089 library 1987013 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9467+/- 0.007; mu= 16.6499+/- 0.476 mean_var=220.6740+/-56.178, 0's: 0 Z-trim: 66 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.086337 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 354 57.3 4.3e-09 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 351 56.8 5.5e-09 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 350 56.6 5.7e-09 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 345 55.4 6.5e-09 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 342 55.7 1.2e-08 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 341 55.7 1.3e-08 KIAA0414 ( 492 res) hh00161 ( 492) 336 54.7 1.7e-08 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 334 54.4 2e-08 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 329 54.1 3.7e-08 KIAA1993 ( 532 res) bg00180 ( 532) 327 53.6 3.9e-08 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 326 53.5 4.3e-08 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 325 53.4 4.6e-08 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 324 53.3 5.2e-08 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 326 53.9 5.2e-08 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 323 53.2 5.6e-08 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 319 52.5 7.3e-08 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 320 53.0 7.8e-08 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 319 52.7 7.9e-08 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 314 52.1 1.2e-07 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 314 52.1 1.3e-07 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 314 52.4 1.4e-07 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 314 52.5 1.5e-07 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 313 52.3 1.6e-07 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 309 51.3 1.8e-07 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 310 51.6 1.8e-07 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 306 51.0 2.4e-07 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 308 51.6 2.4e-07 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 300 49.3 2.5e-07 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 304 50.8 2.9e-07 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 306 51.5 3e-07 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 303 50.8 3.3e-07 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 301 50.3 3.5e-07 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 302 50.6 3.5e-07 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 301 50.4 3.6e-07 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 302 50.8 3.9e-07 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 302 51.0 4.2e-07 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 298 49.9 4.5e-07 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 300 50.6 4.8e-07 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 295 49.6 5.9e-07 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 291 49.1 8.7e-07 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 290 49.1 9.9e-07 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 282 48.0 1.9e-06 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 286 49.2 1.9e-06 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 280 47.7 2.2e-06 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 273 46.8 3.9e-06 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 259 45.4 1.5e-05 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 258 45.1 1.6e-05 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 256 44.6 1.6e-05 KIAA0569 ( 1318 res) hh02356 (1318) 258 45.8 2.2e-05 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 255 45.0 2.3e-05 >>KIAA1962 ( 746 res) hm00158 (746 aa) initn: 1549 init1: 275 opt: 354 Z-score: 255.1 bits: 57.3 E(): 4.3e-09 Smith-Waterman score: 354; 38.017% identity (67.769% similar) in 121 aa overlap (326-442:611-731) 300 310 320 330 340 350 KIAA15 TGSDNIIMASKDVFGPNIRGVDKGLQWHHQCPKCTRVFRHLENYANHLKMH---KLFMCL : : .: :. . : ..: : . : KIAA19 YKCGECGKAFRQNSCLTRHQRIHTGEKPYLCNDCGMTFSHFTSVIYHQRLHSGEKPYKCN 590 600 610 620 630 640 360 370 380 390 400 410 KIAA15 LCGKTFTQKGNLHRHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYCDM : :.: .. : ::.:.:.:.::..:: :::.:::. ::..: .:.:.::..:::: KIAA19 QCEKAFPTHSLLSRHQRIHTGVKPYKCKECGKSFSQSSSLNEHHRIHTGEKPYECNYCGA 650 660 670 680 690 700 420 430 440 450 460 470 KIAA15 VFAHKPVLRKHLKQLHGKNSFD-NANERNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQV .:... .: .::: :. .. : :.. . KIAA19 TFSRSSILVEHLKIHTGRREYECNECEKTFKSNSGLIRHRGFHSAE 710 720 730 740 480 490 KIAA15 LDAGKLAQAVLNLRNDSTCVN >>KIAA0972 ( 702 res) hj06859 (702 aa) initn: 312 init1: 312 opt: 351 Z-score: 253.2 bits: 56.8 E(): 5.5e-09 Smith-Waterman score: 352; 32.020% identity (60.099% similar) in 203 aa overlap (263-440:369-571) 240 250 260 270 280 KIAA15 IVKVESIGDVSEVRSKKDQNQFISSEPTALHSSEPQHSLI--NSTVENRVSE--IEQNHL : ..:: ..: : : : .. ..... KIAA09 KSTVEEYNKLNMGIKHYELNPSGNNFNRKAHLTDPQTAVIEENPLVSNDRTQTWVKSSEY 340 350 360 370 380 390 290 300 310 320 330 KIAA15 HNYALSY-TGSDNIIMASKDVFGP---NIRG---VDKGLQWHHQ----------CPKCTR :. :: :. . :.... : : : .:: .:: : .: . KIAA09 HENKKSYQTSVHRVRRRSHSMMKPYKCNECGKSFCQKGHLIQHQRTHTGEKPFECSECGK 400 410 420 430 440 450 340 350 360 370 380 KIAA15 VFRHLENYANHLKMH---KLFMCLLCGKTFTQKGNLHRHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQ .: . . ..: ..: : . : :::::.::..:. :.:.:.: ::..:. ::::: : KIAA09 TFSQKSHLSTHQRIHTAEKPYKCNECGKTFVQKSTLRGHQRIHTGEKPYECSECGKTFVQ 460 470 480 490 500 510 390 400 410 420 430 440 KIAA15 KCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYCDMVFAHKPVLRKHLKQLHGKNSFD-NANERNVQDLTVD : .:.:: .:.:.: .:: : .:..: :: : . :..... : :.. KIAA09 KSTLRDHHRIHTGEKSFQCNQCGKTFGQKSNLRIHQRTHTGEKTYQCNECEKSFWRKDHL 520 530 540 550 560 570 450 460 470 480 490 KIAA15 FDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQVLDAGKLAQAVLNLRNDSTCVN KIAA09 IQHQKTHTGEKPFKCNECGKTFARTSTLRVHQRIHTGEKPFKCNECGKKFVRKAILSDHQ 580 590 600 610 620 630 >>KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 (638 aa) initn: 689 init1: 268 opt: 350 Z-score: 252.9 bits: 56.6 E(): 5.7e-09 Smith-Waterman score: 350; 26.515% identity (54.924% similar) in 264 aa overlap (180-432:380-638) 150 160 170 180 190 200 KIAA15 ELVNYLTAASFLQMSHIVERCTQALWKFIKPKQPMDSKEGCEPQSASPQSKEQQGDARGS :: : ..:: . :.. .: . .. KIAA10 RKSLRHSTRKKEWGKKEPVAGSPFERREAGPKGPCPGEEGEGVGDRVPNGILASGAGPSG 350 360 370 380 390 400 210 220 230 240 250 260 KIAA15 PKQDSP--CIHPSEDSMDMEDSDIQIVKVESIGDVSEVRSKKDQNQFISSEPTALH---- : . : : . :.. : ... : . . : .: .... : :. KIAA10 PYGEPPYPCKEEEENGKDASEDSAQSGSEGGSGHASAHYMYRQEGYETVSYGDNLYVCIP 410 420 430 440 450 460 270 280 290 300 310 320 KIAA15 --SSEPQHSLINSTVENRVSEIEQNHLHNYALSYTGSDNIIMASKDVFGPNIRGVDKGLQ .. :. .:. ::... :. ... . ::: . ..:. .:. . . KIAA10 CAKGFPSSEQLNAHVETHTE--EELFIKEEGAYETGSGGAEEEAEDLSAPSAAYTAEPRP 470 480 490 500 510 520 330 340 350 360 370 KIAA15 WHHQCPKCTRVFRHLENYANHLKMHKL---FMCLLCGKTFTQKGNLHRHMRVHAGIKPFQ . .: : .... . .: : : : : : .::: :::.:.. :::: : :.::: KIAA10 F--KCSVCEKTYKDPATLRQHEKTHWLTRPFPCNICGKMFTQRGTMTRHMRSHLGLKPFA 530 540 550 560 570 580 380 390 400 410 420 430 KIAA15 CKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYCDMVFAHKPVLRKHLKQLHGKNSFDNANE : :: :... : .:. .:::.::..:. : :... : .::. .: . : KIAA10 CDECGMRFTRQYRLTEHMRVHSGEKPYECQLCGGKFTQQRNLISHLR-MHTSPS 590 600 610 620 630 440 450 460 470 480 490 KIAA15 RNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQVLDAGKLAQAVLNLRNDSTCVN >>KIAA1979 ( 309 res) fj09511 (309 aa) initn: 278 init1: 278 opt: 345 Z-score: 251.9 bits: 55.4 E(): 6.5e-09 Smith-Waterman score: 345; 39.823% identity (69.027% similar) in 113 aa overlap (324-433:15-127) 300 310 320 330 340 350 KIAA15 SYTGSDNIIMASKDVFGPNIRGVDKGLQWHHQCPKCTRVFRHLENYANHLKMH---KLFM ..: : ..: :. . . : :.: : . KIAA19 NIEIRQKIHTGEKCYKCNDCGKIFSHMSSIVYHHKFHSGEKPYK 10 20 30 40 360 370 380 390 400 410 KIAA15 CLLCGKTFTQKGNLHRHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYC : : ..:. :.::.:: :.:.: ::..:. ::::::. :: : ::.:.::.::. : KIAA19 CEECDEAFSFKSNLERHRRIHTGEKPYRCNRCGKTFSHTSSLTCHHRLHTGEKPYKCEEC 50 60 70 80 90 100 420 430 440 450 460 470 KIAA15 DMVFAHKPVLRKHLKQLHGKNSFDNANERNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQ : .: .: :..: . .:.. . KIAA19 DETFRYKSNLERHRRIHNGEKPYKCNEYGKTFSQKSCLTRHHRLHTGNKSYKCNECGKTF 110 120 130 140 150 160 >>KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 (702 aa) initn: 612 init1: 285 opt: 342 Z-score: 247.2 bits: 55.7 E(): 1.2e-08 Smith-Waterman score: 415; 24.651% identity (56.744% similar) in 430 aa overlap (44-445:1-424) 20 30 40 50 60 70 KIAA15 QNRYDNTDLFLEGRSSFLNCLSFLKFNLFTFLFFRSAKMS-ERSDLLHFKFENYGDSMLQ .:. . :. : : : : . . ..:..: KIAA04 WLLKKMAETSPEPSGQLVVHSDAHSDTVLA 10 20 30 80 90 100 110 120 130 KIAA15 KMNKLREENKFCDVTVLIDDIEVQGHKIVFAAGSPFLRDQFLLNDSREVKISILQS--SE ... :... .::.:....... ..:: ..::.: .. .: . .: .:.. .. KIAA04 SFEDQRKKGFLCDITLIVENVHFRAHKALLAASSEYFSMMFAEEGEIGQSIYMLEGMVAD 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 KIAA15 VGRQLLLSCYSGVLEFPEMELVNYLTAASFLQMSHIVERCTQALWKFIKPKQPMDSKEGC . :: :.: :. : . :..:.::.. .:. :. . .:: : . . KIAA04 TFGILLEFIYTGYLHASEKSTEQILATAQFLKVYDLVKAYTDFQNNHSSPK-PTTLNTAG 100 110 120 130 140 200 210 220 230 KIAA15 EPQSASPQSKEQQGD-ARGSPK-----QDSPCIHPSEDSMDME-DSDIQ-----IVKVES : . :..:.. :: :: :. .:. .... ....: .:: .: KIAA04 APVVVIPNKKNDPPKRKRGRPKKVNTLQEEKSELAAEEEIQLRVNNSVQNRQNFVVKGDS 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 KIAA15 IGDVSEVRSKKDQNQFISSEPTALHSSEPQHSLINSTVENRVSEIEQNHLHNYAL----- : ..: . :.... :::: : : . . .. . .: : :. KIAA04 -GVLNEQIAAKEKEE---SEPTCEPSREEEMPVEKDENYDPKTEDGQASQSRYSKRRIWR 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 KIAA15 SYTGSDNIIMASKDVFGPNIRGVDKGLQW---HHQCPKCTRVFRHLENYANHLKMH---K : .: ...... : : . . . .: : .::.. . : : . : . KIAA04 SVKLKDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCGKVFKYNHFLAIHQRSHTGER 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 KIAA15 LFMCLLCGKTFTQKGNLHRHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKC : : ::: :.:: .:. : :.:.: .:. : .:.:... : :: .:..::::.: : KIAA04 PFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLHSGQKSFTC 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 KIAA15 NYCDMVFAHKPVLRKHLKQLHGKNSFDNANE--RNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQ . : :... :..: . .: .:. . .. :. .:.. KIAA04 DQCGKYFSQNRQLKSHYR-VHTGHSLPECKDCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEIC 390 400 410 420 430 440 470 480 490 KIAA15 PDATQVLDAGKLAQAVLNLRNDSTCVN KIAA04 GKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQF 450 460 470 480 490 500 >>KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 (766 aa) initn: 1915 init1: 305 opt: 341 Z-score: 246.2 bits: 55.7 E(): 1.3e-08 Smith-Waterman score: 341; 45.370% identity (65.741% similar) in 108 aa overlap (324-428:318-424) 300 310 320 330 340 350 KIAA15 SYTGSDNIIMASKDVFGPNIRGVDKGLQWHHQCPKCTRVFRHLENYANHLKMH---KLFM ..: .: ..:. : .: : . KIAA20 NPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEKPYK 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 KIAA15 CLLCGKTFTQKGNLHRHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYC : ::::: ::. : :: :.:.: ::..:. ::::::.: :: : ::.:.::.::: : KIAA20 CNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNEC 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 KIAA15 DMVFAHKPVLRKHLKQLHGKNSFDNANERNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQ .:.:: : : ..:: KIAA20 GKTFSHKSSLTCH-RRLHTGEKPYKCEECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKT 410 420 430 440 450 460 >>KIAA0414 ( 492 res) hh00161 (492 aa) initn: 554 init1: 332 opt: 336 Z-score: 244.3 bits: 54.7 E(): 1.7e-08 Smith-Waterman score: 491; 26.226% identity (58.422% similar) in 469 aa overlap (51-440:25-492) 30 40 50 60 70 80 KIAA15 DLFLEGRSSFLNCLSFLKFNLFTFLFFRSAKMSERSDLLHFKFENYGDSMLQKMNKLREE .: .. .. .: ......:::.:. :.. KIAA04 NKFIFGLEFVLIFLSLVAPNKICDEMEPGTNSFRVEFPDFSSTILQKLNQQRQQ 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 140 KIAA15 NKFCDVTVLIDDIEVQGHKIVFAAGSPFLRDQFLLNDSREVKISILQSSEVGRQLLLSCY ...:::..... ..:: :.::.::.. :: ::..::.. . ... .: ...::: : KIAA04 GQLCDVSIVVQGHIFRAHKAVLAASSPYFCDQVLLKNSRRIVLPDVMNPRVFENILLSSY 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 KIAA15 SGVLEFPEMELVNYLTAASFLQMSHIVERCTQALW--KFIKPKQPMDSKEGCEPQSAS-- .: : .: :.:.:::::::::: :.:..::..: . .. ... :.:.: KIAA04 TGRLVMPAPEIVSYLTAASFLQMWHVVDKCTEVLEGNPTVLCQKLNHGSDHQSPSSSSYN 120 130 140 150 160 170 200 210 220 230 KIAA15 ----------------PQSKE-QQGDARGSPKQD--SPCI--H---PSEDSMDMEDSDIQ :...: ..:. . .: : . : ::..: . . . . KIAA04 GLVESFELGSGGHTDFPKAQELRDGENEEESTKDELSSQLTEHEYLPSNSSTEHDRLSTE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 KIAA15 IVKV---ESIGDVSE------VRSKKD---QNQFISSEPTAL---------HSSEPQHSL ... :. .: .: . :: . ....: .: : :.. .:.. KIAA04 MASQDGEEGASDSAEFHYTRPMYSKPSIMAHKRWIHVKPERLEQACEGMDVHATYDEHQV 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 KIAA15 INS--TV--ENRV--SEIEQN-HLHNYAL----SYTGSDNIIMASKDVFGPNIRGV---- .: :: :. : : .:.. :. . . . .... . : .: ... KIAA04 TESINTVQTEHTVQPSGVEEDFHIGEKKVEAEFDEQADESNYDEQVDFYGSSMEEFSGER 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 KIAA15 -DKGLQWHHQCP-------KCTRVFRHLENYANHLKMH---KLFMCLLCGKTFTQKGNLH : .: :.: . .. ... :.:: . ::. : :::.::.:.. KIAA04 SDGNLIGHRQEAALAAGYSENIEMVTGIKEEASHLGFSATDKLYPCQ-CGKSFTHKSQRD 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 KIAA15 RHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYCDMVFAHKPVLRKHL- ::: .: :..:. : .::: :..: : :...:.: ::..:: : : . ...:. KIAA04 RHMSMHLGLRPYGCGVCGKKFKMKHHLVGHMKIHTGIKPYECNICAKRFMWRDSFHRHVT 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 KIAA15 ---KQLHGKNSFDNANERNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQVLDAGKLAQAV :. .. .. .:..: : KIAA04 SCTKSYEAAKAEQNTTEAN 480 490 >>KIAA2003 ( 460 res) ah02593 (460 aa) initn: 992 init1: 268 opt: 334 Z-score: 243.2 bits: 54.4 E(): 2e-08 Smith-Waterman score: 334; 34.677% identity (66.935% similar) in 124 aa overlap (314-434:287-409) 290 300 310 320 330 340 KIAA15 EQNHLHNYALSYTGSDNIIMASKDVFGPNIRGVDKGLQWHHQCPKCTRVFRHLENYANHL ::: : . ..: .: . : . . .: KIAA20 KHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTG-ERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQ 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 KIAA15 KMH---KLFMCLLCGKTFTQKGNLHRHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHS :.: . . : :::.:.:...: .: :::.: .:..:. :::.:::. .: .: ..:. KIAA20 KVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHT 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 KIAA15 GDKPHKCNYCDMVFAHKPVLRKHLKQLHGKNSFDNANERNVQDLTVDFDSFACTTVTDSK :..:..:. : : .. :::: . :. .. KIAA20 GERPYECSECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKP 380 390 400 410 420 430 470 480 490 KIAA15 GCQPQPDATQVLDAGKLAQAVLNLRNDSTCVN KIAA20 YECTECGKSFSHNSSLIKHQRIHSR 440 450 460 >>KIAA0412 ( 720 res) hg03242 (720 aa) initn: 276 init1: 276 opt: 329 Z-score: 238.4 bits: 54.1 E(): 3.7e-08 Smith-Waterman score: 329; 27.308% identity (59.615% similar) in 260 aa overlap (187-433:160-408) 160 170 180 190 200 210 KIAA15 AASFLQMSHIVERCTQALWKFIKPKQPMDSKEGCEPQSASPQSKEQQ--GDARGSPKQDS ..: :: . . . ... :: .:.:: KIAA04 TLYQEVMLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGD-KGKPKTTE 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 KIAA15 P--CIHPSEDSMDMEDSDIQIVKVES-IGDVSEVR--SKKDQNQF---ISSEPTALHSSE : : ...... . : .:.: .:.. . :. ....: :. . . . KIAA04 PTTCEPALSEGISLQGQVTQGNSVDSQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKMS 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 KIAA15 PQHSLINSTVENRVSEIEQNHLHNYALSYTGSDNIIMASKDVFGPNIRGVDKGLQWHHQC :. . .. :... :.: :... . . : : ..:: : :. ..... : KIAA04 PECDGLG-TADGVCSRIGQEQVS--PGDRVRSHNSCESGKD---PMIQEEENNFK----C 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 380 KIAA15 PKCTRVFRHLENYANHLKMH---KLFMCLLCGKTFTQKGNLHRHMRVHAGIKPFQCKICG .: .:: . . :.: :.: : . : ::::: .. .: .: .:.: .:..: :: KIAA04 SECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECG 300 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 440 KIAA15 KTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYCDMVFAHKPVLRKHLKQLHGKNSFDNANERNVQD :.:..: : .: .:::.::.::: : .:.:. . : .. :..:: KIAA04 KAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFR 360 370 380 390 400 410 450 460 470 480 490 KIAA15 LTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQVLDAGKLAQAVLNLRNDSTCVN KIAA04 HRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAA 420 430 440 450 460 470 >>KIAA1993 ( 532 res) bg00180 (532 aa) initn: 752 init1: 309 opt: 327 Z-score: 238.0 bits: 53.6 E(): 3.9e-08 Smith-Waterman score: 524; 26.915% identity (56.455% similar) in 457 aa overlap (47-428:28-483) 20 30 40 50 60 70 KIAA15 YDNTDLFLEGRSSFLNCLSFLKFNLFTFLFFRSAKMSERSDLLHFKFENYGDSMLQKMNK : :..: . :....: .:....:...:. KIAA19 GDWPGAGGGGGGAAGGRCERGALDRVRFMSVEM-DSSSFIQFDVPEYSSTVLSQLNE 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 KIAA15 LREENKFCDVTVLIDDIEVQGHKIVFAAGSPFLRDQFLLNDSREVKISILQSSEVGRQLL :: ..:.::. : :. ..:: :.::.::..::. :. ..::.... .: .::: KIAA19 LRLQGKLCDIIVHIQGQPFRAHKAVLAASSPYFRDHSALSTMSGLSISVIKNPNVFEQLL 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 KIAA15 LSCYSGVLEFPEMELVNYLTAASFLQMSHIVERCTQALWKFIKPKQPMDSKEGCEPQSAS ::.: . . ..:..:::::::::. ....::: : .. . . : . KIAA19 SFCYTGRMSLQLKDVVSFLTAASFLQMQCVIDKCTQILESIHSKISVGDVDSVTVGAEEN 120 130 140 150 160 170 200 210 220 230 KIAA15 PQSKEQQGDAR--GSPKQDSP--CIH---PSEDS-MDMEDSDIQIVKVE----------S :.:.. :. ..: . :: : . :. .: . :: . . .. . : KIAA19 PESRNGVKDSSFFANPVEISPPYCSQGRQPTASSDLRMETTPSKALRSRLQEEGHSDRGS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 KIAA15 IGDVSE----VRSKKDQNQFISSEPTALH-------SSEPQ----HSLINSTVENRVSEI :.::: ... ..:.... : . :..:. :: .. .... . KIAA19 SGSVSEYEIQIEGDHEQGDLLVRESQITEVKVKMEKSDRPSCSDSSSLGDDGYHTEMVDG 240 250 260 270 280 290 290 300 310 KIAA15 EQ---------NHLHNYALSYTGSDNIIMASKDVFG------PN------IRG----VDK :: . . ..: ::. . . ...:: :. .:: . KIAA19 EQVVAVNVGSYGSVLQHAYSYSQAASQPTNVSEAFGSLSNSSPSRSMLSCFRGGRARQKR 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 KIAA15 GLQWH-HQ----------------CPKCTRVFRHLENYANHLKMHKLFMCLLCGKTFTQK .:. : :. : :. .. ... ..:. :::.:.:: KIAA19 ALSVHLHSDLQGLVQGSDSEAMMNNPGYESSPRERSARGHWYPYNERLICIYCGKSFNQK 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 KIAA15 GNLHRHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYCDMVFAHKPVLR :.: ::::.: :: :: ::.::: ...: .:. :. :. ::: .:. : : . .: KIAA19 GSLDRHMRLHMGITPFVCKFCGKKYTRKDQLEYHIRGHTDDKPFRCEICGKCFPFQGTLN 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 KIAA15 KHLKQLHGKNSFDNANERNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQVLDAGKLAQAV .::.. : KIAA19 QHLRKNHPGVAEVRSRIESPERTDVYVEQKLENDASASEMGLDSRMEIHTVSDAPD 480 490 500 510 520 530 492 residues in 1 query sequences 1987013 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:08:39 2008 done: Thu Dec 18 15:08:40 2008 Total Scan time: 0.440 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]